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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.629 ? 42241 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 27.172 ? 9100 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.039 ? 4965 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 3477 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9JM0 _struct.title 'retron Ec86-effector fiber' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9JM0 _struct_keywords.text 'Reverse transcriptase, RNA BINDING PROTEIN/DNA/RNA, RNA BINDING PROTEIN-DNA-RNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'RNA BINDING PROTEIN/DNA/RNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 1 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 2 ? K N N 1 ? L N N 2 ? M N N 3 ? N N N 4 ? O N N 5 ? P N N 1 ? Q N N 3 ? R N N 4 ? S N N 5 ? T N N 2 ? 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P0DV88 1 ? 307 ? 1 307 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 9JM0 LEU A 321 ? UNP P23070 ? ? 'expression tag' 321 1 1 9JM0 GLU A 322 ? UNP P23070 ? ? 'expression tag' 322 2 1 9JM0 HIS A 323 ? UNP P23070 ? ? 'expression tag' 323 3 1 9JM0 HIS A 324 ? UNP P23070 ? ? 'expression tag' 324 4 1 9JM0 HIS A 325 ? UNP P23070 ? ? 'expression tag' 325 5 1 9JM0 HIS A 326 ? UNP P23070 ? ? 'expression tag' 326 6 1 9JM0 HIS A 327 ? UNP P23070 ? ? 'expression tag' 327 7 1 9JM0 HIS A 328 ? UNP P23070 ? ? 'expression tag' 328 8 1 9JM0 HIS A 329 ? UNP P23070 ? ? 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O2 doub N N 197 C C2 N3 sing N N 198 C N3 C4 doub N N 199 C C4 N4 sing N N 200 C C4 C5 sing N N 201 C N4 H41 sing N N 202 C N4 H42 sing N N 203 C C5 C6 doub N N 204 C C5 H5 sing N N 205 C C6 H6 sing N N 206 CYS N CA sing N N 207 CYS N H sing N N 208 CYS N H2 sing N N 209 CYS CA C sing N N 210 CYS CA CB sing N N 211 CYS CA HA sing N N 212 CYS C O doub N N 213 CYS C OXT sing N N 214 CYS CB SG sing N N 215 CYS CB HB2 sing N N 216 CYS CB HB3 sing N N 217 CYS SG HG sing N N 218 CYS OXT HXT sing N N 219 DA OP3 P sing N N 220 DA OP3 HOP3 sing N N 221 DA P OP1 doub N N 222 DA P OP2 sing N N 223 DA P "O5'" sing N N 224 DA OP2 HOP2 sing N N 225 DA "O5'" "C5'" sing N N 226 DA "C5'" "C4'" sing N N 227 DA "C5'" "H5'" sing N N 228 DA "C5'" "H5''" sing N N 229 DA "C4'" "O4'" sing N N 230 DA "C4'" "C3'" sing N N 231 DA "C4'" "H4'" sing N N 232 DA "O4'" "C1'" sing N N 233 DA "C3'" "O3'" sing N N 234 DA "C3'" "C2'" sing N N 235 DA "C3'" "H3'" sing N N 236 DA "O3'" "HO3'" sing N N 237 DA "C2'" "C1'" sing N N 238 DA "C2'" "H2'" sing N N 239 DA "C2'" "H2''" sing N N 240 DA "C1'" N9 sing N N 241 DA "C1'" "H1'" sing N N 242 DA N9 C8 sing Y N 