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E N N 5 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP IPAD_SHIFL P18013 ? 1 ;NITTLTNSISTSSFSPNNTNGSSTETVNSDIKTTTSSHPVSSLTMLNDTLHNIRTTNQALKKELSQKTLTKTSLEEIALH SSQISMDVNKSAQLLDILSRNEYPINKDARELLHSAPKEAELDGDQMISHRELWAKIANSINDINEQYLKVYEHAVSSYT QMYQDFSAVLSSLAGWISPGGNDGNSVKLQVNSLKKALEELKEKYKDKPLYPANNTVSQEQANKWLTELGGTIGKVSQKN GGYVVSINMTPIDNMLKSLDNLGGNGEVVLDNAKYQAWNAGFSAEDETMKNNLQTLVQKYSNANSIFDNLVKVLSSTISS CTDTDKLFLHF ; 2 2 PDB 9ZRS 9ZRS ? 2 ? 1 3 PDB 9ZRS 9ZRS ? 3 ? 1 4 PDB 9ZRS 9ZRS ? 4 ? 1 5 PDB 9ZRS 9ZRS ? 5 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9ZRS D 27 ? 357 ? 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'expression tag' -19 6 1 9ZRS HIS D 7 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' -18 7 1 9ZRS GLY D 8 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' -17 8 1 9ZRS LEU D 9 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' -16 9 1 9ZRS ASN D 10 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' -15 10 1 9ZRS ASP D 11 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' -14 11 1 9ZRS ILE D 12 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' -13 12 1 9ZRS PHE D 13 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' -12 13 1 9ZRS GLU D 14 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' -11 14 1 9ZRS ALA D 15 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' -10 15 1 9ZRS GLN D 16 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' -9 16 1 9ZRS LYS D 17 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' -8 17 1 9ZRS ILE D 18 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' -7 18 1 9ZRS GLU D 19 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' -6 19 1 9ZRS TRP D 20 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' -5 20 1 9ZRS HIS D 21 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' -4 21 1 9ZRS GLU D 22 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' -3 22 1 9ZRS GLY D 23 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' -2 23 1 9ZRS SER D 24 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' -1 24 1 9ZRS GLY D 25 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' 0 25 1 9ZRS SER D 26 ? UNP P18013 ? ? 'expression tag' 1 26 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 68 ? LEU A 90 ? SER D 43 LEU D 65 1 ? 23 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 96 ? GLN A 119 ? THR D 71 GLN D 94 1 ? 24 HELX_P HELX_P3 AA3 LYS A 162 ? GLN A 173 ? LYS D 137 GLN D 148 1 ? 12 HELX_P HELX_P4 AA4 LEU A 175 ? SER A 183 ? LEU D 150 SER D 158 1 ? 9 HELX_P HELX_P5 AA5 SER A 184 ? GLY A 201 ? SER D 159 GLY D 176 1 ? 18 HELX_P HELX_P6 AA6 SER A 219 ? ALA A 223 ? SER D 194 ALA D 198 1 ? 5 HELX_P HELX_P7 AA7 LEU A 224 ? GLU A 229 ? LEU D 199 GLU D 204 1 ? 6 HELX_P HELX_P8 AA8 SER A 244 ? LEU A 255 ? SER D 219 LEU D 230 1 ? 12 HELX_P HELX_P9 AA9 MET A 275 ? LYS A 283 ? MET D 250 LYS D 258 1 ? 