data_9BRB # _entry.id 9BRB # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.395 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 9BRB pdb_00009brb 10.2210/pdb9brb/pdb WWPDB D_1000283963 ? ? EMDB EMD-44355 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2024-06-26 2 'Structure model' 1 1 2024-07-03 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # _pdbx_audit_revision_group.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal 2 _pdbx_audit_revision_group.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_group.group 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' citation 2 2 'Structure model' citation_author # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation.page_first' 2 2 'Structure model' '_citation.page_last' 3 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 4 2 'Structure model' '_citation.title' 5 2 'Structure model' '_citation_author.identifier_ORCID' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9BRB _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2024-05-11 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details . _pdbx_database_related.db_id EMD-44355 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email john.rubinstein@utoronto.ca _pdbx_contact_author.name_first John _pdbx_contact_author.name_last Rubinstein _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0003-0566-2209 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Coupland, C.E.' 1 ? 'Rubinstein, J.L.' 2 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Science _citation.journal_id_ASTM SCIEAS _citation.journal_id_CSD 0038 _citation.journal_id_ISSN 1095-9203 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first eadp5577 _citation.page_last eadp5577 _citation.title 'High-resolution electron cryomicroscopy of V-ATPase in native synaptic vesicles.' _citation.year 2024 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1126/science.adp5577 _citation.pdbx_database_id_PubMed 38900912 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Coupland, C.E.' 1 0000-0002-6041-7532 primary 'Karimi, R.' 2 0000-0003-2300-4824 primary 'Bueler, S.A.' 3 ? primary 'Liang, Y.' 4 0000-0001-6247-8294 primary 'Courbon, G.M.' 5 0000-0001-6628-9087 primary 'Di Trani, J.M.' 6 ? primary 'Wong, C.J.' 7 0009-0009-7292-3780 primary 'Saghian, R.' 8 0009-0000-3726-7014 primary 'Youn, J.Y.' 9 0000-0001-6799-5709 primary 'Wang, L.Y.' 10 0000-0002-5399-944X primary 'Rubinstein, J.L.' 11 0000-0003-0566-2209 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'H(+)-transporting two-sector ATPase' 71483.438 3 7.1.2.2 ? ? ? 2 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit B, brain isoform' 56611.570 3 ? ? ? ? 3 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit C 1' 43958.453 1 ? ? ? ? 4 polymer nat 'ATPase H+-transporting V1 subunit D' 28359.020 1 ? ? ? ? 