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'polypeptide(L)' no no ;MRWYPWLRPDFEKLVASYQAGRGHHALLIQALPGMGDDALIYALSRYLLCQQPQGHKSCGHCRGCQLMQAGTHPDYYTLA PEKGKNTLGVDAVREVTEKLNEHARLGGAKVVWVTDAALLTDAAANALLKTLEEPPAETWFFLATREPERLLATLRSRCR LHYLAPPPEQYAVTWLSREVTMSQDALLAALRLSAGSPGAALALFQGDNWQARETLCQALAYSVPSGDWYSLLAALNHEQ APARLHWLATLLMDALKRHHGAAQVTNVDVPGLVAELANHLSPSRLQAILGDVCHIREQLMSVTGINRELLITDLLLRIE HYLQPGVVLPVPHL ; ;MRWYPWLRPDFEKLVASYQAGRGHHALLIQALPGMGDDALIYALSRYLLCQQPQGHKSCGHCRGCQLMQAGTHPDYYTLA PEKGKNTLGVDAVREVTEKLNEHARLGGAKVVWVTDAALLTDAAANALLKTLEEPPAETWFFLATREPERLLATLRSRCR LHYLAPPPEQYAVTWLSREVTMSQDALLAALRLSAGSPGAALALFQGDNWQARETLCQALAYSVPSGDWYSLLAALNHEQ APARLHWLATLLMDALKRHHGAAQVTNVDVPGLVAELANHLSPSRLQAILGDVCHIREQLMSVTGINRELLITDLLLRIE HYLQPGVVLPVPHL ; E ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MKFTVEREHLLKPLQQVSGPLGGRPTLPILGNLLLQVADGTLSLTGTDLEMEMVARVALVQPHEPGATTVPARKFFDICR GLPEGAEIAVQLEGERMLVRSGRSRFSLSTLPAADFPNLDDWQSEVEFTLPQATMKRLIEATQFSMAHQDVRYYLNGMLF ETEGEELRTVATDGHRLAVCSMPIGQSLPSHSVIVPRKGVIELMRMLDGGDNPLRVQIGSNNIRAHVGDFIFTSKLVDGR 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J . n J 7 2 THR 2 2 ? ? ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.540 ? 29156 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 14.437 ? 3265 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.052 ? 3359 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 3627 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 9OYM _struct.title ;Structure of the E. coli clamp loader DnaX-complex loading beta-clamp onto 10-nt gapped DNA in state 2 conformer 5 with fully closed clamp ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9OYM _struct_keywords.text ;DNA replication, DNA damage repair, clamp loading complex, clamp beta, clamp loader DnaX-complex, REPLICATION, REPLICATION-DNA complex ; _struct_keywords.pdbx_keywords REPLICATION/DNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 2 ? 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T N N 8 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP HOLA_ECOLI P28630 ? 1 ;MIRLYPEQLRAQLNEGLRAAYLLLGNDPLLLQESQDAVRQVAAAQGFEEHHTFSIDPNTDWNAIFSLCQAMSLFASRQTL LLLLPENGPNAAINEQLLTLTGLLHDDLLLIVRGNKLSKAQENAAWFTALANRSVQVTCQTPEQAQLPRWVAARAKQLNL ELDDAANQVLCYCYEGNLLALAQALERLSLLWPDGKLTLPRVEQAVNDAAHFTPFHWVDALLMGKSKRALHILQQLRLEG SEPVILLRTLQRELLLLVNLKRQSAHTPLRALFDKHRVWQNRRGMMGEALNRLSQTQLRQAVQLLTRTELTLKQDYGQSV WAELEGLSLLLCHKPLADVFIDG ; 1 2 UNP DPO3X_ECOLI P06710 ? 