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None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 TRP 193 A . ? TRP 193 A PRO 194 A ? PRO 194 A 1 3.11 2 TRP 193 B . ? TRP 193 B PRO 194 B ? PRO 194 B 1 3.12 3 TRP 193 C . ? TRP 193 C PRO 194 C ? PRO 194 C 1 3.16 4 TRP 193 D . ? TRP 193 D PRO 194 D ? PRO 194 D 1 3.12 5 TRP 193 E . ? TRP 193 E PRO 194 E ? PRO 194 E 1 3.09 6 TRP 193 F . ? TRP 193 F PRO 194 F ? PRO 194 F 1 3.01 7 TRP 193 G . ? TRP 193 G PRO 194 G ? PRO 194 G 1 3.16 8 TRP 193 H . ? TRP 193 H PRO 194 H ? PRO 194 H 1 3.13 9 TRP 193 I . ? TRP 193 I PRO 194 I ? PRO 194 I 1 3.07 10 TRP 193 J . ? TRP 193 J PRO 194 J ? PRO 194 J 1 3.10 11 TRP 193 K . ? TRP 193 K PRO 194 K ? PRO 194 K 1 3.08 12 TRP 193 L . ? TRP 193 L PRO 194 L ? PRO 194 L 1 3.05 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 3 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 53 ? CYS A 54 ? VAL A 53 CYS A 54 AA1 2 VAL A 199 ? PHE A 202 ? VAL A 199 PHE A 202 AA1 3 LEU A 187 ? CYS A 190 ? LEU A 187 CYS A 190 AA2 1 VAL B 53 ? CYS B 54 ? VAL B 53 CYS B 54 AA2 2 VAL B 199 ? PHE B 202 ? VAL B 199 PHE B 202 AA2 3 LEU B 187 ? CYS B 190 ? LEU B 187 CYS B 190 AA3 1 VAL C 53 ? CYS C 54 ? VAL C 53 CYS C 54 AA3 2 VAL C 199 ? PHE C 202 ? VAL C 199 PHE C 202 AA3 3 LEU C 187 ? CYS C 190 ? LEU C 187 CYS C 190 AA4 1 VAL D 53 ? CYS D 54 ? VAL D 53 CYS D 54 AA4 2 VAL D 199 ? PHE D 202 ? VAL D 199 PHE D 202 AA4 3 LEU D 187 ? CYS D 190 ? LEU D 187 CYS D 190 AA5 1 VAL E 53 ? CYS E 54 ? VAL E 53 CYS E 54 AA5 2 VAL E 199 ? PHE E 202 ? VAL E 199 PHE E 202 AA5 3 LEU E 187 ? CYS E 190 ? LEU E 187 CYS E 190 AA6 1 VAL F 53 ? CYS F 54 ? VAL F 53 CYS F 54 AA6 2 VAL F 199 ? PHE F 202 ? VAL F 199 PHE F 202 AA6 3 LEU F 187 ? CYS F 190 ? LEU F 187 CYS F 190 AA7 1 VAL G 53 ? CYS G 54 ? VAL G 53 CYS G 54 AA7 2 VAL G 199 ? PHE G 202 ? VAL G 199 PHE G 202 AA7 3 LEU G 187 ? CYS G 190 ? LEU G 187 CYS G 190 AA8 1 VAL H 53 ? CYS H 54 ? VAL H 53 CYS H 54 AA8 2 VAL H 199 ? PHE H 202 ? VAL H 199 PHE H 202 AA8 3 LEU H 187 ? CYS H 190 ? LEU H 187 CYS H 190 AA9 1 VAL I 53 ? CYS I 54 ? VAL I 53 CYS I 54 AA9 2 VAL I 199 ? PHE I 202 ? VAL I 199 PHE I 202 AA9 3 LEU I 187 ? CYS I 190 ? LEU I 187 CYS I 190 AB1 1 VAL J 53 ? CYS J 54 ? VAL J 53 CYS J 54 AB1 2 VAL J 199 ? PHE J 202 ? VAL J 199 PHE J 202 AB1 3 LEU J 187 ? CYS J 190 ? LEU J 187 CYS J 190 AB2 1 VAL K 53 ? CYS K 54 ? VAL K 53 CYS K 54 AB2 2 VAL K 199 ? PHE K 202 ? VAL K 199 PHE K 202 AB2 3 LEU K 187 ? CYS K 190 ? LEU K 187 CYS K 190 AB3 1 VAL L 53 ? CYS L 54 ? VAL L 53 CYS L 54 AB3 2 VAL L 199 ? PHE L 202 ? VAL L 199 PHE L 202 AB3 3 LEU L 187 ? CYS L 190 ? LEU L 187 CYS L 190 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N VAL A 53 ? N VAL A 53 O PHE A 202 ? O PHE A 202 AA1 2 3 O CYS A 201 ? O CYS A 201 N TYR A 188 ? N TYR A 188 AA2 1 2 N VAL B 53 ? N VAL B 53 O PHE B 202 ? O PHE B 202 AA2 2 3 O CYS B 201 ? O CYS B 201 N TYR B 188 ? N TYR B 188 AA3 1 2 N VAL C 53 ? N VAL C 53 O PHE C 202 ? O PHE C 202 AA3 2 3 O CYS C 201 ? O CYS C 201 N TYR C 188 ? N TYR C 188 AA4 1 2 N VAL D 53 ? N VAL D 53 O PHE D 202 ? O PHE D 202 AA4 2 3 O CYS D 201 ? O CYS D 201 N TYR D 188 ? N TYR D 188 AA5 1 2 N VAL E 53 ? N VAL E 53 O PHE E 202 ? O PHE E 202 AA5 2 3 O CYS E 201 ? O CYS E 201 N TYR E 188 ? N TYR E 188 AA6 1 2 N VAL F 53 ? N VAL F 53 O PHE F 202 ? O PHE F 202 AA6 2 3 O CYS F 201 ? O CYS F 201 N TYR F 188 ? N TYR F 188 AA7 1 2 N VAL G 53 ? N VAL G 53 O PHE G 202 ? O PHE G 202 AA7 2 3 O CYS G 201 ? O CYS G 201 N TYR G 188 ? N TYR G 188 AA8 1 2 N VAL H 53 ? N VAL H 53 O PHE H 202 ? O PHE H 202 AA8 2 3 O CYS H 201 ? O CYS H 201 N TYR H 188 ? N TYR H 188 AA9 1 2 N VAL I 53 ? N VAL I 53 O PHE I 202 ? O PHE I 202 AA9 2 3 O CYS I 201 ? O CYS I 201 N TYR I 188 ? N TYR I 188 AB1 1 2 N VAL J 53 ? N VAL J 53 O PHE J 202 ? O PHE J 202 AB1 2 3 O CYS J 201 ? O CYS J 201 N TYR J 188 ? N TYR J 188 AB2 1 2 N VAL K 53 ? N VAL K 53 O PHE K 202 ? O PHE K 202 AB2 2 3 O CYS K 201 ? O CYS K 201 N TYR K 188 ? N TYR K 188 AB3 1 2 N VAL L 53 ? N VAL L 53 O PHE L 202 ? O PHE L 202 AB3 2 3 O CYS L 201 ? O CYS L 201 N TYR L 188 ? N TYR L 188 # _pdbx_entry_details.entry_id 9Z9B _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest N _pdbx_entry_details.has_protein_modification Y # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 ASP A 47 ? ? -96.11 31.43 2 1 ASN A 197 ? ? 55.72 -128.91 3 1 ASP B 47 ? ? -96.14 31.45 4 1 ASN B 197 ? ? 55.72 -128.91 5 1 ASP C 47 ? ? -96.15 31.46 6 1 ASN C 197 ? ? 55.71 -128.92 7 1 ASP D 47 ? ? -96.12 31.41 8 1 ASN D 197 ? ? 55.73 -128.95 9 1 ASP E 47 ? ? -96.07 31.39 10 1 ASN E 197 ? ? 55.73 -128.90 11 1 ASP F 47 ? ? -96.13 31.43 12 1 ASN F 197 ? ? 55.67 -128.89 13 1 ASP G 47 ? ? -96.05 31.43 14 1 ASN G 197 ? ? 55.72 -128.92 15 1 ASP H 47 ? ? -96.15 31.51 16 1 ASN H 197 ? ? 55.75 -128.93 17 1 ASP I 47 ? ? -96.10 31.46 18 1 ASN I 197 ? ? 55.72 -128.93 19 1 ASP J 47 ? ? -96.16 31.42 20 1 ASN J 197 ? ? 55.76 -128.91 21 1 ASP K 47 ? ? -96.11 31.42 22 1 ASN K 197 ? ? 55.75 -128.95 23 1 ASP L 47 ? ? -96.12 31.39 24 1 ASN L 197 ? ? 55.67 -128.89 # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 9Z9B _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' # _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 7jjp _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id ? _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.details ? _em_3d_fitting_list.chain_id ? _em_3d_fitting_list.chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.source_name PDB _em_3d_fitting_list.type 'experimental model' _em_3d_fitting_list.accession_code 