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H . n C 3 401 PRO 401 370 ? ? ? H . n C 3 402 SER 402 371 ? ? ? H . n C 3 403 ASP 403 372 ? ? ? H . n C 3 404 ILE 404 373 ? ? ? H . n C 3 405 ALA 405 374 ? ? ? H . n C 3 406 VAL 406 375 ? ? ? H . n C 3 407 GLU 407 376 ? ? ? H . n C 3 408 TRP 408 377 ? ? ? H . n C 3 409 GLU 409 378 ? ? ? H . n C 3 410 SER 410 379 ? ? ? H . n C 3 411 ASN 411 380 ? ? ? H . n C 3 412 GLY 412 381 ? ? ? H . n C 3 413 GLN 413 382 ? ? ? H . n C 3 414 PRO 414 383 ? ? ? H . n C 3 415 GLU 415 384 ? ? ? H . n C 3 416 ASN 416 385 ? ? ? H . n C 3 417 ASN 417 386 ? ? ? H . n C 3 418 TYR 418 387 ? ? ? H . n C 3 419 LYS 419 388 ? ? ? H . n C 3 420 THR 420 389 ? ? ? H . n C 3 421 THR 421 390 ? ? ? H . n C 3 422 PRO 422 391 ? ? ? H . n C 3 423 PRO 423 392 ? ? ? H . n C 3 424 VAL 424 393 ? ? ? H . n C 3 425 LEU 425 394 ? ? ? H . n C 3 426 ASP 426 395 ? ? ? H . n C 3 427 SER 427 396 ? ? ? H . n C 3 428 ASP 428 397 ? ? ? H . n C 3 429 GLY 429 398 ? ? ? H . n C 3 430 SER 430 399 ? ? ? H . n C 3 431 PHE 431 400 ? ? ? H . n C 3 432 PHE 432 401 ? ? ? H . n C 3 433 LEU 433 402 ? ? ? H . n C 3 434 TYR 434 403 ? ? ? H . n C 3 435 SER 435 404 ? ? ? H . n C 3 436 LYS 436 405 ? ? ? H . n C 3 437 LEU 437 406 ? ? ? H . n C 3 438 THR 438 407 ? ? ? H . n C 3 439 VAL 439 408 ? ? ? H . n C 3 440 ASP 440 409 ? ? ? H . n C 3 441 LYS 441 410 ? ? ? H . n C 3 442 SER 442 411 ? ? ? H . n C 3 443 ARG 443 412 ? ? ? H . n C 3 444 TRP 444 413 ? ? ? H . n C 3 445 GLN 445 414 ? ? ? H . n C 3 446 GLN 446 415 ? ? ? H . n C 3 447 GLY 447 416 ? ? ? H . n C 3 448 ASN 448 417 ? ? ? H . n C 3 449 VAL 449 418 ? ? ? H . n C 3 450 PHE 450 419 ? ? ? H . n C 3 451 SER 451 420 ? ? ? H . n C 3 452 CYS 452 421 ? ? ? H . n C 3 453 SER 453 422 ? ? ? H . n C 3 454 VAL 454 423 ? ? ? H . n C 3 455 MET 455 424 ? ? ? H . n C 3 456 HIS 456 425 ? ? ? H . n C 3 457 GLU 457 426 ? ? ? H . n C 3 458 ALA 458 427 ? ? ? H . n C 3 459 LEU 459 428 ? ? ? H . n C 3 460 HIS 460 429 ? ? ? H . n C 3 461 ASN 461 430 ? ? ? H . n C 3 462 HIS 462 431 ? ? ? H . n C 3 463 TYR 463 432 ? ? ? H . n C 3 464 THR 464 433 ? ? ? H . n C 3 465 GLN 465 434 ? ? ? H . n C 3 466 LYS 466 435 ? ? ? H . n C 3 467 SER 467 436 ? ? ? H . n C 3 468 LEU 468 437 ? ? ? H . n C 3 469 SER 469 438 ? ? ? H . n C 3 470 LEU 470 439 ? ? ? H . n C 3 471 SER 471 440 ? ? ? H . n C 3 472 PRO 472 441 ? ? ? H . n C 3 473 GLY 473 442 ? ? ? H . n C 3 474 LYS 474 443 ? ? ? H . n # _pdbx_entity_instance_feature.ordinal 1 _pdbx_entity_instance_feature.comp_id ZN _pdbx_entity_instance_feature.asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id ZN _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.feature_type 'SUBJECT OF INVESTIGATION' _pdbx_entity_instance_feature.details ? # _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id D _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id 4 _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id ZN _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num 1 _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num 1000 _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num 1000 _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id ZN _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id ZN _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id A _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code . # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9P1V _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 9P1V _struct.title 'Structure of MAb PhtD3 in complex with PhtD' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9P1V _struct_keywords.text 'A complex of an antibody, PhtD3, with Pneumococcal histidine triad protein D, PhtD., ANTIMICROBIAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'ANTIMICROBIAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A0E3JFL0_STREE A0A0E3JFL0 ? 