2 ;MSYQVLARKWRPQTFADVVGQEHVLTALANGLSLGRIHHAYLFSGTRGVGKTSIARLLAKGLNCETGITATPCGVCDNCR EIEQGRFVDLIEIDAASRTKVEDTRDLLDNVQYAPARGRFKVYLIDEVHMLSRHSFNALLKTLEEPPEHVKFLLATTDPQ KLPVTILSRCLQFHLKALDVEQIRHQLEHILNEEHIAHEPRALQLLARAAEGSLRDALSLTDQAIASGDGQVSTQAVSAM LGTLDDDQALSLVEAMVEANGERVMALINEAAARGIEWEALLVEMLGLLHRIAMVQLSPAALGNDMAAIELRMRELARTI PPTDIQLYYQTLLIGRKELPYAPDRRMGVEMTLLRALAFHPRMPLPEPEVPRQSFAPVAPTAVMTPTQVPPQPQSAPQQA PTVPLPETTSQVLAARQQLQRVQGATKAKKSEPAAATRARPVNNAALERLASVTDRVQARPVPSALEKAPAKKEAYRWKA TTPVMQQKEVVATPKALKKALEHEKTPELAAKLAAEAIERDPWAAQVSQLSLPKLVEQVALNAWKEESDNAVCLHLRSSQ RHLNNRGAQQKLAEALSMLKGSTVELTIVEDDNPAVRTPLEWRQAIYEEKLAQARESIIADNNIQTLRRFFDAELDEESI RPI ; 1 3 UNP HOLB_ECOLI P28631 ? 3 ;MRWYPWLRPDFEKLVASYQAGRGHHALLIQALPGMGDDALIYALSRYLLCQQPQGHKSCGHCRGCQLMQAGTHPDYYTLA PEKGKNTLGVDAVREVTEKLNEHARLGGAKVVWVTDAALLTDAAANALLKTLEEPPAETWFFLATREPERLLATLRSRCR LHYLAPPPEQYAVTWLSREVTMSQDALLAALRLSAGSPGAALALFQGDNWQARETLCQALAYSVPSGDWYSLLAALNHEQ APARLHWLATLLMDALKRHHGAAQVTNVDVPGLVAELANHLSPSRLQAILGDVCHIREQLMSVTGINRELLITDLLLRIE HYLQPGVVLPVPHL ; 1 4 UNP DPO3B_ECO57 P0A990 ? 4 ;MKFTVEREHLLKPLQQVSGPLGGRPTLPILGNLLLQVADGTLSLTGTDLEMEMVARVALVQPHEPGATTVPARKFFDICR GLPEGAEIAVQLEGERMLVRSGRSRFSLSTLPAADFPNLDDWQSEVEFTLPQATMKRLIEATQFSMAHQDVRYYLNGMLF ETEGEELRTVATDGHRLAVCSMPIGQSLPSHSVIVPRKGVIELMRMLDGGDNPLRVQIGSNNIRAHVGDFIFTSKLVDGR FPDYRRVLPKNPDKHLEAGCDLLKQAFARAAILSNEKFRGVRLYVSENQLKITANNPEQEEAEEILDVTYSGAEMEIGFN VSYVLDVLNALKCENVRMMLTDSVSSVQIEDAASQSAAYVVMPMRL ; 1 5 PDB 9OYM 9OYM ? 5 ? 1 6 PDB 9OYM 9OYM ? 6 ? 1 7 UNP HOLD_ECOLI P28632 ? 7 ;MTSRRDWQLQQLGITQWSLRRPGALQGEIAIAIPAHVRLVMVANDLPALTDPLVSDVLRALTVSPDQVLQLTPEKIAMLP QGSHCNSWRLGTDEPLSLEGAQVASPALTDLRANPTARAALWQQICTYEHDFFPRND ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9OYM A 1 ? 343 ? P28630 1 ? 343 ? 1 343 2 2 9OYM B 1 ? 643 ? P06710 1 ? 643 ? 1 643 3 2 9OYM C 1 ? 643 ? P06710 1 ? 643 ? 1 643 4 2 9OYM D 1 ? 643 ? P06710 1 ? 643 ? 1 643 5 3 9OYM E 1 ? 334 ? P28631 1 ? 334 ? 1 334 6 4 9OYM F 1 ? 366 ? P0A990 1 ? 366 ? 1 366 7 4 9OYM G 1 ? 366 ? P0A990 1 ? 366 ? 1 366 8 5 9OYM H 1 ? 50 ? 9OYM 1 ? 50 ? 1 50 9 6 9OYM I 1 ? 20 ? 9OYM 1 ? 20 ? 1 20 10 7 9OYM J 1 ? 137 ? P28632 1 ? 137 ? 1 137 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details decameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 10 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 TYR A 5 ? GLU A 7 ? TYR A 5 GLU A 7 5 ? 3 HELX_P HELX_P2 AA2 GLN A 8 ? GLU A 15 ? GLN A 8 GLU A 15 1 ? 8 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP A 27 ? GLN A 45 ? ASP A 27 GLN A 45 1 ? 