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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.0846 ? 17866 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0876 ? 1996 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0104 ? 2268 ? f_plane_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.1568 ? 1928 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? # loop_ _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details 1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_1 2.12431434504e-10 ? ? ? 'NCS constraints' F C ? ? ? ? 2 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_2 2.21599657024e-11 ? ? ? 'NCS constraints' G B ? ? ? ? 3 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_3 3.15709829033e-13 ? ? ? 'NCS constraints' B L ? ? ? ? 4 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_4 6.6090143272e-13 ? ? ? 'NCS constraints' A H ? ? ? ? 5 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_5 8.71061971116e-14 ? ? ? 'NCS constraints' J A ? ? ? ? 6 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_6 7.0442604173e-14 ? ? ? 'NCS constraints' N B ? ? ? ? # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] _struct_ncs_oper.details 1 given -0.999999982863 3.83053813853e-05 -0.000181124648353 -3.83516462647e-05 -0.999999966641 0.000255434588164 -0.000181114857792 0.000255441530215 0.999999950974 425.025305181 424.960788372 -0.020966941932 ? 2 given -0.999999983687 -3.60189745417e-05 -0.000176998860246 3.59758655712e-05 -0.999999969694 0.000243552222114 -0.000177007627383 0.000243545850454 0.999999954677 425.040330882 424.947522137 -0.00935190197987 ? 3 given -1.0 0.0 0.0 0.0 -1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 424.999 425.001 0.0 ? 4 given -1.0 0.0 0.0 0.0 -1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 424.999 425.001 0.0 ? 5 given -1.0 0.0 0.0 0.0 -1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 424.999 425.001 0.0 ? 6 given -1.0 0.0 0.0 0.0 -1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 424.999 425.001 0.0 ? # loop_ _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details ens_1 d_1 ;chain "C" ; ens_1 d_2 ;chain "A" ; ens_2 d_1 ;chain "B" ; ens_2 d_2 ;chain "D" ; ens_3 d_1 ;chain "L" ; ens_3 d_2 ;chain "E" ; ens_4 d_1 ;chain "H" ; ens_4 d_2 ;chain "F" ; ens_5 d_1 ;chain "G" ; ens_5 d_2 ;chain "J" ; ens_6 d_1 ;chain "M" ; ens_6 d_2 ;chain "K" ; # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details ens_1 d_1 1 F GLU 19 . F ARG 387 . C GLU 1 C ARG 369 ? ? ens_1 d_1 2 K NAG . . K NAG . . C NAG 701 C NAG 701 ? ? ens_1 d_2 1 C GLU 19 . C ARG 387 . A GLU 1 A ARG 369 ? ? ens_1 d_2 2 I NAG . . I NAG . . A NAG 701 A NAG 701 ? ? ens_2 d_1 1 G ILE 388 . G GLN 623 . B ILE 370 B GLN 605 ? ? ens_2 d_2 1 H ILE 388 . H GLN 623 . D ILE 370 D GLN 605 ? ? ens_3 d_1 1 B ASP 1 . B ILE 106 . L ASP 1 L ILE 106 ? ? ens_3 d_2 1 E ASP 1 . E ILE 106 . E ASP 1 E ILE 106 ? ? ens_4 d_1 1 A GLN 1 . A SER 117 . H GLN 1 H SER 117 ? ? ens_4 d_2 1 D GLN 1 . D SER 117 . F GLN 1 F SER 117 ? ? ens_5 d_1 1 J NAG . . J NAG . . A NAG 702 A NAG 702 ? ? ens_5 d_1 2 M NAG . . M NAG . . B NAG 1801 B NAG 1801 ? ? ens_5 d_2 1 L NAG . . L NAG . . C NAG 702 C NAG 702 ? ? ens_5 d_2 2 O NAG . . O NAG . . D NAG 1801 D NAG 1801 ? ? ens_6 d_1 1 N NAG . . N NAG . . B NAG 1802 B NAG 1802 ? ? ens_6 d_2 1 P NAG . . P NAG . . D NAG 1802 D NAG 1802 ? ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details ens_1 ? ens_2 ? ens_3 ? ens_4 ? ens_5 ? ens_6 ? # loop_ _struct_ncs_ens_gen.ens_id _struct_ncs_ens_gen.dom_id_1 _struct_ncs_ens_gen.dom_id_2 _struct_ncs_ens_gen.oper_id ens_1 d_2 d_1 1 ens_2 d_2 d_1 2 ens_3 d_2 d_1 3 ens_4 d_2 d_1 4 ens_5 d_2 d_1 5 ens_6 d_2 d_1 6 # _struct.entry_id 9YRB _struct.title 'Factor XIa in complex with Fab fragment of REGN7508-Cat' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9YRB _struct_keywords.text 'Coagulation, protease, BLOOD CLOTTING' _struct_keywords.pdbx_keywords 'BLOOD CLOTTING' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 3 ? H N N 3 ? I N N 4 ? J N N 4 ? K N N 4 ? L N N 4 ? M N N 4 ? N N N 4 ? O N N 4 ? P N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 9YRB 9YRB ? 1 ? 1 2 PDB 9YRB 9YRB ? 2 ? 1 3 UNP FA11_HUMAN P03951 ? 3 ;MIFLYQVVHFILFTSVSGECVTQLLKDTCFEGGDITTVFTPSAKYCQVVCTYHPRCLLFTFTAESPSEDPTRWFTCVLKD SVTETLPRVNRTAAISGYSFKQCSHQISACNKDIYVDLDMKGINYNSSVAKSAQECQERCTDDVHCHFFTYATRQFPSLE HRNICLLKHTQTGTPTRITKLDKVVSGFSLKSCALSNLACIRDIFPNTVFADSNIDSVMAPDAFVCGRICTHHPGCLFFT FFSQEWPKESQRNLCLLKTSESGLPSTRIKKSKALSGFSLQSCRHSIPVFCHSSFYHDTDFLGEELDIVAAKSHEACQKL CTNAVRCQFFTYTPAQASCNEGKGKCYLKLSSNGSPTKILHGRGGISGYTLRLCKMDNECTTKIKPRIVGGTASVRGEWP WQVTLHTTSPTQRHLCGGSIIGNQWILTAAHCFYGVESPKILRVYSGILNQSEIKEDTSFFGVQEIIIHDQYKMAESGYD IALLKLETTVNYTDSQRPICLPSKGDRNVIYTDCWVTGWGYRKLRDKIQNTLQKAKIPLVTNEECQKRYRGHKITHKMIC AGYREGGKDACKGDSGGPLSCKHNEVWHLVGITSWGEGCAQRERPGVYTNVVEYVDWILEKTQAV ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9YRB H 1 ? 234 ? 9YRB 1 ? 234 ? 1 234 2 2 9YRB L 1 ? 214 ? 9YRB 1 ? 214 ? 1 214 3 3 9YRB A 1 ? 625 ? P03951 1 ? 625 ? -17 607 4 1 9YRB F 1 ? 234 ? 9YRB 1 ? 234 ? 1 234 5 2 9YRB E 1 ? 214 ? 9YRB 1 ? 214 ? 1 214 6 3 9YRB C 1 ? 625 ? P03951 1 ? 625 ? -17 607 7 3 9YRB B 1 ? 625 ? P03951 1 ? 625 ? -17 607 8 3 9YRB D 1 ? 625 ? P03951 1 ? 625 ? -17 607 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 28 ? TYR A 32 ? THR H 28 TYR H 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 62 ? LYS A 65 ? ASP H 62 LYS H 65 5 ? 4 HELX_P HELX_P3 AA3 ARG A 87 ? THR A 91 ? ARG H 87 THR H 91 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 AA4 SER C 42 ? HIS C 53 ? SER A 24 HIS A 35 1 ? 12 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP C 69 ? TRP C 73 ? ASP A 51 TRP A 55 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 SER C 132 ? ASP C 142 ? SER A 114 ASP A 124 1 ? 11 HELX_P HELX_P7 AA7 ASP C 222 ? HIS C 233 ? ASP A 204 HIS A 215 1 ? 12 HELX_P HELX_P8 AA8 SER C 313 ? ALA C 324 ? SER A 295 ALA A 306 1 ? 12 HELX_P HELX_P9 AA9 LEU C 371 ? LYS C 375 ? LEU A 353 LYS A 357 5 ? 5 HELX_P HELX_P10 AB1 THR D 28 ? TYR D 32 ? THR F 28 TYR F 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 ASP D 62 ? LYS D 65 ? ASP F 62 LYS F 65 5 ? 4 HELX_P HELX_P12 AB3 ARG D 87 ? THR D 91 ? ARG F 87 THR F 91 5 ? 5 HELX_P HELX_P13 AB4 SER F 42 ? HIS F 53 ? SER C 24 HIS C 35 1 ? 12 HELX_P HELX_P14 AB5 ASP F 69 ? TRP F 73 ? ASP C 51 TRP C 55 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 SER F 132 ? ASP F 142 ? SER C 114 ASP C 124 1 ? 11 HELX_P HELX_P16 AB7 ASP F 222 ? HIS F 233 ? ASP C 204 HIS C 215 1 ? 12 HELX_P HELX_P17 AB8 SER F 313 ? ALA F 324 ? SER C 295 ALA C 306 1 ? 12 HELX_P HELX_P18 AB9 LEU F 371 ? LYS F 375 ? LEU C 353 LYS C 357 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 AC1 ALA G 429 ? PHE G 433 ? ALA B 411 PHE B 415 5 ? 