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_refine.pdbx_ls_cross_valid_method NONE _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_Zscore _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0018 ? 12932 ? f_bond_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.4208 ? 17854 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0381 ? 2132 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0031 ? 2088 ? f_plane_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 15.8751 ? 2414 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? # _struct.entry_id 9GXW _struct.title 'C. thermocellum UvrA (K39A) in complex with DNA with a fluorescein modification and AMPPNP (basal conformation)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9GXW _struct_keywords.text 'DNA binding protein, DNA Repair pathway, Nucleotide excision repair pathway, NER' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 3 ? I N N 3 ? J N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A3DC70_ACET2 A3DC70 ? 1 ;MKKDYIVVKGAREHNLKNIDVKIPRDKFVVITGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSSYARQFLGQMEKPDVDYIDG LSPAIAIDQKTTSRNPRSTVGTVTEIYDYLRLLFARIGTPHCYLCGREISQQTVDQMVDRIMEFEEGTRIQLLAPVVRGR KGEYHKLIEDIKKEGYVRIRVDGEVVDVNDPVNLDKNKKHNIEIVVDRLIVRPGIQKRLTDSIETVLRLSNGILVVDVIG GKEMLLSQNFACTECNVSMEEITPRMFSFNNPYGACPECTGLGSLMRIDPDLVIPDKKLSLAQGAVRASGWNIANDESYA RMYIDALAKHYNFSVDTPVEELPPHILDIILYGTNGEKIKIEYERENEKGTFMASFPGIINSMERRYKETTSEVMKQYYE NFMSNIPCPVCKGARLKKESLAVTIGGKNIYEVCCLSIGEAKEFFANLNLTERQQLIARQILKEINARLGFLVDVGLDYL TLARAAGTLSGGEAQRIRLATQIGSGLMGVIYILDEPSIGLHQRDNDRLLRSLKKLRDLGNTLLVVEHDEDTMYASDYII DLGPGAGSHGGQIVAEGTVEEIKQNPNSVTGEYLSGRKKIEVPKERRKPNGKWLEIIGARENNLKNINVRIPLGVFTCIT GVSGSGKSSLINEILYKRLAAELNRASVKPGEHDLIKGIEYLDKVIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDFIREIFANTTE AKTRGYKAGRFSFNVKGGRCEACAGDGINKIEMHFLPDIYVPCEVCKGKRYNRETLEVRYKGKNIAEVLDMTVEEALEFF KNIPRIHKKIETLYDVGLGYIKLGQSSTTLSGGEAQRVKLATELSRKSTGKTMYILDEPTTGLHMADVHRLVGILHRLVE AGNSVVVIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGLVVAEGTPEEVAKVENSYTGQFLKKVLST ; 1 2 PDB 9GXW 9GXW ? 2 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9GXW A 21 ? 962 ? 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'expression tag' -13 7 1 9GXW HIS A 8 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -12 8 1 9GXW HIS A 9 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -11 9 1 9GXW HIS A 10 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -10 10 1 9GXW SER A 11 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -9 11 1 9GXW SER A 12 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -8 12 1 9GXW GLY A 13 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -7 13 1 9GXW LEU A 14 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -6 14 1 9GXW VAL A 15 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -5 15 1 9GXW PRO A 16 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -4 16 1 9GXW ARG A 17 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -3 17 1 9GXW GLY A 18 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -2 18 1 9GXW SER A 19 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -1 19 1 9GXW HIS A 20 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' 0 20 1 9GXW ALA A 59 ? UNP A3DC70 LYS 39 'engineered mutation' 39 21 2 9GXW MET B 1 ? UNP A3DC70 ? ? 'initiating methionine' -19 22 2 9GXW GLY B 2 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -18 23 2 9GXW SER B 3 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -17 24 2 9GXW SER B 4 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -16 25 2 9GXW HIS B 5 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -15 26 2 9GXW HIS B 6 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -14 27 2 9GXW HIS B 7 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -13 28 2 9GXW HIS B 8 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -12 29 2 9GXW HIS B 9 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -11 30 2 9GXW HIS B 10 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -10 31 2 9GXW SER B 11 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -9 32 2 9GXW SER B 12 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -8 33 2 9GXW GLY B 13 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -7 34 2 9GXW LEU B 14 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -6 35 2 9GXW VAL B 15 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -5 36 2 9GXW PRO B 16 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -4 37 2 9GXW ARG B 17 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -3 38 2 9GXW GLY B 18 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -2 39 2 9GXW SER B 19 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -1 40 2 9GXW HIS B 20 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' 0 41 2 9GXW ALA B 59 ? UNP A3DC70 LYS 39 'engineered mutation' 39 42 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 58 ? 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C DA 37 N6 ? ? ? 1_555 D DT 13 O4 ? ? C DA 29 D DT 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog67 hydrog ? ? C DA 38 N1 ? ? ? 1_555 D DT 12 N3 ? ? C DA 30 D DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog68 hydrog ? ? C DA 38 N6 ? ? ? 1_555 D DT 12 O4 ? ? C DA 30 D DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog69 hydrog ? ? C DC 39 N3 ? ? ? 1_555 D DG 11 N1 ? ? C DC 31 D DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog70 hydrog ? ? C DC 39 N4 ? ? ? 1_555 D DG 11 O6 ? ? C DC 31 D DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog71 hydrog ? ? C DC 39 O2 ? ? ? 1_555 D DG 11 N2 ? ? C DC 31 D DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog72 hydrog ? ? C DA 40 N1 ? ? ? 1_555 D DT 10 N3 ? ? C DA 32 D DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog73 hydrog ? ? C DA 40 N6 ? ? ? 1_555 D DT 10 O4 ? ? C DA 32 D DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog74 hydrog ? ? C DG 41 N1 ? ? ? 1_555 D DC 9 N3 ? ? C DG 33 D DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog75 hydrog ? ? C DG 41 N2 ? ? ? 1_555 D DC 9 O2 ? ? C DG 33 D DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog76 hydrog ? ? C DG 41 O6 ? ? ? 1_555 D DC 9 N4 ? ? C DG 33 D DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 SG ? 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