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EMDB EMD-74712 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2026-10-14 ? 2 'EM metadata' 1 0 2026-10-14 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'EM metadata' repository 'Initial release' ? ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9ZSI _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2025-12-22 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type EMDB . EMD-74609 'consensus EM volume' EMDB . 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'GLY 0 is expression tag MET 1 has no label ILE 2 is an insertion' 3 polymer man 'Histone H3' 15405.036 2 ? ? ? 'S111C engineered mutation' 4 polymer man 'Histone H4' 11521.611 2 ? ? ? 'ILE 2 is an insertion' 5 polymer man 'PL2-6 scFv' 29631.662 2 ? ? ? 'Chains I,J are from the mouse mAb PL2-6 antibody, Gen Bank IDs X60334 and X60341.' 6 polymer syn 'DNA 130-mer' 39859.379 1 ? ? ? ? 7 polymer syn 'DNA 23-mer' 7054.583 1 ? ? ? ? 8 polymer syn 'DNA 153-mer' 47497.258 1 ? ? ? ? 9 polymer man 'Poly [ADP-ribose] polymerase 2' 56503.555 1 2.4.2.30,2.4.2.- ? ? 'Sequence begins at G90; structure sequence beings at K91.' # _entity_name_com.entity_id 9 _entity_name_com.name ;PARP-2,hPARP-2,ADP-ribosyltransferase diphtheria toxin-like 2,ARTD2,DNA ADP-ribosyltransferase PARP2,NAD(+) ADP-ribosyltransferase 2,ADPRT-2,Poly[ADP-ribose] synthase 2,pADPRT-2,Protein poly-ADP-ribosyltransferase PARP2 ; # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKGGKVKGKAKSRSNRAGLQFPVGRIHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVMEYLAAEVLELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAIRNDEELNKLLSGVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTEKKA ; ;MSGRGKGGKVKGKAKSRSNRAGLQFPVGRIHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVMEYLAAEVLELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAIRNDEELNKLLSGVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTEKKA ; A,B ? 2 'polypeptide(L)' no no ;GMIPPKTSGKAAKKAGKAQKNITKTDKKKKRKRKESYAIYIYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDIFERIAAEASRL 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;ATCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGT CCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTACTGACCAGGTCTCC ; K ? 7 polydeoxyribonucleotide no no ;(DG)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT) (DG)(DA)(DT) ; GTCAGATATATACATCCTGTGAT L ? 8 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DT)(DC)(DA)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT) (DG)(DA)(DC)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG)(DT)(DA)(DG) (DG)(DG)(DA)(DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT) (DT)(DA)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DC) (DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG) (DC)(DT)(DA)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA) (DT)(DT)(DG)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG) (DG)(DA)(DT)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT) ; ;ATCACAGGATGTATATATCTGACGGAGACCTGGTCAGTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGC GTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGAT ; M ? 