243 DA N9 C4 sing Y N 244 DA C8 N7 doub Y N 245 DA C8 H8 sing N N 246 DA N7 C5 sing Y N 247 DA C5 C6 sing Y N 248 DA C5 C4 doub Y N 249 DA C6 N6 sing N N 250 DA C6 N1 doub Y N 251 DA N6 H61 sing N N 252 DA N6 H62 sing N N 253 DA N1 C2 sing Y N 254 DA C2 N3 doub Y N 255 DA C2 H2 sing N N 256 DA N3 C4 sing Y N 257 DC OP3 P sing N N 258 DC OP3 HOP3 sing N N 259 DC P OP1 doub N N 260 DC P OP2 sing N N 261 DC P "O5'" sing N N 262 DC OP2 HOP2 sing N N 263 DC "O5'" "C5'" sing N N 264 DC "C5'" "C4'" sing N N 265 DC "C5'" "H5'" sing N N 266 DC "C5'" "H5''" sing N N 267 DC "C4'" "O4'" sing N N 268 DC "C4'" "C3'" sing N N 269 DC "C4'" "H4'" sing N N 270 DC "O4'" "C1'" sing N N 271 DC "C3'" "O3'" sing N N 272 DC "C3'" "C2'" sing N N 273 DC "C3'" "H3'" sing N N 274 DC "O3'" "HO3'" sing N N 275 DC "C2'" "C1'" sing N N 276 DC "C2'" "H2'" sing N N 277 DC "C2'" "H2''" sing N N 278 DC "C1'" N1 sing N N 279 DC "C1'" "H1'" sing N N 280 DC N1 C2 sing N N 281 DC N1 C6 sing N N 282 DC C2 O2 doub N N 283 DC C2 N3 sing N N 284 DC N3 C4 doub N N 285 DC C4 N4 sing N N 286 DC C4 C5 sing N N 287 DC N4 H41 sing N N 288 DC N4 H42 sing N N 289 DC C5 C6 doub N N 290 DC C5 H5 sing N N 291 DC C6 H6 sing N N 292 DG OP3 P sing N N 293 DG OP3 HOP3 sing N N 294 DG P OP1 doub N N 295 DG P OP2 sing N N 296 DG P "O5'" sing N N 297 DG OP2 HOP2 sing N N 298 DG "O5'" "C5'" sing N N 299 DG "C5'" "C4'" sing N N 300 DG "C5'" "H5'" sing N N 301 DG "C5'" "H5''" sing N N 302 DG "C4'" "O4'" sing N N 303 DG "C4'" "C3'" sing N N 304 DG "C4'" "H4'" sing N N 305 DG "O4'" "C1'" sing N N 306 DG "C3'" "O3'" sing N N 307 DG "C3'" "C2'" sing N N 308 DG "C3'" "H3'" sing N N 309 DG "O3'" "HO3'" sing N N 310 DG "C2'" "C1'" sing N N 311 DG "C2'" "H2'" sing N N 312 DG "C2'" "H2''" sing N N 313 DG "C1'" N9 sing N N 314 DG "C1'" "H1'" sing N N 315 DG N9 C8 sing Y N 316 DG N9 C4 sing Y N 317 DG C8 N7 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358 DT N3 C4 sing N N 359 DT N3 H3 sing N N 360 DT C4 O4 doub N N 361 DT C4 C5 sing N N 362 DT C5 C7 sing N N 363 DT C5 C6 doub N N 364 DT C7 H71 sing N N 365 DT C7 H72 sing N N 366 DT C7 H73 sing N N 367 DT C6 H6 sing N N 368 G OP3 P sing N N 369 G OP3 HOP3 sing N N 370 G P OP1 doub N N 371 G P OP2 sing N N 372 G P "O5'" sing N N 373 G OP2 HOP2 sing N N 374 G "O5'" "C5'" sing N N 375 G "C5'" "C4'" sing N N 376 G "C5'" "H5'" sing N N 377 G "C5'" "H5''" sing N N 378 G "C4'" "O4'" sing N N 379 G "C4'" "C3'" sing N N 380 G "C4'" "H4'" sing N N 381 G "O4'" "C1'" sing N N 382 G "C3'" "O3'" sing N N 383 G "C3'" "C2'" sing N N 384 G "C3'" "H3'" sing N N 385 G "O3'" "HO3'" sing N N 386 G "C2'" "O2'" sing N N 387 G "C2'" "C1'" sing N N 388 G "C2'" "H2'" sing