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J . n # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 9GXA _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 9GXA _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9GXA _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 9GXA _struct.title 'CENP-A/H4 di-tetrasome assembled on alpha-satellite DNA.' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9GXA _struct_keywords.text 'CENP-A/H4, di-tetrasome, nucleosome, centromere, CENP-A, Human, Cell division., DNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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THR H 82 LYS H 91 1 ? 10 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? 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J -61 ? 19 1 1 I DA 136 1_555 J DT 12 1_555 0.063 -0.198 -0.440 2.062 2.473 4.608 110 I_DA62:DT-62_J I 62 ? J -62 ? 20 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 I DA 25 1_555 J DT 123 1_555 I DC 26 1_555 J DG 122 1_555 0.417 -0.601 3.362 2.270 0.432 29.804 -1.258 -0.322 3.375 0.839 -4.405 29.891 1 II_DA-49DC-48:DG48DT49_JJ I -49 ? J 49 ? I -48 ? J 48 ? 1 I DC 26 1_555 J DG 122 1_555 I DC 27 1_555 J DG 121 1_555 0.440 1.270 3.542 4.090 -2.933 41.617 2.105 -0.156 3.474 -4.110 -5.731 41.907 2 II_DC-48DC-47:DG47DG48_JJ I -48 ? J 48 ? I -47 ? J 47 ? 1 I DC 27 1_555 J DG 121 1_555 I DA 28 1_555 J DT 120 1_555 -0.649 1.415 3.663 3.526 -2.839 39.219 2.461 1.417 3.487 -4.212 -5.231 39.470 3 II_DC-47DA-46:DT46DG47_JJ I -47 ? J 47 ? I -46 ? J 46 ? 1 I DA 28 1_555 J DT 120 1_555 I DA 29 1_555 J DT 119 1_555 -0.301 -0.137 3.252 -1.107 2.406 30.748 -0.723 0.351 3.241 4.527 2.083 30.860 4 II_DA-46DA-45:DT45DT46_JJ I -46 ? J 46 ? I -45 ? J 45 ? 1 I DA 29 1_555 J DT 119 1_555 I DA 30 1_555 J DT 118 1_555 -0.497 1.335 3.702 -2.283 -0.093 40.378 1.943 0.428 3.720 -0.135 3.305 40.440 5 II_DA-45DA-44:DT44DT45_JJ I -45 ? J 45 ? I -44 ? J 44 ? 1 I DA 30 1_555 J DT 118 1_555 I DA 31 1_555 J DT 117 1_555 -0.484 0.596 3.549 -5.293 4.226 39.179 0.334 0.032 3.624 6.245 7.823 39.737 6 II_DA-44DA-43:DT43DT44_JJ I -44 ? J 44 ? I -43 ? J 43 ? 1 I DA 31 1_555 J DT 117 1_555 I DG 32 1_555 J DC 116 1_555 -0.554 -0.154 3.198 -5.090 3.925 30.711 -1.015 0.078 3.202 7.310 9.480 31.360 7 II_DA-43DG-42:DC42DT43_JJ I -43 ? J 43 ? I -42 ? J 42 ? 1 I DG 32 1_555 J DC 116 1_555 I DT 33 1_555 J DA 115 1_555 0.357 -0.258 3.221 -2.911 4.984 32.084 -1.305 -1.130 3.104 8.927 5.215 32.586 8 II_DG-42DT-41:DA41DC42_JJ I -42 ? J 42 ? I -41 ? J 41 ? 1 I DT 33 1_555 J DA 115 1_555 I DG 34 1_555 J DC 114 1_555 0.806 -0.386 2.902 -0.667 6.100 31.015 -1.696 -1.589 2.760 11.270 1.232 31.602 9 II_DT-41DG-40:DC40DA41_JJ I -41 ? J 41 ? I -40 ? J 40 ? 