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EMD-19815 'consensus EM volume' PDB . 9EMA unspecified EMDB 'RUVBL1/2 in complex with ATP' EMD-19817 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email ollorca@cnio.es _pdbx_contact_author.name_first Oscar _pdbx_contact_author.name_last Llorca _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0001-5705-0699 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Lopez-Perrote, A.' 1 0000-0001-7872-3442 'Llorca, O.' 2 0000-0001-5705-0699 'Garcia-Martin, C.' 3 0000-0003-4132-9307 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Cell Rep Phys Sci' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2666-3864 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Mechanism of allosteric inhibition of RUVBL1-RUVBL2 by the small-molecule CB-6644' _citation.year 2024 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.xcrp.2024.101982 _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Garcia-Martin, C.' 1 0000-0003-4132-9307 primary 'Lopez-Perrote, A.' 2 0000-0001-7872-3442 primary 'Boskovic, J.' 3 0000-0001-6135-0686 primary 'Llorca, O.' 4 0000-0001-5705-0699 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'RuvB-like 1' 50579.188 3 3.6.4.12 ? ? ;Sequence contains three extra aminoacids (GSH) at the N-terminus due to protease cleavage that do not affect the structure and activity of the protein ; 2 polymer man 'RuvB-like 2' 53047.488 3 3.6.4.12 ? ? ;A strectch of 18 extra residues is present at the N-terminus due to cloning design that do not affect the structure and activity of the protein ; 3 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 507.181 6 ? ? ? ? 4 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 6 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 ;49 kDa TATA box-binding protein-interacting protein,49 kDa TBP-interacting protein,54 kDa erythrocyte cytosolic protein,ECP-54,INO80 complex subunit H,Nuclear matrix protein 238,NMP 238,Pontin 52,TIP49a,TIP60-associated protein 54-alpha,TAP54-alpha ; 2 ;48 kDa TATA box-binding protein-interacting protein,48 kDa TBP-interacting protein,51 kDa erythrocyte cytosolic 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R N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP RUVB1_HUMAN Q9Y265 ? 1 ;MKIEEVKSTTKTQRIASHSHVKGLGLDESGLAKQAASGLVGQENAREACGVIVELIKSKKMAGRAVLLAGPPGTGKTALA LAIAQELGSKVPFCPMVGSEVYSTEIKKTEVLMENFRRAIGLRIKETKEVYEGEVTELTPCETENPMGGYGKTISHVIIG LKTAKGTKQLKLDPSIFESLQKERVEAGDVIYIEANSGAVKRQGRCDTYATEFDLEAEEYVPLPKGDVHKKKEIIQDVTL HDLDVANARPQGGQDILSMMGQLMKPKKTEITDKLRGEINKVVNKYIDQGIAELVPGVLFVDEVHMLDIECFTYLHRALE SSIAPIVIFASNRGNCVIRGTEDITSPHGIPLDLLDRVMIIRTMLYTPQEMKQIIKIRAQTEGINISEEALNHLGEIGTK TTLRYSVQLLTPANLLAKINGKDSIEKEHVEEISELFYDAKSSAKILADQQDKYMK ; 1 2 UNP RUVB2_HUMAN Q9Y230 ? 2 ;MATVTATTKVPEIRDVTRIERIGAHSHIRGLGLDDALEPRQASQGMVGQLAARRAAGVVLEMIREGKIAGRAVLIAGQPG TGKTAIAMGMAQALGPDTPFTAIAGSEIFSLEMSKTEALTQAFRRSIGVRIKEETEIIEGEVVEIQIDRPATGTGSKVGK LTLKTTEMETIYDLGTKMIESLTKDKVQAGDVITIDKATGKISKLGRSFTRARDYDAMGSQTKFVQCPDGELQKRKEVVH TVSLHEIDVINSRTQGFLALFSGDTGEIKSEVREQINAKVAEWREEGKAEIIPGVLFIDEVHMLDIESFSFLNRALESDM APVLIMATNRGITRIRGTSYQSPHGIPIDLLDRLLIVSTTPYSEKDTKQILRIRCEEEDVEMSEDAYTVLTRIGLETSLR YAIQLITAASLVCRKRKGTEVQVDDIKRVYSLFLDESRSTQYMKEYQDAFLFNELKGETMDTS ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9EMC A 4 ? 459 ? 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UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -15 6 2 9EMC LEU D 4 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -14 7 2 9EMC ASN D 5 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -13 8 2 9EMC TRP D 6 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -12 9 2 9EMC ILE D 7 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -11 10 2 9EMC SER D 8 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -10 11 2 9EMC ALA D 9 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -9 12 2 9EMC GLY D 10 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -8 13 2 9EMC HIS D 11 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -7 14 2 9EMC ALA D 12 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -6 15 2 9EMC ILE D 13 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -5 16 2 9EMC ALA D 14 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -4 17 2 9EMC ASP D 15 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -3 18 2 9EMC VAL D 16 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -2 19 2 9EMC GLY D 17 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -1 20 2 9EMC THR D 18 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' 0 21 3 9EMC GLY B 1 ? UNP Q9Y265 ? ? 'expression tag' -2 22 3 9EMC SER B 2 ? UNP Q9Y265 ? ? 'expression tag' -1 23 3 9EMC HIS B 3 ? UNP Q9Y265 ? ? 'expression tag' 0 24 4 9EMC GLY C 1 ? UNP Q9Y265 ? ? 'expression tag' -2 25 4 9EMC SER C 2 ? UNP Q9Y265 ? ? 'expression tag' -1 26 4 9EMC HIS C 3 ? UNP Q9Y265 ? ? 'expression tag' 0 27 5 9EMC MET F 1 ? UNP Q9Y230 ? ? 'initiating methionine' -17 28 5 9EMC ALA F 2 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -16 29 5 9EMC ASP F 3 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -15 30 5 9EMC LEU F 4 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -14 31 5 9EMC ASN F 5 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -13 32 5 9EMC TRP F 6 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -12 33 5 9EMC ILE F 7 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -11 34 5 9EMC SER F 8 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -10 35 5 9EMC ALA F 9 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -9 36 5 9EMC GLY F 10 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -8 37 5 9EMC HIS F 11 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -7 38 5 9EMC ALA F 12 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -6 39 5 9EMC ILE F 13 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -5 40 5 9EMC ALA F 14 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -4 41 5 9EMC ASP F 15 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -3 42 5 9EMC VAL F 16 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -2 43 5 9EMC GLY F 17 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -1 44 5 9EMC THR F 18 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' 0 45 6 9EMC MET E 1 ? UNP Q9Y230 ? ? 'initiating methionine' -17 46 6 9EMC ALA E 2 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -16 47 6 9EMC ASP E 3 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -15 48 6 9EMC LEU E 4 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -14 49 6 9EMC ASN E 5 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -13 50 6 9EMC TRP E 6 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -12 51 6 9EMC ILE E 7 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -11 52 6 9EMC SER E 8 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -10 53 6 9EMC ALA E 9 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -9 54 6 9EMC GLY E 10 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -8 55 6 9EMC HIS E 11 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -7 56 6 9EMC ALA E 12 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -6 57 6 9EMC ILE E 13 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -5 58 6 9EMC ALA E 14 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -4 59 6 9EMC ASP E 15 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -3 60 6 9EMC VAL E 16 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -2 61 6 9EMC GLY E 17 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' -1 62 6 9EMC THR E 18 ? UNP Q9Y230 ? ? 'expression tag' 0 63 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLN A 45 ? 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