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The complete dimers of the focused models (PDB 9GLC and 9GLD) were used as templates for 4 repeats of the filament in the composite map (also containing the RRM1 domains by rigid fitting) to represent the biological assembly. ; _em_3d_fitting.overall_b_value 150 _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' # loop_ _em_3d_fitting_list.id _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range _em_3d_fitting_list.details _em_3d_fitting_list.chain_id _em_3d_fitting_list.chain_residue_range _em_3d_fitting_list.source_name _em_3d_fitting_list.type _em_3d_fitting_list.accession_code _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 1 6WMZ A ? SFPQ A ? PDB 'experimental model' 6WMZ 1 2 1 6WMZ B ? NONO B ? PDB 'experimental model' 6WMZ 1 3 1 9GLC BC ? SFPQ BC ? PDB 'experimental model' 9GLC 2 4 1 9GLC BE ? SFPQ BE ? PDB 'experimental model' 9GLC 2 5 1 9GLC BD ? NONO BD ? PDB 'experimental model' 9GLC 2 6 1 9GLC BF ? NONO BF ? PDB 'experimental model' 9GLC 2 7 1 9GLD AA ? SFPQ AA ? PDB 'experimental model' 9GLD 3 8 1 9GLD BG ? SFPQ BG ? PDB 'experimental model' 9GLD 3 9 1 9GLD AB ? NONO AB ? PDB 'experimental model' 9GLD 3 10 1 9GLD BH ? NONO BH ? PDB 'experimental model' 9GLD 3 # _em_3d_reconstruction.entry_id 9GNI _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm 'FOURIER SPACE' _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ;This is a composite map produced with Phenix "combine focused maps" (1.20.1) with EMD-51413 (overall consensus map), EMD-51417 and EMD-51418 (focused maps of single strands), EMD-51438 and EMD-51439 (focused maps of central units from single strands) ; _em_3d_reconstruction.resolution 3.9 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 2974535 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.5 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source NATURAL _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.name 'NONO/SFPQ filament' _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list '1, 2' # _em_imaging.entry_id 9GNI _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'TFS KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_min 500 _em_imaging.nominal_defocus_max 1400 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification 130000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure 'ZEMLIN TABLEAU' _em_imaging.c2_aperture_diameter 70 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.objective_aperture ? _em_imaging.microscope_serial_number ? _em_imaging.microscope_version ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.method ? _em_sample_support.grid_material GOLD _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R0.6/1' _em_sample_support.details ? _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.entry_id 9GNI _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 90 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature 277 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details '5 sec blotting time, +20 blot force' # _em_experiment.entry_id 9GNI _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state FILAMENT _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 AA MET 1 ? A MET 1 2 1 Y 1 AA SER 2 ? A SER 2 3 1 Y 1 AA ARG 3 ? A ARG 3 4 1 Y 1 AA ASP 4 ? A ASP 4 5 1 Y 1 AA ARG 5 ? A ARG 5 6 1 Y 1 AA PHE 6 ? A PHE 6 7 1 Y 1 AA ARG 7 ? A ARG 7 8 1 Y 1 AA SER 8 ? A SER 8 9 1 Y 1 AA ARG 9 ? A ARG 9 10 1 Y 1 AA GLY 10 ? A GLY 10 11 1 Y 1 AA GLY 11 ? A GLY 11 12 1 Y 1 AA GLY 12 ? A GLY 12 13 1 Y 1 AA GLY 13 ? A GLY 13 14 1 Y 1 AA GLY 14 ? A GLY 14 15 1 Y 1 AA GLY 15 ? A GLY 15 16 1 Y 1 AA PHE 16 ? A PHE 16 17 1 Y 1 AA HIS 17 ? A HIS 17 18 1 Y 1 AA ARG 18 ? A ARG 18 19 1 Y 1 AA ARG 19 ? A ARG 19 20 1 Y 1 AA GLY 20 ? A GLY 20 21 1 Y 1 AA GLY 21 ? A GLY 21 22 1 Y 1 AA GLY 22 ? A GLY 22 23 1 Y 1 AA GLY 23 ? A GLY 23 24 1 Y 1 AA GLY 24 ? A GLY 24 25 1 Y 1 AA ARG 25 ? A ARG 25 26 1 Y 1 AA GLY 26 ? A GLY 26 27 1 Y 1 AA GLY 27 ? A GLY 27 28 1 Y 1 AA LEU 28 ? A LEU 28 29 1 Y 1 AA HIS 29 ? A HIS 29 30 1 Y 1 AA ASP 30 ? A ASP 30 31 1 Y 1 AA PHE 31 ? A PHE 31 32 1 Y 1 AA ARG 32 ? A ARG 32 33 1 Y 1 AA SER 33 ? A SER 33 34 1 Y 1 AA PRO 34 ? A PRO 34 35 1 Y 1 AA PRO 35 ? A PRO 35 36 1 Y 1 AA PRO 36 ? A PRO 36 37 1 Y 1 AA GLY 37 ? A GLY 37 38 1 Y 1 AA MET 38 ? A MET 38 39 1 Y 1 AA GLY 39 ? A GLY 39 40 1 Y 1 AA LEU 40 ? A LEU 40 41 1 Y 1 AA ASN 41 ? A ASN 41 42 1 Y 1 AA GLN 42 ? A GLN 42 43 1 Y 1 AA ASN 43 ? A ASN 43 44 1 Y 1 AA ARG 44 ? A ARG 44 45 1 Y 1 AA GLY 45 ? A GLY 45 46 1 Y 1 AA PRO 46 ? A PRO 46 47 1 Y 1 AA MET 47 ? A MET 47 48 1 Y 1 AA GLY 48 ? A GLY 48 49 1 Y 1 AA PRO 49 ? A PRO 49 50 1 Y 1 AA GLY 50 ? A GLY 50 51 1 Y 1 AA PRO 51 ? A PRO 51 52 1 Y 1 AA GLY 52 ? A GLY 52 53 1 Y 1 AA GLY 53 ? A GLY 53 54 1 Y 1 AA PRO 54 ? A PRO 54 55 1 Y 1 AA LYS 55 ? A LYS 55 56 1 Y 1 AA PRO 56 ? A PRO 56 57 1 Y 1 AA PRO 57 ? A PRO 57 58 1 Y 1 AA ILE 58 ? A ILE 58 59 1 Y 1 AA PRO 59 ? A PRO 59 60 1 Y 1 AA PRO 60 ? A PRO 60 61 1 Y 1 AA PRO 61 ? A PRO 61 62 1 Y 1 AA PRO 62 ? A PRO 62 63 1 Y 1 AA PRO 63 ? A PRO 63 64 1 Y 1 AA HIS 64 ? A HIS 64 65 1 Y 1 AA GLN 65 ? A GLN 65 66 1 Y 1 AA GLN 66 ? A GLN 66 67 1 Y 1 AA GLN 67 ? A GLN 67 68 1 Y 1 AA PRO 68 ? A PRO 68 69 1 Y 1 AA GLN 69 ? A GLN 69 70 1 Y 1 AA GLN 70 ? A GLN 70 71 1 Y 1 AA PRO 71 ? A PRO 71 72 1 Y 1 AA PRO 72 ? A PRO 72 73 1 Y 1 AA PRO 73 ? A PRO 73 74 1 Y 1 AA GLN 74 ? A GLN 74 75 1 Y 1 AA GLN 75 ? A GLN 75 76 1 Y 1 AA PRO 76 ? A PRO 76 77 1 Y 1 AA PRO 77 ? A PRO 77 78 1 Y 1 AA PRO 78 ? A PRO 78 79 1 Y 1 AA GLN 79 ? A GLN 79 80 1 Y 1 AA GLN 80 ? A GLN 80 81 1 Y 1 AA PRO 81 ? A PRO 81 82 1 Y 1 AA PRO 82 ? A PRO 82 83 1 Y 1 AA PRO 83 ? A PRO 83 84 1 Y 1 AA HIS 84 ? A HIS 84 85 1 Y 1 AA GLN 85 ? A GLN 85 86 1 Y 1 AA GLN 86 ? A GLN 86 87 1 Y 1 AA PRO 87 ? A PRO 87 88 1 Y 1 AA PRO 88 ? A PRO 88 89 1 Y 1 AA PRO 89 ? A PRO 89 90 1 Y 1 AA HIS 90 ? A HIS 90 91 1 Y 1 AA GLN 91 ? A GLN 91 92 1 Y 1 AA PRO 92 ? A PRO 92 93 1 Y 1 AA PRO 93 ? A PRO 93 94 1 Y 1 AA HIS 94 ? A HIS 94 95 1 Y 1 AA GLN 95 ? A GLN 95 96 1 Y 1 AA GLN 96 ? A GLN 96 97 1 Y 1 AA PRO 97 ? A PRO 97 98 1 Y 1 AA PRO 98 ? A PRO 98 99 1 Y 1 AA PRO 99 ? A PRO 99 100 1 Y 1 AA PRO 100 ? A PRO 100 101 1 Y 1 AA PRO 101 ? A PRO 101 102 1 Y 1 AA GLN 102 ? A GLN 102 103 1 Y 1 AA ASP 103 ? A ASP 103 104 1 Y 1 AA SER 104 ? A SER 104 105 1 Y 1 AA SER 105 ? A SER 105 106 1 Y 1 AA LYS 106 ? A LYS 106 107 1 Y 1 AA PRO 107 ? A PRO 107 108 1 Y 1 AA VAL 108 ? A VAL 108 109 1 Y 1 AA VAL 109 ? A VAL 109 110 1 Y 1 AA PRO 110 ? A PRO 110 111 1 Y 1 AA GLN 111 ? A GLN 111 112 1 Y 1 AA GLY 112 ? A GLY 112 113 1 Y 1 AA PRO 113 ? A PRO 113 114 1 Y 1 AA GLY 114 ? A GLY 114 115 1 Y 1 AA SER 115 ? A SER 115 116 1 Y 1 AA ALA 116 ? A ALA 116 117 1 Y 1 AA PRO 117 ? A PRO 117 118 1 Y 1 AA GLY 118 ? A GLY 118 119 1 Y 1 AA VAL 119 ? A VAL 119 120 1 Y 1 AA SER 120 ? A SER 120 121 1 Y 1 AA PRO 121 ? A PRO 121 122 1 Y 1 AA ALA 122 ? A ALA 122 123 1 Y 1 AA PRO 123 ? A PRO 123 124 1 Y 1 AA PRO 124 ? A PRO 124 125 1 Y 1 AA PRO 125 ? A PRO 125 126 1 Y 1 AA ALA 126 ? A ALA 126 127 1 Y 1 AA GLY 127 ? A GLY 127 128 1 Y 1 AA SER 128 ? A SER 128 129 1 Y 1 AA ALA 129 ? A ALA 129 130 1 Y 1 AA PRO 130 ? A PRO 130 131 1 Y 1 AA PRO 131 ? A PRO 131 132 1 Y 1 AA ALA 132 ? A ALA 132 133 1 Y 1 AA ASN 133 ? A ASN 133 134 1 Y 1 AA PRO 134 ? A PRO 134 135 1 Y 1 AA PRO 135 ? A PRO 135 136 1 Y 1 AA THR 136 ? A THR 136 137 1 Y 1 AA THR 137 ? A THR 137 138 1 Y 1 AA GLY 138 ? A GLY 138 139 1 Y 1 AA ALA 139 ? A ALA 139 140 1 Y 1 AA PRO 140 ? A PRO 140 141 1 Y 1 AA PRO 141 ? A PRO 141 142 1 Y 1 AA GLY 142 ? A GLY 142 143 1 Y 1 AA PRO 143 ? A PRO 143 144 1 Y 1 AA GLY 144 ? A GLY 144 145 1 Y 1 AA PRO 145 ? A PRO 145 