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EMDB EMD-70598 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2025-08-06 ? 2 'Structure model' 1 1 2025-10-08 ? # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Data collection' 2 2 'Structure model' 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' citation 2 2 'Structure model' citation_author 3 2 'Structure model' em_admin # _pdbx_audit_revision_item.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal 2 _pdbx_audit_revision_item.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_item.item '_em_admin.last_update' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9OLO _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2025-05-12 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type PDB . 9OJ2 unspecified PDB . 9OJJ unspecified PDB . 9OJR unspecified PDB . 9OJU unspecified PDB . 9OJZ unspecified PDB . 9OK3 unspecified PDB . 9OK5 unspecified PDB . 9OKC unspecified PDB . 9OLJ unspecified EMDB '22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 19' EMD-70598 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email brunger@stanford.edu _pdbx_contact_author.name_first Axel _pdbx_contact_author.name_last Brunger _pdbx_contact_author.name_mi T _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0001-5121-2036 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'White, K.I.' 1 0000-0001-8182-3655 'Brunger, A.T.' 2 0000-0001-5121-2036 # loop_ _citation.abstract _citation.abstract_id_CAS _citation.book_id_ISBN _citation.book_publisher _citation.book_publisher_city _citation.book_title _citation.coordinate_linkage _citation.country _citation.database_id_Medline _citation.details _citation.id _citation.journal_abbrev _citation.journal_id_ASTM _citation.journal_id_CSD _citation.journal_id_ISSN _citation.journal_full _citation.journal_issue _citation.journal_volume _citation.language _citation.page_first _citation.page_last _citation.title _citation.year _citation.database_id_CSD _citation.pdbx_database_id_DOI _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_patent _citation.unpublished_flag ? ? ? ? ? ? ? UK ? ? primary 'Nat Commun' ? ? 2041-1723 ? ? 16 ? 8371 8371 'Structural remodeling of target-SNARE protein complexes by NSF enables synaptic transmission.' 2025 ? 10.1038/s41467-025-62764-0 40993127 ? ? ? ? ? ? ? ? ? US ? ? 1 Biorxiv ? ? 2692-8205 ? ? ? ? ? ? 'Pre-fusion AAA+ remodeling of target-SNARE protein complexes enables synaptic transmission.' 2024 ? 10.1101/2024.10.11.617886 39416070 ? ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'White, K.I.' 1 0000-0001-8182-3655 primary 'Khan, Y.A.' 2 0000-0003-0201-2796 primary 'Qiu, K.' 3 ? primary 'Balaji, A.' 4 0000-0002-0075-4203 primary 'Couoh-Cardel, S.' 5 0000-0002-5186-4648 primary 'Esquivies, L.' 6 ? primary 'Pfuetzner, R.A.' 7 ? primary 'Diao, J.' 8 0000-0003-4288-3203 primary 'Brunger, A.T.' 9 0000-0001-5121-2036 1 'White, K.I.' 10 0000-0001-8182-3655 1 'Khan, Y.A.' 11 0000-0003-0201-2796 1 'Qiu, K.' 12 ? 1 'Balaji, A.' 13 ? 1 'Couoh-Cardel, S.' 14 ? 1 'Esquivies, L.' 15 ? 1 'Pfuetzner, R.A.' 16 ? 1 'Diao, J.' 17 0000-0003-4288-3203 1 'Brunger, A.T.' 18 0000-0001-5121-2036 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules 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_entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;GANMAGRSMQAARCPTDELSLSNCAVVSEKDYQSGQHVIVRTSPNHKYIFTLRTHPSVVPGSVAFSLPQRKWAGLSIGQE IEVALYSFDKAKQCIGTMTIEIDFLQKKNIDSNPYDTDKMAAEFIQQFNNQAFSVGQQLVFSFNDKLFGLLVKDIEAMDP SILKGEPASGKRQKIEVGLVVGNSQVAFEKAENSSLNLIGKAKTKENRQSIINPDWNFEKMGIGGLDKEFSDIFRRAFAS RVFPPEIVEQMGCKHVKGILLYGPPGCGKTLLARQIGKMLNAREPKVVNGPEILNKYVGESEANIRKLFADAEEEQRRLG ANSGLHIIIFDEIDAICKQRGSMAGSTGVHDTVVNQLLSKIDGVEQLNNILVIGMTNRPDLIDEALLRPGRLEVKMEIGL PDEKGRLQILHIHTARMRGHQLLSADVDIKELAVETKNFSGAELEGLVRAAQSTAMNRHIKASTKVEVDMEKAESLQVTR GDFLASLENDIKPAFGTNQEDYASYIMNGIIKWGDPVTRVLDDGELLVQQTKNSDRTPLVSVLLEGPPHSGKTALAAKIA EESNFPFIKICSPDKMIGFSETAKCQAMKKIFDDAYKSQLSCVVVDDIERLLDYVPIGPRFSNLVLQALLVLLKKAPPQG RKLLIIGTTSRKDVLQEMEMLNAFSTTIHVPNIATGEQLLEALELLGNFKDKERTTIAQQVKGKKVWIGIKKLLMLIEMS 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TSEELEDMLESGNPAIFASGIIMDSSISKQALSEIETRHSEIIKLENSIRELHDMFMDMAMLVESQGEMIDRIEYNVEHA VDYVERAVSDTKKAVKYQSKARRKKIM ; ;MKDRTQELRTAKDSDDDDDVTVTVDRDRFMDEFFEQVEEIRGFIDKIAENVEEVKRKHSAILASPNPDEKTKEELEELMS DIKKTANKVRSKLKSIEQSIEQEEGLNRSSADLRIRKTQHSTLSRKFVEVMSEYNATQSDYRERCKGRIQRQLEITGRTT TSEELEDMLESGNPAIFASGIIMDSSISKQALSEIETRHSEIIKLENSIRELHDMFMDMAMLVESQGEMIDRIEYNVEHA VDYVERAVSDTKKAVKYQSKARRKKIM ; G,H ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MGSSHHHHHHSQDPNSMAEDADMRNELEEMQRRADQLADESLESTRRMLQLVEESKDAGIRTLVMLDEQGEQLERIEEGM DQINKDMKEAEKNLTDLGKFAGLAVAPANKLKSSDAYKKAWGNNQDGVVASQPARVVDEREQMAISGGFIRRVTNDAREN EMDENLEQVSGIIGNLRHMALDMGNEIDTQNRQIDRIMEKADSNKTRIDEANQRATKMLGSG ; ;MGSSHHHHHHSQDPNSMAEDADMRNELEEMQRRADQLADESLESTRRMLQLVEESKDAGIRTLVMLDEQGEQLERIEEGM DQINKDMKEAEKNLTDLGKFAGLAVAPANKLKSSDAYKKAWGNNQDGVVASQPARVVDEREQMAISGGFIRRVTNDAREN EMDENLEQVSGIIGNLRHMALDMGNEIDTQNRQIDRIMEKADSNKTRIDEANQRATKMLGSG ; I,J ? 