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_refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'REAL-SPACE (WEIGHTED MAP SUM AT ATOM CENTERS)' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.516 ? 28920 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 10.240 ? 8040 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.042 ? 3108 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 3900 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 9ZHQ _struct.title 'Cryo-EM structure of IGFBP7 dodecamer.' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9ZHQ _struct_keywords.text 'IGFBP7, cell adhesion' _struct_keywords.pdbx_keywords 'CELL ADHESION' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 1 ? 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ALA E 268 ILE E 272 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 AB7 GLU D 36 ? CYS D 40 ? GLU F 36 CYS F 40 5 ? 5 HELX_P HELX_P17 AB8 LYS D 97 ? ALA D 101 ? LYS F 97 ALA F 101 5 ? 5 HELX_P HELX_P18 AB9 SER D 129 ? GLY D 144 ? SER F 129 GLY F 144 1 ? 16 HELX_P HELX_P19 AC1 SER D 239 ? ALA D 243 ? SER F 239 ALA F 243 5 ? 5 HELX_P HELX_P20 AC2 ALA D 268 ? ILE D 272 ? ALA F 268 ILE F 272 5 ? 5 HELX_P HELX_P21 AC3 GLU E 36 ? CYS E 40 ? GLU G 36 CYS G 40 5 ? 5 HELX_P HELX_P22 AC4 GLY E 74 ? ARG E 78 ? GLY G 74 ARG G 78 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 LYS E 97 ? ALA E 102 ? LYS G 97 ALA G 102 1 ? 6 HELX_P HELX_P24 AC6 SER E 129 ? GLY E 144 ? SER G 129 GLY G 144 1 ? 16 HELX_P HELX_P25 AC7 SER E 239 ? ALA E 243 ? SER G 239 ALA G 243 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 AC8 ALA E 268 ? ILE E 272 ? ALA G 268 ILE G 272 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 AC9 LYS F 97 ? ALA F 101 ? LYS H 97 ALA H 101 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 AD1 SER F 129 ? GLY F 144 ? SER H 129 GLY H 144 1 ? 16 HELX_P HELX_P29 AD2 SER F 239 ? ALA F 243 ? SER H 239 ALA H 243 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 AD3 ALA F 268 ? ILE F 272 ? ALA H 268 ILE H 272 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 AD4 LYS G 97 ? ALA G 101 ? LYS I 97 ALA I 101 5 ? 5 HELX_P HELX_P32 AD5 SER G 129 ? GLY G 144 ? SER I 129 GLY I 144 1 ? 16 HELX_P HELX_P33 AD6 SER G 239 ? ALA G 243 ? SER I 239 ALA I 243 5 ? 5 HELX_P HELX_P34 AD7 ALA G 268 ? ILE G 272 ? ALA I 268 ILE I 272 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 AD8 LYS H 97 ? ALA H 101 ? LYS J 97 ALA J 101 5 ? 5 HELX_P HELX_P36 AD9 SER H 129 ? GLY H 144 ? SER J 129 GLY J 144 1 ? 16 HELX_P HELX_P37 AE1 SER H 239 ? ALA H 243 ? SER J 239 ALA J 243 5 ? 5 HELX_P HELX_P38 AE2 ALA H 268 ? ILE H 272 ? ALA J 268 ILE J 272 5 ? 5 HELX_P HELX_P39 AE3 GLY I 47 ? LEU I 50 ? GLY K 47 LEU K 50 5 ? 4 HELX_P HELX_P40 AE4 LYS I 97 ? ALA I 101 ? LYS K 97 ALA K 101 5 ? 5 HELX_P HELX_P41 AE5 SER I 129 ? GLY I 144 ? SER K 129 GLY K 144 1 ? 16 HELX_P HELX_P42 AE6 SER I 239 ? ALA I 243 ? SER K 239 ALA K 243 5 ? 5 HELX_P HELX_P43 AE7 ALA I 268 ? ILE I 272 ? ALA K 268 ILE K 272 5 ? 5 HELX_P HELX_P44 AE8 GLU J 36 ? CYS J 40 ? GLU L 36 CYS L 40 5 ? 5 HELX_P HELX_P45 AE9 LYS J 97 ? ALA J 101 ? LYS L 97 ALA L 101 5 ? 5 HELX_P HELX_P46 AF1 SER J 129 ? GLY J 144 ? SER L 129 GLY L 144 1 ? 16 HELX_P HELX_P47 AF2 SER J 239 ? ALA J 243 ? SER L 239 ALA L 243 5 ? 5 HELX_P HELX_P48 AF3 ALA J 268 ? ILE J 272 ? ALA L 268 ILE L 272 5 ? 5 HELX_P HELX_P49 AF4 GLY K 74 ? ARG K 78 ? GLY M 74 ARG M 78 5 ? 5 HELX_P HELX_P50 AF5 LYS K 97 ? ALA K 101 ? LYS M 97 ALA M 101 5 ? 5 HELX_P HELX_P51 AF6 SER K 129 ? GLY K 144 ? SER M 129 GLY M 144 1 ? 16 HELX_P HELX_P52 AF7 SER K 239 ? ALA K 243 ? SER M 239 ALA M 243 5 ? 5 HELX_P HELX_P53 AF8 ALA K 268 ? ILE K 272 ? ALA M 268 ILE M 272 5 ? 5 HELX_P HELX_P54 AF9 GLU L 36 ? CYS L 40 ? GLU N 36 CYS N 40 5 ? 5 HELX_P HELX_P55 AG1 LYS L 97 ? ALA L 101 ? LYS N 97 ALA N 101 5 ? 5 HELX_P HELX_P56 AG2 SER L 129 ? GLY L 144 ? SER N 129 GLY N 144 1 ? 16 HELX_P HELX_P57 AG3 SER L 239 ? ALA L 243 ? SER N 239 ALA N 243 5 ? 