5 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit E 1' 26167.453 3 ? ? ? ? 6 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit F' 13389.262 1 ? ? ? ? 7 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit G' 13690.476 3 ? ? ? ? 8 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit S1' 51160.359 1 ? ? ? ? 9 polymer man 'Type IV secretion protein Dot' 65505.297 3 ? ? ? ? 10 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit H' 53661.473 1 ? ? ? ? 11 polymer nat Synaptophysin 33331.523 1 ? ? ? ? 12 polymer nat 'V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1' 96429.438 1 ? ? ? ? 13 polymer nat 'ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a' 21618.553 1 ? ? ? ? 14 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit' 40341.934 1 ? ? ? ? 15 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit e 2' 9203.020 1 ? ? ? ? 16 polymer nat 'Rnasek protein' 10597.495 1 ? ? ? ? 17 polymer nat 'V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit c' 15815.833 9 ? ? ? ? 18 polymer nat 'Renin receptor' 39118.578 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 2 'V-ATPase subunit B 2,Endomembrane proton pump 58 kDa subunit,Vacuolar proton pump subunit B 2' 3 'V-ATPase subunit C 1,Vacuolar proton pump subunit C 1' 4 'ATPase,H+ transporting,V1 subunit D,isoform CRA_c,lysosomal V1 subunit D' 5 'V-ATPase subunit E 1,Vacuolar proton pump subunit E 1' 6 'V-ATPase subunit F,V-ATPase 14 kDa subunit,Vacuolar proton pump subunit F' 8 'V-ATPase subunit S1,C7-1 protein,V-ATPase Ac45 subunit,V-ATPase S1 accessory protein,Vacuolar proton pump subunit S1' 11 'Major synaptic vesicle protein p38' 12 ;V-ATPase 116 kDa isoform a1,Clathrin-coated vesicle/synaptic vesicle proton pump 116 kDa subunit,Vacuolar adenosine triphosphatase subunit Ac116,Vacuolar proton pump subunit 1,Vacuolar proton translocating ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 ; 13 'ATPase,H+ transporting,lysosomal V0 subunit B,Atp6v0b protein' 15 'V-ATPase subunit e 2,Vacuolar proton pump subunit e 2' 17 'V-ATPase 16 kDa proteolipid subunit c,Vacuolar proton pump 16 kDa proteolipid subunit c' 18 ;ATPase H(+)-transporting lysosomal accessory protein 2,ATPase H(+)-transporting lysosomal-interacting protein 2,Renin/prorenin receptor ; # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MCFKFKSDRASGSGLGTDSALRARAGKFSTMDFSKLPKIRDEDKESTFGYVHGVSGPVVTACDMAGAAMYELVRVGHSEL VGEIIRLEGDMATIQVYEETSGVSVGDPVLRTGKPLSVELGPGIMGAIFDGIQRPLSDISSQTQSIYIPRGVNVSALSRD IKWEFIPSKNLRVGSHITGGDIYGIVNENSLIKHKIMLPPRSRGSVTYIAPPGNYDASDVVLELEFEGVKEKLSMVQVWP VRQVRPVTEKLPANHPLLTGQRVLDALFPCVQGGTTAIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDVIIYVGCGERGNEMSEVLRD FPELTMEVDGKVESIMKRTALVANTSNMPVAAREASIYTGITLSEYFRDMGYHVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPA DSGYPAYLGARLASFYERAGRVKCLGNPEREGSVSIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLGIVQVFWGLDKKLAQRKHFPSVNW