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F . n L 2 1 UNK 1 1 1 UNK UNK L . n L 2 2 UNK 2 2 2 UNK UNK L . n L 2 3 UNK 3 3 3 UNK UNK L . n L 2 4 UNK 4 4 4 UNK UNK L . n L 2 5 UNK 5 5 5 UNK UNK L . n L 2 6 UNK 6 6 6 UNK UNK L . n L 2 7 UNK 7 7 7 UNK UNK L . n L 2 8 UNK 8 8 8 UNK UNK L . n # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 9JBP _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 9JBP _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9JBP _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 9JBP _struct.title 'Cryo-EM structure of human SOD1 (C6A/C111A) amyloid filament' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9JBP _struct_keywords.text 'amyloid, filament, superoxide dismutase 1, amyotrophic lateral sclerosis, PROTEIN FIBRIL' _struct_keywords.pdbx_keywords 'PROTEIN FIBRIL' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 1 ? J N N 2 ? K N N 1 ? 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UNP P00441 ? ? 'expression tag' -6 2 1 9JBP MET A 3 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -5 3 1 9JBP ASP A 4 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -4 4 1 9JBP PRO A 5 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -3 5 1 9JBP GLU A 6 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -2 6 1 9JBP PHE A 7 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -1 7 1 9JBP ALA A 14 ? UNP P00441 CYS 7 'engineered mutation' 6 8 1 9JBP ALA A 119 ? UNP P00441 CYS 112 'engineered mutation' 111 9 3 9JBP GLY B 1 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -7 10 3 9JBP ALA B 2 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -6 11 3 9JBP MET B 3 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -5 12 3 9JBP ASP B 4 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -4 13 3 9JBP PRO B 5 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -3 14 3 9JBP GLU B 6 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -2 15 3 9JBP PHE B 7 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -1 16 3 9JBP ALA B 14 ? UNP P00441 CYS 7 'engineered mutation' 6 17 3 9JBP ALA B 119 ? UNP P00441 CYS 112 'engineered mutation' 111 18 5 9JBP GLY C 1 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -7 19 5 9JBP ALA C 2 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -6 20 5 9JBP MET C 3 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -5 21 5 9JBP ASP C 4 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -4 22 5 9JBP PRO C 5 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -3 23 5 9JBP GLU C 6 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -2 24 5 9JBP PHE C 7 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -1 25 5 9JBP ALA C 14 ? UNP P00441 CYS 7 'engineered mutation' 6 26 5 9JBP ALA C 119 ? UNP P00441 CYS 112 'engineered mutation' 111 27 7 9JBP GLY D 1 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -7 28 7 9JBP ALA D 2 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -6 29 7 9JBP MET D 3 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -5 30 7 9JBP ASP D 4 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -4 31 7 9JBP PRO D 5 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -3 32 7 9JBP GLU D 6 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -2 33 7 9JBP PHE D 7 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -1 34 7 9JBP ALA D 14 ? UNP P00441 CYS 7 'engineered mutation' 6 35 7 9JBP ALA D 119 ? UNP P00441 CYS 112 'engineered mutation' 111 36 9 9JBP GLY E 1 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -7 37 9 9JBP ALA E 2 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -6 38 9 9JBP MET E 3 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -5 39 9 9JBP ASP E 4 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -4 40 9 9JBP PRO E 5 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -3 41 9 9JBP GLU E 6 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -2 42 9 9JBP PHE E 7 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -1 43 9 9JBP ALA E 14 ? UNP P00441 CYS 7 'engineered mutation' 6 44 9 9JBP ALA E 119 ? UNP P00441 CYS 112 'engineered mutation' 111 45 11 9JBP GLY F 1 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -7 46 11 9JBP ALA F 2 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -6 47 11 9JBP MET F 3 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -5 48 11 9JBP ASP F 4 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -4 49 11 9JBP PRO F 5 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -3 50 11 9JBP GLU F 6 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -2 51 11 9JBP PHE F 7 ? UNP P00441 ? ? 'expression tag' -1 52 11 9JBP ALA F 14 ? UNP P00441 CYS 7 'engineered mutation' 6 53 11 9JBP ALA F 119 ? UNP P00441 CYS 112 'engineered mutation' 111 54 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'amyloid filaments are shown in EM images' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 13 ? LEU A 16 ? VAL A 5 LEU A 8 AA1 2 VAL C 13 ? LEU C 16 ? VAL B 5 LEU B 8 AA1 3 VAL E 13 ? LEU E 16 ? VAL C 5 LEU C 8 AA2 1 VAL A 22 ? GLN A 23 ? VAL A 14 GLN A 15 AA2 2 VAL C 22 ? ILE C 26 ? VAL B 14 ILE B 18 AA2 3 VAL E 22 ? ILE E 26 ? VAL C 14 ILE C 18 AA3 1 LYS A 38 ? ILE A 43 ? LYS A 30 ILE A 35 AA3 2 LYS C 38 ? ILE C 43 ? LYS B 30 ILE B 35 AA3 3 LYS E 38 ? ILE E 43 ? LYS C 30 ILE C 35 AA4 1 UNK B 3 ? UNK B 6 ? UNK G 3 UNK G 6 AA4 2 UNK D 3 ? UNK D 6 ? UNK H 3 UNK H 6 AA4 3 UNK F 3 ? UNK F 6 ? UNK I 3 UNK I 6 AA5 1 THR G 10 ? LEU G 16 ? THR D 2 LEU D 8 AA5 2 THR I 10 ? LEU I 16 ? THR E 2 LEU E 8 AA5 3 VAL K 13 ? LEU K 16 ? VAL F 5 LEU F 8 AA6 1 VAL G 22 ? ILE G 26 ? VAL D 14 ILE D 18 AA6 2 VAL I 22 ? ILE I 26 ? VAL E 14 ILE E 18 AA6 3 VAL K 22 ? ILE K 26 ? VAL F 14 ILE F 18 AA7 1 LYS G 38 ? ILE G 43 ? LYS D 30 ILE D 35 AA7 2 LYS I 38 ? ILE I 43 ? LYS E 30 ILE E 35 AA7 3 LYS K 38 ? ILE K 43 ? LYS F 30 ILE F 35 AA8 1 UNK H 3 ? UNK H 6 ? UNK J 3 UNK J 6 AA8 2 UNK J 3 ? UNK J 6 ? UNK K 3 UNK K 6 AA8 3 UNK L 3 ? UNK L 6 ? 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