9 'polypeptide(L)' no no ;GKAPVDPECTAKVGKAHVYCEGNDVYDVMLNQTNLQFNNNKYYLIQLLEDDAQRNFSVWMRWGRVGKMGQHSLVACSGNL NKAKEIFQKKFLDKTKNNWEDREKFEKVPGKYDMLQMDYATNTQDEEETKKEESLKSPLKPESQLDLRVQELIKLICNVQ AMEEMMMEMKYNTKKAPLGKLTVAQIKAGYQSLKKIEDCIRAGQHGRALMEACNEFYTRIPHDFGLRTPPLIRTQKELSE KIQLLEALGDIEIAIKLVKTELQSPEHPLDQHYRNLHCALRPLDHESYEFKVISQYLQSTHAPTHSDYTMTLLDLFEVEK DGEKEAFREDLHNRMLLWHGSRMSNWVGILSHGLRIAPPEAPITGYMFGKGIYFADMSSKSANYCFASRLKNTGLLLLSE VALGQCNELLEANPKAEGLLQGKHSTKGLGKMAPSSAHFVTLNGSTVPLGPASDTGILNPDGYTLNYNEYIVYNPNQVRM RYLLKVQFNFLQLW ; ;GKAPVDPECTAKVGKAHVYCEGNDVYDVMLNQTNLQFNNNKYYLIQLLEDDAQRNFSVWMRWGRVGKMGQHSLVACSGNL NKAKEIFQKKFLDKTKNNWEDREKFEKVPGKYDMLQMDYATNTQDEEETKKEESLKSPLKPESQLDLRVQELIKLICNVQ AMEEMMMEMKYNTKKAPLGKLTVAQIKAGYQSLKKIEDCIRAGQHGRALMEACNEFYTRIPHDFGLRTPPLIRTQKELSE KIQLLEALGDIEIAIKLVKTELQSPEHPLDQHYRNLHCALRPLDHESYEFKVISQYLQSTHAPTHSDYTMTLLDLFEVEK DGEKEAFREDLHNRMLLWHGSRMSNWVGILSHGLRIAPPEAPITGYMFGKGIYFADMSSKSANYCFASRLKNTGLLLLSE VALGQCNELLEANPKAEGLLQGKHSTKGLGKMAPSSAHFVTLNGSTVPLGPASDTGILNPDGYTLNYNEYIVYNPNQVRM RYLLKVQFNFLQLW ; P ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 SER n 1 3 GLY n 1 4 ARG n 1 5 GLY n 1 6 LYS n 1 7 GLY n 1 8 GLY n 1 9 LYS n 1 10 VAL n 1 11 LYS n 1 12 GLY n 1 13 LYS n 1 14 ALA n 1 15 LYS n 1 16 SER n 1 17 ARG n 1 18 SER n 1 19 ASN n 1 20 ARG n 1 21 ALA n 1 22 GLY n 1 23 LEU n 1 24 GLN n 1 25 PHE n 1 26 PRO n 1 27 VAL n 1 28 GLY n 1 29 ARG n 1 30 ILE n 1 31 HIS n 1 32 ARG n 1 33 LEU n 1 34 LEU n 1 35 ARG n 1 36 LYS n 1 37 GLY n 1 38 ASN n 1 39 TYR n 1 40 ALA n 1 41 GLU n 1 42 ARG n 1 43 VAL n 1 44 GLY n 1 45 ALA n 1 46 GLY n 1 47 ALA n 1 48 PRO n 1 49 VAL n 1 50 TYR n 1 51 LEU n 1 52 ALA n 1 53 ALA n 1 54 VAL n 1 55 MET n 1 56 GLU n 1 57 TYR n 1 58 LEU n 1 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LYS n 2 25 THR n 2 26 ASP n 2 27 LYS n 2 28 LYS n 2 29 LYS n 2 30 LYS n 2 31 ARG n 2 32 LYS n 2 33 ARG n 2 34 LYS n 2 35 GLU n 2 36 SER n 2 37 TYR n 2 38 ALA n 2 39 ILE n 2 40 TYR n 2 41 ILE n 2 42 TYR n 2 43 LYS n 2 44 VAL n 2 45 LEU n 2 46 LYS n 2 47 GLN n 2 48 VAL n 2 49 HIS n 2 50 PRO n 2 51 ASP n 2 52 THR n 2 53 GLY n 2 54 ILE n 2 55 SER n 2 56 SER n 2 57 LYS n 2 58 ALA n 2 59 MET n 2 60 SER n 2 61 ILE n 2 62 MET n 2 63 ASN n 2 64 SER n 2 65 PHE n 2 66 VAL n 2 67 ASN n 2 68 ASP n 2 69 ILE n 2 70 PHE n 2 71 GLU n 2 72 ARG n 2 73 ILE n 2 74 ALA n 2 75 ALA n 2 76 GLU n 2 77 ALA n 2 78 SER n 2 79 ARG n 2 80 LEU n 2 81 ALA n 2 82 HIS n 2 83 TYR n 2 84 ASN n 2 85 LYS n 2 86 ARG n 2 87 SER n 2 88 THR n 2 89 ILE n 2 90 THR n 2 91 SER n 2 92 ARG n 2 93 GLU n 2 94 ILE n 2 95 GLN n 2 96 THR n 2 97 ALA n 2 98 VAL n 2 99 ARG n 2 100 LEU n 2 101 LEU n 2 102 LEU n 2 103 PRO n 2 104 GLY n 2 105 GLU n 2 106 LEU n 2 107 ALA n 2 108 LYS n 2 109 HIS n 2 110 ALA n 2 111 VAL n 2 112 SER n 2 113 GLU n 2 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P . n N 9 451 PRO 451 540 ? ? ? P . n N 9 452 ALA 452 541 ? ? ? P . n N 9 453 SER 453 542 ? ? ? P . n N 9 454 ASP 454 543 ? ? ? P . n N 9 455 THR 455 544 ? ? ? P . n N 9 456 GLY 456 545 ? ? ? P . n N 9 457 ILE 457 546 ? ? ? P . n N 9 458 LEU 458 547 ? ? ? P . n N 9 459 ASN 459 548 ? ? ? P . n N 9 460 PRO 460 549 ? ? ? P . n N 9 461 ASP 461 550 ? ? ? P . n N 9 462 GLY 462 551 ? ? ? P . n N 9 463 TYR 463 552 ? ? ? P . n N 9 464 THR 464 553 ? ? ? P . n N 9 465 LEU 465 554 ? ? ? P . n N 9 466 ASN 466 555 ? ? ? P . n N 9 467 TYR 467 556 ? ? ? P . n N 9 468 ASN 468 557 ? ? ? P . n N 9 469 GLU 469 558 ? ? ? P . n N 9 470 TYR 470 559 ? ? ? P . n N 9 471 ILE 471 560 ? ? ? P . n N 9 472 VAL 472 561 ? ? ? P . n N 9 473 TYR 473 562 ? ? ? P . n N 9 474 ASN 474 563 ? ? ? P . n N 9 475 PRO 475 564 ? ? ? P . n N 9 476 ASN 476 565 ? ? ? P . n N 9 477 GLN 477 566 ? ? ? P . n N 9 478 VAL 478 567 ? ? ? P . n N 9 479 ARG 479 568 ? ? ? P . n N 9 480 MET 480 569 ? ? ? P . n N 9 481 ARG 481 570 ? ? ? 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UNP P84040 ? ? insertion 2 8 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetradecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 14 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 16 ? 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