19 HELX_P HELX_P4 AA4 ASP A 60 ? ALA A 70 ? ASP A 60 ALA A 70 1 ? 11 HELX_P HELX_P5 AA5 ASN A 90 ? GLY A 102 ? ASN A 90 GLY A 102 1 ? 13 HELX_P HELX_P6 AA6 ALA A 120 ? ASN A 123 ? ALA A 120 ASN A 123 5 ? 4 HELX_P HELX_P7 AA7 ALA A 124 ? LEU A 130 ? ALA A 124 LEU A 130 1 ? 7 HELX_P HELX_P8 AA8 GLN A 146 ? LEU A 158 ? GLN A 146 LEU A 158 1 ? 13 HELX_P HELX_P9 AA9 ASP A 163 ? TYR A 174 ? ASP A 163 TYR A 174 1 ? 12 HELX_P HELX_P10 AB1 ASN A 177 ? TRP A 192 ? ASN A 177 TRP A 192 1 ? 16 HELX_P HELX_P11 AB2 THR A 198 ? GLN A 204 ? THR A 198 GLN A 204 1 ? 7 HELX_P HELX_P12 AB3 THR A 213 ? GLY A 224 ? THR A 213 GLY A 224 1 ? 12 HELX_P HELX_P13 AB4 LYS A 225 ? GLY A 240 ? LYS A 225 GLY A 240 1 ? 16 HELX_P HELX_P14 AB5 GLU A 242 ? SER A 264 ? GLU A 242 SER A 264 1 ? 23 HELX_P HELX_P15 AB6 PRO A 268 ? HIS A 276 ? PRO A 268 HIS A 276 1 ? 9 HELX_P HELX_P16 AB7 ARG A 282 ? LEU A 293 ? ARG A 282 LEU A 293 1 ? 12 HELX_P HELX_P17 AB8 SER A 294 ? GLN A 314 ? SER A 294 GLN A 314 1 ? 21 HELX_P HELX_P18 AB9 SER A 319 ? CYS A 332 ? SER A 319 CYS A 332 1 ? 14 HELX_P HELX_P19 AC1 ALA A 337 ? GLY A 343 ? ALA A 337 GLY A 343 1 ? 7 HELX_P HELX_P20 AC2 VAL B 5 ? TRP B 10 ? VAL B 5 TRP B 10 1 ? 6 HELX_P HELX_P21 AC3 THR B 14 ? VAL B 18 ? THR B 14 VAL B 18 5 ? 5 HELX_P HELX_P22 AC4 GLN B 21 ? GLY B 35 ? GLN B 21 GLY B 35 1 ? 15 HELX_P HELX_P23 AC5 GLY B 50 ? ASN B 63 ? GLY B 50 ASN B 63 1 ? 14 HELX_P HELX_P24 AC6 CYS B 76 ? GLY B 85 ? CYS B 76 GLY B 85 1 ? 10 HELX_P HELX_P25 AC7 ALA B 96 ? ARG B 98 ? ALA B 96 ARG B 98 5 ? 3 HELX_P HELX_P26 AC8 LYS B 100 ? ASP B 109 ? LYS B 100 ASP B 109 1 ? 10 HELX_P HELX_P27 AC9 ASN B 110 ? TYR B 113 ? ASN B 110 TYR B 113 5 ? 4 HELX_P HELX_P28 AD1 VAL B 128 ? LEU B 131 ? VAL B 128 LEU B 131 5 ? 4 HELX_P HELX_P29 AD2 SER B 132 ? GLU B 145 ? SER B 132 GLU B 145 1 ? 14 HELX_P HELX_P30 AD3 ASP B 158 ? LEU B 162 ? ASP B 158 LEU B 162 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 AD4 PRO B 163 ? SER B 168 ? PRO B 163 SER B 168 1 ? 6 HELX_P HELX_P32 AD5 ASP B 179 ? GLU B 194 ? ASP B 179 GLU B 194 1 ? 16 HELX_P HELX_P33 AD6 GLU B 199 ? GLU B 211 ? GLU B 199 GLU B 211 1 ? 13 HELX_P HELX_P34 AD7 SER B 213 ? GLY B 228 ? SER B 213 GLY B 228 1 ? 16 HELX_P HELX_P35 AD8 SER B 233 ? ASP B 245 ? SER B 233 ASP B 245 1 ? 13 HELX_P HELX_P36 AD9 ASP B 247 ? GLU B 258 ? ASP B 247 GLU B 258 1 ? 12 HELX_P HELX_P37 AE1 ASN B 260 ? GLY B 275 ? ASN B 260 GLY B 275 1 ? 16 HELX_P HELX_P38 AE2 GLU B 277 ? GLN B 296 ? GLU B 277 GLN B 296 1 ? 20 HELX_P HELX_P39 AE3 SER B 298 ? LEU B 302 ? SER B 298 LEU B 302 5 ? 