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C PHE 396 CG 270 1 Y 1 LZ PHE 396 ? CD1 ? C PHE 396 CD1 271 1 Y 1 LZ PHE 396 ? CD2 ? C PHE 396 CD2 272 1 Y 1 LZ PHE 396 ? CE1 ? C PHE 396 CE1 273 1 Y 1 LZ PHE 396 ? CE2 ? C PHE 396 CE2 274 1 Y 1 LZ PHE 396 ? CZ ? C PHE 396 CZ 275 1 Y 1 LZ ILE 397 ? CG1 ? C ILE 397 CG1 276 1 Y 1 LZ ILE 397 ? CG2 ? C ILE 397 CG2 277 1 Y 1 LZ ILE 397 ? CD1 ? C ILE 397 CD1 278 1 Y 1 LZ ASN 398 ? CG ? C ASN 398 CG 279 1 Y 1 LZ ASN 398 ? OD1 ? C ASN 398 OD1 280 1 Y 1 LZ ASN 398 ? ND2 ? C ASN 398 ND2 281 1 Y 1 LZ SER 399 ? OG ? C SER 399 OG 282 1 Y 1 LZ LYS 400 ? CG ? C LYS 400 CG 283 1 Y 1 LZ LYS 400 ? CD ? C LYS 400 CD 284 1 Y 1 LZ LYS 400 ? CE ? C LYS 400 CE 285 1 Y 1 LZ LYS 400 ? NZ ? 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ARG TN 35 VAL TN 39 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 8 ? AA3 ? 7 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 7 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? parallel AA2 4 5 ? parallel AA2 5 6 ? parallel AA2 6 7 ? parallel AA2 7 8 ? parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? parallel AA3 3 4 ? parallel AA3 4 5 ? parallel AA3 5 6 ? parallel AA3 6 7 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA5 6 7 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLU B 238 ? LEU B 239 ? GLU LV 238 LEU LV 239 AA1 2 TYR B 1047 ? ALA B 1048 ? TYR LV 1047 ALA LV 1048 AA2 1 ARG B 507 ? VAL B 509 ? ARG LV 507 VAL LV 509 AA2 2 GLY B 501 ? VAL B 504 ? GLY LV 501 VAL LV 504 AA2 3 ILE B 516 ? MET B 519 ? ILE LV 516 MET LV 519 AA2 4 MET B 470 ? THR B 474 ? MET LV 470 THR LV 474 AA2 5 TYR B 537 ? LEU B 542 ? TYR LV 537 LEU LV 542 AA2 6 LYS B 570 ? SER B 575 ? LYS LV 570 SER LV 575 AA2 7 VAL B 441 ? GLY B 446 ? VAL LV 441 GLY LV 446 AA2 8 PHE B 593 ? ILE B 595 ? PHE LV 593 ILE LV 595 AA3 1 LEU B 669 ? PRO B 673 ? LEU LV 669 PRO LV 673 AA3 2 ARG B 695 ? ALA B 700 ? ARG LV 695 ALA LV 700 AA3 3 VAL B 634 ? PHE B 637 ? VAL LV 634 PHE LV 637 AA3 4 TYR B 715 ? ASP B 718 ? TYR LV 715 ASP LV 718 AA3 5 GLY B 759 ? ARG B 763 ? GLY LV 759 ARG LV 763 AA3 6 VAL B 602 ? LEU B 607 ? VAL LV 602 LEU LV 607 AA3 7 PHE D 8 ? THR D 9 ? PHE TN 8 THR TN 9 AA4 1 PHE B 721 ? PHE B 727 ? PHE LV 721 PHE LV 727 AA4 2 ASP B 734 ? PRO B 740 ? ASP LV 734 PRO LV 740 AA5 1 ASP B 1019 ? MET B 1022 ? ASP LV 1019 MET LV 1022 AA5 2 GLU B 1026 ? THR B 1029 ? GLU LV 1026 THR LV 1029 AA5 3 GLU B 998 ? VAL B 1001 ? GLU LV 998 VAL LV 1001 AA5 4 SER B 989 ? THR B 992 ? SER LV 989 THR LV 992 AA5 5 ALA B 979 ? ASP B 984 ? ALA LV 979 ASP LV 984 AA5 6 TYR B 1014 ? LEU B 1016 ? TYR LV 1014 LEU LV 1016 AA5 7 LEU B 1032 ? ALA B 1033 ? LEU LV 1032 ALA LV 1033 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N GLU B 238 ? N GLU LV 238 O ALA B 1048 ? O ALA LV 1048 AA2 1 2 O VAL B 509 ? O VAL LV 509 N TYR B 502 ? N TYR LV 502 AA2 2 3 N GLY B 501 ? N GLY LV 501 O ILE B 516 ? O ILE LV 516 AA2 3 4 O LYS B 517 ? O LYS LV 517 N ILE B 471 ? N ILE LV 