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EMDB EMD-45530 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2025-11-19 ? 2 'Structure model' 1 1 2025-12-03 ? # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Data collection' 2 2 'Structure model' 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' citation 2 2 'Structure model' citation_author 3 2 'Structure model' em_admin # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation.country' 2 2 'Structure model' '_citation.journal_abbrev' 3 2 'Structure model' '_citation.journal_id_CSD' 4 2 'Structure model' '_citation.journal_id_ISSN' 5 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_DOI' 6 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 7 2 'Structure model' '_citation.title' 8 2 'Structure model' '_citation.year' 9 2 'Structure model' '_em_admin.last_update' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9CF5 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2024-06-27 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details ;STRUCTURE OF CD4 MIMETIC CJF-III-288 IN COMPLEX WITH BG505 SOSIP.664 HIV-1 ENV TRIMER AND 17B FAB ; _pdbx_database_related.db_id EMD-45530 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email marzena.pazgier@usuhs.edu _pdbx_contact_author.name_first Marzena _pdbx_contact_author.name_last Pazgier _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0003-0594-5057 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Niu, L.' 1 ? 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J GLU 110 OE2 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 9CF5 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 9CF5 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9CF5 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 9CF5 _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 18428 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.685 ? 25033 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 9.211 ? 2795 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.045 ? 2975 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 3101 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9CF5 _struct.title 'STRUCTURE OF CD4 MIMETIC CJF-III-288 IN COMPLEX WITH BG505 SOSIP.664 HIV-1ENV TRIMER AND 17B FAB' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9CF5 _struct_keywords.text 'HIV-1, FUSION, ENTRY, MEMBRANE, VIRAL PROTEIN, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM COMPLEX' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 1 ? J N N 2 ? K N N 3 ? L N N 4 ? M N N 5 ? N N N 6 ? O N N 5 ? P N N 5 ? Q N N 7 ? R N N 5 ? S N N 5 ? T N N 5 ? U N N 7 ? V N N 5 ? W N N 5 ? X N N 5 ? Y N N 8 ? Z N N 8 ? AA N N 8 ? BA N N 8 ? CA N N 8 ? DA N N 8 ? EA N N 8 ? FA N N 9 ? GA N N 8 ? HA N N 8 ? IA N N 8 ? JA N N 8 ? KA N N 8 ? LA N N 8 ? MA N N 8 ? NA N N 8 ? OA N N 8 ? PA N N 9 ? QA N N 8 ? RA N N 8 ? SA N N 8 ? TA N N 8 ? UA N N 8 ? VA N N 8 ? WA N N 8 ? XA N N 8 ? YA N N 8 ? ZA N N 8 ? AB N N 9 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP Q2N0S6_9HIV1 Q2N0S6 ? 1 ;NLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETEKHNVWATHACVPTDPNPQEIHLENVTEEFNMWKNNMVEQMHTDIISLW DQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNVTNNITDDMRGELKNCSFNMTTELRDKKQKVYSLFYRLDVVQINENQGNRSNNSNKEYR LINCNTSAITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNGTGPCPSVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEVMI RSENITNNAKNILVQFNTPVQINCTRPNNNTRKSIRIGPGQAFYATGDIIGDIRQAHCTVSKATWNETLGKVVKQLRKHF GNNTIIRFANSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCNTSGLFNSTWISNTSVQGSNSTGSNDSITLPCRIKQIINMWQRIGQAM YAPPIQGVIRCVSNITGLILTRDGGSTNSTTETFRPGGGDMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTRAKRRVVGREKR ; 32 2 UNP Q2N0S6_9HIV1 Q2N0S6 ? 2 ;AVGIGAVFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRAIEAQQHLLKLTVWGIKQLQARVLAVERYLRDQQ LLGIWGCSGKLICTTNVPWNSSWSNRNLSEIWDNMTWLQWDKEISNYTQIIYGLLEESQNQQEKNEQDLLALD ; 509 3 PDB 9CF5 9CF5 ? 3 ? 1 4 PDB 9CF5 9CF5 ? 4 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9CF5 A 1 ? 477 ? 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UNP Q2N0S6 THR 330 'engineered mutation' 332 1 1 9CF5 CYS A 467 ? UNP Q2N0S6 ALA 498 'engineered mutation' 501 2 1 9CF5 ARG A 475 ? UNP Q2N0S6 GLU 506 'engineered mutation' 509 3 1 9CF5 ARG A 476 ? UNP Q2N0S6 LYS 507 'engineered mutation' 510 4 1 9CF5 ARG A 478 ? UNP Q2N0S6 ? ? insertion 512 5 1 9CF5 ARG A 479 ? UNP Q2N0S6 ? ? insertion 513 6 2 9CF5 PRO B 48 ? UNP Q2N0S6 ILE 556 'engineered mutation' 559 7 2 9CF5 CYS B 94 ? UNP Q2N0S6 THR 602 'engineered mutation' 605 8 5 9CF5 ASN C 299 ? UNP Q2N0S6 THR 330 'engineered mutation' 332 9 5 9CF5 CYS C 467 ? UNP Q2N0S6 ALA 498 'engineered mutation' 501 10 5 9CF5 ARG C 475 ? UNP Q2N0S6 GLU 506 'engineered mutation' 509 11 5 9CF5 ARG C 476 ? UNP Q2N0S6 LYS 507 'engineered mutation' 510 12 5 9CF5 ARG C 478 ? UNP Q2N0S6 ? ? insertion 512 13 5 9CF5 ARG C 479 ? UNP Q2N0S6 ? ? insertion 513 14 6 9CF5 PRO D 48 ? UNP Q2N0S6 ILE 556 'engineered mutation' 559 15 6 9CF5 CYS D 94 ? UNP Q2N0S6 THR 602 'engineered mutation' 605 16 9 9CF5 ASN E 299 ? UNP Q2N0S6 THR 330 'engineered mutation' 332 17 9 9CF5 CYS E 467 ? UNP Q2N0S6 ALA 498 'engineered mutation' 501 18 9 9CF5 ARG E 475 ? UNP Q2N0S6 GLU 506 'engineered mutation' 509 19 9 9CF5 ARG E 476 ? UNP Q2N0S6 LYS 507 'engineered mutation' 510 20 9 9CF5 ARG E 478 ? UNP Q2N0S6 ? ? insertion 512 21 9 9CF5 ARG E 479 ? UNP Q2N0S6 ? ? insertion 513 22 10 9CF5 PRO F 48 ? UNP Q2N0S6 ILE 556 'engineered mutation' 559 23 10 9CF5 CYS F 94 ? UNP Q2N0S6 THR 602 'engineered mutation' 605 24 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB ; # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLU A 32 ? 