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J . n J 6 216 DC 216 142 ? ? ? J . n J 6 217 DC 217 143 ? ? ? J . n J 6 218 DC 218 144 ? ? ? J . n J 6 219 DG 219 145 ? ? ? J . n J 6 220 DG 220 146 ? ? ? J . n J 6 221 DG 221 147 ? ? ? J . n J 6 222 DT 222 148 ? ? ? J . n J 6 223 DA 223 149 ? ? ? J . n J 6 224 DC 224 150 ? ? ? J . n J 6 225 DC 225 151 ? ? ? J . n J 6 226 DG 226 152 ? ? ? J . n J 6 227 DA 227 153 ? ? ? J . n # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id 1 1 Y 1 B LEU 38 ? CG ? B LEU 38 CG 2 1 Y 1 B LEU 38 ? CD1 ? B LEU 38 CD1 3 1 Y 1 B LEU 38 ? CD2 ? B LEU 38 CD2 4 1 Y 1 F LEU 38 ? CG ? F LEU 38 CG 5 1 Y 1 F LEU 38 ? CD1 ? F LEU 38 CD1 6 1 Y 1 F LEU 38 ? CD2 ? F LEU 38 CD2 7 1 Y 1 F LYS 92 ? CG ? F LYS 92 CG 8 1 Y 1 F LYS 92 ? CD ? F LYS 92 CD 9 1 Y 1 F LYS 92 ? CE ? F LYS 92 CE 10 1 Y 1 F LYS 92 ? NZ ? F LYS 92 NZ 11 1 Y 1 G ILE 63 ? 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G ILE 89 CD1 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 9CAU _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 9CAU _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9CAU _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 9CAU _struct.title 'DeltaArp8 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, Nucleosome' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9CAU _struct_keywords.text 'Chromatin Remodeler, nucleosome, DNA BINDING PROTEIN, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN/DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP H3_YEAST P61830 ? 1 ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLASKAARKSAPSTGGVKKPHRYKPGTVALREIRRFQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAIGALQESVEAYLVSLFEDTNLAAIHAKRVTIQKKDIKLARRLRGERS ; 1 2 UNP H4_XENLA P62799 ? 2 ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 1 3 UNP H2A1_YEAST P04911 ? 3 ;MSGGKGGKAGSAAKASQSRSAKAGLTFPVGRVHRLLRRGNYAQRIGSGAPVYLTAVLEYLAAEILELAGNAARDNKKTRI IPRHLQLAIRNDDELNKLLGNVTIAQGGVLPNIHQNLLPKKSAKATKASQEL ; 1 4 UNP H2B1_YEAST P02293 ? 4 ;MSAKAEKKPASKAPAEKKPAAKKTSTSTDGKKRSKARKETYSSYIYKVLKQTHPDTGISQKSMSILNSFVNDIFERIATE ASKLAAYNKKSTISAREIQTAVRLILPGELAKHAVSEGTRAVTKYSSSTQA ; 1 5 PDB 9CAU 9CAU ? 5 ? 1 6 PDB 9CAU 9CAU ? 6 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9CAU A 1 ? 136 ? P61830 1 ? 136 ? 0 135 2 2 9CAU B 1 ? 103 ? P62799 1 ? 103 ? 1 103 3 3 9CAU C 1 ? 132 ? P04911 1 ? 132 ? 0 131 4 4 9CAU D 1 ? 131 ? P02293 1 ? 131 ? 0 130 5 1 9CAU E 1 ? 136 ? P61830 1 ? 136 ? 0 135 6 2 9CAU F 1 ? 103 ? P62799 1 ? 103 ? 1 103 7 3 9CAU G 1 ? 132 ? P04911 1 ? 132 ? 0 131 8 4 9CAU H 1 ? 131 ? P02293 1 ? 131 ? 0 130 9 5 9CAU I 1 ? 227 ? 9CAU -153 ? 73 ? -153 73 10 6 9CAU J 1 ? 227 ? 9CAU -73 ? 153 ? -73 153 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details decameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 10 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 45 ? 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SER H 58 LYS H 88 1 ? 31 HELX_P HELX_P30 AD3 SER H 94 ? LEU H 106 ? SER H 93 LEU H 105 1 ? 13 HELX_P HELX_P31 AD4 PRO H 107 ? SER H 127 ? PRO H 106 SER H 126 1 ? 21 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? 