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M 9 BEF 1 1502 1502 BEF BEF W . # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 9EAR _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 9EAR _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9EAR _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 9EAR _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 18978 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.644 ? 26969 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 24.822 ? 7643 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.088 ? 3007 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 2327 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9EAR _struct.title 'CHD1-nucleosome complex (closed state)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9EAR _struct_keywords.text 'chromatin, remodeler, genome organization, nuclear protein, TRANSLOCASE' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSLOCASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? L N N 8 ? M N N 9 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A310TTQ1_XENLA A0A310TTQ1 ? 1 ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 1 2 UNP H4_XENLA P62799 ? 2 ;RHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRT LYGFGG ; 18 3 UNP Q6AZJ8_XENLA Q6AZJ8 ? 3 ;AKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAVRNDEEL NKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPK ; 15 4 UNP A0A1L8FQA5_XENLA A0A1L8FQA5 ? 4 ;KTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHA VSEGTKAVTKYTSAK ; 32 5 PDB 9EAR 9EAR ? 5 ? 1 6 PDB 9EAR 9EAR ? 6 ? 1 7 UNP CHD1_HUMAN O14646 ? 7 ;NGHSDEESVRNSSGESSQSDDDSGSASGSGSGSSSGSSSDGSSSQSGSSDSDSGSESGSQSESESDTSRENKVQAKPPKV DGAEFWKSSPSILAVQRSAILKKQQQQQQQQQHQASSNSGSEEDSSSSEDSDDSSSEVKRKKHKDEDWQMSGSGSPSQSG SDSESEEEREKSSCDETESDYEPKNKVKSRKPQNRSKSKNGKKILGQKKRQIDSSEEDDDEEDYDNDKRSSRRQATVNVS YKEDEEMKTDSDDLLEVCGEDVPQPEEEEFETIERFMDCRIGRKGATGATTTIYAVEADGDPNAGFEKNKEPGEIQYLIK WKGWSHIHNTWETEETLKQQNVRGMKKLDNYKKKDQETKRWLKNASPEDVEYYNCQQELTDDLHKQYQIVERIIAHSNQK SAAGYPDYYCKWQGLPYSECSWEDGALISKKFQACIDEYFSRNQSKTTPFKDCKVLKQRPRFVALKKQPSYIGGHEGLEL RDYQLNGLNWLAHSWCKGNSCILADEMGLGKTIQTISFLNYLFHEHQLYGPFLLVVPLSTLTSWQREIQTWASQMNAVVY LGDINSRNMIRTHEWTHHQTKRLKFNILLTTYEILLKDKAFLGGLNWAFIGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLI TGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFSSWEDFEEEHGKGREYGYASLHKELEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRMEMSAL QKQYYKWILTRNYKALSKGSKGSTSGFLNIMMELKKCCNHCYLIKPPDNNEFYNKQEALQHLIRSSGKLILLDKLLIRLR ERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLKYRQFPFQRLDGSIKGELRKQALDHFNAEGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVI FDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGSVEEDILERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGKTVLHTGSAPSSSTPFN KEELSAILKFGAEELFKEPEGEEQEPQEMDIDEILKRAETHENEPGPLTVGDELLSQFKVANFSNMDEDDIELEPERNSK NWEEIIPEDQRRRLEEEERQKELEEIYMLPRMRNCAKQISFNGSEGRRSRSRRYSGSDSDSISEGKRPKKRGRPRTIPRE NIKGFSDAEIRRFIKSYKKFGGPLERLDAIARDAELVDKSETDLRRLGELVHNGCIKALKDSSSGTERTGGRLGKVKGPT FRISGVQVNAKLVISHEEELIPLHKSIPSDPEERKQYTIPCHTKAAHFDIDWGKEDDSNLLIGIYEYGYGSWEMIKMDPD LSLTHKILPDDPDKKPQAKQLQTRADYLIKLLSRDLAKKEALSGAG ; 2 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9EAR A 1 ? 136 ? A0A310TTQ1 1 ? 136 ? 0 135 2 2 9EAR B 1 ? 86 ? P62799 18 ? 103 ? 17 102 3 3 9EAR C 1 ? 105 ? Q6AZJ8 15 ? 119 ? 14 118 4 4 9EAR D 1 ? 95 ? A0A1L8FQA5 32 ? 126 ? 28 122 5 1 9EAR E 1 ? 136 ? A0A310TTQ1 1 ? 136 ? 0 135 6 2 9EAR F 1 ? 86 ? P62799 18 ? 103 ? 17 102 7 3 9EAR G 1 ? 105 ? Q6AZJ8 15 ? 119 ? 14 118 8 4 9EAR H 1 ? 95 ? A0A1L8FQA5 32 ? 126 ? 28 122 9 5 9EAR I 1 ? 158 ? 9EAR -81 ? 76 ? -81 76 10 6 9EAR J 1 ? 158 ? 9EAR -76 ? 81 ? -76 81 11 7 9EAR W 4 ? 1329 ? O14646 2 ? 1327 ? 