5 HELX_P HELX_P40 AE4 GLY B 303 ? ALA B 307 ? GLY B 303 ALA B 307 5 ? 5 HELX_P HELX_P41 AE5 ILE B 309 ? ILE B 320 ? ILE B 309 ILE B 320 1 ? 12 HELX_P HELX_P42 AE6 PRO B 321 ? GLU B 338 ? PRO B 321 GLU B 338 1 ? 18 HELX_P HELX_P43 AE7 LEU B 339 ? ALA B 342 ? LEU B 339 ALA B 342 5 ? 4 HELX_P HELX_P44 AE8 ASP B 344 ? ALA B 358 ? ASP B 344 ALA B 358 1 ? 15 HELX_P HELX_P45 AE9 VAL C 5 ? TRP C 10 ? VAL C 5 TRP C 10 1 ? 6 HELX_P HELX_P46 AF1 THR C 14 ? VAL C 18 ? THR C 14 VAL C 18 5 ? 5 HELX_P HELX_P47 AF2 GLN C 21 ? GLY C 35 ? GLN C 21 GLY C 35 1 ? 15 HELX_P HELX_P48 AF3 GLY C 50 ? CYS C 64 ? GLY C 50 CYS C 64 1 ? 15 HELX_P HELX_P49 AF4 CYS C 76 ? GLN C 84 ? CYS C 76 GLN C 84 1 ? 9 HELX_P HELX_P50 AF5 LYS C 100 ? ASN C 110 ? LYS C 100 ASN C 110 1 ? 11 HELX_P HELX_P51 AF6 VAL C 128 ? LEU C 131 ? VAL C 128 LEU C 131 5 ? 4 HELX_P HELX_P52 AF7 SER C 132 ? LEU C 139 ? SER C 132 LEU C 139 1 ? 8 HELX_P HELX_P53 AF8 LEU C 139 ? GLU C 145 ? LEU C 139 GLU C 145 1 ? 7 HELX_P HELX_P54 AF9 ASP C 158 ? LEU C 162 ? ASP C 158 LEU C 162 5 ? 5 HELX_P HELX_P55 AG1 PRO C 163 ? ARG C 169 ? PRO C 163 ARG C 169 1 ? 7 HELX_P HELX_P56 AG2 ASP C 179 ? HIS C 195 ? ASP C 179 HIS C 195 1 ? 17 HELX_P HELX_P57 AG3 GLU C 199 ? GLU C 211 ? GLU C 199 GLU C 211 1 ? 13 HELX_P HELX_P58 AG4 SER C 213 ? GLY C 228 ? SER C 213 GLY C 228 1 ? 16 HELX_P HELX_P59 AG5 SER C 233 ? GLY C 242 ? SER C 233 GLY C 242 1 ? 10 HELX_P HELX_P60 AG6 ASP C 245 ? GLU C 258 ? ASP C 245 GLU C 258 1 ? 14 HELX_P HELX_P61 AG7 ASN C 260 ? ARG C 274 ? ASN C 260 ARG C 274 1 ? 15 HELX_P HELX_P62 AG8 GLU C 277 ? SER C 298 ? GLU C 277 SER C 298 1 ? 22 HELX_P HELX_P63 AG9 GLY C 303 ? ALA C 307 ? GLY C 303 ALA C 307 5 ? 5 HELX_P HELX_P64 AH1 ILE C 309 ? ILE C 320 ? ILE C 309 ILE C 320 1 ? 12 HELX_P HELX_P65 AH2 PRO C 321 ? LEU C 339 ? PRO C 321 LEU C 339 1 ? 19 HELX_P HELX_P66 AH3 PRO C 340 ? ALA C 342 ? PRO C 340 ALA C 342 5 ? 3 HELX_P HELX_P67 AH4 ASP C 344 ? PHE C 359 ? ASP C 344 PHE C 359 1 ? 16 HELX_P HELX_P68 AH5 VAL D 5 ? TRP D 10 ? VAL D 5 TRP D 10 1 ? 6 HELX_P HELX_P69 AH6 THR D 14 ? VAL D 18 ? THR D 14 VAL D 18 5 ? 5 HELX_P HELX_P70 AH7 GLN D 21 ? GLY D 35 ? GLN D 21 GLY D 35 1 ? 15 HELX_P HELX_P71 AH8 GLY D 50 ? ASN D 63 ? 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'DC-G PAIR' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OG1 ? 