LISYSKYMRALDEYYDKHFTEFVPLRTKAKEILQEEEDLAEIVQLVGKASLAETDKITLEVAKLIKDDFLQQNGYTPYDR FCPFYKTVGMLSNMISFYDMARRAVETTAQSDNKITWSIIREHMGEILYKLSSMKFKDPVKDGEAKIKADYAQLLEDMQN AFRSLED ; ;MCFKFKSDRASGSGLGTDSALRARAGKFSTMDFSKLPKIRDEDKESTFGYVHGVSGPVVTACDMAGAAMYELVRVGHSEL VGEIIRLEGDMATIQVYEETSGVSVGDPVLRTGKPLSVELGPGIMGAIFDGIQRPLSDISSQTQSIYIPRGVNVSALSRD IKWEFIPSKNLRVGSHITGGDIYGIVNENSLIKHKIMLPPRSRGSVTYIAPPGNYDASDVVLELEFEGVKEKLSMVQVWP VRQVRPVTEKLPANHPLLTGQRVLDALFPCVQGGTTAIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDVIIYVGCGERGNEMSEVLRD FPELTMEVDGKVESIMKRTALVANTSNMPVAAREASIYTGITLSEYFRDMGYHVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPA DSGYPAYLGARLASFYERAGRVKCLGNPEREGSVSIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLGIVQVFWGLDKKLAQRKHFPSVNW LISYSKYMRALDEYYDKHFTEFVPLRTKAKEILQEEEDLAEIVQLVGKASLAETDKITLEVAKLIKDDFLQQNGYTPYDR FCPFYKTVGMLSNMISFYDMARRAVETTAQSDNKITWSIIREHMGEILYKLSSMKFKDPVKDGEAKIKADYAQLLEDMQN AFRSLED ; A,B,C ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MALRAMRGIVNGAAPELPVPTGGPMAGAREQALAVSRNYLSQPRLTYKTVSGVNGPLVILDHVKFPRYAEIVHLTLPDGT KRSGQVLEVSGSKAVVQVFEGTSGIDAKKTSCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPIDRGPVVLAEDFLDIMGQPINP QCRIYPEEMIQTGISAIDGMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKDVVDYSEENFAIVFAAMGVNMET ARFFKSDFEENGSMDNVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGR RGFPGYMYTDLATIYERAGRVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSR LMKSAIGEGMTRKDHADVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSDDLLYLEFLQKFEKNFITQGPYENRTVYETLDIG WQLLRIFPKEMLKRIPQSTLSEFYPRDSAKH ; ;MALRAMRGIVNGAAPELPVPTGGPMAGAREQALAVSRNYLSQPRLTYKTVSGVNGPLVILDHVKFPRYAEIVHLTLPDGT KRSGQVLEVSGSKAVVQVFEGTSGIDAKKTSCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPIDRGPVVLAEDFLDIMGQPINP QCRIYPEEMIQTGISAIDGMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKDVVDYSEENFAIVFAAMGVNMET ARFFKSDFEENGSMDNVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGR RGFPGYMYTDLATIYERAGRVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSR LMKSAIGEGMTRKDHADVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSDDLLYLEFLQKFEKNFITQGPYENRTVYETLDIG WQLLRIFPKEMLKRIPQSTLSEFYPRDSAKH ; D,E,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MTEFWLISAPGEKTCQQTWEKLHAATTKNNNLAVSSKFNIPDLKVGTLDVLVGLSDELAKLDAFVEGVVKKVAQYMADVL EDSKDKVQENLLASGVDLVTYITRFQWDMAKYPIKQSLKNISEIIAKGVTQIDNDLKSRASAYNNLKGNLQNLERKNAGS LLTRSLAEIVKKDDFVLDSEYLVTLLVVVPKLNHNDWIKQYETLAEMVVPRSSNVLSEDQDSYLCNVTLFKKAVDDFRHK ARENKFIVRDFQYNEEEMRADKEEMNRLSTDKKKQFGPLVRWLKVNFSEAFIAWIHIKALRVFVESVLRYGLPVNFQAML LQPNKKSVKKLREVLHELYKHLDSSAAAIIDAPMDIPGLNLSQQEYYPYVYYKIDCNLLEFK ; ;MTEFWLISAPGEKTCQQTWEKLHAATTKNNNLAVSSKFNIPDLKVGTLDVLVGLSDELAKLDAFVEGVVKKVAQYMADVL EDSKDKVQENLLASGVDLVTYITRFQWDMAKYPIKQSLKNISEIIAKGVTQIDNDLKSRASAYNNLKGNLQNLERKNAGS LLTRSLAEIVKKDDFVLDSEYLVTLLVVVPKLNHNDWIKQYETLAEMVVPRSSNVLSEDQDSYLCNVTLFKKAVDDFRHK