1 ;MKINKKYLAGSVAVLALSVCSYELGRHQAGQVKKESNRVSYIDGDQAGQKAENLTPDEVSKREGINAEQIVIKITDQGYV TSHGDHYHYYNGKVPYDAIISEELLMKDPNYQLKDSDIVNEIKGGYVIKVDGKYYVYLKDAAHADNIRTKEEIKRQKQER SHNHNSRADNAVAAARAQGRYTTDDGYIFNASDIIEDTGDAYIVPHGDHYHYIPKNELSASELAAAEAYWNGKQGSRPSS SSSYNANPAQPRLSENHNLTVTPTYHQNQGENISSLLRELYAKPLSERHVESDGLIFDPAQITSRTARGVAVPHGNHYHF IPYEQMSELEKRIARIIPLRYRSNHWVPDSRPEQPSPQSTPEPSPSLQPAPNPQPAPSNPIDEKLVKEAVRKVGDGYVFE KNGVSRYIPAKDLSAETAAGIDSKLAKQESLSHKLGAKKTDLPSSDREFYNKTYDLLARIHQDLLDNKGRQVDFEALDNL LERLKDVSSDKVKLVDDILAFLAPIRHPERLGKPNAQITYTDDEIQVAKLAGKYTTEDGYIFDPRDITSDEGDAYVTPHM THSHWIKKDSLSEAERAAAQAYAKEKGLTPPSTDHQDSGNTEAKGAEAIYNRVKAAKKVPLDRMPYNLQYTVEVKNGSLI IPHYDHYHNIKFEWFDEGLYEAPKGYTLEDLLATVKYYVEHPNERPHSDNGFGNASDHVRKNKADQDSKPDEDKGHDEVS EPTHPESDEKENHAGLNPSADNLYKPSTDTEETEEEAEDTTDEAEIPQVEHSVINAKIADAEALLEKVTDPSIRQNAMET LTGLKSSLLLGTKDNNTISAEVDSLLALLKKSQPAPIQ ; 1 2 PDB 9P1V 9P1V ? 2 ? 1 3 PDB 9P1V 9P1V ? 3 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9P1V A 1 ? 838 ? A0A0E3JFL0 1 ? 838 ? 1 838 2 2 9P1V L 1 ? 235 ? 9P1V -19 ? 214 ? -19 214 3 3 9P1V H 1 ? 474 ? 9P1V -18 ? 443 ? -18 443 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLU A 103 ? LEU A 105 ? GLU A 103 LEU A 105 5 ? 3 HELX_P HELX_P2 AA2 LYS A 114 ? SER A 116 ? LYS A 114 SER A 116 5 ? 3 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP A 140 ? ALA A 144 ? ASP A 140 ALA A 144 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 AA4 THR A 149 ? LYS A 157 ? THR A 149 LYS A 157 1 ? 9 HELX_P HELX_P5 AA5 LEU B 49 ? ASN B 52 ? LEU L 28 ASN L 31 5 ? 4 HELX_P HELX_P6 AA6 GLU B 100 ? PHE B 104 ? GLU L 79 PHE L 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 AA7 SER B 142 ? SER B 148 ? SER L 121 SER L 127 1 ? 7 HELX_P HELX_P8 AA8 LYS B 204 ? LYS B 209 ? LYS L 183 LYS L 188 1 ? 6 HELX_P HELX_P9 AA9 ALA C 47 ? PHE C 51 ? ALA H 28 PHE H 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P10 AB1 ARG C 106 ? THR C 110 ? ARG H 83 THR H 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 SER C 187 ? ALA C 189 ? SER H 156 ALA H 158 5 ? 3 HELX_P HELX_P12 AB3 SER C 218 ? THR C 222 ? SER H 187 THR H 191 5 ? 5 HELX_P HELX_P13 AB4 LYS C 232 ? ASN C 235 ? LYS H 201 ASN H 204 5 ? 4 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? B CYS 43 SG ? ? ? 1_555 B CYS 109 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 155 SG ? ? ? 1_555 B CYS 215 SG ? ? L CYS 134 L CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.137 ? ? disulf3 disulf ? ? C CYS 41 SG ? ? ? 1_555 C CYS 115 SG ? ? H CYS 22 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf4 disulf ? ? C CYS 171 SG ? ? ? 1_555 C CYS 227 SG ? ? H CYS 140 H CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.152 ? ? metalc1 metalc ? ? A HIS 83 ND1 ? ? ? 1_555 D ZN . ZN ? ? A HIS 83 A ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.013 ? ? metalc2 metalc ? ? A HIS 86 ND1 ? ? ? 1_555 D ZN . ZN ? ? A HIS 86 A ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.445 ? ? metalc3 metalc ? ? A HIS 88 NE2 ? ? ? 1_555 D ZN . ZN ? ? A HIS 88 A ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? metalc ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 ND1 ? 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