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UK ? ? primary 'Nat Microbiol' ? ? 2058-5276 ? ? 10 ? 1723 1740 'In situ structure of a bacterial flagellar motor at subnanometre resolution reveals adaptations for increased torque.' 2025 ? 10.1038/s41564-025-02012-9 40595286 ? ? ? ? ? ? ? ? ? US ? ? 1 Biorxiv ? ? 2692-8205 ? ? ? ? ? ? ;Molecular model of a bacterial flagellar motor in situ reveals a "parts-list" of protein adaptations to increase torque. ; 2024 ? 10.1101/2023.09.08.556779 39416179 ? ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Drobnic, T.' 1 0000-0001-6364-1874 primary 'Cohen, E.J.' 2 ? primary 'Calcraft, T.' 3 0000-0002-5716-0270 primary 'Alzheimer, M.' 4 0000-0002-0094-3987 primary 'Froschauer, K.' 5 0000-0001-5288-4440 primary 'Svensson, S.' 6 0000-0002-3183-6084 primary 'Hoffman, W.H.' 7 0000-0002-6689-2609 primary 'Singh, N.' 8 ? primary 'Garg, S.G.' 9 ? primary 'Henderson, L.D.' 10 0000-0002-7495-3109 primary 'Umrekar, T.R.' 11 0000-0003-3138-4185 primary 'Nans, A.' 12 0000-0002-3791-2447 primary 'Ribardo, D.' 13 0009-0009-8693-0535 primary 'Pedaci, F.' 14 0000-0002-4530-3027 primary 'Nord, A.L.' 15 0000-0001-6199-2769 primary 'Hochberg, G.K.A.' 16 0000-0002-7155-0451 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PMYPLDPFTLNLLSDSGSRYVKCTIELEQNSELLKPELDKKVPVIRDIIIRTLTAKTFEEVSTQKGKERLKDELVGKINE ILTDGFIKNVYFTDFVVS ; O,P,Q,R ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MRILFLILLSFLNAFAFELVLNTGRENNQAFAVLHASNDLEFTCQKFITEAKVHFECDIVGMVDNKLKDQSFSAFDLKFI QEAQKIKMIILPKIQARMFDTSQNIYIDKELSSSSSHKSKAFTFIFTPELAPIKDYDGLDFNINFPHESLPYVGALDLNS DPVVIPQSADINTYLRIKKEYDKANYNQVVIDAQNAINRYRGSIFTSEFILYKLRAQNKLYTQDPSMRDQQILEKMIDDA KNWTRTFTSDKNFSEVLHIMLRTYIALAQRADVEYTMSILDNEQPNNYFTQLSKLDYADYIYNLNEKEKAVNIYENTYFN TKNLDLAARAAMSLAKNLLSNEQVNKAIEYINTILKANPEYFGKDIPRSLELAKLFNQKGQFDISASIYEDAFAKMSKLD PSYEETLKDLALVLSHANRSSDAKKYLDLYMDDYLDGKYLDEIKKASDEVFFALGDNNASFLHQRYTDLMKQYANKDENI ANKALDEDVALYYKEGNFSAILAYKDLIESKKIPNATQFLEKAAINDLKNAIKADNCINAANIFMRFSAYDIGQKIENKK QMLACLIRTSNVEQALDYIDKNYNEDSIFYGLQKASILFDNKQYPQVIKISKDIANSRILKSDDENFKAYYLQFLSLLRL NDYNQAIKILQILESFPMNFSMVEAYDALLSYANDHNMQTTILTYAPKAIDYQNFKGINLFSPNLEFIYLDALTKINKNE ESLAVLTDLLKLKLSDEDRARALYIQALTYERMQNIQAEKESLKQCLEIKSASNWQNLCKSKNQILNQ ; ;MRILFLILLSFLNAFAFELVLNTGRENNQAFAVLHASNDLEFTCQKFITEAKVHFECDIVGMVDNKLKDQSFSAFDLKFI QEAQKIKMIILPKIQARMFDTSQNIYIDKELSSSSSHKSKAFTFIFTPELAPIKDYDGLDFNINFPHESLPYVGALDLNS DPVVIPQSADINTYLRIKKEYDKANYNQVVIDAQNAINRYRGSIFTSEFILYKLRAQNKLYTQDPSMRDQQILEKMIDDA KNWTRTFTSDKNFSEVLHIMLRTYIALAQRADVEYTMSILDNEQPNNYFTQLSKLDYADYIYNLNEKEKAVNIYENTYFN TKNLDLAARAAMSLAKNLLSNEQVNKAIEYINTILKANPEYFGKDIPRSLELAKLFNQKGQFDISASIYEDAFAKMSKLD PSYEETLKDLALVLSHANRSSDAKKYLDLYMDDYLDGKYLDEIKKASDEVFFALGDNNASFLHQRYTDLMKQYANKDENI ANKALDEDVALYYKEGNFSAILAYKDLIESKKIPNATQFLEKAAINDLKNAIKADNCINAANIFMRFSAYDIGQKIENKK