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B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 9ASD 9ASD ? 1 ? 1 2 PDB 9ASD 9ASD ? 2 ? 1 3 UNP SPIKE_SARS2 P0DTC2 ? 3 ;MFVFLVLLPLVSSQCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFD NPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYYHKNNKSWMESEFRVY SSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQT LLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRV QPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSF VIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPC NGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFL PFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQDVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGS NVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSPRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPTNFTI SVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGF NFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAG TITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQDVVNQNAQALN TLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRV DFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNT FVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDL QELGKYEQ ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9ASD H 1 ? 123 ? 9ASD 1 ? 123 ? 1 123 2 2 9ASD L 1 ? 110 ? 9ASD 1 ? 110 ? 1 110 3 3 9ASD R 1 ? 1204 ? P0DTC2 1 ? 1208 ? 4 1208 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 3 9ASD MET R 17 ? UNP P0DTC2 ? ? insertion 20 1 3 9ASD PRO R 18 ? UNP P0DTC2 ASN 17 conflict 21 2 3 9ASD PHE R 20 ? UNP P0DTC2 THR 19 conflict 23 3 3 9ASD ASN R 21 ? UNP P0DTC2 THR 20 conflict 24 4 3 9ASD LEU R 22 ? UNP P0DTC2 ARG 21 conflict 25 5 3 9ASD ILE R 23 ? UNP P0DTC2 THR 22 conflict 26 6 3 9ASD THR R 24 ? UNP P0DTC2 GLN 23 conflict 27 7 3 9ASD THR R 25 ? UNP P0DTC2 LEU 24 conflict 28 8 3 9ASD THR R 26 ? UNP P0DTC2 PRO 25 conflict 29 9 3 9ASD GLN R 27 ? 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'expression tag' 1277 143 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 28 ? PHE A 32 ? THR H 28 PHE H 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 62 ? LYS A 65 ? ASP H 62 LYS H 65 5 ? 4 HELX_P HELX_P3 AA3 PHE C 335 ? ASN C 340 ? PHE R 338 ASN R 343 1 ? 6 HELX_P HELX_P4 AA4 SER C 346 ? TRP C 350 ? SER R 349 TRP R 353 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 AA5 ASN C 402 ? ILE C 407 ? ASN R 405 ILE R 410 5 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 GLY C 498 ? HIS C 501 ? GLY R 502 HIS R 505 5 ? 4 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 22 SG ? ? ? 1_555 A CYS 96 SG ? ? H CYS 22 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.088 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 22 SG ? ? ? 1_555 B CYS 90 SG ? ? L CYS 22 L CYS 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.172 ? ? disulf3 disulf ? ? C CYS 333 SG ? ? ? 1_555 C CYS 358 SG ? ? R CYS 336 R CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? ? disulf4 disulf ? ? C CYS 376 SG ? ? ? 1_555 C CYS 429 SG ? ? R CYS 379 R CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf5 disulf ? ? C CYS 388 SG ? ? ? 1_555 C CYS 521 SG ? ? R CYS 391 R CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? ? disulf6 disulf ? ? C CYS 477 SG ? ? ? 1_555 C CYS 484 SG ? ? R CYS 480 R CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? covale1 covale one ? C ASN 340 ND2 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? R ASN 343 R NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? C ASN 351 ND2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? R ASN 354 R NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG D . ? 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ASP L 87 GLY L 95 AA5 4 ILE B 98 ? PHE B 101 ? ILE L 98 PHE L 101 AA6 1 VAL B 18 ? THR B 23 ? VAL L 18 THR L 23 AA6 2 THR B 72 ? ILE B 77 ? THR L 72 ILE L 77 AA6 3 PHE B 64 ? SER B 69 ? PHE L 64 SER L 69 AA7 1 ASN C 351 ? ILE C 355 ? ASN R 354 ILE R 358 AA7 2 ASN C 391 ? LYS C 400 ? ASN R 394 LYS R 403 AA7 3 PRO C 503 ? GLU C 512 ? PRO R 507 GLU R 516 AA7 4 GLY C 428 ? ASN C 434 ? GLY R 431 ASN R 437 AA7 5 ALA C 373 ? TYR C 377 ? ALA R 376 TYR R 380 AA8 1 CYS C 358 ? VAL C 359 ? CYS R 361 VAL R 362 AA8 2 VAL C 520 ? CYS C 521 ? VAL R 524 CYS R 525 AA9 1 TRP C 449 ? ARG C 451 ? TRP R 452 ARG R 454 AA9 2 LEU C 488 ? SER C 490 ? LEU R 492 SER R 494 AB1 1 TYR C 470 ? GLN C 471 ? TYR R 473 GLN R 474 AB1 2 CYS C 484 ? TYR C 485 ? 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