9 HELX_P HELX_P10 AB1 GLN A 302 ? SER A 345 ? GLN D 277 SER D 320 1 ? 44 HELX_P HELX_P11 AB2 THR B 87 ? THR B 91 ? THR H 83 THR H 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 AB3 GLU C 84 ? VAL C 88 ? GLU L 79 VAL L 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P13 AB4 PRO D 63 ? LYS D 66 ? PRO O 61 LYS O 64 5 ? 4 HELX_P HELX_P14 AB5 THR D 88 ? THR D 92 ? THR O 83 THR O 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 GLN E 79 ? PHE E 83 ? GLN P 79 PHE P 83 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? B CYS 22 SG ? ? ? 1_555 B CYS 96 SG ? ? H CYS 22 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? ? disulf2 disulf ? ? C CYS 23 SG ? ? ? 1_555 C CYS 93 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf3 disulf ? ? D CYS 22 SG ? ? ? 1_555 D CYS 97 SG ? ? O CYS 22 O CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf4 disulf ? ? E CYS 23 SG ? ? ? 1_555 E CYS 88 SG ? ? P CYS 23 P CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 CYS B 22 ? CYS B 96 ? CYS H 22 ? 1_555 CYS H 92 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 2 CYS C 23 ? CYS C 93 ? CYS L 23 ? 1_555 CYS L 88 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 3 CYS D 22 ? CYS D 97 ? CYS O 22 ? 1_555 CYS O 92 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 4 CYS E 23 ? CYS E 88 ? CYS P 23 ? 1_555 CYS P 88 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 7 C . ? SER 7 L PRO 8 C ? PRO 8 L 1 -3.75 2 LEU 99 C . ? LEU 94 L PRO 100 C ? PRO 95 L 1 -2.91 3 SER 7 E . ? SER 7 P PRO 8 E ? PRO 8 P 1 -4.82 4 TYR 94 E . ? TYR 94 P PRO 95 E ? PRO 95 P 1 3.67 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 5 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLY A 260 ? LYS A 265 ? GLY D 235 LYS D 240 AA1 2 GLY A 268 ? ILE A 273 ? GLY D 243 ILE D 248 AA2 1 GLN B 3 ? SER B 7 ? GLN H 3 SER H 7 AA2 2 LEU B 18 ? SER B 25 ? LEU H 18 SER H 25 AA2 3 GLN B 78 ? LEU B 83 ? GLN H 77 LEU H 82 AA2 4 VAL B 68 ? ASP B 73 ? VAL H 67 ASP H 72 AA3 1 THR B 58 ? TYR B 60 ? THR H 57 TYR H 59 AA3 2 GLU B 46 ? TYR B 52 ? GLU H 46 TYR H 52 AA3 3 TYR B 33 ? GLN B 39 ? TYR H 33 GLN H 39 AA3 4 VAL B 93 ? ARG B 98 ? VAL H 89 ARG H 94 AA3 5 VAL B 110 ? LEU B 111 ? VAL H 106 LEU H 107 AA4 1 MET C 4 ? SER C 7 ? MET L 4 SER L 7 AA4 2 ALA C 19 ? SER C 25 ? ALA L 19 SER L 25 AA4 3 ASP C 75 ? ILE C 80 ? ASP L 70 ILE L 75 AA4 4 PHE C 67 ? ALA C 72 ? PHE L 62 ALA L 67 AA5 1 SER C 10 ? SER C 12 ? SER L 10 SER L 12 AA5 2 THR C 107 ? ASP C 110 ? THR L 102 ASP L 105 AA5 3 VAL C 90 ? GLN C 95 ? VAL L 85 GLN L 90 AA5 4 LEU C 38 ? ARG C 44 ? LEU L 33 ARG L 39 AA5 5 GLN C 47 ? TYR C 54 ? GLN L 42 TYR L 49 AA5 6 ASP C 58 ? ARG C 59 ? ASP L 53 ARG L 54 AA6 1 GLU D 6 ? SER D 7 ? GLU O 6 SER O 7 AA6 2 LEU D 18 ? ALA D 23 ? LEU O 18 ALA O 23 AA6 3 GLN D 79 ? LEU D 84 ? GLN O 77 LEU O 82 AA6 4 VAL D 69 ? ASP D 74 ? VAL O 67 ASP O 72 AA7 1 THR D 59 ? TYR D 61 ? THR O 57 TYR O 59 AA7 2 GLU D 47 ? ILE D 52 ? GLU O 46 