5 HELX_P HELX_P58 AG4 ALA L 268 ? ILE L 272 ? ALA N 268 ILE N 272 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ILE 186 A . ? ILE 186 C PRO 187 A ? PRO 187 C 1 -0.19 2 SER 236 A . ? SER 236 C PRO 237 A ? PRO 237 C 1 -1.50 3 ILE 186 B . ? ILE 186 D PRO 187 B ? PRO 187 D 1 -2.55 4 SER 236 B . ? SER 236 D PRO 237 B ? PRO 237 D 1 -1.47 5 ILE 186 C . ? ILE 186 E PRO 187 C ? 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ILE 186 N PRO 187 L ? PRO 187 N 1 3.46 24 SER 236 L . ? SER 236 N PRO 237 L ? PRO 237 N 1 -1.52 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 8 ? AA5 ? 5 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 3 ? AA9 ? 8 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 5 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 8 ? AC1 ? 5 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 3 ? AC5 ? 5 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 3 ? AC9 ? 8 ? AD1 ? 5 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 2 ? AD4 ? 5 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 2 ? AD7 ? 3 ? AD8 ? 8 ? AD9 ? 5 ? AE1 ? 3 ? AE2 ? 2 ? AE3 ? 3 ? AE4 ? 5 ? AE5 ? 2 ? AE6 ? 2 ? AE7 ? 2 ? AE8 ? 8 ? AE9 ? 4 ? AF1 ? 5 ? AF2 ? 2 ? AF3 ? 2 ? AF4 ? 3 ? AF5 ? 5 ? AF6 ? 3 ? AF7 ? 2 ? AF8 ? 3 ? AF9 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA4 6 7 ? anti-parallel AA4 7 8 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AA9 4 5 ? anti-parallel AA9 5 6 ? anti-parallel AA9 6 7 ? anti-parallel AA9 7 8 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? anti-parallel AB9 5 6 ? anti-parallel AB9 6 7 ? anti-parallel AB9 7 8 ? anti-parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC1 4 5 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC5 1 2 ? parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC6 1 2 ? parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AC9 4 5 ? anti-parallel AC9 5 6 ? anti-parallel AC9 6 7 ? anti-parallel AC9 7 8 ? anti-parallel AD1 1 2 ? parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD1 4 5 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD8 4 5 ? anti-parallel AD8 5 6 ? anti-parallel AD8 6 7 ? anti-parallel AD8 7 8 ? anti-parallel AD9 1 2 ? parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AD9 4 5 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE4 1 2 ? parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE4 4 5 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE8 3 4 ? anti-parallel AE8 4 5 ? anti-parallel AE8 5 6 ? anti-parallel AE8 6 7 ? anti-parallel AE8 7 8 ? anti-parallel AE9 1 2 ? parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AE9 3 4 ? anti-parallel AF1 1 2 ? parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? anti-parallel AF1 4 5 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF5 1 2 ? parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF5 3 4 ? anti-parallel AF5 4 5 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF8 2 3 ? anti-parallel AF9 1 2 ? parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AF9 3 4 ? anti-parallel AF9 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLU A 52 ? 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MET E 62 CYS E 63 AB3 1 MET C 85 ? VAL C 88 ? MET E 85 VAL E 88 AB3 2 VAL C 110 ? CYS C 113 ? VAL E 110 CYS E 113 AB4 1 THR C 126 ? TYR C 127 ? THR E 126 TYR E 127 AB4 2 VAL C 119 ? GLY C 121 ? VAL E 119 GLY E 121 AB4 3 GLN C 150 ? LYS C 153 ? GLN E 150 LYS E 153 AB5 1 ILE C 169 ? VAL C 172 ? ILE E 169 VAL E 172 AB5 2 GLY C 255 ? VAL C 266 ? GLY E 255 VAL E 266 AB5 3 GLY C 244 ? ASN C 252 ? GLY E 244 ASN E 252 AB5 4 VAL C 190 ? GLY C 199 ? VAL E 190 GLY E 199 AB5 5 GLY C 202 ? GLU C 207 ? GLY E 202 GLU E 207 AB6 1 GLU D 52 ? THR D 53 ? GLU F 52 THR F 53 AB6 2 MET D 62 ? CYS D 63 ? MET F 62 CYS F 63 AB7 1 MET D 85 ? VAL D 88 ? MET F 85 VAL F 88 AB7 2 VAL D 110 ? CYS D 113 ? VAL F 110 CYS F 113 AB8 1 THR D 126 ? TYR D 127 ? THR F 126 TYR F 127 AB8 2 VAL D 119 ? GLY D 121 ? VAL F 119 GLY F 121 AB8 3 GLN D 150 ? LYS D 153 ? GLN F 150 LYS F 153 AB9 1 GLN D 158 ? ILE D 162 ? GLN F 158 ILE F 162 AB9 2 VAL D 177 ? ILE D 186 ? VAL F 177 ILE F 186 AB9 3 VAL D 229 ? VAL D 235 ? 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