471 AA2 4 5 N ALA B 472 ? N ALA LV 472 O ILE B 541 ? O ILE LV 541 AA2 5 6 N LEU B 542 ? N LEU LV 542 O THR B 574 ? O THR LV 574 AA2 6 7 O VAL B 573 ? O VAL LV 573 N LEU B 444 ? N LEU LV 444 AA2 7 8 N VAL B 445 ? N VAL LV 445 O ILE B 595 ? O ILE LV 595 AA3 1 2 N LEU B 672 ? N LEU LV 672 O VAL B 697 ? O VAL LV 697 AA3 2 3 O VAL B 698 ? O VAL LV 698 N VAL B 634 ? N VAL LV 634 AA3 3 4 N LEU B 635 ? N LEU LV 635 O VAL B 717 ? O VAL LV 717 AA3 4 5 N ASP B 718 ? N ASP LV 718 O TYR B 762 ? O TYR LV 762 AA3 5 6 O CYS B 761 ? O CYS LV 761 N GLU B 603 ? N GLU LV 603 AA3 6 7 N TYR B 606 ? N TYR LV 606 O THR D 9 ? O THR TN 9 AA4 1 2 N CYS B 722 ? N CYS LV 722 O MET B 739 ? O MET LV 739 AA5 1 2 N ARG B 1021 ? N ARG LV 1021 O TYR B 1027 ? O TYR LV 1027 AA5 2 3 O GLU B 1026 ? O GLU LV 1026 N TYR B 1000 ? N TYR LV 1000 AA5 3 4 O VAL B 999 ? O VAL LV 999 N TYR B 990 ? N TYR LV 990 AA5 4 5 O VAL B 991 ? O VAL LV 991 N ARG B 981 ? N ARG LV 981 AA5 5 6 N ALA B 980 ? N ALA LV 980 O VAL B 1015 ? O VAL LV 1015 AA5 6 7 N LEU B 1016 ? N LEU LV 1016 O LEU B 1032 ? O LEU LV 1032 # _pdbx_entry_details.entry_id 9IBC _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? _pdbx_entry_details.has_protein_modification N # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 VAL LF 108 ? ? -114.35 70.78 2 1 MET LV 255 ? ? 73.08 -6.79 3 1 GLU LV 498 ? ? 57.63 -120.45 4 1 ASN LV 702 ? ? 73.48 -4.40 5 1 THR LV 772 ? ? -96.89 -62.82 6 1 LYS LV 1024 ? ? 57.88 -122.03 7 1 GLU LV 1030 ? ? 60.75 65.21 # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 9IBC _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 9IBC _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 3.51 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 98912 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.8 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source NATURAL _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.name 'Leishmania tarentolae ATP-dependant RNA helicase PRP22/DHX8 in closed conformation bound to pre-mRNA' _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list '1, 2, 3, 4, 5' # _em_imaging.entry_id 9IBC _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'TFS KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_min 500 _em_imaging.nominal_defocus_max 2500 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification 64000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.method ? _em_sample_support.grid_material GOLD _em_sample_support.grid_mesh_size 400 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R3.5/1' _em_sample_support.details ? _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.entry_id 9IBC _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature 283 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 9IBC _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 9IBC _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 LF MET 1 ? A MET 1 2 1 Y 1 LF ASP 2 ? A ASP 2 3 1 Y 1 LF TRP 3 ? A TRP 3 