QMLACLIRTSNVEQALDYIDKNYNEDSIFYGLQKASILFDNKQYPQVIKISKDIANSRILKSDDENFKAYYLQFLSLLRL NDYNQAIKILQILESFPMNFSMVEAYDALLSYANDHNMQTTILTYAPKAIDYQNFKGINLFSPNLEFIYLDALTKINKNE ESLAVLTDLLKLKLSDEDRARALYIQALTYERMQNIQAEKESLKQCLEIKSASNWQNLCKSKNQILNQ ; K ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MAEQEDIILEKPEDGLNQPRLDESLEGFKGQEGQAPEDEEFASLPEELPQENSESGFKFTRESAPEDVSTFEEVESQEPT PWYKDRKFMSLVGLSLGIICILVFTLFYLTFSEGKIKPDIIASKPLEQPVVMPDESYKYNDMQRIDGMIQKANALYLKGE VEQALKVYEQVAVYNESLSNYNLGVSQMNENKFQEAFESFKKAIANGENQSVAAINAAVCALKLNDKEKFRYYIDLAQVY LPKEGKSKLYDYYLSLINYYKGYYPEALQMLQRTDMEPYSDVAKYLSAKIYAKMDFDSKAIQQLNSQGNFESSLSLGLLY ARIGEYAKAKVALSTAMKIERDFNQSLAALTLVDIKTGNYQDMLARLQNSYDNDKDRYKILDAYKIQVRLNKDLFNIAVA QNSFSKDLLKKQKDQFDLLFYFAPYQVFDSKQAALYIKKANVTDFVDDSADAGVYLNTSKALSSTNVKIANIINYALNQK LRLANQEFQKLIKDYPEHSILHYNLALTYAQMQNYELAYKHFSSSYHLNPKNYLAGAFAMFCAKLIDIDTTKLYNEILDN IAADSNFKANMQKSMLFLVNNNYISMLPYLDETKKDTPLSLIFEAIVAKNNNLNNQVDVKIAKLRSELPEDILANILYFN SLNSNLNIKEYAQNAQIHFKNLKLDYRSVFGGPNIAREFYVNLMHIAGLLNLERQKIKELINVSGAKDEGILQTLAYLDI FAQQYEEAYALYNSLIDDYGAKDTKTLFLAAVAAIGANNPNSAIALLQLSKLTDKNNKESKAALGMLYQEVKNYEAAISQ YKTLPNNFKSEFFTFDINNN ; ;MAEQEDIILEKPEDGLNQPRLDESLEGFKGQEGQAPEDEEFASLPEELPQENSESGFKFTRESAPEDVSTFEEVESQEPT PWYKDRKFMSLVGLSLGIICILVFTLFYLTFSEGKIKPDIIASKPLEQPVVMPDESYKYNDMQRIDGMIQKANALYLKGE VEQALKVYEQVAVYNESLSNYNLGVSQMNENKFQEAFESFKKAIANGENQSVAAINAAVCALKLNDKEKFRYYIDLAQVY LPKEGKSKLYDYYLSLINYYKGYYPEALQMLQRTDMEPYSDVAKYLSAKIYAKMDFDSKAIQQLNSQGNFESSLSLGLLY ARIGEYAKAKVALSTAMKIERDFNQSLAALTLVDIKTGNYQDMLARLQNSYDNDKDRYKILDAYKIQVRLNKDLFNIAVA QNSFSKDLLKKQKDQFDLLFYFAPYQVFDSKQAALYIKKANVTDFVDDSADAGVYLNTSKALSSTNVKIANIINYALNQK LRLANQEFQKLIKDYPEHSILHYNLALTYAQMQNYELAYKHFSSSYHLNPKNYLAGAFAMFCAKLIDIDTTKLYNEILDN IAADSNFKANMQKSMLFLVNNNYISMLPYLDETKKDTPLSLIFEAIVAKNNNLNNQVDVKIAKLRSELPEDILANILYFN SLNSNLNIKEYAQNAQIHFKNLKLDYRSVFGGPNIAREFYVNLMHIAGLLNLERQKIKELINVSGAKDEGILQTLAYLDI FAQQYEEAYALYNSLIDDYGAKDTKTLFLAAVAAIGANNPNSAIALLQLSKLTDKNNKESKAALGMLYQEVKNYEAAISQ YKTLPNNFKSEFFTFDINNN ; L ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MKKILIICMLFTLSFGIERPKFEDFLAGYERNKASMLNYEGMPAFALSENLLAVLKQPNTKLNKYVKYDPFLNLYLVRTD FSLIPTPMGDEEKLTRNDWVGIWDPNKPYIGHIKYLAQNIDEKDQLDFNSKIGLLGTPCCEMMGIALNNSSFIGNRYLKH FMKYNDVYWGDIGVDFVVRENKIYVNNVRKNPQFLINDQVISVDGLPANDLRKLNEKILFADRGSTLYFQVLRDNMDLNI STEVFAKDLSKFNLPDSKPKPKITNFTSNLGLTVNTSLVVTKIDPKSKASNAGFMVGDKILRVNNIILNNFKELQNILSA GNDFSILIERKSTKLPLSNFNNELGGNANSGGDGKFQFFIRLTK ; ;MKKILIICMLFTLSFGIERPKFEDFLAGYERNKASMLNYEGMPAFALSENLLAVLKQPNTKLNKYVKYDPFLNLYLVRTD FSLIPTPMGDEEKLTRNDWVGIWDPNKPYIGHIKYLAQNIDEKDQLDFNSKIGLLGTPCCEMMGIALNNSSFIGNRYLKH FMKYNDVYWGDIGVDFVVRENKIYVNNVRKNPQFLINDQVISVDGLPANDLRKLNEKILFADRGSTLYFQVLRDNMDLNI STEVFAKDLSKFNLPDSKPKPKITNFTSNLGLTVNTSLVVTKIDPKSKASNAGFMVGDKILRVNNIILNNFKELQNILSA GNDFSILIERKSTKLPLSNFNNELGGNANSGGDGKFQFFIRLTK ; D,E,F,G,H,I,J ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MKKIYFMLAIAGIFAGCVPSANSATKNSSANSTAPSQDVIVQKVDKDDVRDIIREEKMLAPDASETELSFTAVGEGIAPM NTVSTAQALALAKRAAITDAYRQLASKLYGVKVNGKDTVKDAMLRSSTITAQVNGLIKNASIIDENFNQGLYRVNLELKI DADKWKELFAY ; ;MKKIYFMLAIAGIFAGCVPSANSATKNSSANSTAPSQDVIVQKVDKDDVRDIIREEKMLAPDASETELSFTAVGEGIAPM NTVSTAQALALAKRAAITDAYRQLASKLYGVKVNGKDTVKDAMLRSSTITAQVNGLIKNASIIDENFNQGLYRVNLELKI DADKWKELFAY ; C,B,A ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MAKKHKCPECPAGEKWAVPYADFLSLLLALFIALWAISKTNPAKVEALKTEFVKIFDYTSTQTVKEESKTQEKYKGAAKE ESDELKSLKQMTMTQQETIKRLQAALDQSDNQVALNLPSKVEFERGSAQIVSADIQDYLKRMAELTTYLPPQAKIEIRGY TDNSDSIIRSYELAYQRAENVLKYFIEGGANLKNISIKSYGLNNPINGNPQALENNRVEIYFKVDTADTSTQKSVLELIN KIGTKAP ; ;MAKKHKCPECPAGEKWAVPYADFLSLLLALFIALWAISKTNPAKVEALKTEFVKIFDYTSTQTVKEESKTQEKYKGAAKE ESDELKSLKQMTMTQQETIKRLQAALDQSDNQVALNLPSKVEFERGSAQIVSADIQDYLKRMAELTTYLPPQAKIEIRGY TDNSDSIIRSYELAYQRAENVLKYFIEGGANLKNISIKSYGLNNPINGNPQALENNRVEIYFKVDTADTSTQKSVLELIN KIGTKAP ; M,N ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ASP n 1 3 GLU n 1 4 GLU n 1 5 LEU n 1 6 GLU n 1 7 ASN n 1 8 GLU n 1 9 GLU n 1 10 THR n 1 11 LYS n 1 12 LYS n 1 13 LYS n 1 14 LYS n 1 15 GLY n 1 16 GLY n 1 17 SER n 1 18 LEU n 1 19 VAL n 1 20 ILE n 1 21 ILE n 1 22 ILE n 1 23 VAL n 1 24 ILE n 1 25 LEU n 1 26 LEU n 1 27 PHE n 1 28 VAL n 1 29 LEU n 1 30 LEU n 1 31 LEU n 1 32 SER n 1 33 ILE n 1 34 MET n 1 35 GLY n 1 36 VAL n 1 37 ILE n 1 38 ALA n 1 39 TRP n 1 40 LEU n 1 41 ILE n 1 42 SER n 1 43 SER n 1 44 SER n 1 45 SER n 1 46 SER n 1 47 ASP n 1 48 GLU n 1 49 SER n 1 50 GLU n 1 51 VAL n 1 52 LYS n 1 53 GLU n 1 54 ALA n 1 55 PRO n 1 56 LYS n 1 57 GLU n 1 58 GLU n 1 59 ALA n 1 60 LYS n 1 61 ALA n 1 62 ASP n 1 63 LYS n 1 64 PRO n 1 65 LYS n 1 66 VAL n 1 67 SER n 1 68 ALA n 1 69 PRO n 1 70 THR n 1 71 GLN n 1 72 ARG n 1 73 GLY n 1 74 SER n 1 75 ASP n 1 76 PHE n 1 77 ALA n 1 78 ASN n 1 79 ILE n 1 80 GLY n 1 81 PRO n 1 82 MET n 1 83 TYR n 1 84 PRO n 1 85 LEU n 1 86 ASP n 1 87 PRO n 1 88 PHE n 1 89 THR n 1 90 LEU n 1 91 ASN n 1 92 LEU n 1 93 LEU n 1 94 SER n 1 95 ASP n 1 96 SER n 1 97 GLY n 1 98 SER n 1 99 ARG n 1 100 TYR n 1 101 VAL n 1 102 LYS n 1 103 CYS n 1 104 THR n 1 105 ILE n 1 106 GLU n 1 107 LEU n 1 108 GLU n 1 109 GLN n 1 110 ASN n 1 111 SER n 1 112 GLU n 1 113 LEU n 1 114 LEU n 1 115 LYS n 1 116 PRO n 1 117 GLU n 1 118 LEU n 1 119 ASP n 1 120 LYS n 1 121 LYS n 1 122 VAL n 1 123 PRO n 1 124 VAL n 1 125 ILE n 1 126 ARG n 1 127 ASP n 1 128 ILE n 1 129 ILE n 1 130 ILE n 1 131 ARG n 1 132 THR n 1 133 LEU n 1 134 THR n 1 135 ALA n 1 136 LYS n 1 137 THR n 1 138 PHE n 1 139 GLU n 1 140 GLU n 1 141 VAL n 1 142 SER n 1 143 THR n 1 144 GLN n 1 145 LYS n 1 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A0A0H3PBX6 1 ? 247 ? 1 247 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 102-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 102 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 2 'point symmetry operation' ? ? 