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'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? 2 ZN ? ? ZN ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 9 6LT 1 401 401 6LT 6LT E . 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.533 ? 24649 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.373 ? 2423 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.039 ? 2787 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 3156 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9E81 _struct.title 'Cryo-EM structure of COP9 signalosome in complex with CSN5i-3' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9E81 _struct_keywords.text 'COP9, COP9 signalosome, signalosome, NEDD8, CSN5i-3, deneddylation, CSN5, metalloprotease, SIGNALING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'SIGNALING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? 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O LYS F 97 # _pdbx_entry_details.entry_id 9E81 _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y _pdbx_entry_details.has_protein_modification N # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 CYS A 67 ? ? -161.98 73.70 2 1 LEU A 70 ? ? -140.57 17.71 3 1 ARG A 84 ? ? -79.87 -166.00 4 1 VAL A 88 ? ? -121.63 -63.43 5 1 GLU A 230 ? ? 39.13 51.32 6 1 GLN A 234 ? ? 57.75 -95.36 7 1 SER A 240 ? ? 64.72 171.73 8 1 CYS A 278 ? ? 59.50 -116.33 9 1 SER A 314 ? ? -91.36 50.19 10 1 LYS B 288 ? ? 45.27 26.08 11 1 ILE B 291 ? ? 52.06 70.25 12 1 PHE B 294 ? ? -69.29 7.35 13 1 PRO B 306 ? ? -67.12 1.63 14 1 SER B 335 ? ? 67.93 -2.90 15 1 ASN B 379 ? ? 60.99 60.17 16 1 ASN C 38 ? ? -98.21 36.16 17 1 THR C 44 ? ? -92.28 49.38 18 1 VAL C 51 ? ? 31.33 -128.49 19 1 PHE C 66 ? ? 65.90 -2.15 20 1 SER C 70 ? ? -141.87 48.15 21 1 VAL C 71 ? ? 53.20 -173.71 22 1 PRO C 72 ? ? -51.44 -9.17 23 1 ASP C 73 ? ? -95.44 34.92 24 1 ASN C 89 ? ? 55.80 -172.03 25 1 THR C 97 ? ? -80.41 48.81 26 1 PRO C 117 ? ? -81.00 45.96 27 1 LEU C 124 ? ? -82.54 46.16 28 1 LYS C 125 ? ? -130.79 -36.79 29 1 ALA C 175 ? ? 60.00 -148.83 30 1 HIS C 218 ? ? -90.91 43.99 31 1 GLU C 222 ? ? -81.78 44.49 32 1 SER C 223 ? ? -132.12 -37.38 33 1 TYR C 267 ? ? -84.50 46.09 34 1 ASN C 270 ? ? -69.09 98.53 35 1 HIS C 282 ? ? -98.24 31.62 36 1 ASN C 291 ? ? -94.00 52.71 37 1 THR C 316 ? ? -160.53 117.18 38 1 ALA C 323 ? ? -84.57 46.66 39 1 SER C 324 ? ? -140.23 -17.12 40 1 PHE C 403 ? ? -91.82 46.52 41 1 ARG D 199 ? ? 56.36 17.46 42 1 GLU D 365 ? ? -59.90 172.43 43 1 ALA D 392 ? ? -154.71 73.87 44 1 GLU D 394 ? ? 51.01 -122.40 45 1 TRP D 395 ? ? 33.20 -128.66 46 1 HIS E 50 ? ? -94.58 57.10 47 1 ALA E 109 ? ? 55.81 -97.83 48 1 ALA E 111 ? ? 60.57 -100.09 49 1 ASP E 197 ? ? 33.68 -128.02 50 1 GLU F 95 ? ? 54.84 -97.30 51 1 VAL F 115 ? ? -101.67 -63.01 52 1 LEU F 221 ? ? -86.56 48.70 53 1 TYR F 313 ? ? -97.84 37.09 54 1 TYR G 78 ? ? -92.48 48.11 55 1 ALA H 27 ? ? 61.45 157.46 56 1 GLU H 100 ? ? 57.46 19.12 57 1 THR H 158 ? ? 62.14 -69.45 # _space_group_symop.id 1 _space_group_symop.operation_xyz x,y,z # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 9E81 _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? # loop_ _em_3d_fitting_list.id _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range _em_3d_fitting_list.details _em_3d_fitting_list.chain_id _em_3d_fitting_list.chain_residue_range _em_3d_fitting_list.source_name _em_3d_fitting_list.type _em_3d_fitting_list.accession_code _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 1 4D10 ? ? ? ? ? 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