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F ARG 399 NH1 36 1 Y 1 F ARG 400 ? NH2 ? F ARG 399 NH2 37 1 Y 1 G ARG 400 ? CG ? G ARG 399 CG 38 1 Y 1 G ARG 400 ? CD ? G ARG 399 CD 39 1 Y 1 G ARG 400 ? NE ? G ARG 399 NE 40 1 Y 1 G ARG 400 ? CZ ? G ARG 399 CZ 41 1 Y 1 G ARG 400 ? NH1 ? G ARG 399 NH1 42 1 Y 1 G ARG 400 ? NH2 ? G ARG 399 NH2 43 1 Y 1 H ARG 400 ? CG ? H ARG 399 CG 44 1 Y 1 H ARG 400 ? CD ? H ARG 399 CD 45 1 Y 1 H ARG 400 ? NE ? H ARG 399 NE 46 1 Y 1 H ARG 400 ? CZ ? H ARG 399 CZ 47 1 Y 1 H ARG 400 ? NH1 ? H ARG 399 NH1 48 1 Y 1 H ARG 400 ? NH2 ? H ARG 399 NH2 49 1 Y 1 I ARG 400 ? CG ? I ARG 399 CG 50 1 Y 1 I ARG 400 ? CD ? I ARG 399 CD 51 1 Y 1 I ARG 400 ? NE ? I ARG 399 NE 52 1 Y 1 I ARG 400 ? CZ ? I ARG 399 CZ 53 1 Y 1 I ARG 400 ? NH1 ? I ARG 399 NH1 54 1 Y 1 I ARG 400 ? NH2 ? I ARG 399 NH2 55 1 Y 1 J ARG 400 ? CG ? J ARG 399 CG 56 1 Y 1 J ARG 400 ? CD ? J ARG 399 CD 57 1 Y 1 J ARG 400 ? NE ? J ARG 399 NE 58 1 Y 1 J ARG 400 ? CZ ? J ARG 399 CZ 59 1 Y 1 J ARG 400 ? NH1 ? J ARG 399 NH1 60 1 Y 1 J ARG 400 ? NH2 ? J ARG 399 NH2 61 1 Y 1 K ARG 400 ? CG ? K ARG 399 CG 62 1 Y 1 K ARG 400 ? CD ? K ARG 399 CD 63 1 Y 1 K ARG 400 ? NE ? K ARG 399 NE 64 1 Y 1 K ARG 400 ? CZ ? K ARG 399 CZ 65 1 Y 1 K ARG 400 ? NH1 ? K ARG 399 NH1 66 1 Y 1 K ARG 400 ? NH2 ? K ARG 399 NH2 67 1 Y 1 L ARG 400 ? CG ? L ARG 399 CG 68 1 Y 1 L ARG 400 ? CD ? L ARG 399 CD 69 1 Y 1 L ARG 400 ? NE ? L ARG 399 NE 70 1 Y 1 L ARG 400 ? CZ ? L ARG 399 CZ 71 1 Y 1 L ARG 400 ? NH1 ? L ARG 399 NH1 72 1 Y 1 L ARG 400 ? NH2 ? L ARG 399 NH2 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 9KBI _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 9KBI _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9KBI _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean ? _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details ? _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 9KBI _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? 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_refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.002 ? 29001 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.436 ? 39663 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 9.599 ? 3880 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.039 ? 4512 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 4791 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9KBI _struct.title 'The structure of B19V NS1_2-570/dsDNA/AMPPNP' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9KBI _struct_keywords.text 'Human parvovirus B19, NS1, DNA BINDING PROTEIN/DNA, DNA BINDING PROTEIN-DNA COMPLEX' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN/DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 1 ? L N N 1 ? M N N 2 ? N N N 3 ? O N N 4 ? P N N 5 ? Q N N 4 ? R N N 4 ? S N N 4 ? T N N 5 ? U N N 4 ? V N N 4 ? W N N 5 ? X N N 4 ? Y N N 5 ? Z N N 4 ? AA N N 5 ? BA N N 4 ? CA N N 5 ? DA N N 4 ? EA N N 5 ? FA N N 4 ? GA N N 4 ? HA N N 5 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP I7BP20_PAVHB I7BP20 ? 1 ;ELFRGVLQVSSNVLDCANDNWWCSLLDLDTSDWEPLTHTNRLMAIYLSSVASKLDFTGGPLAGCLYFFQVECNKFEEGYH IHVVIGGPGLNPRNLTVCVEGLFNNVLYHLVTGNVKLKFLPGMTTKGKYFRDGEQFIENYLMKKIPLNVVWCVTNIDGYI DTCISATFRRGACHAKKPRMTTAINDTSSDAGEPSGTGAEVVPFNGKGTKASIKFQTMVNWLCENRVFTEDKWKLVDFNQ YTLLSSSHSGSFQIQSALKLAIYKATNLVPTSTFLLHADFEQVMCIKDNKIVKLLLCQNYDPLLVGQHVLKWIDKKCGKK NTLWFYGPPSTGKTNLAMAIAKSVPVYGMVNWNNENFPFNDVAGKSLVVWDEGIIKSTIVEAAKAILGGQPTRVDQKMRG SVAVPGVPVVITSNGDITFVVSGNTTTTVHAKALKERMVKLNFTVRCSPDMGLLTEADVQQWLTWCNAQSWDHYENWAIN YTFDFPGINADALHPDLQTTPIVTDTSISSSGGESSEELSESSFFNLITPGACNTETPRSSTPIPGTSSGESLVGSPVSS EVVAASWEE ; 2 2 PDB 9KBI 9KBI ? 2 ? 1 3 PDB 9KBI 9KBI ? 3 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9KBI A 1 ? 569 ? 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