5 HELX_P HELX_P20 AC2 SER G 438 ? LYS G 440 ? SER B 420 LYS B 422 5 ? 3 HELX_P HELX_P21 AC3 ASN G 450 ? ILE G 454 ? ASN B 432 ILE B 436 5 ? 5 HELX_P HELX_P22 AC4 MET G 474 ? GLY G 478 ? MET B 456 GLY B 460 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 SER G 503 ? ARG G 507 ? SER B 485 ARG B 489 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 AC6 THR G 541 ? TYR G 549 ? THR B 523 TYR B 531 1 ? 9 HELX_P HELX_P25 AC7 ASN G 610 ? GLN G 623 ? ASN B 592 GLN B 605 1 ? 14 HELX_P HELX_P26 AC8 ALA H 429 ? PHE H 433 ? ALA D 411 PHE D 415 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 AC9 SER H 438 ? LYS H 440 ? SER D 420 LYS D 422 5 ? 3 HELX_P HELX_P28 AD1 ASN H 450 ? ILE H 454 ? ASN D 432 ILE D 436 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 AD2 MET H 474 ? GLY H 478 ? MET D 456 GLY D 460 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 AD3 SER H 503 ? ARG H 507 ? SER D 485 ARG D 489 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 AD4 THR H 541 ? TYR H 549 ? THR D 523 TYR D 531 1 ? 9 HELX_P HELX_P32 AD5 ASN H 610 ? GLN H 623 ? ASN D 592 GLN D 605 1 ? 14 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 22 SG ? ? ? 1_555 A CYS 96 SG ? ? H CYS 22 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 23 SG ? ? ? 1_555 B CYS 88 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf3 disulf ? ? C CYS 20 SG ? ? ? 1_555 C CYS 103 SG ? ? A CYS 2 A CYS 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf4 disulf ? ? C CYS 46 SG ? ? ? 1_555 C CYS 76 SG ? ? A CYS 28 A CYS 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? ? disulf5 disulf ? ? C CYS 50 SG ? ? ? 1_555 C CYS 56 SG ? ? A CYS 32 A CYS 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf6 disulf ? ? C CYS 110 SG ? ? ? 1_555 C CYS 193 SG ? ? A CYS 92 A CYS 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf7 disulf ? ? C CYS 136 SG ? ? ? 1_555 C CYS 165 SG ? ? A CYS 118 A CYS 147 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf8 disulf ? ? C CYS 140 SG ? ? ? 1_555 C CYS 146 SG ? ? A CYS 122 A CYS 128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf9 disulf ? ? C CYS 200 SG ? ? ? 1_555 C CYS 283 SG ? ? A CYS 182 A CYS 265 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf10 disulf ? ? C CYS 226 SG ? ? ? 1_555 C CYS 255 SG ? ? A CYS 208 A CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? ? disulf11 disulf ? ? C CYS 230 SG ? ? ? 1_555 C CYS 236 SG ? ? A CYS 212 A CYS 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf12 disulf ? ? C CYS 291 SG ? ? ? 1_555 C CYS 374 SG ? ? A CYS 273 A CYS 356 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf13 disulf ? ? C CYS 317 SG ? ? ? 1_555 C CYS 346 SG ? ? A CYS 299 A CYS 328 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf14 disulf ? ? C CYS 321 SG ? ? ? 1_555 C CYS 327 SG ? ? A CYS 303 A CYS 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf15 disulf ? ? C CYS 380 SG ? ? ? 1_555 G CYS 500 SG ? ? A CYS 362 B CYS 482 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf16 disulf ? ? D CYS 22 SG ? ? ? 1_555 D CYS 96 SG ? ? F CYS 22 F CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? ? disulf17 disulf ? ? E CYS 23 SG ? ? ? 1_555 E CYS 88 SG ? ? E CYS 23 E CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf18 disulf ? ? F CYS 20 SG ? ? ? 1_555 F CYS 103 SG ? ? C CYS 2 C CYS 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf19 disulf ? ? 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