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# loop_ _refine_ls_shell.pdbx_refine_id _refine_ls_shell.d_res_high _refine_ls_shell.d_res_low _refine_ls_shell.number_reflns_all _refine_ls_shell.number_reflns_obs _refine_ls_shell.number_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_R_work _refine_ls_shell.percent_reflns_obs _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free _refine_ls_shell.R_factor_all _refine_ls_shell.R_factor_obs _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error _refine_ls_shell.R_factor_R_work _refine_ls_shell.redundancy_reflns_all _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs _refine_ls_shell.wR_factor_all _refine_ls_shell.wR_factor_obs _refine_ls_shell.wR_factor_R_free _refine_ls_shell.wR_factor_R_work _refine_ls_shell.pdbx_R_complete _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used _refine_ls_shell.pdbx_phase_error _refine_ls_shell.pdbx_fsc_work _refine_ls_shell.pdbx_fsc_free _refine_ls_shell.R_factor_R_free 'X-RAY DIFFRACTION' 3.4000 3.4400 2421 . 121 2300 88.0000 . . . 0.0000 0.2445 . . . . . . . 27 . . . 0.3099 'X-RAY DIFFRACTION' 3.4400 3.4900 2666 . 139 2527 100.0000 . . . 0.0000 0.2284 . . . . . . . 27 . . . 0.2783 'X-RAY DIFFRACTION' 3.4900 3.5400 2671 . 146 2525 100.0000 . . . 0.0000 0.2086 . . . . . . . 27 . . . 0.2997 'X-RAY DIFFRACTION' 3.5400 3.5900 2750 . 165 2585 99.0000 . . . 0.0000 0.2111 . . . . . . . 27 . . . 0.2912 'X-RAY DIFFRACTION' 3.5900 3.6400 2662 . 126 2536 100.0000 . . . 0.0000 0.1879 . . . . . . . 27 . . . 0.2471 'X-RAY DIFFRACTION' 3.6400 3.7000 2731 . 152 2579 100.0000 . . . 0.0000 0.1824 . . . . . . . 27 . . . 0.2285 'X-RAY DIFFRACTION' 3.7000 3.7600 2681 . 161 2520 100.0000 . . . 0.0000 0.1704 . . . . . . . 27 . . . 0.2375 'X-RAY DIFFRACTION' 3.7600 3.8200 2713 . 129 2584 100.0000 . . . 0.0000 0.1650 . . . . . . . 27 . . . 0.2174 'X-RAY DIFFRACTION' 3.8200 3.8900 2702 . 126 2576 100.0000 . . . 0.0000 0.1625 . . . . . . . 27 . . . 0.2333 'X-RAY DIFFRACTION' 3.8900 3.9700 2722 . 105 2617 100.0000 . . . 0.0000 0.1651 . . . . . . . 27 . . . 0.2094 'X-RAY DIFFRACTION' 3.9700 4.0500 2697 . 126 2571 100.0000 . . . 0.0000 0.1575 . . . . . . . 27 . . . 0.2146 'X-RAY DIFFRACTION' 4.0500 4.1300 2684 . 122 2562 100.0000 . . . 0.0000 0.1540 . . . . . . . 27 . . . 0.2166 'X-RAY DIFFRACTION' 4.1300 4.2300 2722 . 153 2569 100.0000 . . . 0.0000 0.1419 . . . . . . . 27 . . . 0.1930 'X-RAY DIFFRACTION' 4.2300 4.3400 2674 . 122 2552 100.0000 . . . 0.0000 0.1460 . . . . . . . 27 . . . 0.1799 'X-RAY DIFFRACTION' 4.3400 4.4500 2738 . 132 2606 100.0000 . . . 0.0000 0.1424 . . . . . . . 27 . . . 0.1756 'X-RAY DIFFRACTION' 4.4500 4.5800 2707 . 143 2564 100.0000 . . . 0.0000 0.1415 . . . . . . . 27 . . . 0.2108 'X-RAY DIFFRACTION' 4.5800 4.7300 2713 . 166 2547 100.0000 . . . 0.0000 0.1336 . . . . . . . 27 . . . 0.1904 'X-RAY DIFFRACTION' 4.7300 4.9000 2703 . 150 2553 100.0000 . . . 0.0000 0.1361 . . . . . . . 27 . . . 0.1827 'X-RAY DIFFRACTION' 4.9000 5.0900 2740 . 134 2606 100.0000 . . . 0.0000 0.1322 . . . . . . . 27 . . . 0.1767 'X-RAY DIFFRACTION' 5.0900 5.3300 2684 . 140 2544 100.0000 . . . 0.0000 0.1433 . . . . . . . 27 . . . 0.1864 'X-RAY DIFFRACTION' 5.3300 5.6000 2745 . 156 2589 100.0000 . . . 0.0000 0.1667 . . . . . . . 27 . . . 0.2244 'X-RAY DIFFRACTION' 5.6000 5.9500 2705 . 126 2579 100.0000 . . . 0.0000 0.1612 . . . . . . . 27 . . . 0.2267 'X-RAY DIFFRACTION' 5.9500 6.4100 2727 . 124 2603 100.0000 . . . 0.0000 0.1566 . . . . . . . 27 . . . 