4 1 Y 1 LF ASP 4 ? A ASP 4 5 1 Y 1 LF ARG 5 ? A ARG 5 6 1 Y 1 LF PRO 6 ? A PRO 6 7 1 Y 1 LF SER 7 ? A SER 7 8 1 Y 1 LF GLY 8 ? A GLY 8 9 1 Y 1 LF LYS 9 ? A LYS 9 10 1 Y 1 LF ARG 10 ? A ARG 10 11 1 Y 1 LF ARG 11 ? A ARG 11 12 1 Y 1 LF ARG 12 ? A ARG 12 13 1 Y 1 LF ARG 163 ? A ARG 163 14 1 Y 1 LF GLY 164 ? A GLY 164 15 1 Y 1 LF ASP 165 ? A ASP 165 16 1 Y 1 LF ARG 166 ? A ARG 166 17 1 Y 1 LF ASP 167 ? A ASP 167 18 1 Y 1 LF ASP 168 ? A ASP 168 19 1 Y 1 LF ASP 169 ? A ASP 169 20 1 Y 1 LF ASP 170 ? A ASP 170 21 1 Y 1 LF TYR 171 ? A TYR 171 22 1 Y 1 LF ASP 172 ? A ASP 172 23 1 Y 1 LF ASP 173 ? A ASP 173 24 1 Y 1 LF TYR 174 ? A TYR 174 25 1 Y 1 LF ASP 175 ? A ASP 175 26 1 Y 1 LF ASP 176 ? A ASP 176 27 1 Y 1 LF ALA 177 ? A ALA 177 28 1 Y 1 LF ASP 178 ? A ASP 178 29 1 Y 1 LF ASN 179 ? A ASN 179 30 1 Y 1 LF TYR 180 ? A TYR 180 31 1 Y 1 LF GLY 181 ? A GLY 181 32 1 Y 1 LF GLY 182 ? A GLY 182 33 1 Y 1 LF GLY 183 ? A GLY 183 34 1 Y 1 LF TYR 184 ? A TYR 184 35 1 Y 1 LF ASP 185 ? A ASP 185 36 1 Y 1 LF ASP 186 ? A ASP 186 37 1 Y 1 LF TYR 187 ? A TYR 187 38 1 Y 1 LF SER 188 ? A SER 188 39 1 Y 1 LF ARG 189 ? A ARG 189 40 1 Y 1 LF SER 190 ? A SER 190 41 1 Y 1 LF ARG 191 ? A ARG 191 42 1 Y 1 LF ASP 192 ? A ASP 192 43 1 Y 1 LF ARG 193 ? A ARG 193 44 1 Y 1 LF ASP 194 ? A ASP 194 45 1 Y 1 LF ASP 195 ? A ASP 195 46 1 Y 1 LF GLY 196 ? A GLY 196 47 1 Y 1 LF TYR 197 ? A TYR 197 48 1 Y 1 LF SER 198 ? A SER 198 49 1 Y 1 LF ARG 199 ? A ARG 199 50 1 Y 1 LF LEU 200 ? A LEU 200 51 1 Y 1 LF THR 201 ? A THR 201 52 1 Y 1 LF ASN 202 ? A ASN 202 53 1 Y 1 LF GLU 203 ? A GLU 203 54 1 Y 1 LF GLU 204 ? A GLU 204 55 1 Y 1 LF GLY 205 ? A GLY 205 56 1 Y 1 LF GLU 206 ? A GLU 206 57 1 Y 1 LF GLY 207 ? A GLY 207 58 1 Y 1 LF ASP 208 ? A ASP 208 59 1 Y 1 LF GLY 209 ? A GLY 209 60 1 Y 1 LF GLU 210 ? A GLU 210 61 1 Y 1 LF GLY 211 ? A GLY 211 62 1 Y 1 LF ASP 212 ? A ASP 212 63 1 Y 1 LF HIS 213 ? A HIS 213 64 1 Y 1 LF GLY 214 ? A GLY 214 65 1 Y 1 LF SER 215 ? A SER 215 66 1 Y 1 LF PRO 216 ? A PRO 216 67 1 Y 1 LF ALA 217 ? A ALA 217 68 1 Y 1 LF SER 218 ? A SER 218 69 1 Y 1 LF PRO 219 ? A PRO 219 70 1 Y 1 LF HIS 220 ? A HIS 220 71 1 Y 1 LF LYS 221 ? A LYS 221 72 1 Y 1 LF ASP 222 ? A ASP 222 73 1 Y 1 LF THR 223 ? A THR 223 74 1 Y 1 LF ASN 224 ? A ASN 224 75 1 Y 1 LF ARG 278 ? A ARG 278 76 1 Y 1 LF GLY 279 ? A GLY 279 77 1 Y 1 LF GLY 280 ? A GLY 280 78 1 Y 1 LF GLY 281 ? A GLY 281 79 1 Y 1 LF ASP 282 ? A ASP 282 80 1 Y 1 LF HIS 283 ? A HIS 283 81 1 Y 1 LF ASP 284 ? A ASP 284 82 1 Y 1 LF GLU 285 ? A GLU 285 83 1 Y 1 LF ALA 286 ? A ALA 286 84 1 Y 1 LF SER 287 ? A SER 287 85 1 Y 1 LF VAL 288 ? A VAL 288 86 1 Y 1 LF GLU 289 ? A GLU 289 87 1 Y 1 LF ALA 290 ? A ALA 290 88 1 Y 1 LF VAL 291 ? A VAL 291 89 1 Y 1 LF ALA 292 ? A ALA 292 90 1 Y 1 LF LEU 293 ? A LEU 293 91 1 Y 1 LF ALA 294 ? A ALA 294 92 1 Y 1 LF GLY 295 ? A GLY 295 93 1 Y 1 LF GLY 296 ? A GLY 296 94 1 Y 1 LF SER 297 ? A SER 297 95 1 Y 1 LF ALA 298 ? 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