ARENKFIVRDFQYNEEEMRADKEEMNRLSTDKKKQFGPLVRWLKVNFSEAFIAWIHIKALRVFVESVLRYGLPVNFQAML LQPNKKSVKKLREVLHELYKHLDSSAAAIIDAPMDIPGLNLSQQEYYPYVYYKIDCNLLEFK ; G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSGKDRIEIFPSRMAQTIMKARLKGAQTGRNLLKKKSDALTLRFRQILKKIIETKMLMGEVMREAAFSLAEAKFTAGDFS TTVIQNVNKAQVKIRAKKDNVAGVTLPVFEHYHEGTDSYELTGLARGGEQLAKLKRNYAKAVELLVELASLQTSFVTLDE AIKITNRRVNAIEHVIIPRIERTLAYIITELDEREREEFYRLKKIQEKKKIIKEKSEKDLERRRAAGEVMEPANLLAEEK DEDLLFE ; ;MSGKDRIEIFPSRMAQTIMKARLKGAQTGRNLLKKKSDALTLRFRQILKKIIETKMLMGEVMREAAFSLAEAKFTAGDFS TTVIQNVNKAQVKIRAKKDNVAGVTLPVFEHYHEGTDSYELTGLARGGEQLAKLKRNYAKAVELLVELASLQTSFVTLDE AIKITNRRVNAIEHVIIPRIERTLAYIITELDEREREEFYRLKKIQEKKKIIKEKSEKDLERRRAAGEVMEPANLLAEEK DEDLLFE ; H ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MALSDADVQKQIKHMMAFIEQEANEKAEEIDAKAEEEFNIEKGRLVQTQRLKIMEYYEKKEKQIEQQKKIQMSNLMNQAR LKVLRARDDLITDLLNEAKQRLSKVVKDTTRYQVLLDGLVLQGLYQLLEPRMIVRCRKQDFPLVKAAVQKAIPMYKIATK KDVDVQIDLEAYLPEDIAGGVEIYNGDRKIKVSNTLESRLDLIAQQMMPEVRGALFGANANRKFLD ; ;MALSDADVQKQIKHMMAFIEQEANEKAEEIDAKAEEEFNIEKGRLVQTQRLKIMEYYEKKEKQIEQQKKIQMSNLMNQAR LKVLRARDDLITDLLNEAKQRLSKVVKDTTRYQVLLDGLVLQGLYQLLEPRMIVRCRKQDFPLVKAAVQKAIPMYKIATK KDVDVQIDLEAYLPEDIAGGVEIYNGDRKIKVSNTLESRLDLIAQQMMPEVRGALFGANANRKFLD ; I,J,K ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MAGRGKLIAVIGDEDTVTGFLLGGIGELNKNRHPNFLVVEKDTTINEIEDTFRQFLNRDDIGIILINQYIAEMVRHALDA HQRSIPAVLEIPSKEHPYDAAKDSILRRAKGMFTAEDLR ; ;MAGRGKLIAVIGDEDTVTGFLLGGIGELNKNRHPNFLVVEKDTTINEIEDTFRQFLNRDDIGIILINQYIAEMVRHALDA HQRSIPAVLEIPSKEHPYDAAKDSILRRAKGMFTAEDLR ; L ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MASQSQGIQQLLQAEKRAAEKVADARKRKARRLKQAKEEAQMEVEQYRREREQEFQSKQQAAMGSQGNLSAEVEQATRRQ VQGMQSSQQRNRERVLTQLLGMVCDVRPQVHPNYRITV ; ;MASQSQGIQQLLQAEKRAAEKVADARKRKARRLKQAKEEAQMEVEQYRREREQEFQSKQQAAMGSQGNLSAEVEQATRRQ VQGMQSSQQRNRERVLTQLLGMVCDVRPQVHPNYRITV ; M,N,O ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MMAATVVSRIRTGTRWAPVLWLLLSLVAVAAAVAAEQQVPLVLWSSDRDLWAPVADTHEGHITSDMQLSTYLDPALELGP RNVLLFLQDKLSIEDFTAYGGVFGNKQDSAFSNLENALDLAPSSLVLPAVDWYAISTLTTYLQEKLGASPLHVDLATLKE LKLNASLPALLLIRLPYTASSGLMAPREVLTGNDEVIGQVLSTLESEDVPYTAALTAVRPSRVARDVAMVAGGLGRQLLQ TQVASPAIHPPVSYNDTAPRILFWAQNFSVAYKDEWKDLTSLTFGVENLNLTGSFWNDSFAMLSLTYEPLFGATVTFKFI LASRFYPVSARYWFTMERLEIHSNGSVAHFNVSQVTGPSIYSFHCEYVSSLSKKGSLLVTNVPSLWQMTLHNFQIQAFNV TGEQFSYASDCAGFFSPGIWMGLLTTLFMLFIFTYGLHMILSLKTMDRFDDRKGPTITLTQIV ; ;MMAATVVSRIRTGTRWAPVLWLLLSLVAVAAAVAAEQQVPLVLWSSDRDLWAPVADTHEGHITSDMQLSTYLDPALELGP RNVLLFLQDKLSIEDFTAYGGVFGNKQDSAFSNLENALDLAPSSLVLPAVDWYAISTLTTYLQEKLGASPLHVDLATLKE LKLNASLPALLLIRLPYTASSGLMAPREVLTGNDEVIGQVLSTLESEDVPYTAALTAVRPSRVARDVAMVAGGLGRQLLQ TQVASPAIHPPVSYNDTAPRILFWAQNFSVAYKDEWKDLTSLTFGVENLNLTGSFWNDSFAMLSLTYEPLFGATVTFKFI LASRFYPVSARYWFTMERLEIHSNGSVAHFNVSQVTGPSIYSFHCEYVSSLSKKGSLLVTNVPSLWQMTLHNFQIQAFNV TGEQFSYASDCAGFFSPGIWMGLLTTLFMLFIFTYGLHMILSLKTMDRFDDRKGPTITLTQIV ; P ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MSFIKVGIKMGGLTSEQYHSQVVGKIGYIARCMQTIDPENNLKKIREDYQDVLIWAEKNYRFEEILEASKSGKCPNDLDA LSRRSLILQELLRLVSSISPFKMKLDLIESQYEKMKQHVNLWKSDYHVKLNQLNQLTDYLKNAAPTPKNNFLRAMTSVLQ MQIAQYGITEDNEGINQLFKLGLHLLAMANEKIDEQYHLFKGYVKDQPEESPFEGILPAEDQKILVKTMIDYAMPKLSSK VLQDKLSALSSSDVLTKTLLDSIDRIVKENEKLNALSKVKLGKFGLDIREIEVIYSQALKISPQDALQYTAQQCDAQLLS MAFPDSQNYIIESISNKKVKTIAELIHSKEFIYQIIKTEVFKQVDPNEKIRLQAATELYQLLGRIMDKQINLFTKMNLEQ INEYIQTKTKAILDKIPERVELLTFMGFEIPTFKGIETLMTDISHSQDNETLAIAQEFYTNIKNAKNQLLGDKLIEDITP QDVEKFFNQCSQYGSEAAEKLADNRPVLTKIADILTAIARWAISLIGFNTPPQFLAPTRTCVDQVSDEITKIKLKLEDTL GSLQKVQEESLSL ; ;MSFIKVGIKMGGLTSEQYHSQVVGKIGYIARCMQTIDPENNLKKIREDYQDVLIWAEKNYRFEEILEASKSGKCPNDLDA LSRRSLILQELLRLVSSISPFKMKLDLIESQYEKMKQHVNLWKSDYHVKLNQLNQLTDYLKNAAPTPKNNFLRAMTSVLQ MQIAQYGITEDNEGINQLFKLGLHLLAMANEKIDEQYHLFKGYVKDQPEESPFEGILPAEDQKILVKTMIDYAMPKLSSK VLQDKLSALSSSDVLTKTLLDSIDRIVKENEKLNALSKVKLGKFGLDIREIEVIYSQALKISPQDALQYTAQQCDAQLLS MAFPDSQNYIIESISNKKVKTIAELIHSKEFIYQIIKTEVFKQVDPNEKIRLQAATELYQLLGRIMDKQINLFTKMNLEQ INEYIQTKTKAILDKIPERVELLTFMGFEIPTFKGIETLMTDISHSQDNETLAIAQEFYTNIKNAKNQLLGDKLIEDITP QDVEKFFNQCSQYGSEAAEKLADNRPVLTKIADILTAIARWAISLIGFNTPPQFLAPTRTCVDQVSDEITKIKLKLEDTL GSLQKVQEESLSL ; Q,R,S ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MTKMDIRGAVDAAVPTNIIAAKAAEVRANKVNWQSYLQGQMISAEDCEFIQRFEMKRCSEEKQEMLQTEGSQCAKTFINL MTHISKEQTVQYILTMVDDMLQENHQRVSIFFDYAKRSKSTAWPYFLPMLNRQDPFTVHMAARIIAKLAAWGKELMEGSD LNYYFNWIKTQLSSQKLRGSGVAVETGTISASDSSQYVQCVAGCLQLMLRVNEYRFAWVEADGVNCIMGVLSNKCGFQLQ YQMIFSIWLLAFSPQMCEHLRRYNIIPVLSDILQESVKEKVTRIILAAFRNFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLEN LEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEV SDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHN ; ;MTKMDIRGAVDAAVPTNIIAAKAAEVRANKVNWQSYLQGQMISAEDCEFIQRFEMKRCSEEKQEMLQTEGSQCAKTFINL MTHISKEQTVQYILTMVDDMLQENHQRVSIFFDYAKRSKSTAWPYFLPMLNRQDPFTVHMAARIIAKLAAWGKELMEGSD LNYYFNWIKTQLSSQKLRGSGVAVETGTISASDSSQYVQCVAGCLQLMLRVNEYRFAWVEADGVNCIMGVLSNKCGFQLQ YQMIFSIWLLAFSPQMCEHLRRYNIIPVLSDILQESVKEKVTRIILAAFRNFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLEN LEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEV SDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHN ; T ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MDVVNQLVAGGQFRVVKEPLGFVKVLQWVFAIFAFATCGSYTGELRLSVECANKTESALNIEVEFEYPFRLHQVYFDAPS CVKGGTTKIFLVGDYSSSAEFFVTVAVFAFLYSMGALATYIFLQNKYRENNKGPMMDFLATAVFAFMWLVSSSAWAKGLS DVKMATDPENIIKEMPMCRQTGNTCKELRDPVTSGLNTSVVFGFLNLVLWVGNLWFVFKETGWAAPFMRAPPGAPEKQPA PGDAYGDAGYGQGPGGYGPQDSYGPQGGYQPDYGQPASGGGGYGPQGDYGQQGYGQQGAPTSFSNQM ; 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10 ;MTKMDIRGAVDAAVPTNIIAAKAAEVRANKVNWQSYLQGQMISAEDCEFIQRFEMKRCSEEKQEMLQTEGSQCAKTFINL MTHISKEQTVQYILTMVDDMLQENHQRVSIFFDYAKRSKSTAWPYFLPMLNRQDPFTVHMAARIIAKLAAWGKELMEGSD LNYYFNWIKTQLSSQKLRGSGVAVETGTISASDSSQYVQCVAGCLQLMLRVNEYRFAWVEADGVNCIMGVLSNKCGFQLQ YQMIFSIWLLAFSPQMCEHLRRYNIIPVLSDILQESVKEKVTRIILAAFRNFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLEN LEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEV SDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHN ; 1 11 UNP SYPH_RAT P07825 ? 