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E . n F 1 352 THR 352 328 ? ? ? E . n # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 3 NAG 1 401 404 NAG NAG A . H 3 NAG 1 402 413 NAG NAG A . I 3 NAG 1 403 414 NAG NAG A . J 3 NAG 1 501 202 NAG NAG B . K 3 NAG 1 501 202 NAG NAG D . L 3 NAG 1 501 202 NAG NAG F . M 3 NAG 1 401 404 NAG NAG C . N 3 NAG 1 402 413 NAG NAG C . O 3 NAG 1 403 414 NAG NAG C . P 3 NAG 1 401 404 NAG NAG E . Q 3 NAG 1 402 413 NAG NAG E . R 3 NAG 1 403 414 NAG NAG E . # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id 1 1 Y 1 A THR 10 ? CB ? A THR 34 CB 2 1 Y 1 A THR 10 ? OG1 ? A THR 34 OG1 3 1 Y 1 A THR 10 ? CG2 ? A THR 34 CG2 4 1 Y 1 C THR 10 ? CB ? E THR 34 CB 5 1 Y 1 C THR 10 ? OG1 ? E THR 34 OG1 6 1 Y 1 C THR 10 ? CG2 ? E THR 34 CG2 7 1 Y 1 E THR 10 ? CB ? F THR 34 CB 8 1 Y 1 E THR 10 ? OG1 ? F THR 34 OG1 9 1 Y 1 E THR 10 ? CG2 ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.723 ? 15960 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 11.381 ? 4332 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.100 ? 1782 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.013 ? 2082 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9CXU _struct.title 'Endo H-treated hemagglutinin A/Hong Kong/1/68' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9CXU _struct_keywords.text 'hemagglutinin, glycoprotein, H3, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 3 ? H N N 3 ? I N N 3 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 3 ? M N N 3 ? N N N 3 ? O N N 3 ? P N N 3 ? Q N N 3 ? 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D CYS 145 SG ? ? ? 1_555 D CYS 149 SG ? ? F CYS 144 F CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.070 ? ? disulf11 disulf ? ? E CYS 76 SG ? ? ? 1_555 E CYS 301 SG ? ? C CYS 52 C CYS 277 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? ? disulf12 disulf ? ? E CYS 88 SG ? ? ? 1_555 E CYS 100 SG ? ? C CYS 64 C CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf13 disulf ? ? E CYS 121 SG ? ? ? 1_555 E CYS 163 SG ? ? C CYS 97 C CYS 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf14 disulf ? ? E CYS 305 SG ? ? ? 1_555 E CYS 329 SG ? ? C CYS 281 C CYS 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf15 disulf ? ? F CYS 76 SG ? ? ? 1_555 F CYS 301 SG ? ? E CYS 52 E CYS 277 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? ? disulf16 disulf ? ? F CYS 88 SG ? ? ? 1_555 F CYS 100 SG ? ? E CYS 64 E CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? ? disulf17 disulf ? ? F CYS 121 SG ? ? ? 1_555 F CYS 163 SG ? ? E CYS 97 E CYS 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf18 disulf ? ? F CYS 305 SG ? ? ? 1_555 F CYS 329 SG ? ? E CYS 281 E CYS 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? ? covale1 covale one ? A ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? A ASN 81 A NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 189 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? A ASN 165 A NAG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 309 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? A ASN 285 A NAG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? B ASN 155 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? B ASN 154 B NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? C ASN 155 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? D ASN 154 D NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.520 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? D ASN 155 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? F ASN 154 F NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.520 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? E ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? C ASN 81 C NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? E ASN 189 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? C ASN 165 C NAG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? E ASN 309 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? C ASN 285 C NAG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? F ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? E ASN 81 E NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? F ASN 189 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? E ASN 165 E NAG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? F ASN 309 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? E ASN 285 E NAG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG G . ? 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CYS E 281 ? 1_555 CYS E 305 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASN 78 A . ? ASN 54 A PRO 79 A ? PRO 55 A 1 -3.64 2 ASN 78 E . ? ASN 54 C PRO 79 E ? PRO 55 C 1 -3.73 3 ASN 78 F . ? ASN 54 E PRO 79 F ? PRO 55 E 1 -3.78 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 5 ? AB5 ? 5 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 3 ? AC2 ? 5 ? AC3 ? 5 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 3 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 2 ? AD1 ? 3 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 3 ? AD4 ? 5 ? AD5 ? 5 ? AD6 ? 2 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 4 ? AD9 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? parallel AA5 1 2 ? parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? parallel AB9 1 2 ? parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? parallel AD1 2 3 ? parallel AD2 1 2 ? parallel AD3 1 2 ? parallel AD3 2 3 ? parallel AD4 1 2 ? parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD5 1 2 ? parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD5 4 5 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLY B 32 ? 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