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'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 3 oligosaccharide 4 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 3 'DGlcpNAcb1-2DManpa1-6DManpb1-4DGlcpNAcb1-4[LFucpa1-6]DGlcpNAcb1-' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 3 'WURCS=2.0/4,6,5/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5][a1221m-1a_1-5]/1-1-2-3-1-4/a4-b1_a6-f1_b4-c1_c6-d1_d2-e1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 3 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(6+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}}[(6+1)][a-L-Fucp]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 4 DGlcpNAcb1-2DManpa1-6DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 4 'WURCS=2.0/3,5,4/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-1/a4-b1_b4-c1_c6-d1_d2-e1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 4 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(6+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}}}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 3 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 3 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 3 3 4 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 4 3 5 NAG C1 O1 4 MAN O2 HO2 sing ? 5 3 6 FUC C1 O1 1 NAG O6 HO6 sing ? 6 4 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 7 4 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 8 4 4 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 9 4 5 NAG C1 O1 4 MAN O2 HO2 sing ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 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G MAN 4 G NAG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG F . ? 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None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLN 13 A . ? GLN 28 A PRO 14 A ? PRO 29 A 1 3.24 2 TYR 158 B . ? TYR 373 B PRO 159 B ? PRO 374 B 1 2.31 3 TYR 158 C . ? TYR 373 C PRO 159 C ? PRO 374 C 1 0.28 4 TYR 158 D . ? TYR 373 D PRO 159 D ? PRO 374 D 1 2.77 5 TYR 158 E . ? TYR 373 E PRO 159 E ? PRO 374 E 1 1.12 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 3 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 4 ? AD3 ? 4 ? AD4 ? 4 ? AD5 ? 4 ? AD6 ? 4 ? AD7 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ILE A 9 ? 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VAL A 181 ILE A 183 AA8 1 VAL A 178 ? ALA A 181 ? VAL A 193 ALA A 196 AA8 2 VAL A 192 ? GLU A 197 ? VAL A 207 GLU A 212 AA8 3 ASN A 229 ? ILE A 232 ? ASN A 244 ILE A 247 AA9 1 ARG A 210 ? PHE A 214 ? ARG A 225 PHE A 229 AA9 2 PHE A 242 ? ALA A 248 ? PHE A 257 ALA A 263 AA9 3 ILE A 255 ? ASP A 257 ? ILE A 270 ASP A 272 AB1 1 ARG A 210 ? PHE A 214 ? ARG A 225 PHE A 229 AB1 2 PHE A 242 ? ALA A 248 ? PHE A 257 ALA A 263 AB1 3 SER A 261 ? TRP A 262 ? SER A 276 TRP A 277 AB2 1 SER B 24 ? PHE B 28 ? SER B 239 PHE B 243 AB2 2 GLU B 43 ? VAL B 49 ? GLU B 258 VAL B 264 AB2 3 VAL B 88 ? THR B 92 ? VAL B 303 THR B 307 AB2 4 LYS B 73 ? THR B 74 ? LYS B 288 THR B 289 AB3 1 LYS B 59 ? TYR B 63 ? LYS B 274 TYR B 278 AB3 2 TYR B 104 ? SER B 109 ? TYR B 319 SER B 324 AB3 3 ILE B 117 ? ILE B 121 ? ILE B 332 ILE B 336 AB4 1 GLU B 78 ? GLU B 79 ? GLU B 293 GLU B 294 AB4 2 TYR B 85 ? ARG B 86 ? TYR B 300 ARG B 301 AB5 1 GLN B 132 ? LEU B 136 ? GLN B 347 LEU B 351 AB5 2 GLN B 147 ? PHE B 157 ? GLN B 362 PHE B 372 AB5 3 PHE B 189 ? ASP B 198 ? PHE B 404 ASP B 413 AB5 4 TYR B 176 ? THR B 178 ? TYR B 391 THR B 393 AB6 1 GLN B 132 ? LEU B 136 ? GLN B 347 LEU B 351 AB6 2 GLN B 147 ? PHE B 157 ? GLN B 362 PHE B 372 AB6 3 PHE B 189 ? ASP B 198 ? PHE B 404 ASP B 413 AB6 4 VAL B 182 ? LEU B 183 ? VAL B 397 LEU B 398 AB7 1 PRO B 172 ? GLU B 173 ? PRO B 387 GLU B 388 AB7 2 ILE B 162 ? GLU B 167 ? ILE B 377 GLU B 382 AB7 3 SER B 209 ? HIS B 214 ? SER B 424 HIS B 429 AB7 4 THR B 222 ? LYS B 224 ? THR B 437 LYS B 439 AB8 1 SER C 24 ? PHE C 28 ? SER C 239 PHE C 243 AB8 2 GLU C 43 ? VAL C 51 ? GLU C 258 VAL C 266 AB8 3 TYR C 85 ? THR C 92 ? TYR C 300 THR C 307 AB8 4 LYS C 73 ? THR C 74 ? LYS C 288 THR C 289 AB9 1 SER C 24 ? PHE C 28 ? SER C 239 PHE C 243 AB9 2 GLU C 43 ? VAL C 51 ? GLU C 258 VAL C 266 AB9 3 TYR C 85 ? THR C 92 ? TYR C 300 THR C 307 AB9 4 GLU C 78 ? GLU C 79 ? GLU C 293 GLU C 294 AC1 1 VAL C 67 ? VAL C 69 ? VAL C 282 VAL C 284 AC1 2 LYS C 59 ? VAL C 64 ? LYS C 274 VAL C 279 AC1 3 TYR C 104 ? SER C 109 ? TYR C 319 SER C 324 AC1 4 ILE C 117 ? ILE C 121 ? ILE C 332 ILE C 336 AC2 1 GLN C 132 ? LEU C 136 ? GLN C 347 LEU C 351 AC2 2 GLN C 147 ? PHE C 157 ? GLN C 362 PHE C 372 AC2 3 PHE C 189 ? ASP C 198 ? PHE C 404 ASP C 413 AC2 4 TYR C 176 ? THR C 178 ? TYR C 391 THR C 393 AC3 1 GLN C 132 ? LEU C 136 ? GLN C 347 LEU C 351 AC3 2 GLN C 147 ? PHE C 157 ? GLN C 362 PHE C 372 AC3 3 PHE C 189 ? ASP C 198 ? PHE C 404 ASP C 413 AC3 4 VAL C 182 ? LEU C 183 ? VAL C 397 LEU C 398 AC4 1 GLN C 171 ? GLU C 173 ? GLN C 386 GLU C 388 AC4 2 ILE C 162 ? SER C 168 ? ILE C 377 SER C 383 AC4 3 PHE C 208 ? HIS C 214 ? PHE C 423 HIS C 429 AC4 4 THR C 222 ? LEU C 226 ? THR C 437 LEU C 441 AC5 1 SER D 24 ? PHE D 28 ? SER D 239 PHE D 243 AC5 2 GLU D 43 ? VAL D 51 ? GLU D 258 VAL D 266 AC5 3 TYR D 85 ? THR D 92 ? TYR D 300 THR D 307 AC5 4 LYS D 73 ? THR D 74 ? LYS D 288 THR D 289 AC6 1 SER D 24 ? PHE D 28 ? SER D 239 PHE D 243 AC6 2 GLU D 43 ? VAL D 51 ? 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THR E 437 LEU E 441 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N PHE A 11 ? 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