1 I DG 34 1_555 J DC 114 1_555 I DT 35 1_555 J DA 113 1_555 0.075 -0.922 3.133 3.994 2.611 33.724 -1.968 0.476 3.043 4.473 -6.842 34.050 10 II_DG-40DT-39:DA39DC40_JJ I -40 ? J 40 ? I -39 ? J 39 ? 1 I DT 35 1_555 J DA 113 1_555 I DA 36 1_555 J DT 112 1_555 0.151 0.880 3.227 4.456 1.528 50.979 0.913 0.131 3.252 1.771 -5.164 51.182 11 II_DT-39DA-38:DT38DA39_JJ I -39 ? J 39 ? I -38 ? 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J 28 ? 1 I DT 46 1_555 J DA 102 1_555 I DG 47 1_555 J DC 101 1_555 0.558 0.746 3.141 2.300 -0.721 38.566 1.213 -0.571 3.154 -1.091 -3.477 38.638 22 II_DT-28DG-27:DC27DA28_JJ I -28 ? J 28 ? I -27 ? J 27 ? 1 I DG 47 1_555 J DC 101 1_555 I DC 48 1_555 J DG 100 1_555 -0.583 -0.266 3.287 -0.266 -1.406 37.527 -0.228 0.871 3.299 -2.184 0.413 37.553 23 II_DG-27DC-26:DG26DC27_JJ I -27 ? J 27 ? I -26 ? J 26 ? 1 I DC 48 1_555 J DG 100 1_555 I DT 49 1_555 J DA 99 1_555 0.094 1.682 3.750 2.672 -3.214 35.981 3.213 0.271 3.589 -5.181 -4.307 36.215 24 II_DC-26DT-25:DA25DG26_JJ I -26 ? J 26 ? I -25 ? J 25 ? 1 I DT 49 1_555 J DA 99 1_555 I DC 50 1_555 J DG 98 1_555 -0.856 1.373 3.719 -3.781 -3.918 39.738 2.508 0.761 3.636 -5.731 5.531 40.094 25 II_DT-25DC-24:DG24DA25_JJ I -25 ? J 25 ? I -24 ? J 24 ? 1 I DC 50 1_555 J DG 98 1_555 I DC 51 1_555 J DG 97 1_555 -1.474 0.248 3.285 -8.240 4.705 29.995 -0.486 1.068 3.552 8.818 15.442 31.427 26 II_DC-24DC-23:DG23DG24_JJ I -24 ? J 24 ? I -23 ? J 23 ? 1 I DC 51 1_555 J DG 97 1_555 I DT 53 1_555 J DA 95 1_555 0.309 -0.208 5.882 -4.318 7.225 58.581 -0.872 -0.709 5.789 7.342 4.388 59.130 27 II_DC-23DT-21:DA21DG23_JJ I -23 ? J 23 ? I -21 ? J 21 ? 1 I DT 53 1_555 J DA 95 1_555 I DC 54 1_555 J DG 94 1_555 -0.127 -0.275 3.135 1.554 4.635 33.025 -1.211 0.467 3.060 8.098 -2.716 33.375 28 II_DT-21DC-20:DG20DA21_JJ I -21 ? J 21 ? I -20 ? J 20 ? 1 I DC 54 1_555 J DG 94 1_555 I DA 55 1_555 J DT 93 1_555 -0.039 -0.533 3.027 0.573 16.151 30.073 -3.202 0.148 2.434 28.671 -1.018 34.052 29 II_DC-20DA-19:DT19DG20_JJ I -20 ? J 20 ? I -19 ? J 19 ? 1 I DA 55 1_555 J DT 93 1_555 I DA 56 1_555 J DT 92 1_555 0.889 -0.225 3.017 0.590 5.990 30.778 -1.452 -1.542 2.938 11.153 -1.098 31.347 30 II_DA-19DA-18:DT18DT19_JJ I -19 ? J 19 ? I -18 ? J 18 ? 1 I DA 56 1_555 J DT 92 1_555 I DA 57 1_555 J DT 91 1_555 -0.455 -0.389 3.183 2.212 -0.455 33.518 -0.600 1.138 3.152 -0.788 -3.830 33.592 31 II_DA-18DA-17:DT17DT18_JJ I -18 ? J 18 ? I -17 ? J 17 ? 1 I DA 57 1_555 J DT 91 1_555 I DG 59 1_555 J DC 89 1_555 -0.022 1.511 6.845 5.011 -13.331 75.120 2.036 0.323 6.532 -10.841 -4.075 76.262 32 II_DA-17DG-15:DC15DT17_JJ I -17 ? J 17 ? I -15 ? J 15 ? 