0.2127 'X-RAY DIFFRACTION' 6.4100 7.0400 2727 . 126 2601 100.0000 . . . 0.0000 0.1608 . . . . . . . 27 . . . 0.1998 'X-RAY DIFFRACTION' 7.0500 8.0500 2736 . 145 2591 100.0000 . . . 0.0000 0.1390 . . . . . . . 27 . . . 0.1697 'X-RAY DIFFRACTION' 8.0500 10.0700 2733 . 147 2586 100.0000 . . . 0.0000 0.1157 . . . . . . . 27 . . . 0.1450 'X-RAY DIFFRACTION' 10.0700 29.8800 2723 . 141 2582 97.0000 . . . 0.0000 0.1622 . . . . . . . 27 . . . 0.1684 # _struct.entry_id 9JKC _struct.title 'Crystal structure of Aspergillus fumigatus polymycovirus 1 ploymerase (residues 85-763) in its apo state' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9JKC _struct_keywords.text 'RNA virus, RNA-dependent RNA polymerase, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 2 ? J N N 2 ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name UNP _struct_ref.db_code A0A0H5BRR0_9VIRU _struct_ref.pdbx_db_accession A0A0H5BRR0 _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ;QARARAFRLKSYADGDLLRELRQFDGAKNASELGPRAFVRDSHRLDAAVEKASKLTDPTFHISQYQLPHPYSFGGGPPNP ERPLTAPLISAINKVSQRTRDPVGYRKRAKESIDLGDFTTHDPDTLHPRFLEYVHERTRSVDGPTDDAMRAAQTVFARLW RRKGCKVKARSLSDAQPDNLLAIIKKGSPGEYRSLGAEDRRDPRLIATMSSSLLRYASAGVQVARGRPPPGWVDTTTQVT LTFGKREPKAAKIVDGVRQAPVPRFIFNLSPVNYALASFLHYDISHFLMDNDPTHGPGFGPGRGRARKFMDLVERAFDGR FSTPDGARLIMSDITKWDANMCEALIKYSIDLLEDAVDKSALSPEGLATRGLMYRVARRQLLEKLVEHPAGYFVKLYGCM PSGSFYTSLVNTTGNNLLVIGHAIARAVEETSLTHHGAAELLADAVDGTLISYGDNQLFSEHLFSVLGLAYDPEKHAEFL ARFGMKLKVDETEVTVKLGRVRFCSRSLVRTPHGLLITRSHNSLFAKLAGRPRHDPVVDKLYVRAMMVDHMGTDPIVYAI LNEIDRSLNVSLEAAGLTDAAKKVLEDTAQSMFGNREQDALLAVYRALSETVIDRRALLSLHTPRDGDHDPGRLHTSVST GMHLFTGELTPAAQWAYECTVEKWCQYLHDTDQEGVMFD ; _struct_ref.pdbx_align_begin 85 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9JKC A 2 ? 680 ? A0A0H5BRR0 85 ? 763 ? 85 763 2 1 9JKC B 2 ? 680 ? A0A0H5BRR0 85 ? 763 ? 85 763 3 1 9JKC C 2 ? 680 ? A0A0H5BRR0 85 ? 763 ? 85 763 4 1 9JKC D 2 ? 680 ? A0A0H5BRR0 85 ? 763 ? 85 763 5 1 9JKC E 2 ? 680 ? A0A0H5BRR0 85 ? 763 ? 85 763 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 9JKC MET A 1 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'initiating methionine' 84 1 1 9JKC GLY A 681 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 764 2 1 9JKC SER A 682 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 765 3 1 9JKC SER A 683 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 766 4 1 9JKC SER A 684 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 767 5 1 9JKC HIS A 685 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 768 6 1 9JKC HIS A 686 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 769 7 1 9JKC HIS A 687 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 770 8 1 9JKC HIS A 688 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 771 9 1 9JKC HIS A 689 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 772 10 1 9JKC HIS A 690 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 773 11 2 9JKC MET B 1 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'initiating methionine' 84 12 2 9JKC GLY B 681 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 764 13 2 9JKC SER B 682 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 765 14 2 9JKC SER B 683 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 766 15 2 9JKC SER B 684 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 767 16 2 9JKC HIS B 685 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 768 17 2 9JKC HIS B 686 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 769 18 2 9JKC HIS B 687 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 