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O GLU G 165 # _pdbx_entry_details.entry_id 9OYM _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest N _pdbx_entry_details.has_protein_modification N # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 ASP B 247 ? ? -93.00 30.49 2 1 MET B 363 ? ? 68.35 152.42 3 1 ASP C 229 ? ? 60.49 61.27 4 1 PHE C 359 ? ? -97.92 32.08 5 1 SER D 2 ? ? -79.41 -166.24 6 1 ARG D 98 ? ? -93.95 55.10 7 1 ARG D 117 ? ? 73.23 -3.24 8 1 ASP D 247 ? ? -99.86 33.41 9 1 MET D 306 ? ? -95.40 30.99 10 1 ALA E 137 ? ? -165.26 114.31 11 1 ASP F 39 ? ? -68.18 77.47 12 1 LEU F 49 ? ? 74.65 -5.17 13 1 GLU F 287 ? ? -58.85 109.88 14 1 GLU F 298 ? ? -69.66 5.42 15 1 ASP G 39 ? ? -68.89 93.48 16 1 ASP G 120 ? ? -141.37 17.75 17 1 GLU G 165 ? ? -95.36 31.76 18 1 GLU G 298 ? ? -69.18 1.74 # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 9OYM _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 9OYM _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 2.60 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 539340 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.5 # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details _em_entity_assembly.entity_id_list 1 0 'MULTIPLE SOURCES' COMPLEX 'E. coli clamp loading complex' ? ? ? 1,2,5,3,4,6 2 1 RECOMBINANT COMPLEX 'beta clamp bound to loader DnaX-complex' ? ? ? 1,2,3,4,7 3 1 RECOMBINANT COMPLEX '10-nt gapped DNA substrate' ? ? ? 5,6 # _em_imaging.entry_id 9OYM _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'TFS KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_min 1200 _em_imaging.nominal_defocus_max 1600 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen ? _em_imaging.objective_aperture ? _em_imaging.microscope_serial_number ? _em_imaging.microscope_version ? # _em_vitrification.entry_id 9OYM _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.instrument ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 9OYM _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 B MET 1 ? 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sing N N 81 ARG CZ NH2 doub N N 82 ARG NH1 HH11 sing N N 83 ARG NH1 HH12 sing N N 84 ARG NH2 HH21 sing N N 85 ARG NH2 HH22 sing N N 86 ARG OXT HXT sing N N 87 ASN N CA sing N N 88 ASN N H sing N N 89 ASN N H2 sing N N 90 ASN CA C sing N N 91 ASN CA CB sing N N 92 ASN CA HA sing N N 93 ASN C O doub N N 94 ASN C OXT sing N N 95 ASN CB CG sing N N 96 ASN CB HB2 sing N N 97 ASN CB HB3 sing N N 98 ASN CG OD1 doub N N 99 ASN CG ND2 sing N N 100 ASN ND2 HD21 sing N N 101 ASN ND2 HD22 sing N N 102 ASN OXT HXT sing N N 103 ASP N CA sing N N 104 ASP N H sing N N 105 