N N 389 G "O2'" "HO2'" sing N N 390 G "C1'" N9 sing N N 391 G "C1'" "H1'" sing N N 392 G N9 C8 sing Y N 393 G N9 C4 sing Y N 394 G C8 N7 doub Y N 395 G C8 H8 sing N N 396 G N7 C5 sing Y N 397 G C5 C6 sing N N 398 G C5 C4 doub Y N 399 G C6 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OE2 HE2 sing N N 444 GLU OXT HXT sing N N 445 GLY N CA sing N N 446 GLY N H sing N N 447 GLY N H2 sing N N 448 GLY CA C sing N N 449 GLY CA HA2 sing N N 450 GLY CA HA3 sing N N 451 GLY C O doub N N 452 GLY C OXT sing N N 453 GLY OXT HXT sing N N 454 HIS N CA sing N N 455 HIS N H sing N N 456 HIS N H2 sing N N 457 HIS CA C sing N N 458 HIS CA CB sing N N 459 HIS CA HA sing N N 460 HIS C O doub N N 461 HIS C OXT sing N N 462 HIS CB CG sing N N 463 HIS CB HB2 sing N N 464 HIS CB HB3 sing N N 465 HIS CG ND1 sing Y N 466 HIS CG CD2 doub Y N 467 HIS ND1 CE1 doub Y N 468 HIS ND1 HD1 sing N N 469 HIS CD2 NE2 sing Y N 470 HIS CD2 HD2 sing N N 471 HIS CE1 NE2 sing Y N 472 HIS CE1 HE1 sing N N 473 HIS NE2 HE2 sing N N 474 HIS OXT HXT sing N N 475 ILE N CA sing N N 476 ILE N H sing N N 477 ILE N H2 sing N N 478 ILE CA C sing N N 479 ILE CA CB sing N N 480 ILE CA HA sing N N 481 ILE C O doub N N 482 ILE C OXT sing N N 483 ILE CB CG1 sing N N 484 ILE CB CG2 sing N N 485 ILE CB HB sing N N 486 ILE CG1 CD1 sing N N 487 ILE CG1 HG12 sing N N 488 ILE CG1 HG13 sing N N 489 ILE CG2 HG21 sing N N 490 ILE CG2 HG22 sing N N 491 ILE CG2 HG23 sing N N 492 ILE CD1 HD11 sing N N 493 ILE CD1 HD12 sing N N 494 ILE CD1 HD13 sing N N 495 ILE OXT HXT sing N N 496 LEU N CA sing N N 497 LEU N H sing N N 498 LEU N H2 sing N N 499 LEU CA C sing N N 500 LEU CA CB sing N N 501 LEU CA HA sing N N 502 LEU C O doub N N 503 LEU C OXT sing N N 504 LEU CB CG sing N N 505 LEU CB HB2 sing N N 506 LEU CB HB3 sing N N 507 LEU CG CD1 sing N N 508 LEU CG CD2 sing N N 509 LEU CG HG sing N N 510 LEU CD1 HD11 sing N N 511 LEU CD1 HD12 sing N N 512 LEU CD1 HD13 sing N N 513 LEU CD2 HD21 sing N N 514 LEU CD2 HD22 sing N N 515 LEU CD2 HD23 sing N N 516 LEU OXT HXT sing N N 517 LYS N CA sing N N 518 LYS N H sing N N 519 LYS N H2 sing N N 520 LYS CA C sing N N 521 LYS CA CB sing N N 522 LYS CA HA sing N N 523 LYS C O doub N N 524 LYS C OXT sing N N 525 LYS CB CG sing N N 526 LYS CB HB2 sing N N 527 LYS CB HB3 sing N N 528 LYS CG CD sing N N 529 LYS CG HG2 sing N N 530 LYS CG HG3 sing N N 531 LYS CD CE sing N N 532 LYS CD HD2 sing N N 533 LYS CD HD3 sing N N 534 LYS CE NZ sing N N 535 LYS CE HE2 sing N N 536 LYS CE HE3 sing N N 537 LYS NZ HZ1 sing N N 538 LYS NZ HZ2 sing N N 539 LYS NZ HZ3 sing N N 540 LYS OXT HXT sing N N 541 MET N CA sing N N 542 MET N H sing N N 543 MET N H2 sing N N 544 