ILE O 51 AA7 3 TRP D 34 ? GLN D 40 ? TRP O 34 GLN O 39 AA7 4 ILE D 94 ? HIS D 100 ? ILE O 89 HIS O 95 AA7 5 VAL D 113 ? VAL D 114 ? VAL O 107 VAL O 108 AA8 1 MET E 4 ? SER E 7 ? MET P 4 SER P 7 AA8 2 VAL E 19 ? ALA E 25 ? VAL P 19 ALA P 25 AA8 3 GLU E 70 ? ILE E 75 ? GLU P 70 ILE P 75 AA8 4 PHE E 62 ? SER E 65 ? PHE P 62 SER P 65 AA9 1 LEU E 11 ? PHE E 12 ? LEU P 11 PHE P 12 AA9 2 VAL E 104 ? GLU E 105 ? VAL P 104 GLU P 105 AB1 1 SER E 53 ? LEU E 54 ? SER P 53 LEU P 54 AB1 2 LYS E 45 ? TYR E 49 ? LYS P 45 TYR P 49 AB1 3 TRP E 35 ? GLN E 38 ? TRP P 35 GLN P 38 AB1 4 THR E 85 ? TYR E 87 ? THR P 85 TYR P 87 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N SER A 263 ? N SER D 238 O VAL A 270 ? O VAL D 245 AA2 1 2 N SER B 7 ? N SER H 7 O THR B 21 ? O THR H 21 AA2 2 3 N LEU B 18 ? N LEU H 18 O LEU B 83 ? O LEU H 82 AA2 3 4 O ASN B 82 ? O ASN H 81 N THR B 69 ? N THR H 68 AA3 1 2 O GLY B 59 ? O GLY H 58 N PHE B 50 ? N PHE H 50 AA3 2 3 O ILE B 51 ? O ILE H 51 N TRP B 34 ? N TRP H 34 AA3 3 4 N THR B 35 ? N THR H 35 O VAL B 97 ? O VAL H 93 AA3 4 5 N TYR B 94 ? N TYR H 90 O VAL B 110 ? O VAL H 106 AA4 1 2 N THR C 5 ? N THR L 5 O VAL C 24 ? O VAL L 24 AA4 2 3 N ILE C 21 ? N ILE L 21 O LEU C 78 ? O LEU L 73 AA4 3 4 O LYS C 79 ? O LYS L 74 N ARG C 68 ? N ARG L 63 AA5 1 2 N LEU C 11 ? N LEU L 11 O LYS C 108 ? O LYS L 103 AA5 2 3 O THR C 107 ? O THR L 102 N TYR C 91 ? N TYR L 86 AA5 3 4 O GLY C 94 ? O GLY L 89 N ALA C 39 ? N ALA L 34 AA5 4 5 N TRP C 40 ? N TRP L 35 O ILE C 53 ? O ILE L 48 AA5 5 6 N TYR C 54 ? N TYR L 49 O ASP C 58 ? O ASP L 53 AA6 1 2 N SER D 7 ? N SER O 7 O THR D 21 ? O THR O 21 AA6 2 3 N LEU D 18 ? N LEU O 18 O LEU D 84 ? O LEU O 82 AA6 3 4 O GLN D 79 ? O GLN O 77 N ASP D 74 ? N ASP O 72 AA7 1 2 O TYR D 60 ? O TYR O 58 N ASN D 51 ? N ASN O 50 AA7 2 3 O ILE D 52 ? O ILE O 51 N TRP D 35 ? N TRP O 35 AA7 3 4 N ILE D 38 ? N ILE O 37 O TYR D 96 ? O TYR O 91 AA7 4 5 N TYR D 95 ? N TYR O 90 O VAL D 113 ? O VAL O 107 AA8 1 2 N SER E 7 ? N SER P 7 O THR E 22 ? O THR P 22 AA8 2 3 N CYS E 23 ? N CYS P 23 O PHE E 71 ? O PHE P 71 AA8 3 4 O THR E 72 ? O THR P 72 N SER E 65 ? N SER P 65 AA9 1 2 N LEU E 11 ? N LEU P 11 O GLU E 105 ? O GLU P 105 AB1 1 2 O SER E 53 ? O SER P 53 N TYR E 49 ? N TYR P 49 AB1 2 3 O LEU E 47 ? O LEU P 47 N TRP E 35 ? N TRP P 35 AB1 3 4 N GLN E 38 ? N GLN P 38 O THR E 85 ? O THR P 85 # _pdbx_entry_details.entry_id 9ZRS _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? _pdbx_entry_details.has_protein_modification Y # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 SER D 66 ? ? -97.15 59.09 2 1 THR D 233 ? ? 78.78 -2.31 3 1 ILE H 48 ? ? -108.20 -61.35 4 1 LYS H 64 ? ? 61.48 -119.04 5 1 SER H 65 ? ? -103.83 62.88 6 1 HIS H 96 ? ? -102.68 -61.24 7 1 GLN L 42 ? ? -162.59 116.38 8 1 VAL L 51 ? ? 64.04 -60.09 9 1 SER O 30 ? ? -92.52 32.01 10 1 ASN O 32 ? ? -91.33 50.07 11 1 SER P 30 ? ? 57.39 -116.51 12 1 ALA P 51 ? ? 