ASP N H2 sing N N 106 ASP CA C sing N N 107 ASP CA CB sing N N 108 ASP CA HA sing N N 109 ASP C O doub N N 110 ASP C OXT sing N N 111 ASP CB CG sing N N 112 ASP CB HB2 sing N N 113 ASP CB HB3 sing N N 114 ASP CG OD1 doub N N 115 ASP CG OD2 sing N N 116 ASP OD2 HD2 sing N N 117 ASP OXT HXT sing N N 118 CYS N CA sing N N 119 CYS N H sing N N 120 CYS N H2 sing N N 121 CYS CA C sing N N 122 CYS CA CB sing N N 123 CYS CA HA sing N N 124 CYS C O doub N N 125 CYS C OXT sing N N 126 CYS CB SG sing N N 127 CYS CB HB2 sing N N 128 CYS CB HB3 sing N N 129 CYS SG HG sing N N 130 CYS OXT HXT sing N N 131 DA OP3 P sing N N 132 DA OP3 HOP3 sing N N 133 DA P OP1 doub N N 134 DA P OP2 sing N N 135 DA P "O5'" sing N N 136 DA OP2 HOP2 sing N N 137 DA "O5'" "C5'" sing N N 138 DA "C5'" "C4'" sing N N 139 DA "C5'" "H5'" sing N N 140 DA "C5'" "H5''" sing N N 141 DA "C4'" "O4'" sing N N 142 DA "C4'" "C3'" sing N N 143 DA "C4'" "H4'" sing N N 144 DA "O4'" "C1'" sing N N 145 DA "C3'" "O3'" sing N N 146 DA "C3'" "C2'" sing N N 147 DA "C3'" "H3'" sing N N 148 DA "O3'" "HO3'" sing N N 149 DA "C2'" "C1'" sing N N 150 DA "C2'" "H2'" sing N N 151 DA "C2'" "H2''" sing N N 152 DA "C1'" N9 sing N N 153 DA "C1'" "H1'" sing N N 154 DA N9 C8 sing Y N 155 DA N9 C4 sing Y N 156 DA C8 N7 doub Y N 157 DA C8 H8 sing N N 158 DA N7 C5 sing Y N 159 DA C5 C6 sing Y N 160 DA C5 C4 doub Y N 161 DA C6 N6 sing N N 162 DA C6 N1 doub Y N 163 DA N6 H61 sing N N 164 DA N6 H62 sing N N 165 DA N1 C2 sing Y N 166 DA C2 N3 doub Y N 167 DA C2 H2 sing N N 168 DA N3 C4 sing Y N 169 DC OP3 P sing N N 170 DC OP3 HOP3 sing N N 171 DC P OP1 doub N N 172 DC P OP2 sing N N 173 DC P "O5'" sing N N 174 DC OP2 HOP2 sing N N 175 DC "O5'" "C5'" sing N N 176 DC "C5'" "C4'" sing N N 177 DC "C5'" "H5'" sing N N 178 DC "C5'" "H5''" sing N N 179 DC "C4'" "O4'" sing N N 180 DC "C4'" "C3'" sing N N 181 DC "C4'" "H4'" sing N N 182 DC "O4'" "C1'" sing N N 183 DC "C3'" "O3'" sing N N 184 DC "C3'" "C2'" sing N N 185 DC "C3'" "H3'" sing N N 186 DC "O3'" "HO3'" sing N N 187 DC "C2'" "C1'" sing N N 188 DC "C2'" "H2'" sing N N 189 DC "C2'" "H2''" sing N N 190 DC "C1'" N1 sing N N 191 DC "C1'" "H1'" sing N N 192 DC N1 C2 sing N N 193 DC N1 C6 sing N N 194 DC C2 O2 doub N N 195 DC C2 N3 sing N N 196 DC N3 C4 doub N N 197 DC C4 N4 sing N N 198 DC C4 C5 sing N N 199 DC N4 H41 sing N N 200 DC N4 H42 sing N N 201 DC C5 C6 doub N N 202 DC C5 H5 sing N N 203 DC C6 H6 sing N N 204 DG OP3 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