146 1 Y 1 AA THR 146 ? A THR 146 147 1 Y 1 AA PRO 147 ? A PRO 147 148 1 Y 1 AA THR 148 ? A THR 148 149 1 Y 1 AA PRO 149 ? A PRO 149 150 1 Y 1 AA PRO 150 ? A PRO 150 151 1 Y 1 AA PRO 151 ? A PRO 151 152 1 Y 1 AA ALA 152 ? A ALA 152 153 1 Y 1 AA VAL 153 ? A VAL 153 154 1 Y 1 AA THR 154 ? A THR 154 155 1 Y 1 AA SER 155 ? A SER 155 156 1 Y 1 AA ALA 156 ? A ALA 156 157 1 Y 1 AA THR 157 ? A THR 157 158 1 Y 1 AA PRO 158 ? A PRO 158 159 1 Y 1 AA GLY 159 ? A GLY 159 160 1 Y 1 AA PRO 160 ? A PRO 160 161 1 Y 1 AA PRO 161 ? A PRO 161 162 1 Y 1 AA PRO 162 ? A PRO 162 163 1 Y 1 AA PRO 163 ? A PRO 163 164 1 Y 1 AA SER 164 ? A SER 164 165 1 Y 1 AA THR 165 ? A THR 165 166 1 Y 1 AA PRO 166 ? A PRO 166 167 1 Y 1 AA SER 167 ? A SER 167 168 1 Y 1 AA SER 168 ? A SER 168 169 1 Y 1 AA GLY 169 ? A GLY 169 170 1 Y 1 AA VAL 170 ? A VAL 170 171 1 Y 1 AA SER 171 ? A SER 171 172 1 Y 1 AA THR 172 ? A THR 172 173 1 Y 1 AA THR 173 ? A THR 173 174 1 Y 1 AA PRO 174 ? A PRO 174 175 1 Y 1 AA PRO 175 ? A PRO 175 176 1 Y 1 AA GLN 176 ? A GLN 176 177 1 Y 1 AA SER 177 ? A SER 177 178 1 Y 1 AA GLY 178 ? A GLY 178 179 1 Y 1 AA GLY 179 ? A GLY 179 180 1 Y 1 AA PRO 180 ? A PRO 180 181 1 Y 1 AA PRO 181 ? A PRO 181 182 1 Y 1 AA PRO 182 ? A PRO 182 183 1 Y 1 AA PRO 183 ? A PRO 183 184 1 Y 1 AA PRO 184 ? A PRO 184 185 1 Y 1 AA ALA 185 ? A ALA 185 186 1 Y 1 AA GLY 186 ? A GLY 186 187 1 Y 1 AA GLY 187 ? A GLY 187 188 1 Y 1 AA ALA 188 ? A ALA 188 189 1 Y 1 AA GLY 189 ? A GLY 189 190 1 Y 1 AA PRO 190 ? A PRO 190 191 1 Y 1 AA GLY 191 ? A GLY 191 192 1 Y 1 AA PRO 192 ? A PRO 192 193 1 Y 1 AA LYS 193 ? A LYS 193 194 1 Y 1 AA GLN 194 ? A GLN 194 195 1 Y 1 AA GLY 195 ? A GLY 195 196 1 Y 1 AA PRO 196 ? A PRO 196 197 1 Y 1 AA GLY 197 ? A GLY 197 198 1 Y 1 AA PRO 198 ? A PRO 198 199 1 Y 1 AA GLY 199 ? A GLY 199 200 1 Y 1 AA PRO 200 ? A PRO 200 201 1 Y 1 AA GLY 201 ? A GLY 201 202 1 Y 1 AA GLY 202 ? A GLY 202 203 1 Y 1 AA PRO 203 ? A PRO 203 204 1 Y 1 AA LYS 204 ? A LYS 204 205 1 Y 1 AA GLY 205 ? A GLY 205 206 1 Y 1 AA GLY 206 ? A GLY 206 207 1 Y 1 AA LYS 207 ? A LYS 207 208 1 Y 1 AA MET 208 ? A MET 208 209 1 Y 1 AA PRO 209 ? A PRO 209 210 1 Y 1 AA GLY 210 ? A GLY 210 211 1 Y 1 AA GLY 211 ? A GLY 211 212 1 Y 1 AA PRO 212 ? A PRO 212 213 1 Y 1 AA LYS 213 ? A LYS 213 214 1 Y 1 AA PRO 214 ? A PRO 214 215 1 Y 1 AA GLY 215 ? A GLY 215 216 1 Y 1 AA GLY 216 ? A GLY 216 217 1 Y 1 AA GLY 217 ? A GLY 217 218 1 Y 1 AA PRO 218 ? A PRO 218 219 1 Y 1 AA GLY 219 ? A GLY 219 220 1 Y 1 AA MET 220 ? A MET 220 221 1 Y 1 AA GLY 221 ? 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