1 I DG 59 1_555 J DC 89 1_555 I DG 60 1_555 J DC 88 1_555 0.212 1.171 3.643 4.674 -7.285 39.383 2.595 0.267 3.385 -10.655 -6.835 40.286 33 II_DG-15DG-14:DC14DC15_JJ I -15 ? J 15 ? I -14 ? J 14 ? 1 I DG 60 1_555 J DC 88 1_555 I DC 61 1_555 J DG 87 1_555 -0.579 0.827 3.666 -3.822 -1.225 39.761 1.369 0.352 3.678 -1.795 5.602 39.954 34 II_DG-14DC-13:DG13DC14_JJ I -14 ? J 14 ? I -13 ? J 13 ? 1 I DC 61 1_555 J DG 87 1_555 I DA 62 1_555 J DT 86 1_555 -0.025 0.504 3.762 -3.304 1.417 37.850 0.566 -0.447 3.767 2.179 5.079 38.014 35 II_DC-13DA-12:DT12DG13_JJ I -13 ? J 13 ? I -12 ? J 12 ? 1 I DA 62 1_555 J DT 86 1_555 I DT 63 1_555 J DA 85 1_555 0.189 -1.130 3.373 -3.059 2.360 29.359 -2.718 -1.026 3.239 4.632 6.002 29.607 36 II_DA-12DT-11:DA11DT12_JJ I -12 ? J 12 ? I -11 ? J 11 ? 1 I DT 63 1_555 J DA 85 1_555 I DG 64 1_555 J DC 84 1_555 0.972 -0.578 2.930 -0.871 6.467 35.915 -1.708 -1.658 2.765 10.382 1.397 36.484 37 II_DT-11DG-10:DC10DA11_JJ I -11 ? J 11 ? I -10 ? J 10 ? 1 I DG 64 1_555 J DC 84 1_555 I DT 65 1_555 J DA 83 1_555 -0.161 -1.192 3.198 1.626 3.027 34.010 -2.487 0.520 3.073 5.158 -2.772 34.179 38 II_DG-10DT-9:DA9DC10_JJ I -10 ? J 10 ? I -9 ? J 9 ? 1 I DT 65 1_555 J DA 83 1_555 I DT 66 1_555 J DA 82 1_555 -0.010 -0.854 3.212 2.163 3.448 30.625 -2.251 0.425 3.091 6.491 -4.073 30.888 39 II_DT-9DT-8:DA8DA9_JJ I -9 ? J 9 ? I -8 ? J 8 ? 1 I DT 66 1_555 J DA 82 1_555 I DC 67 1_555 J DG 81 1_555 0.524 0.215 3.002 5.548 3.184 39.691 -0.023 -0.176 3.052 4.652 -8.107 40.183 40 II_DT-8DC-7:DG7DA8_JJ I -8 ? J 8 ? I -7 ? J 7 ? 1 I DC 67 1_555 J DG 81 1_555 I DA 68 1_555 J DT 80 1_555 0.034 1.808 4.117 19.190 11.183 39.108 1.001 2.311 4.067 15.302 -26.257 44.759 41 II_DC-7DA-6:DT6DG7_JJ I -7 ? J 7 ? I -6 ? J 6 ? 1 I DA 68 1_555 J DT 80 1_555 I DG 69 1_555 J DC 79 1_555 -0.637 2.390 3.461 -5.386 -3.824 36.549 4.283 0.255 3.261 -6.037 8.503 37.121 42 II_DA-6DG-5:DC5DT6_JJ I -6 ? J 6 ? I -5 ? J 5 ? 1 I DG 69 1_555 J DC 79 1_555 I DC 70 1_555 J DG 78 1_555 -0.175 1.442 3.182 -7.484 -4.143 40.755 2.450 -0.513 3.013 -5.871 10.605 41.606 43 II_DG-5DC-4:DG4DC5_JJ I -5 ? J 5 ? I -4 ? J 4 ? 1 I DC 70 1_555 J DG 78 1_555 I DT 71 1_555 J DA 77 1_555 -0.321 0.749 3.480 -2.273 1.969 35.079 0.924 0.167 3.529 3.259 3.763 35.203 44 II_DC-4DT-3:DA3DG4_JJ I -4 ? J 4 ? I -3 ? J 3 ? 1 I DT 71 1_555 J DA 77 1_555 I DC 72 1_555 J DG 76 1_555 0.592 0.360 3.073 -0.756 3.898 39.436 0.102 -0.957 3.082 5.759 1.116 39.628 45 II_DT-3DC-2:DG2DA3_JJ I -3 ? J 3 ? I -2 ? J 2 ? 1 I DC 72 1_555 J DG 76 1_555 I DT 73 1_555 J DA 75 1_555 0.282 0.142 3.301 -1.021 3.844 29.701 -0.528 -0.759 3.281 7.457 1.980 29.960 46 II_DC-2DT-1:DA1DG2_JJ I -2 ? J 2 ? I -1 ? 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