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ARG H 83 THR H 87 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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B CYS 87 SG ? ? ? 1_555 B CYS 93 SG ? ? B CYS 598 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf11 disulf ? ? C CYS 23 SG ? ? ? 1_555 C CYS 88 SG ? ? K CYS 23 K CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf12 disulf ? ? D CYS 22 SG ? ? ? 1_555 D CYS 96 SG ? ? L CYS 22 L CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf13 disulf ? ? E CYS 22 SG ? ? ? 1_555 E CYS 42 SG ? ? C CYS 54 C CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf14 disulf ? ? E CYS 87 SG ? ? ? 1_555 E CYS 173 SG ? ? C CYS 119 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf15 disulf ? ? E CYS 94 SG ? ? ? 1_555 E CYS 164 SG ? ? C CYS 126 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf16 disulf ? ? E CYS 186 SG ? ? ? 1_555 E CYS 215 SG ? ? C CYS 218 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf17 disulf ? ? E CYS 196 SG ? ? ? 1_555 E CYS 207 SG ? ? C CYS 228 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf18 disulf ? ? E CYS 264 SG ? ? ? 1_555 E CYS 298 SG ? ? C CYS 296 C CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf19 disulf ? ? E CYS 345 SG ? ? ? 1_555 E CYS 411 SG ? ? C CYS 378 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf20 disulf ? ? E CYS 352 SG ? ? ? 1_555 E CYS 384 SG ? ? C CYS 385 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? ? disulf21 disulf ? ? E CYS 467 SG ? ? ? 1_555 F CYS 94 SG ? ? C CYS 501 D CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf22 disulf ? ? F CYS 87 SG ? ? ? 1_555 F CYS 93 SG ? ? D CYS 598 D CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf23 disulf ? ? G CYS 23 SG ? ? ? 1_555 G CYS 88 SG ? ? I CYS 23 I CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf24 disulf ? ? H CYS 22 SG ? ? ? 1_555 H CYS 96 SG ? ? J CYS 22 J CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf25 disulf ? ? I CYS 22 SG ? ? ? 1_555 I CYS 42 SG ? ? E CYS 54 E CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf26 disulf ? ? I CYS 87 SG ? ? ? 1_555 I CYS 173 SG ? ? E CYS 119 E CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf27 disulf ? ? I CYS 94 SG ? ? ? 1_555 I CYS 164 SG ? ? E CYS 126 E CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf28 disulf ? ? I CYS 186 SG ? ? ? 1_555 I CYS 215 SG ? ? E CYS 218 E CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf29 disulf ? ? I CYS 196 SG ? ? ? 1_555 I CYS 207 SG ? ? E CYS 228 E CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf30 disulf ? ? I CYS 264 SG ? ? ? 1_555 I CYS 298 SG ? ? E CYS 296 E CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf31 disulf ? ? I CYS 345 SG ? ? ? 1_555 I CYS 411 SG ? ? E CYS 378 E CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf32 disulf ? ? I CYS 352 SG ? ? ? 1_555 I CYS 384 SG ? ? E CYS 385 E CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? ? disulf33 disulf ? ? I CYS 467 SG ? ? ? 1_555 J CYS 94 SG ? ? E CYS 501 F CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf34 disulf ? ? J CYS 87 SG ? ? ? 1_555 J CYS 93 SG ? ? F CYS 598 F CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf35 disulf ? ? K CYS 23 SG ? ? ? 1_555 K CYS 88 SG ? ? G CYS 23 G CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf36 disulf ? ? L CYS 22 SG ? ? ? 1_555 L CYS 96 SG ? ? H CYS 22 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? covale1 covale one ? 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N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 353 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? A ASN 386 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? A ASN 359 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? A ASN 392 A NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? A ASN 414 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? A ASN 448 A NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? B ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? B ASN 637 B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? E ASN 56 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? C ASN 88 C NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? E ASN 202 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? C ASN 234 C NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? E ASN 230 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? C ASN 262 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? E ASN 244 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? C ASN 276 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? E ASN 263 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? C ASN 295 C NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? E ASN 299 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? C ASN 332 C NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? E ASN 306 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? C ASN 339 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? E ASN 322 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? C ASN 355 C NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? E ASN 330 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? C ASN 363 C NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? E ASN 353 