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J 75 ? I -74 ? J 74 ? 1 I DC 80 1_555 J DG 148 1_555 I DA 81 1_555 J DT 147 1_555 -0.425 0.684 4.283 -0.615 -1.425 37.814 1.294 0.552 4.262 -2.198 0.948 37.845 2 II_DC-74DA-73:DT73DG74_JJ I -74 ? J 74 ? I -73 ? J 73 ? 1 I DA 81 1_555 J DT 147 1_555 I DC 82 1_555 J DG 146 1_555 -0.350 -0.663 3.309 -3.196 0.210 32.462 -1.218 0.059 3.323 0.374 5.699 32.615 3 II_DA-73DC-72:DG72DT73_JJ I -73 ? J 73 ? I -72 ? J 72 ? 1 I DC 82 1_555 J DG 146 1_555 I DA 83 1_555 J DT 145 1_555 0.380 0.184 3.477 -1.178 2.611 38.383 -0.066 -0.732 3.469 3.965 1.789 38.486 4 II_DC-72DA-71:DT71DG72_JJ I -72 ? J 72 ? I -71 ? J 71 ? 1 I DA 83 1_555 J DT 145 1_555 I DG 84 1_555 J DC 144 1_555 -0.743 -0.453 3.318 -1.090 0.144 33.489 -0.810 1.106 3.338 0.249 1.890 33.506 5 II_DA-71DG-70:DC70DT71_JJ I -71 ? J 71 ? I -70 ? J 70 ? 1 I DG 84 1_555 J DC 144 1_555 I DG 85 1_555 J DC 143 1_555 -0.054 -0.281 3.509 1.357 -1.043 38.674 -0.286 0.260 3.512 -1.574 -2.048 38.711 6 II_DG-70DG-69:DC69DC70_JJ I -70 ? J 70 ? I -69 ? 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J 58 ? 1 I DC 96 1_555 J DG 132 1_555 I DT 97 1_555 J DA 131 1_555 0.543 -0.239 3.673 -1.299 -1.737 35.928 -0.109 -1.087 3.659 -2.812 2.103 35.991 17 II_DC-58DT-57:DA57DG58_JJ I -58 ? J 58 ? I -57 ? J 57 ? 1 I DT 97 1_555 J DA 131 1_555 I DG 98 1_555 J DC 130 1_555 0.645 -0.478 3.507 3.188 0.502 38.900 -0.781 -0.551 3.540 0.753 -4.776 39.029 18 II_DT-57DG-56:DC56DA57_JJ I -57 ? J 57 ? I -56 ? J 56 ? 1 I DG 98 1_555 J DC 130 1_555 I DA 99 1_555 J DT 129 1_555 -0.058 0.050 3.660 1.165 1.449 40.125 -0.112 0.232 3.656 2.111 -1.697 40.166 19 II_DG-56DA-55:DT55DC56_JJ I -56 ? J 56 ? I -55 ? J 55 ? 1 I DA 99 1_555 J DT 129 1_555 I DC 100 1_555 J DG 128 1_555 0.267 -1.082 3.510 0.354 -2.397 34.280 -1.425 -0.392 3.578 -4.061 -0.600 34.363 20 II_DA-55DC-54:DG54DT55_JJ I -55 ? J 55 ? I -54 ? J 54 ? 1 I DC 100 1_555 J DG 128 1_555 I DA 101 1_555 J DT 127 1_555 0.113 0.938 4.654 1.548 -2.099 47.680 1.395 0.035 4.612 -2.594 -1.913 47.747 21 II_DC-54DA-53:DT53DG54_JJ I -54 ? J 54 ? I -53 ? J 53 ? 1 I DA 101 1_555 J DT 127 1_555 I DC 102 1_555 J DG 126 1_555 -0.247 -0.819 3.588 -6.292 1.827 33.483 -1.714 -0.676 3.527 3.134 10.792 34.100 22 II_DA-53DC-52:DG52DT53_JJ I -53 ? J 53 ? I -52 ? J 52 ? 1 I DC 102 1_555 J DG 126 1_555 I DG 103 1_555 J DC 125 1_555 -0.357 0.251 3.559 -2.657 -0.588 39.954 0.440 0.190 3.571 -0.859 3.883 40.042 23 II_DC-52DG-51:DC51DG52_JJ I -52 ? J 52 ? I -51 ? J 51 ? 1 I DG 103 1_555 J DC 125 1_555 I DT 104 1_555 J DA 124 1_555 -0.750 -0.880 3.370 0.141 4.132 31.416 -2.383 1.400 3.228 7.590 -0.259 31.680 24 II_DG-51DT-50:DA50DC51_JJ I -51 ? J 51 ? I -50 ? J 50 ? 1 I DT 104 1_555 J DA 124 1_555 I DG 105 1_555 J DC 123 1_555 -0.366 0.222 3.248 -1.598 8.172 45.648 -0.412 0.330 3.250 10.431 2.040 46.362 25 II_DT-50DG-49:DC49DA50_JJ I -50 ? J 50 ? I -49 ? J 49 ? 1 I DG 105 1_555 J DC 123 1_555 I DC 106 1_555 J DG 122 1_555 -0.103 -0.603 3.265 4.524 1.723 29.007 -1.555 1.165 3.172 3.411 -8.954 29.400 26 II_DG-49DC-48:DG48DC49_JJ I -49 ? J 49 ? I -48 ? J 48 ? 