11 ;MDVVNQLVAGGQFRVVKEPLGFVKVLQWVFAIFAFATCGSYTGELRLSVECANKTESALNIEVEFEYPFRLHQVYFDAPS CVKGGTTKIFLVGDYSSSAEFFVTVAVFAFLYSMGALATYIFLQNKYRENNKGPMMDFLATAVFAFMWLVSSSAWAKGLS DVKMATDPENIIKEMPMCRQTGNTCKELRDPVTSGLNTSVVFGFLNLVLWVGNLWFVFKETGWAAPFMRAPPGAPEKQPA PGDAYGDAGYGQGPGGYGPQDSYGPQGGYQPDYGQPASGGGGYGPQGDYGQQGYGQQGAPTSFSNQM ; 1 12 UNP VPP1_RAT P25286 ? 12 ;MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELEELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEEMDRKLRFVEKEIRKANIPIM DTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKRNFLELTELKFILRKTQQFFDEMADPDLLEESSSLLEPNEM GRGAPLRLGFVAGVINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRVKKICEGF RASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVWFIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLI AEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILNRMQTNQTPPTYNKTNKFTHGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTVITFP FLFAVMFGDFGHGILMTLFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSMVFSGRYIILLMGLFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFGSSWS VRPMFTIGNWTEETLLGSSVLQLNPAIPGVFGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLNSFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNH IYFKKPLNIYFGFIPEIIFMSSLFGYLVILIFYKWTAYDAHSSRNAPSLLIHFINMFLFSYPESGNAMLYSGQKGIQCFL IVVAMLCVPWMLLFKPLILRHQYLRKKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDAEEPTEDEVFDFGDTMVH QAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLHVRSLAGGLGLFFIFAAFATLTVAILLIMEGLSAF LHALRLHWVEFQNKFYTGTGFKFLPFSFEHIREGKFDE ; 1 13 UNP B0K022_RAT B0K022 ? 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18 ;MAVLVVLLSSLVSSALANEFSILRSPGSVVFRNGNWPIPGDRIPDVAALSMGFSVKEDLSWPGLAVGNLFHRPRATIMVT VKGVDKLALPTGSVISYPLENAVPFSLDSVANSIHSLFSEETPVVLQLAPSEERVYMVGKANSVFEDLSVTLRQLRNRLF QENSVLNSLPLNSLSRNNEVDLLFLSELQVLHDISSLLSRHKHLAKDHSPDLYSLELAGLDELGKRYGEDSEQFRDASRI LVDALQKFADDMYSLYGGNAVVELVTVKSFDTSLVRKSRTILETKQENTQSPYNLAYKYNLEYSVVFNLVLWIMTGLALA VIITSYNIWNMDPGYDSIIYRMTNQKIRMD ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9BRB A 1 ? 647 ? 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Q6AXS4 1 ? 350 ? 1 350 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 36-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 36 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 PRO A 135 ? 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ARG o 126 LYS o 155 1 ? 30 HELX_P HELX_P379 BQ1 GLU JA 302 ? ASN JA 330 ? GLU p 302 ASN p 330 1 ? 29 HELX_P HELX_P380 BQ2 TYR JA 335 ? THR JA 343 ? TYR p 335 THR p 343 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 475 A . ? PHE 445 A PRO 476 A ? 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