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D GLU 105 OE2 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 9DZG _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 9DZG _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9DZG _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 9DZG _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.002 ? 8372 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.542 ? 11452 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.425 ? 1235 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.067 ? 1305 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 1458 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9DZG _struct.title 'Human GC-A bound to XX16' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9DZG _struct_keywords.text 'receptor, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 4 ? F N N 5 ? G N N 4 ? H N N 4 ? I N N 6 ? J N N 6 ? K N N 7 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ANPRA_HUMAN P16066 ? 1 ;GNLTVAVVLPLANTSYPWSWARVGPAVELALAQVKARPDLLPGWTVRTVLGSSENALGVCSDTAAPLAAVDLKWEHNPAV FLGPGCVYAAAPVGRFTAHWRVPLLTAGAPALGFGVKDEYALTTRAGPSYAKLGDFVAALHRRLGWERQALMLYAYRPGD EEHCFFLVEGLFMRVRDRLNITVDHLEFAEDDLSHYTRLLRTMPRKGRVIYICSSPDAFRTLMLLALEAGLCGEDYVFFH LDIFGQSLQGGQGPAPRRPWERGDGQDVSARQAFQAAKIITYKDPDNPEYLEFLKQLKHLAYEQFNFTMEDGLVNTIPAS FHDGLLLYIQAVTETLAHGGTVTDGENITQRMWNRSFQGVTGYLKIDSSGDRETDFSLWDMDPENGAFRVVLNYNGTSQE LVAVSGRKLNWPLGYPPPDIPKCGFDNEDPACNQDHLSTLEVLALVGSLSLLGILIVSFFIYRKMQLEKELASELWRVRW EDVEPSSLERHLRSAGSRLTLSGRGSNYGSLLTTEGQFQVFAKTAYYKGNLVAVKRVNRKRIELTRKVLFELKHMRDVQN EHLTRFVGACTDPPNICILTEYCPRGSLQDILENESITLDWMFRYSLTNDIVKGMLFLHNGAICSHGNLKSSNCVVDGRF VLKITDYGLESFRDLDPEQGHTVYAKKLWTAPELLRMASPPVRGSQAGDVYSFGIILQEIALRSGVFHVEGLDLSPKEII ERVTRGEQPPFRPSLALQSHLEELGLLMQRCWAEDPQERPPFQQIRLTLRKFNRENSSNILDNLLSRMEQYANNLEELVE ERTQAYLEEKRKAEALLYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAESTPMQVVTLLNDLYTCFDAVI DNFDVYKVETIGDAYMVVSGLPVRNGRLHACEVARMALALLDAVRSFRIRHRPQEQLRLRIGIHTGPVCAGVVGLKMPRY CLFGDTVNTASRMESNGEALKIHLSSETKAVLEEFGGFELELRGDVEMKGKGKVRTYWLLGERGSSTRG ; 33 2 PDB 9DZG 9DZG ? 2 ? 1 3 PDB 9DZG 9DZG ? 3 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9DZG A 1 ? 1029 ? P16066 33 ? 1061 ? 1 1029 2 1 9DZG B 1 ? 1029 ? P16066 33 ? 1061 ? 1 1029 3 2 9DZG H 1 ? 228 ? 9DZG 1 ? 228 ? 1 228 4 3 9DZG L 1 ? 214 ? 9DZG 1 ? 214 ? 1 214 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 19 ? LYS A 35 ? SER A 19 LYS A 35 1 ? 17 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 63 ? ASN A 77 ? THR A 63 ASN A 77 1 ? 15 HELX_P HELX_P3 AA3 CYS A 86 ? ARG A 101 ? CYS A 86 ARG A 101 1 ? 16 HELX_P HELX_P4 AA4 ALA A 111 ? VAL A 116 ? ALA A 111 VAL A 116 5 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 TYR A 130 ? GLY A 145 ? TYR A 130 GLY A 145 1 ? 16 HELX_P HELX_P6 AA6 GLU A 162 ? LEU A 179 ? GLU A 162 LEU A 179 1 ? 18 HELX_P HELX_P7 AA7 LEU A 193 ? ARG A 201 ? LEU A 193 ARG A 201 1 ? 9 HELX_P HELX_P8 AA8 THR A 202 ? LYS A 206 ? THR A 202 LYS A 206 5 ? 5 HELX_P HELX_P9 AA9 SER A 215 ? ALA A 229 ? SER A 215 ALA A 229 1 ? 15 HELX_P HELX_P10 AB1 CYS A 232 ? TYR A 236 ? CYS A 232 TYR A 236 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 GLN A 266 ? PHE A 274 ? GLN A 266 PHE A 274 1 ? 9 HELX_P HELX_P12 AB3 ASN A 287 ? ASN A 306 ? ASN A 287 ASN A 306 1 ? 