MET CA C sing N N 545 MET CA CB sing N N 546 MET CA HA sing N N 547 MET C O doub N N 548 MET C OXT sing N N 549 MET CB CG sing N N 550 MET CB HB2 sing N N 551 MET CB HB3 sing N N 552 MET CG SD sing N N 553 MET CG HG2 sing N N 554 MET CG HG3 sing N N 555 MET SD CE sing N N 556 MET CE HE1 sing N N 557 MET CE HE2 sing N N 558 MET CE HE3 sing N N 559 MET OXT HXT sing N N 560 NCA N1 C2 doub Y N 561 NCA N1 C6 sing Y N 562 NCA C2 C3 sing Y N 563 NCA C2 H2 sing N N 564 NCA C3 C4 doub Y N 565 NCA C3 C7 sing N N 566 NCA C4 C5 sing Y N 567 NCA C4 H4 sing N N 568 NCA C5 C6 doub Y N 569 NCA C5 H5 sing N N 570 NCA C6 H6 sing N N 571 NCA C7 O7 doub N N 572 NCA C7 N7 sing N N 573 NCA N7 HN71 sing N N 574 NCA N7 HN72 sing N N 575 PHE N CA sing N N 576 PHE N H sing N N 577 PHE N H2 sing N N 578 PHE CA C sing N N 579 PHE CA CB sing N N 580 PHE CA HA sing N N 581 PHE C O doub N N 582 PHE C OXT sing N N 583 PHE CB CG sing N N 584 PHE CB HB2 sing N N 585 PHE CB HB3 sing N N 586 PHE CG CD1 doub Y N 587 PHE CG CD2 sing Y N 588 PHE CD1 CE1 sing Y N 589 PHE CD1 HD1 sing N N 590 PHE CD2 CE2 doub Y N 591 PHE CD2 HD2 sing N N 592 PHE CE1 CZ doub Y N 593 PHE CE1 HE1 sing N N 594 PHE CE2 CZ sing Y N 595 PHE CE2 HE2 sing N N 596 PHE CZ HZ sing N N 597 PHE OXT HXT sing N N 598 PRO N CA sing N N 599 PRO N CD sing N N 600 PRO N H sing N N 601 PRO CA C sing N N 602 PRO CA CB sing N N 603 PRO CA HA sing N N 604 PRO C O doub N N 605 PRO C OXT sing N N 606 PRO CB CG sing N N 607 PRO CB HB2 sing N N 608 PRO CB HB3 sing N N 609 PRO CG CD sing N N 610 PRO CG HG2 sing N N 611 PRO CG HG3 sing N N 612 PRO CD HD2 sing N N 613 PRO CD HD3 sing N N 614 PRO OXT HXT sing N N 615 SER N CA sing N N 616 SER N H sing N N 617 SER N H2 sing N N 618 SER CA C sing N N 619 SER CA CB sing N N 620 SER CA HA sing N N 621 SER C O doub N N 622 SER C OXT sing N N 623 SER CB OG sing N N 624 SER CB HB2 sing N N 625 SER CB HB3 sing N N 626 SER OG HG sing N N 627 SER OXT HXT sing N N 628 THR N CA sing N N 629 THR N H sing N N 630 THR N H2 sing N N 631 THR CA C sing N N 632 THR CA CB sing N N 633 THR CA HA sing N N 634 THR C O doub N N 635 THR C OXT sing N N 636 THR CB OG1 sing N N 637 THR CB CG2 sing N N 638 THR CB HB sing N N 639 THR OG1 HG1 sing N N 640 THR CG2 HG21 sing N N 641 THR CG2 HG22 sing N N 642 THR CG2 HG23 sing N N 643 THR OXT HXT sing N N 644 TRP N CA sing N N 645 TRP N H sing N N 646 TRP N H2 sing N N 647 TRP CA C sing N N 648 TRP CA CB sing N N 649 TRP CA HA sing N N 650 TRP C O doub N N 651 TRP C OXT sing N N 652 TRP CB CG sing N N 653 TRP CB HB2 sing N N 654 TRP CB HB3 sing N N 655 TRP CG CD1 doub Y N 656 TRP CG CD2 sing Y 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