7jjp _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 # _em_3d_reconstruction.entry_id 9Z9B _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 2.7 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 15342 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.4 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source NATURAL _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.name 'Gated state dodecameric connexin-50 gap junction in DMPC nanodiscs at neutral pH' _em_entity_assembly.details ;Connexin-46 and connexin-50 coassemble in the gap junction complex and arrangement cannot be disentangled. Thus both isoforms are individually modeled into the same gap junction density. ; _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list 1 # _em_imaging.entry_id 9Z9B _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'TFS KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_min 500 _em_imaging.nominal_defocus_max 1800 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification 105000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen ? _em_imaging.objective_aperture ? _em_imaging.microscope_serial_number ? _em_imaging.microscope_version ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.method ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 400 _em_sample_support.grid_type Quantifoil _em_sample_support.details ? _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.entry_id 9Z9B _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 9Z9B _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 9Z9B _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry D6 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? 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A SER 134 34 1 Y 1 A VAL 135 ? A VAL 135 35 1 Y 1 A LYS 136 ? A LYS 136 36 1 Y 1 A LYS 137 ? A LYS 137 37 1 Y 1 A SER 138 ? A SER 138 38 1 Y 1 A SER 139 ? A SER 139 39 1 Y 1 A SER 140 ? A SER 140 40 1 Y 1 A SER 141 ? A SER 141 41 1 Y 1 A SER 142 ? A SER 142 42 1 Y 1 A LYS 143 ? A LYS 143 43 1 Y 1 A GLY 144 ? A GLY 144 44 1 Y 1 A THR 145 ? A THR 145 45 1 Y 1 A LYS 146 ? A LYS 146 46 1 Y 1 A LYS 147 ? A LYS 147 47 1 Y 1 A PHE 148 ? A PHE 148 48 1 Y 1 A ARG 149 ? A ARG 149 49 1 Y 1 A LEU 150 ? A LEU 150 50 1 Y 1 A GLU 151 ? A GLU 151 51 1 Y 1 A GLY 235 ? A GLY 235 52 1 Y 1 A LEU 236 ? A LEU 236 53 1 Y 1 A LYS 237 ? A LYS 237 54 1 Y 1 A LYS 238 ? A LYS 238 55 1 Y 1 A ILE 239 ? A ILE 239 56 1 Y 1 A ARG 240 ? A ARG 240 57 1 Y 1 A SER 241 ? A SER 241 58 1 Y 1 A ALA 242 ? A ALA 242 59 1 Y 1 A PHE 243 ? A PHE 243 60 1 Y 1 A LYS 244 ? A LYS 244 61 1 Y 1 A ARG 245 ? A ARG 245 62 1 Y 1 A PRO 246 ? A PRO 246 63 1 Y 1 A VAL 247 ? A VAL 247 64 1 Y 1 A GLU 248 ? A GLU 248 65 1 Y 1 A GLN 249 ? 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