0.93247223 -0.36124167 0.00000000 377.31710437 0.36124167 0.93247223 0.00000000 -258.46822812 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 3 'point symmetry operation' ? ? 0.73900892 -0.67369564 0.00000000 822.52431925 0.67369564 0.73900892 0.00000000 -363.18001356 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 4 'point symmetry operation' ? ? 0.44573836 -0.89516329 0.00000000 1275.49394331 0.89516329 0.44573836 0.00000000 -299.99344948 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 5 'point symmetry operation' ? ? 0.09226836 -0.99573418 0.00000000 1675.04991881 0.99573418 0.09226836 0.00000000 -77.44223147 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 6 'point symmetry operation' ? ? -0.27366299 -0.96182564 0.00000000 1967.22999726 0.96182564 -0.27366299 0.00000000 274.41686527 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 7 'point symmetry operation' ? ? -0.60263464 -0.79801723 0.00000000 2112.57364002 0.79801723 -0.60263464 0.00000000 708.06332001 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 8 'point symmetry operation' ? ? -0.85021714 -0.52643216 0.00000000 2091.45138277 0.52643216 -0.85021714 0.00000000 1164.93077611 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 9 'point symmetry operation' ? ? -0.98297310 -0.18374952 0.00000000 1906.71590340 0.18374952 -0.98297310 0.00000000 1583.31675204 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 10 'point symmetry operation' ? ? -0.98297310 0.18374952 0.00000000 1583.31675204 -0.18374952 -0.98297310 0.00000000 1906.71590340 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 11 'point symmetry operation' ? ? -0.85021714 0.52643216 0.00000000 1164.93077611 -0.52643216 -0.85021714 0.00000000 2091.45138277 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 12 'point symmetry operation' ? ? -0.60263464 0.79801723 0.00000000 708.06332001 -0.79801723 -0.60263464 0.00000000 2112.57364002 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 13 'point symmetry operation' ? ? -0.27366299 0.96182564 0.00000000 274.41686527 -0.96182564 -0.27366299 0.00000000 1967.22999726 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 14 'point symmetry operation' ? 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_em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' # loop_ _em_3d_fitting_list.id _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range _em_3d_fitting_list.details _em_3d_fitting_list.chain_id _em_3d_fitting_list.chain_residue_range _em_3d_fitting_list.source_name _em_3d_fitting_list.type _em_3d_fitting_list.accession_code _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 1 . . . ? 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