770 19 2 9JKC HIS B 688 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 771 20 2 9JKC HIS B 689 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 772 21 2 9JKC HIS B 690 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 773 22 3 9JKC MET C 1 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'initiating methionine' 84 23 3 9JKC GLY C 681 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 764 24 3 9JKC SER C 682 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 765 25 3 9JKC SER C 683 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 766 26 3 9JKC SER C 684 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 767 27 3 9JKC HIS C 685 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 768 28 3 9JKC HIS C 686 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 769 29 3 9JKC HIS C 687 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 770 30 3 9JKC HIS C 688 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 771 31 3 9JKC HIS C 689 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 772 32 3 9JKC HIS C 690 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 773 33 4 9JKC MET D 1 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'initiating methionine' 84 34 4 9JKC GLY D 681 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 764 35 4 9JKC SER D 682 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 765 36 4 9JKC SER D 683 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 766 37 4 9JKC SER D 684 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 767 38 4 9JKC HIS D 685 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 768 39 4 9JKC HIS D 686 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 769 40 4 9JKC HIS D 687 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 770 41 4 9JKC HIS D 688 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 771 42 4 9JKC HIS D 689 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 772 43 4 9JKC HIS D 690 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 773 44 5 9JKC MET E 1 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'initiating methionine' 84 45 5 9JKC GLY E 681 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 764 46 5 9JKC SER E 682 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 765 47 5 9JKC SER E 683 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 766 48 5 9JKC SER E 684 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 767 49 5 9JKC HIS E 685 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 768 50 5 9JKC HIS E 686 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 769 51 5 9JKC HIS E 687 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 770 52 5 9JKC HIS E 688 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 771 53 5 9JKC HIS E 689 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 772 54 5 9JKC HIS E 690 ? UNP A0A0H5BRR0 ? ? 'expression tag' 773 55 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_defined_assembly ? monomeric 1 2 author_defined_assembly ? monomeric 1 3 author_defined_assembly ? monomeric 1 4 author_defined_assembly ? monomeric 1 5 author_defined_assembly ? monomeric 1 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,F 2 1 B,G 3 1 C,H 4 1 D,I 5 1 E,J # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ;Cryo-electron microscopy data indicate that this protein forms a decamer (dimer of pentamer arranged in back-to-back fashion) in solution ; # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ALA A 14 ? 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