20 HELX_P HELX_P13 AB4 GLY A 312 ? THR A 316 ? GLY A 312 THR A 316 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 AB5 ASP A 323 ? LEU A 336 ? ASP A 323 LEU A 336 1 ? 14 HELX_P HELX_P15 AB6 ALA A 337 ? GLY A 339 ? ALA A 337 GLY A 339 5 ? 3 HELX_P HELX_P16 AB7 ASP A 344 ? THR A 349 ? ASP A 344 THR A 349 1 ? 6 HELX_P HELX_P17 AB8 SER B 19 ? ALA B 32 ? SER B 19 ALA B 32 1 ? 14 HELX_P HELX_P18 AB9 ALA B 64 ? HIS B 76 ? ALA B 64 HIS B 76 1 ? 13 HELX_P HELX_P19 AC1 ALA B 89 ? ALA B 98 ? ALA B 89 ALA B 98 1 ? 10 HELX_P HELX_P20 AC2 ALA B 111 ? VAL B 116 ? ALA B 111 VAL B 116 5 ? 6 HELX_P HELX_P21 AC3 TYR B 130 ? GLY B 145 ? TYR B 130 GLY B 145 1 ? 16 HELX_P HELX_P22 AC4 GLU B 162 ? ASP B 177 ? GLU B 162 ASP B 177 1 ? 16 HELX_P HELX_P23 AC5 LEU B 193 ? MET B 203 ? LEU B 193 MET B 203 1 ? 11 HELX_P HELX_P24 AC6 PRO B 204 ? LYS B 206 ? PRO B 204 LYS B 206 5 ? 3 HELX_P HELX_P25 AC7 SER B 215 ? ALA B 229 ? SER B 215 ALA B 229 1 ? 15 HELX_P HELX_P26 AC8 GLN B 266 ? PHE B 274 ? GLN B 266 PHE B 274 1 ? 9 HELX_P HELX_P27 AC9 ASN B 287 ? GLN B 304 ? ASN B 287 GLN B 304 1 ? 18 HELX_P HELX_P28 AD1 GLY B 312 ? VAL B 314 ? GLY B 312 VAL B 314 5 ? 3 HELX_P HELX_P29 AD2 ASN B 315 ? LEU B 327 ? ASN B 315 LEU B 327 1 ? 13 HELX_P HELX_P30 AD3 LEU B 327 ? HIS B 338 ? LEU B 327 HIS B 338 1 ? 12 HELX_P HELX_P31 AD4 ASP B 344 ? GLN B 350 ? ASP B 344 GLN B 350 1 ? 7 HELX_P HELX_P32 AD5 THR C 28 ? TYR C 32 ? THR H 28 TYR H 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P33 AD6 ARG C 87 ? THR C 91 ? ARG H 87 THR H 91 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 60 SG ? ? ? 1_555 A CYS 86 SG ? ? A CYS 60 A CYS 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 164 SG ? ? ? 1_555 A CYS 213 SG ? ? A CYS 164 A CYS 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 60 SG ? ? ? 1_555 B CYS 86 SG ? ? B CYS 60 B CYS 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf4 disulf ? ? B CYS 164 SG ? ? ? 1_555 B CYS 213 SG ? ? B CYS 164 B CYS 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf5 disulf ? ? C CYS 22 SG ? ? ? 1_555 C CYS 96 SG ? ? H CYS 22 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf6 disulf ? ? D CYS 23 SG ? ? ? 1_555 D CYS 88 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? covale1 covale one ? A ASN 13 ND2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? A ASN 13 C NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 395 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? A ASN 395 D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? B ASN 13 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? B ASN 13 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? B ASN 395 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? B ASN 395 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale5 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? C NAG 1 C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale6 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? D NAG 1 D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale7 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F BMA . C1 ? ? D NAG 2 D BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale8 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale9 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG E . ? 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