4 'polypeptide(L)' no no ;GMDTSGKQAEAMALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKH 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n 1 189 GLU n 1 190 LYS n 1 191 ALA n 1 192 GLU n 1 193 ASN n 1 194 SER n 1 195 SER n 1 196 LEU n 1 197 ASN n 1 198 LEU n 1 199 ILE n 1 200 GLY n 1 201 LYS n 1 202 ALA n 1 203 LYS n 1 204 THR n 1 205 LYS n 1 206 GLU n 1 207 ASN n 1 208 ARG n 1 209 GLN n 1 210 SER n 1 211 ILE n 1 212 ILE n 1 213 ASN n 1 214 PRO n 1 215 ASP n 1 216 TRP n 1 217 ASN n 1 218 PHE n 1 219 GLU n 1 220 LYS n 1 221 MET n 1 222 GLY n 1 223 ILE n 1 224 GLY n 1 225 GLY n 1 226 LEU n 1 227 ASP n 1 228 LYS n 1 229 GLU n 1 230 PHE n 1 231 SER n 1 232 ASP n 1 233 ILE n 1 234 PHE n 1 235 ARG n 1 236 ARG n 1 237 ALA n 1 238 PHE n 1 239 ALA n 1 240 SER n 1 241 ARG n 1 242 VAL n 1 243 PHE n 1 244 PRO n 1 245 PRO n 1 246 GLU n 1 247 ILE n 1 248 VAL n 1 249 GLU n 1 250 GLN n 1 251 MET n 1 252 GLY n 1 253 CYS n 1 254 LYS n 1 255 HIS n 1 256 VAL n 1 257 LYS n 1 258 GLY n 1 259 ILE n 1 260 LEU n 1 261 LEU n 1 262 TYR n 1 263 GLY n 1 264 PRO n 1 265 PRO n 1 266 GLY n 1 267 CYS n 1 268 GLY n 1 269 LYS n 1 270 THR n 1 271 LEU n 1 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P54921 1 ? 295 ? 1 295 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 9OLO GLY A 1 ? UNP P18708 ? ? 'expression tag' -2 1 1 9OLO ALA A 2 ? UNP P18708 ? ? 'expression tag' -1 2 1 9OLO ASN A 3 ? UNP P18708 ? ? 'expression tag' 0 3 2 9OLO GLY B 1 ? UNP P18708 ? ? 'expression tag' -2 4 2 9OLO ALA B 2 ? UNP P18708 ? ? 'expression tag' -1 5 2 9OLO ASN B 3 ? UNP P18708 ? ? 'expression tag' 0 6 3 9OLO GLY C 1 ? UNP P18708 ? ? 'expression tag' -2 7 3 9OLO ALA C 2 ? UNP P18708 ? ? 'expression tag' -1 8 3 9OLO ASN C 3 ? UNP P18708 ? ? 'expression tag' 0 9 4 9OLO GLY D 1 ? UNP P18708 ? ? 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'expression tag' -8 46 10 9OLO HIS J 9 ? UNP P60881 ? ? 'expression tag' -7 47 10 9OLO HIS J 10 ? UNP P60881 ? ? 'expression tag' -6 48 10 9OLO SER J 11 ? UNP P60881 ? ? 'expression tag' -5 49 10 9OLO GLN J 12 ? UNP P60881 ? ? 'expression tag' -4 50 10 9OLO ASP J 13 ? UNP P60881 ? ? 'expression tag' -3 51 10 9OLO PRO J 14 ? UNP P60881 ? ? 'expression tag' -2 52 10 9OLO ASN J 15 ? UNP P60881 ? ? 'expression tag' -1 53 10 9OLO SER J 16 ? UNP P60881 ? ? 'expression tag' 0 54 10 9OLO ALA J 101 ? UNP P60881 CYS 85 conflict 85 55 10 9OLO ALA J 104 ? UNP P60881 CYS 88 conflict 88 56 10 9OLO ALA J 106 ? UNP P60881 CYS 90 conflict 90 57 10 9OLO ALA J 108 ? UNP P60881 CYS 92 conflict 92 58 11 9OLO GLY K 1 ? UNP P54921 ? ? 'expression tag' 0 59 12 9OLO GLY L 1 ? UNP P54921 ? ? 'expression tag' 0 60 13 9OLO GLY M 1 ? UNP P54921 ? ? 'expression tag' 0 61 14 9OLO GLY N 1 ? UNP P54921 ? ? 'expression tag' 0 62 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetradecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 14 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'Homohexameric NSF' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 227 ? 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