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2 557 U 557 710 710 U U B . n B 2 558 A 558 711 711 A A B . n B 2 559 U 559 712 712 U U B . n B 2 560 C 560 713 713 C C B . n B 2 561 G 561 714 714 G G B . n B 2 562 G 562 715 715 G G B . n B 2 563 C 563 716 716 C C B . n B 2 564 G 564 717 717 G G B . n B 2 565 A 565 718 718 A A B . n B 2 566 A 566 719 719 A A B . n B 2 567 A 567 720 720 A A B . n B 2 568 G 568 721 721 G G B . n B 2 569 A 569 722 722 A A B . n B 2 570 G 570 723 723 G G B . n B 2 571 C 571 724 724 C C B . n B 2 572 C 572 725 725 C C B . n B 2 573 A 573 726 726 A A B . n B 2 574 A 574 727 727 A A B . n B 2 575 G 575 728 728 G G B . n B 2 576 C 576 729 729 C C B . n B 2 577 G 577 730 730 G G B . n B 2 578 G 578 731 731 G G B . n B 2 579 U 579 732 732 U U B . n B 2 580 A 580 733 733 A A B . n B 2 581 A 581 734 734 A A B . n B 2 582 C 582 735 735 C C B . n # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 3 MG 1 201 1 MG M A . 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.523 ? 26539 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 16.195 ? 8451 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.026 ? 3525 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 705 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9IS7 _struct.title 'Paracandidimonas lactea CP group II intron 2S state' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9IS7 _struct_keywords.text 'CryoEM, Ribozyme, RNA' _struct_keywords.pdbx_keywords RNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 3 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 4 ? I N N 3 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 3 ? M N N 3 ? N N N 3 ? O N N 3 ? P N N 3 ? Q N N 3 ? R N N 3 ? S N N 3 ? T N N 3 ? U N N 3 ? V N N 3 ? W N N 3 ? X N N 3 ? Y N N 3 ? Z N N 3 ? AA N N 3 ? 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IA N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 9IS7 9IS7 ? 1 ? 1 2 PDB 9IS7 9IS7 ? 2 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9IS7 A 1 ? 153 ? 9IS7 1 ? 153 ? 1 153 2 2 9IS7 B 1 ? 582 ? 9IS7 154 ? 735 ? 154 735 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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A A 152 B MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.704 ? ? metalc11 metalc ? ? A G 153 "O3'" ? ? ? 1_555 D MG . MG ? ? A G 153 A MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.822 ? ? metalc12 metalc ? ? G K . K ? ? ? 1_555 B A 491 OP2 ? ? A K 205 B A 644 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.685 ? ? metalc13 metalc ? ? B G 2 O6 ? ? ? 1_555 HA K . K ? ? B G 155 B K 826 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.634 ? ? metalc14 metalc ? ? B G 5 OP2 ? ? ? 1_555 HA K . K ? ? B G 158 B K 826 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.644 ? ? metalc15 metalc ? ? B A 13 OP2 ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? B A 166 B MG 814 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.802 ? ? metalc16 metalc ? ? B U 46 OP1 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? B U 199 B MG 820 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.723 ? ? metalc17 metalc ? ? B G 121 OP2 ? ? ? 1_555 EA MG . MG ? ? B G 274 B MG 823 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.708 ? ? metalc18 metalc ? ? B G 197 OP2 ? ? ? 1_555 S MG . MG ? ? B G 350 B MG 811 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.727 ? ? metalc19 metalc ? ? B A 202 OP2 ? ? ? 1_555 L MG . MG ? ? B A 355 B MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.904 ? ? metalc20 metalc ? ? B U 203 OP2 ? ? ? 1_555 L MG . MG ? ? B U 356 B MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? ? metalc21 metalc ? ? B C 206 OP2 ? ? ? 1_555 K MG . MG ? ? B C 359 B MG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.707 ? ? metalc22 metalc ? ? B G 302 OP2 ? ? ? 1_555 Q MG . MG ? ? B G 455 B MG 809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.795 ? ? metalc23 metalc ? ? B C 306 OP2 ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? B C 459 B MG 818 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.725 ? ? metalc24 metalc ? ? B U 353 OP1 ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? B U 506 B MG 810 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.722 ? ? metalc25 metalc ? ? B G 355 OP2 ? ? ? 1_555 Q MG . MG ? ? B G 508 B MG 809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.857 ? ? metalc26 metalc ? ? B A 426 OP1 ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? B A 579 B MG 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.738 ? ? metalc27 metalc ? ? B G 427 OP2 ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? B G 580 B MG 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.707 ? ? metalc28 metalc ? ? B A 489 OP1 ? ? ? 1_555 HA K . K ? ? B A 642 B K 826 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.883 ? ? metalc29 metalc ? ? B A 489 OP2 ? ? ? 1_555 HA K . K ? ? B A 642 B K 826 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.663 ? ? metalc30 metalc ? ? B A 541 OP1 ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? B A 694 B MG 816 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.856 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A A 1 N6 ? ? ? 1_555 A U 17 O4 ? ? A A 1 A U 17 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-U PAIR' ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A G 2 N1 ? ? ? 1_555 A C 16 N3 ? ? A G 2 A C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A G 2 N2 ? ? ? 1_555 A C 16 O2 ? ? A G 2 A C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A G 2 O6 ? ? ? 1_555 A C 16 N4 ? ? A G 2 A C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A C 3 N3 ? ? ? 1_555 A G 15 N1 ? ? A C 3 A G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A C 3 N4 ? ? ? 1_555 A G 15 O6 ? ? A C 3 A G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A C 3 O2 ? ? ? 1_555 A G 15 N2 ? ? A C 3 A G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A A 4 N1 ? ? ? 1_555 A U 14 N3 ? ? A A 4 A U 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A A 4 N6 ? ? ? 1_555 A U 14 O4 ? ? A A 4 A U 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A G 5 N1 ? ? ? 1_555 A C 13 N3 ? ? A G 5 A C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A G 5 N2 ? ? ? 1_555 A C 13 O2 ? ? A G 5 A C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A G 5 O6 ? ? ? 1_555 A C 13 N4 ? ? A G 5 A C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A G 6 N1 ? ? ? 1_555 A C 12 N3 ? ? A G 6 A C 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A G 6 N2 ? ? ? 1_555 A C 12 O2 ? ? A G 6 A C 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A G 6 O6 ? ? ? 1_555 A C 12 N4 ? ? A G 6 A C 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A C 7 O2 ? ? ? 1_555 A A 11 N6 ? ? A C 7 A A 11 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-A MISPAIR' ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A C 7 N3 ? ? ? 1_555 A C 12 N4 ? ? 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