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? C ASN 386 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? E ASN 359 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? C ASN 392 C NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? E ASN 414 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? C ASN 448 C NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? F ASN 107 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? D ASN 618 D NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? F ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? D ASN 637 D NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? I ASN 56 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? E ASN 88 E NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? I ASN 202 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? E ASN 234 E NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? I ASN 230 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? E ASN 262 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? I ASN 244 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? E ASN 276 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? I ASN 263 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? E ASN 295 E NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? I ASN 299 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? E ASN 332 E NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? I ASN 306 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? E ASN 339 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? I ASN 322 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? E ASN 355 E NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? I ASN 330 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? E ASN 363 E NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? I ASN 353 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? E ASN 386 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? I ASN 359 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? E ASN 392 E NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? I ASN 414 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? E ASN 448 E NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale39 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale40 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale41 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N BMA . C1 ? ? N NAG 2 N BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale42 covale both ? N BMA . O3 ? ? ? 1_555 N MAN . C1 ? ? N BMA 3 N MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale43 covale both ? N BMA . O6 ? ? ? 1_555 N MAN . C1 ? ? N BMA 3 N MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale44 covale both ? N MAN . O2 ? ? ? 1_555 N MAN . C1 ? ? N MAN 4 N MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale45 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale46 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale47 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale48 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q BMA . C1 ? ? O NAG 2 O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale49 covale both ? Q BMA . O3 ? ? ? 1_555 Q MAN . C1 ? ? O BMA 3 O MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale50 covale both ? Q BMA . O6 ? ? ? 1_555 Q MAN . C1 ? ? O BMA 3 O MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale51 covale both ? Q MAN . O2 ? ? ? 1_555 Q MAN . C1 ? ? O MAN 4 O MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale52 covale both ? Q MAN . O3 ? ? ? 1_555 Q MAN . C1 ? ? O MAN 6 O MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale53 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale54 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale55 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale56 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale57 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U BMA . C1 ? ? 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AE2 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC2 5 6 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC7 4 5 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC8 4 5 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD5 4 5 ? anti-parallel AD5 5 6 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD7 4 5 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LEU A 460 ? 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SER A 413 CYS A 418 AA8 2 ALA A 296 ? SER A 301 ? ALA A 329 SER A 334 AA8 3 VAL A 260 ? ARG A 266 ? VAL A 292 ARG A 298 AA8 4 ILE A 409 ? ILE A 415 ? ILE A 443 ILE A 449 AA9 1 ILE A 389 ? ILE A 390 ? ILE A 423 ILE A 424 AA9 2 ALA A 399 ? MET A 400 ? ALA A 433 MET A 434 AB1 1 LEU C 33 ? GLN C 38 ? LEU K 33 GLN K 38 AB1 2 VAL C 85 ? GLN C 90 ? VAL K 85 GLN K 90 AB2 1 GLN D 3 ? GLU D 6 ? GLN L 3 GLU L 6 AB2 2 CYS D 22 ? SER D 25 ? CYS L 22 SER L 25 AB3 1 VAL D 57 ? ALA D 58 ? VAL L 56 ALA L 57 AB3 2 ARG D 50 ? ILE D 52 ? ARG L 50 ILE L 52 AB3 3 SER D 33 ? GLN D 39 ? SER L 33 GLN L 39 AB3 4 VAL D 93 ? VAL D 99 ? VAL L 89 VAL L 95 AB3 5 THR D 122 ? LEU D 123 ? THR L 107 LEU L 108 AB4 1 VAL D 68 ? ASP D 73 ? VAL L 67 ASP L 72 AB4 2 THR D 78 ? LEU D 83 ? THR L 77 LEU L 82 AB5 1 VAL E 462 ? ALA E 463 ? VAL C 496 ALA C 497 AB5 2 TRP E 3 ? TYR E 7 ? TRP C 35 TYR C 39 AB5 3 ILE F 92 ? PRO F 98 ? ILE D 603 PRO D 609 AB6 1 VAL E 12 ? ASP E 15 ? VAL C 44 ASP C 47 AB6 2 LYS E 453 ? GLU E 458 ? 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