71.27 -8.64 13 1 SER P 52 ? ? -142.58 -15.95 14 1 HIS P 91 ? ? -142.01 43.15 # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 9ZRS _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 9ZRS _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 3.4 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 1/2 BIT CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 73375 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.5 # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details _em_entity_assembly.entity_id_list 1 0 'MULTIPLE SOURCES' COMPLEX ;Shigella flexneri type III secretion system (T3SS) protein IpaD bound to hemolysis blocking Fab D02-F2 and hemolysis enhancing Fab D02-E4, both stablized by an anti-Fab nanobody. ; ;Antibody fragments were prepared by papain digest. Only the variable domains were modeled. Although two copies of an anti-Fab single-domain antibody were present in the sample, these were not modeled. ; ? ? '1, 2, 3, 4, 5' 2 1 RECOMBINANT COMPLEX 'Shigella flexneri type III secretion system (T3SS) protein IpaD' ? ? ? 1 3 1 RECOMBINANT COMPLEX 'Hemolysis blocking antibody fragment D02-F2' ? ? ? '2, 3' 4 1 RECOMBINANT COMPLEX 'Hemolysis enhancing antibody fragment D02-E4' ? ? ? '4, 5' # _em_imaging.entry_id 9ZRS _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'FEI TALOS ARCTICA' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 200 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_min 1500 _em_imaging.nominal_defocus_max 3000 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen ? _em_imaging.objective_aperture ? _em_imaging.microscope_serial_number ? _em_imaging.microscope_version ? # _em_vitrification.entry_id 9ZRS _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.instrument ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 9ZRS _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 D MET -24 ? A MET 1 2 1 Y 1 D HIS -23 ? A HIS 2 3 1 Y 1 D HIS -22 ? A HIS 3 4 1 Y 1 D HIS -21 ? A HIS 4 5 1 Y 1 D HIS -20 ? A HIS 5 6 1 Y 1 D HIS -19 ? A HIS 6 7 1 Y 1 D HIS -18 ? A HIS 7 8 1 Y 1 D GLY -17 ? A GLY 8 9 1 Y 1 D LEU -16 ? A LEU 9 10 1 Y 1 D ASN -15 ? A ASN 10 11 1 Y 1 D ASP -14 ? A ASP 11 12 1 Y 1 D ILE -13 ? A ILE 12 13 1 Y 1 D PHE -12 ? A PHE 13 14 1 Y 1 D GLU -11 ? A GLU 14 15 1 Y 1 D ALA -10 ? A ALA 15 16 1 Y 1 D GLN -9 ? A GLN 16 17 1 Y 1 D LYS -8 ? A LYS 17 18 1 Y 1 D ILE -7 ? A ILE 18 19 1 Y 1 D GLU -6 ? A GLU 19 20 1 Y 1 D TRP -5 ? A TRP 20 21 1 Y 1 D HIS -4 ? A HIS 21 22 1 Y 1 D GLU -3 ? A GLU 22 23 1 Y 1 D GLY -2 ? A GLY 23 24 1 Y 1 D SER -1 ? A SER 24 25 1 Y 1 D GLY 0 ? A GLY 25 26 1 Y 1 D SER 1 ? A SER 26 27 1 Y 1 D ASN 2 ? A ASN 27 28 1 Y 1 D ILE 3 ? A ILE 28 29 1 Y 1 D THR 4 ? A THR 29 30 1 Y 1 D THR 5 ? A THR 30 31 1 Y 1 D LEU 6 ? A LEU 31 32 1 Y 1 D THR 7 ? A THR 32 33 1 Y 1 D ASN 8 ? A ASN 33 34 1 Y 1 D SER 9 ? A SER 34 35 1 Y 1 D ILE 10 ? A ILE 35 36 1 Y 1 D SER 11 ? A SER 36 37 1 Y 1 D THR 12 ? A THR 37 38 1 Y 1 D SER 13 ? A SER 38 39 1 