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'beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 586.542 2 ? ? ? ? 12 non-polymer syn 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 221.208 46 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;QVQLVQSGSEVKKPGASVRVSCKASGYTFSDHAITWVRQAPGAGLEWMAWISLHNGNANYARKFQGRVSMTTDTSTSTAY MELKNLTSDDTAVYYCARSYMRIYGVIAFNEYYYDGMDVWGQGSTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVK DYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCD ; ;QVQLVQSGSEVKKPGASVRVSCKASGYTFSDHAITWVRQAPGAGLEWMAWISLHNGNANYARKFQGRVSMTTDTSTSTAY MELKNLTSDDTAVYYCARSYMRIYGVIAFNEYYYDGMDVWGQGSTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVK DYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCD ; H ? 2 'polypeptide(L)' no no 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;ALTQPPSVSGSPGQSVTISCTGTSSDIGSYNYVSWYQQHPGKAPKLMIYDVTQRPSGVSDRFSGSKSGNTASLTISGLQA DDEADYYCSAYAGRQTFYIFGGGTRLTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKA GVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS ; ;ALTQPPSVSGSPGQSVTISCTGTSSDIGSYNYVSWYQQHPGKAPKLMIYDVTQRPSGVSDRFSGSKSGNTASLTISGLQA DDEADYYCSAYAGRQTFYIFGGGTRLTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKA GVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS ; M,O,S ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MDAMKRGLCCVLLLCGAVFVSPSQEIHARFRRGARAENLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETEKHNVWATHACV PTDPNPQEIHLENVTEEFNMWKNNMVEQMHTDIISLWDQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNVTNNITDDMRGELKNCSFNMTT ELRDKKQKVYSLFYRLDVVQINENQGNRSNNSNKEYRLINCNTSAITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNG TGPCPSVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEVMIRSENITNNAKNILVQFNTPVQINCTRPNNNTRKSIRIGPGQAF YATGDIIGDIRQAHCNVSKATWNETLGKVVKQLRKHFGNNTIIRFANSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCNTSGLFNSTWI SNTSVQGSNSTGSNDSITLPCRIKQIINMWQRIGQAMYAPPIQGVIRCVSNITGLILTRDGGSTNSTTETFRPGGGDMRD NWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTRCKRRVVGRRRRRR ; ;MDAMKRGLCCVLLLCGAVFVSPSQEIHARFRRGARAENLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETEKHNVWATHACV PTDPNPQEIHLENVTEEFNMWKNNMVEQMHTDIISLWDQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNVTNNITDDMRGELKNCSFNMTT ELRDKKQKVYSLFYRLDVVQINENQGNRSNNSNKEYRLINCNTSAITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNG TGPCPSVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEVMIRSENITNNAKNILVQFNTPVQINCTRPNNNTRKSIRIGPGQAF YATGDIIGDIRQAHCNVSKATWNETLGKVVKQLRKHFGNNTIIRFANSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCNTSGLFNSTWI SNTSVQGSNSTGSNDSITLPCRIKQIINMWQRIGQAMYAPPIQGVIRCVSNITGLILTRDGGSTNSTTETFRPGGGDMRD NWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTRCKRRVVGRRRRRR ; A,C,E ? 6 'polypeptide(L)' no no ;AVGIGAVFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRAPEAQQHLLKLTVWGIKQLQARVLAVERYLRDQQ LLGIWGCSGKLICCTNVPWNSSWSNRNLSEIWDNMTWLQWDKEISNYTQIIYGLLEESQNQQEKNEQDLLALD ; ;AVGIGAVFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRAPEAQQHLLKLTVWGIKQLQARVLAVERYLRDQQ LLGIWGCSGKLICCTNVPWNSSWSNRNLSEIWDNMTWLQWDKEISNYTQIIYGLLEESQNQQEKNEQDLLALD ; B,D,F ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 12 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.005 ? 29837 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 11.736 ? 9187 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.062 ? 3602 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.014 ? 3677 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 9YIW _struct.title 'PC94-A.15 Fab in complex with BG505 SOSIP trimer and RM20A3 Fab' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9YIW _struct_keywords.text 'HIV, broadly neutralizing antibody, bnAb, V3-glycan, N332, Env, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 4 ? F N N 4 ? G N N 2 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 5 ? L N N 6 ? M N N 5 ? N N N 6 ? O N N 7 ? P N N 8 ? Q N N 9 ? R N N 7 ? 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ASN D 618 ASN D 625 1 ? 8 HELX_P HELX_P31 AD4 THR L 116 ? ILE L 124 ? THR D 627 ILE D 635 1 ? 9 HELX_P HELX_P32 AD5 TYR L 127 ? LEU L 152 ? TYR D 638 LEU D 663 1 ? 26 HELX_P HELX_P33 AD6 ASN M 103 ? LYS M 122 ? ASN E 98 LYS E 117 1 ? 20 HELX_P HELX_P34 AD7 LYS M 339 ? GLY M 358 ? LYS E 335 GLY E 354 1 ? 20 HELX_P HELX_P35 AD8 ASP M 372 ? THR M 377 ? ASP E 368 THR E 373 1 ? 6 HELX_P HELX_P36 AD9 TRP M 430 ? ARG M 432 ? TRP E 427 ARG E 429 5 ? 3 HELX_P HELX_P37 AE1 ASP M 477 ? SER M 484 ? ASP E 474 SER E 481 1 ? 8 HELX_P HELX_P38 AE2 THR N 25 ? ASN N 32 ? THR F 536 ASN F 543 1 ? 8 HELX_P HELX_P39 AE3 VAL N 59 ? ILE N 84 ? VAL F 570 ILE F 595 1 ? 26 HELX_P HELX_P40 AE4 ASN N 107 ? ASN N 114 ? ASN F 618 ASN F 625 1 ? 8 HELX_P HELX_P41 AE5 THR N 116 ? ILE N 124 ? THR F 627 ILE F 635 1 ? 9 HELX_P HELX_P42 AE6 TYR N 127 ? LEU N 152 ? 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