2 1327 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 9EAR ALA A 111 ? UNP A0A310TTQ1 CYS 111 'engineered mutation' 110 1 5 9EAR ALA E 111 ? UNP A0A310TTQ1 CYS 111 'engineered mutation' 110 2 11 9EAR SER W 1 ? UNP O14646 ? ? 'expression tag' -1 3 11 9EAR ASN W 2 ? UNP O14646 ? ? 'expression tag' 0 4 11 9EAR ALA W 3 ? UNP O14646 ? ? 'expression tag' 1 5 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 11-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 11 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 45 ? SER A 58 ? GLY A 44 SER A 57 1 ? 14 HELX_P HELX_P2 AA2 ARG A 64 ? ASP A 78 ? ARG A 63 ASP A 77 1 ? 15 HELX_P HELX_P3 AA3 GLN A 86 ? ALA A 115 ? GLN A 85 ALA A 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P4 AA4 MET A 121 ? GLY A 133 ? MET A 120 GLY A 132 1 ? 13 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP B 8 ? ILE B 13 ? ASP B 24 ILE B 29 5 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 THR B 14 ? GLY B 25 ? THR B 30 GLY B 41 1 ? 12 HELX_P HELX_P7 AA7 LEU B 33 ? ALA B 60 ? LEU B 49 ALA B 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P8 AA8 THR B 66 ? GLN B 77 ? THR B 82 GLN B 93 1 ? 12 HELX_P HELX_P9 AA9 SER C 5 ? GLY C 9 ? SER C 18 GLY C 22 5 ? 5 HELX_P HELX_P10 AB1 PRO C 13 ? LYS C 23 ? PRO C 26 LYS C 36 1 ? 11 HELX_P HELX_P11 AB2 ALA C 32 ? ASN C 60 ? ALA C 45 ASN C 73 1 ? 29 HELX_P HELX_P12 AB3 ILE C 66 ? ASP C 77 ? ILE C 79 ASP C 90 1 ? 12 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP C 77 ? LEU C 84 ? ASP C 90 LEU C 97 1 ? 8 HELX_P HELX_P14 AB5 GLN C 99 ? LEU C 103 ? GLN C 112 LEU C 116 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 TYR D 7 ? HIS D 19 ? TYR D 34 HIS D 46 1 ? 13 HELX_P HELX_P16 AB7 SER D 25 ? 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J 69 ? 1 I DA 13 1_555 J DT 146 1_555 I DG 14 1_555 J DC 145 1_555 0.077 -0.176 2.785 0.379 6.094 34.217 -1.083 -0.080 2.715 10.255 -0.637 34.741 12 II_DA-69DG-68:DC68DT69_JJ I -69 ? J 69 ? I -68 ? J 68 ? 1 I DG 14 1_555 J DC 145 1_555 I DA 15 1_555 J DT 144 1_555 0.340 0.187 3.369 6.438 -0.504 26.865 0.520 0.920 3.354 -1.065 -13.608 27.616 13 II_DG-68DA-67:DT67DC68_JJ I -68 ? J 68 ? I -67 ? J 67 ? 1 I DC 18 1_555 J DG 141 1_555 I DC 19 1_555 J DG 140 1_555 -0.766 1.391 4.198 -1.018 3.843 60.293 1.139 0.697 4.283 3.821 1.012 60.411 14 II_DC-64DC-63:DG63DG64_JJ I -64 ? J 64 ? I -63 ? J 63 ? 1 I DC 19 1_555 J DG 140 1_555 I DC 20 1_555 J DG 139 1_555 2.257 -1.240 2.848 -8.503 4.789 77.893 -1.091 -1.981 2.563 3.795 6.739 78.405 15 II_DC-63DC-62:DG62DG63_JJ I -63 ? J 63 ? I -62 ? J 62 ? 1 I DC 20 1_555 J DG 139 1_555 I DG 21 1_555 J DC 138 1_555 0.216 1.735 3.856 5.793 0.093 -31.567 -3.159 1.611 3.753 -0.169 10.537 -32.081 16 II_DC-62DG-61:DC61DG62_JJ I -62 ? J 62 ? I -61 ? 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J 45 ? 1 I DA 37 1_555 J DT 122 1_555 I DA 38 1_555 J DT 121 1_555 -0.688 1.352 3.506 -3.261 -0.876 39.055 2.128 0.606 3.520 -1.307 4.867 39.195 32 II_DA-45DA-44:DT44DT45_JJ I -45 ? J 45 ? I -44 ? J 44 ? 1 I DA 38 1_555 J DT 121 1_555 I DT 39 1_555 J DA 120 1_555 -0.707 -0.478 3.115 -11.591 3.543 31.043 -1.419 -0.671 3.102 6.325 20.694 33.271 33 II_DA-44DT-43:DA43DT44_JJ I -44 ? J 44 ? I -43 ? J 43 ? 1 I DT 39 1_555 J DA 120 1_555 I DT 40 1_555 J DA 119 1_555 -0.013 -0.162 3.052 -5.737 5.155 36.101 -0.906 -0.702 2.969 8.203 9.129 36.889 34 II_DT-43DT-42:DA42DA43_JJ I -43 ? J 43 ? I -42 ? J 42 ? 1 I DT 40 1_555 J DA 119 1_555 I DG 41 1_555 J DC 118 1_555 0.316 -0.524 3.018 -7.025 10.415 32.635 -2.280 -1.476 2.613 17.736 11.964 34.908 35 II_DT-42DG-41:DC41DA42_JJ I -42 ? J 42 ? I -41 ? J 41 ? 1 I DG 41 1_555 J DC 118 1_555 I DG 42 1_555 J DC 117 1_555 -0.390 -1.054 2.943 1.992 6.450 32.755 -2.756 0.964 2.666 11.288 -3.485 33.424 36 II_DG-41DG-40:DC40DC41_JJ I -41 ? J 41 ? I -40 ? 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