Y 1 D SER 14 ? A SER 39 40 1 Y 1 D PHE 15 ? A PHE 40 41 1 Y 1 D SER 16 ? A SER 41 42 1 Y 1 D PRO 17 ? A PRO 42 43 1 Y 1 D ASN 18 ? A ASN 43 44 1 Y 1 D ASN 19 ? A ASN 44 45 1 Y 1 D THR 20 ? A THR 45 46 1 Y 1 D ASN 21 ? A ASN 46 47 1 Y 1 D GLY 22 ? A GLY 47 48 1 Y 1 D SER 23 ? A SER 48 49 1 Y 1 D SER 24 ? A SER 49 50 1 Y 1 D THR 25 ? A THR 50 51 1 Y 1 D GLU 26 ? A GLU 51 52 1 Y 1 D THR 27 ? A THR 52 53 1 Y 1 D VAL 28 ? A VAL 53 54 1 Y 1 D ASN 29 ? A ASN 54 55 1 Y 1 D SER 30 ? A SER 55 56 1 Y 1 D ASP 31 ? A ASP 56 57 1 Y 1 D ILE 32 ? A ILE 57 58 1 Y 1 D LYS 33 ? A LYS 58 59 1 Y 1 D THR 34 ? A THR 59 60 1 Y 1 D THR 35 ? A THR 60 61 1 Y 1 D THR 36 ? A THR 61 62 1 Y 1 D SER 37 ? A SER 62 63 1 Y 1 D SER 38 ? A SER 63 64 1 Y 1 D HIS 39 ? A HIS 64 65 1 Y 1 D PRO 40 ? A PRO 65 66 1 Y 1 D VAL 41 ? A VAL 66 67 1 Y 1 D SER 42 ? A SER 67 68 1 Y 1 D ASP 97 ? A ASP 122 69 1 Y 1 D ILE 98 ? A ILE 123 70 1 Y 1 D LEU 99 ? A LEU 124 71 1 Y 1 D SER 100 ? A SER 125 72 1 Y 1 D ARG 101 ? A ARG 126 73 1 Y 1 D ASN 102 ? A ASN 127 74 1 Y 1 D GLU 103 ? A GLU 128 75 1 Y 1 D TYR 104 ? A TYR 129 76 1 Y 1 D PRO 105 ? A PRO 130 77 1 Y 1 D ILE 106 ? A ILE 131 78 1 Y 1 D ASN 107 ? A ASN 132 79 1 Y 1 D LYS 108 ? A LYS 133 80 1 Y 1 D ASP 109 ? A ASP 134 81 1 Y 1 D ALA 110 ? A ALA 135 82 1 Y 1 D ARG 111 ? A ARG 136 83 1 Y 1 D GLU 112 ? A GLU 137 84 1 Y 1 D LEU 113 ? A LEU 138 85 1 Y 1 D LEU 114 ? A LEU 139 86 1 Y 1 D HIS 115 ? A HIS 140 87 1 Y 1 D SER 116 ? A SER 141 88 1 Y 1 D ALA 117 ? A ALA 142 89 1 Y 1 D PRO 118 ? A PRO 143 90 1 Y 1 D LYS 119 ? A LYS 144 91 1 Y 1 D GLU 120 ? A GLU 145 92 1 Y 1 D ALA 121 ? A ALA 146 93 1 Y 1 D GLU 122 ? A GLU 147 94 1 Y 1 D LEU 123 ? A LEU 148 95 1 Y 1 D ASP 124 ? A ASP 149 96 1 Y 1 D GLY 125 ? A GLY 150 97 1 Y 1 D ASP 126 ? A ASP 151 98 1 Y 1 D GLN 127 ? A GLN 152 99 1 Y 1 D MET 128 ? A MET 153 100 1 Y 1 D ILE 129 ? A ILE 154 101 1 Y 1 D SER 130 ? A SER 155 102 1 Y 1 D HIS 131 ? A HIS 156 103 1 Y 1 D ARG 132 ? A ARG 157 104 1 Y 1 D GLU 133 ? A GLU 158 105 1 Y 1 D LEU 134 ? A LEU 159 106 1 Y 1 D TRP 135 ? A TRP 160 107 1 Y 1 D TRP 177 ? A TRP 202 108 1 Y 1 D ILE 178 ? A ILE 203 109 1 Y 1 D SER 179 ? A SER 204 110 1 Y 1 D PRO 180 ? A PRO 205 111 1 Y 1 D GLY 181 ? A GLY 206 112 1 Y 1 D GLY 182 ? A GLY 207 113 1 Y 1 D ASN 183 ? A ASN 208 114 1 Y 1 D ASP 184 ? A ASP 209 115 1 Y 1 D GLY 185 ? A GLY 210 116 1 Y 1 D ASN 186 ? A ASN 211 117 1 Y 1 D SER 187 ? A SER 212 118 1 Y 1 D VAL 188 ? A VAL 213 119 1 Y 1 D LYS 189 ? A LYS 214 120 1 Y 1 D LEU 190 ? A LEU 215 121 1 Y 1 D GLN 191 ? A GLN 216 122 1 Y 1 D VAL 192 ? A VAL 217 123 1 Y 1 D ASN 262 ? A ASN 287 124 1 Y 1 D LEU 263 ? A LEU 288 125 1 Y 1 D GLY 264 ? A GLY 289 126 1 Y 1 D GLY 265 ? A GLY 290 127 1 Y 1 D ASN 266 ? A ASN 291 128 1 Y 1 D GLY 267 ? A GLY 292 129 1 Y 1 D GLU 268 ? A GLU 293 130 1 Y 1 D VAL 269 ? A VAL 294 131 1 Y 1 D VAL 270 ? A VAL 295 132 1 Y 1 D LEU 271 ? 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