1 I DC 106 1_555 J DG 122 1_555 I DC 107 1_555 J DG 121 1_555 -0.451 0.910 3.409 -0.326 0.785 30.403 1.569 0.791 3.435 1.496 0.621 30.414 27 II_DC-48DC-47:DG47DG48_JJ I -48 ? J 48 ? I -47 ? J 47 ? 1 I DC 107 1_555 J DG 121 1_555 I DT 108 1_555 J DA 120 1_555 0.864 2.134 3.411 -0.112 -3.078 44.260 3.117 -1.155 3.261 -4.079 0.148 44.362 28 II_DC-47DT-46:DA46DG47_JJ I -47 ? J 47 ? I -46 ? J 46 ? 1 I DT 108 1_555 J DA 120 1_555 I DG 109 1_555 J DC 119 1_555 -0.250 2.074 3.489 -0.578 -0.174 37.933 3.214 0.306 3.483 -0.267 0.889 37.937 29 II_DT-46DG-45:DC45DA46_JJ I -46 ? J 46 ? I -45 ? J 45 ? 1 I DG 109 1_555 J DC 119 1_555 I DG 110 1_555 J DC 118 1_555 -0.895 1.720 3.615 -3.378 0.498 39.617 2.464 0.877 3.696 0.733 4.973 39.758 30 II_DG-45DG-44:DC44DC45_JJ I -45 ? J 45 ? I -44 ? J 44 ? 1 I DG 110 1_555 J DC 118 1_555 I DA 111 1_555 J DT 117 1_555 -0.585 0.342 3.297 -6.575 9.440 31.784 -1.007 -0.104 3.314 16.573 11.543 33.751 31 II_DG-44DA-43:DT43DC44_JJ I -44 ? J 44 ? I -43 ? 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J 28 ? 1 I DC 126 1_555 J DG 102 1_555 I DC 127 1_555 J DG 101 1_555 0.803 0.798 3.393 3.568 0.267 36.419 1.233 -0.764 3.459 0.425 -5.692 36.588 47 II_DC-28DC-27:DG27DG28_JJ I -28 ? J 28 ? I -27 ? J 27 ? 1 I DC 127 1_555 J DG 101 1_555 I DC 128 1_555 J DG 100 1_555 -0.198 1.000 3.353 0.551 -0.430 39.432 1.534 0.360 3.340 -0.637 -0.817 39.438 48 II_DC-27DC-26:DG26DG27_JJ I -27 ? J 27 ? I -26 ? J 26 ? 1 I DC 128 1_555 J DG 100 1_555 I DC 129 1_555 J DG 99 1_555 0.352 1.277 3.330 3.761 -0.317 36.856 2.054 -0.039 3.338 -0.500 -5.930 37.042 49 II_DC-26DC-25:DG25DG26_JJ I -26 ? J 26 ? I -25 ? J 25 ? 1 I DC 129 1_555 J DG 99 1_555 I DT 130 1_555 J DA 98 1_555 -0.316 1.552 3.708 0.551 -1.318 34.794 2.819 0.623 3.643 -2.204 -0.922 34.823 50 II_DC-25DT-24:DA24DG25_JJ I -25 ? J 25 ? I -24 ? J 24 ? 1 I DT 130 1_555 J DA 98 1_555 I DT 131 1_555 J DA 97 1_555 0.004 1.385 3.489 -6.489 6.177 34.013 1.274 -1.077 3.616 10.339 10.861 35.139 51 II_DT-24DT-23:DA23DA24_JJ I -24 ? J 24 ? I -23 ? 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J -27 ? 1 I DG 181 1_555 J DC 47 1_555 I DA 182 1_555 J DT 46 1_555 -1.444 1.556 3.732 -5.413 1.031 44.455 1.933 1.318 3.907 1.356 7.122 44.778 102 II_DG27DA28:DT-28DC-27_JJ I 27 ? J -27 ? I 28 ? J -28 ? 1 I DA 182 1_555 J DT 46 1_555 I DG 183 1_555 J DC 45 1_555 0.271 0.223 3.238 -5.488 3.684 26.419 -0.437 -1.933 3.121 7.905 11.774 27.219 103 II_DA28DG29:DC-29DT-28_JJ I 28 ? J -28 ? I 29 ? J -29 ? 1 I DG 183 1_555 J DC 45 1_555 I DC 184 1_555 J DG 44 1_555 -0.146 0.292 3.042 -4.822 2.928 35.337 0.080 -0.413 3.048 4.785 7.881 35.770 104 II_DG29DC30:DG-30DC-29_JJ I 29 ? J -29 ? I 30 ? J -30 ? 1 I DC 184 1_555 J DG 44 1_555 I DT 185 1_555 J DA 43 1_555 0.138 -0.748 3.447 -1.838 6.478 29.763 -2.751 -0.638 3.203 12.413 3.522 30.499 105 II_DC30DT31:DA-31DG-30_JJ I 30 ? J -30 ? I 31 ? J -31 ? 1 I DT 185 1_555 J DA 43 1_555 I DG 186 1_555 J DC 42 1_555 0.428 -0.571 3.020 -1.611 8.388 35.171 -1.985 -0.895 2.793 13.634 2.618 36.161 106 II_DT31DG32:DC-32DA-31_JJ I 31 ? J -31 ? I 32 ? 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