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T . n F 4 53 DA 53 53 ? ? ? T . n F 4 54 DA 54 54 ? ? ? T . n F 4 55 DC 55 55 ? ? ? T . n F 4 56 DC 56 56 ? ? ? T . n F 4 57 DT 57 57 ? ? ? T . n F 4 58 DC 58 58 ? ? ? T . n F 4 59 DA 59 59 ? ? ? T . n # loop_ _pdbx_entity_instance_feature.ordinal _pdbx_entity_instance_feature.comp_id _pdbx_entity_instance_feature.asym_id _pdbx_entity_instance_feature.seq_num _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num _pdbx_entity_instance_feature.feature_type _pdbx_entity_instance_feature.details 1 MG ? ? MG ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? 2 SF4 ? ? SF4 ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? 3 TTP ? ? TTP ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 5 TTP 1 3001 3001 TTP TTP A . H 6 MG 1 3002 3002 MG MG A . 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.950 ? 22952 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 15.792 ? 2672 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.053 ? 2557 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.007 ? 2781 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9B8T _struct.title 'Human polymerase epsilon bound to PCNA and DNA in the nucleotide bound state' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9B8T _struct_keywords.text 'DNA polymerase, DNA, DNA Binding Protein-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA Binding Protein/DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 4 ? G N N 5 ? H N N 6 ? I N N 7 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP Q9Y5S4_HUMAN Q9Y5S4 ? 1 ;MSLRSGGRRRADPGADGEASRDDGATSSVSALKRLERSQWTDKMDLRFGFERLKEPGEKTGWLINMHPTEILDEDKRLGS AVDYYFIQDDGSRFKVALPYKPYFYIATRKGCEREVSSFLSKKFQGKIAKVETVPKEDLDLPNHLVGLKRNYIRLSFHTV EDLVKVRKEISPAVKKNREQDHASDAYTALLSSVLQRGGVITDEEETSKKIADQLDNIVDMREYDVPYHIRLSIDLKIHV AHWYNVRYRGNAFPVEITRRDDLVERPDPVVLAFDIETTKLPLKFPDAETDQIMMISYMIDGQGYLITNREIVSEDIEDF EFTPKPEYEGPFCVFNEPDEAHLIQRWFEHVQETKPTIMVTYNGDFFDWPFVEARAAVHGLSMQQEIGFQKDSQGEYKAP QCIHMDCLRWVKRDSYLPVGSHNLKAAAKAKLGYDPVELDPEDMCRMATEQPQTLATYSVSDAVATYYLYMKYVHPFIFA LCTIIPMEPDEVLRKGSGTLCEALLMVQAFHANIIFPNKQEQEFNKLTDDGHVLDSETYVGGHVEALESGVFRSDIPCRF RMNPAAFDFLLQRVEKTLRHALEEEEKVPVEQVTNFEEVCDEIKSKLASLKDVPSRIECPLIYHLDVGAMYPNIILTNRL QPSAMVDEATCAACDFNKPGANCQRKMAWQWRGEFMPASRSEYHRIQHQLESEKFPPLFPEGPARAFHELSREEQAKYEK RRLADYCRKAYKKIHITKVEERLTTICQRENSFYVDTVRAFRDRRYEFKGLHKVWKKKLSAAVEVGDAAEVKRCKNMEVL YDSLQLAHKCILNSFYGYVMRKGARWYSMEMAGIVCFTGANIITQARELIEQIGRPLELDTDGIWCVLPNSFPENFVFKT TNVKKPKVTISYPGAMLNIMVKEGFTNDQYQELAEPSSLTYVTRSENSIFFEVDGPYLAMILPASKEEGKKLKKRYAVFN EDGSLAELKGFEVKRRGELQLIKIFQSSVFEAFLKGSTLEEVYGSVAKVADYWLDVLYSKAANMPDSELFELISENRSMS RKLEDYGEQKSTSISTAKRLAEFLGDQMVKDAGLSCRYIISRKPEGSPVTERAIPLAIFQAEPTVRKHFLRKWLKSSSLQ DFDIRAILDWDYYIERLGSAIQKIITIPAALQQVKNPVPRVKHPDWLHKKLLEKNDVYKQKKISELFTLEGRRQVTMAEA SEDSPRPSAPDMEDFGLVKLPHPAAPVTVKRKRVLWESQEESQDLTPTVPWQEILGQPPALGTSQEEWLVWLRFHKKKWQ LQARQRLARRKRQRLESAEGVLRPGAIRDGPATGLGSFLRRTARSILDLPWQIVQISETSQAGLFRLWALVGSDLHCIRL SIPRVFYVNQRVAKAEEGASYRKVNRVLPRSNMVYNLYEYSVPEDMYQEHINEINAELSAPDIEGVYETQVPLLFRALVH LGCVCVVNKQLVRHLSGWEAETFALEHLEMRSLAQFSYLEPGSIRHIYLYHHAQAHKALFGIFIPSQRRASVFVLDTVRT DQMPSLGALYSAEHGLLLEKVGPELLPPPKHTFEVRAETDLKTICRAIQRFLLAYKEERRGPTLIAVQSSWELKRLASEI PVLEEFPLVPICVADKINYGVLDWQRHGARRMIRHYLNLDTCLSQAFEMSRYFHIPIGNLPEDISTFGSDLFFARHLQRH NHLLWLSPTARPDLGGKEADDNCLVMEFDDQATVEINSSGCYSTVCVELDLQNLAVNTILQSHHVNDMEGADSMGISFDV IQQASLEDMITGGQAASAPASYDETALCSNTFRILKSMVVGWVKEITQYHNIYADNQVMHFYRWLRSPSSLLHDPALHRT LHNMMKKLFLQLIAEFKRLGSSVIYANFNRIILCTKKRRVEDAIAYVEYITSSIHSKETFHSLTISFSRCWEFLLWMDPS NYGGIKGKVSSRIHCGLQDSQKAGGAEDEQENEDDEEERDGEEEEEAEESNVEDLLENNWNILQFLPQAASCQNYFLMIV SAYIVAVYHCMKDGLRRSAPGSTPVRRRGASQLSQEAEGAVGALPGMITFSQDYVANELTQSFFTITQKIQKKVTGSRNS TELSEMFPVLPGSHLLLNNPALEFIKYVCKVLSLDTNITNQVNKLNRDLLRLVDVGEFSEEAQFRDPCRSYVLPEVICRS CNFCRDLDLCKDSSFSEDGAVLPQWLCSNCQAPYDSSAIEMTLVEVLQKKLMAFTLQDLVCLKCRGVKETSMPVYCTCAG DFALTIHTQVFMEQIGIFRNIAQHYGMSYLLETLEWLLQKNPQLGH ; 1 2 UNP PCNA_HUMAN P12004 ? 2 ;MFEARLVQGSILKKVLEALKDLINEACWDISSSGVNLQSMDSSHVSLVQLTLRSEGFDTYRCDRNLAMGVNLTSMSKILK CAGNEDIITLRAEDNADTLALVFEAPNQEKVSDYEMKLMDLDVEQLGIPEQEYSCVVKMPSGEFARICRDLSHIGDAVVI SCAKDGVKFSASGELGNGNIKLSQTSNVDKEEEAVTIEMNEPVQLTFALRYLNFFTKATPLSSTVTLSMSADVPLVVEYK IADMGHLKYYLAPKIEDEEGS ; 1 3 PDB 9B8T 9B8T ? 3 ? 1 4 PDB 9B8T 9B8T ? 4 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9B8T A 1 ? 2286 ? 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UNP Q9Y5S4 GLU 277 'engineered mutation' 277 2 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 24 ? 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