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_refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'REAL-SPACE (WEIGHTED MAP SUM AT ATOM CENTERS)' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.428 ? 33122 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 12.806 ? 9219 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.037 ? 3709 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 4046 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 9PD5 _struct.title 'NER dual incision complex - NoF' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9PD5 _struct_keywords.text 'NER, XPA, XPG, XPF, DNA BINDING PROTEIN, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN/DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 13 ? O N N 13 ? P N N 13 ? Q N N 13 ? 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2 ;MKLNVDGLLVYFPYDYIYPEQFSYMRELKRTLDAKGHGVLEMPSGTGKTVSLLALIMAYQRAYPLEVTKLIYCSRTVPEI EKVIEELRKLLNFYEKQEGEKLPFLGLALSSRKNLCIHPEVTPLRFGKDVDGKCHSLTASYVRAQYQHDTSLPHCRFYEE FDAHGREVPLPAGIYNLDDLKALGRRQGWCPYFLARYSILHANVVVYSYHYLLDPKIADLVSKELARKAVVVFDEAHNID NVCIDSMSVNLTRRTLDRCQGNLETLQKTVLRIKETDEQRLRDEYRRLVEGLREASAARETDAHLANPVLPDEVLQEAVP GSIRTAEHFLGFLRRLLEYVKWRLRVQHVVQESPPAFLSGLAQRVCIQRKPLRFCAERLRSLLHTLEITDLADFSPLTLL ANFATLVSTYAKGFTIIIEPFDDRTPTIANPILHFSCMDASLAIKPVFERFQSVIITSGTLSPLDIYPKILDFHPVTMAT FTMTLARVCLCPMIIGRGNDQVAISSKFETREDIAVIRNYGNLLLEMSAVVPDGIVAFFTSYQYMESTVASWYEQGILEN IQRNKLLFIETQDGAETSVALEKYQEACENGRGAILLSVARGKVSEGIDFVHHYGRAVIMFGVPYVYTQSRILKARLEYL RDQFQIRENDFLTFDAMRHAAQCVGRAIRGKTDYGLMVFADKRFARGDKRGKLPRWIQEHLTDANLNLTVDEGVQVAKYF LRQMAQPFHREDQLGLSLLSLEQLESEETLKRIEQIAQQL ; 1 3 UNP TF2H1_HUMAN P32780 ? 3 ;MATSSEEVLLIVKKVRQKKQDGALYLMAERIAWAPEGKDRFTISHMYADIKCQKISPEGKAKIQLQLVLHAGDTTNFHFS NESTAVKERDAVKDLLQQLLPKFKRKANKELEEKNRMLQEDPVLFQLYKDLVVSQVISAEEFWANRLNVNATDSSSTSNH KQDVGISAAFLADVRPQTDGCNGLRYNLTSDIIESIFRTYPAVKMKYAENVPHNMTEKEFWTRFFQSHYFHRDRLNTGSK DLFAECAKIDEKGLKTMVSLGVKNPLLDLTALEDKPLDEGYGISSVPSASNSKSIKENSNAAIIKRFNHHSAMVLAAGLR KQEAQNEQTSEPSNMDGNSGDADCFQPAVKRAKLQESIEYEDLGKNNSVKTIALNLKKSDRYYHGPTPIQSLQYATSQDI INSFQSIRQEMEAYTPKLTQVLSSSAASSTITALSPGGALMQGGTQQAINQMVPNDIQSELKHLYVAVGELLRHFWSCFP VNTPFLEEKVVKMKSNLERFQVTKLCPFQEKIRRQYLSTNLVSHIEEMLQTAYNKLHTWQSRRLMKKT ; 1 4 UNP TF2H4_HUMAN Q92759 ? 4 ;MESTPSRGLNRVHLQCRNLQEFLGGLSPGVLDRLYGHPATCLAVFRELPSLAKNWVMRMLFLEQPLPQAAVALWVKKEFS KAQEESTGLLSGLRIWHTQLLPGGLQGLILNPIFRQNLRIALLGGGKAWSDDTSQLGPDKHARDVPSLDKYAEERWEVVL HFMVGSPSAAVSQDLAQLLSQAGLMKSTEPGEPPCITSAGFQFLLLDTPAQLWYFMLQYLQTAQSRGMDLVEILSFLFQL SFSTLGKDYSVEGMSDSLLNFLQHLREFGLVFQRKRKSRRYYPTRLAINLSSGVSGAGGTVHQPGFIVVETNYRLYAYTE SELQIALIALFSEMLYRFPNMVVAQVTRESVQQAIASGITAQQIIHFLRTRAHPVMLKQTPVLPPTITDQIRLWELERDR LRFTEGVLYNQFLSQVDFELLLAHARELGVLVFENSAKRLMVVTPAGHSDVKRFWKRQKHSS ; 1 5 UNP TF2H2_HUMAN Q13888 ? 5 ;MDEEPERTKRWEGGYERTWEILKEDESGSLKATIEDILFKAKRKRVFEHHGQVRLGMMRHLYVVVDGSRTMEDQDLKPNR LTCTLKLLEYFVEEYFDQNPISQIGIIVTKSKRAEKLTELSGNPRKHITSLKKAVDMTCHGEPSLYNSLSIAMQTLKHMP GHTSREVLIIFSSLTTCDPSNIYDLIKTLKAAKIRVSVIGLSAEVRVCTVLARETGGTYHVILDESHYKELLTHHVSPPP ASSSSECSLIRMGFPQHTIASLSDQDAKPSFSMAHLDGNTEPGLTLGGYFCPQCRAKYCELPVECKICGLTLVSAPHLAR SYHHLFPLDAFQEIPLEEYNGERFCYGCQGELKDQHVYVCAVCQNVFCVDCDVFVHDSLHCCPGCIHKIPAPSGV ; 1 6 UNP TF2H3_HUMAN Q13889 ? 6 ;MVSDEDELNLLVIVVDANPIWWGKQALKESQFTLSKCIDAVMVLGNSHLFMNRSNKLAVIASHIQESRFLYPGKNGRLGD FFGDPGNPPEFNPSGSKDGKYELLTSANEVIVEEIKDLMTKSDIKGQHTETLLAGSLAKALCYIHRMNKEVKDNQEMKSR ILVIKAAEDSALQYMNFMNVIFAAQKQNILIDACVLDSDSGLLQQACDITGGLYLKVPQMPSLLQYLLWVFLPDQDQRSQ LILPPPVHVDYRAACFCHRNLIEIGYVCSVCLSIFCNFSPICTTCETAFKISLPPVLKAKKKKLKVSA ; 1 7 UNP TF2H5_HUMAN Q6ZYL4 ? 7 MVNVLKGVLIECDPAMKQFLLYLDESNALGKKFIIQDIDDTHVFVIAELVNVLQERVGELMDQNAFSLTQK 1 8 UNP XPA_HUMAN P23025 ? 8 ;MAAADGALPEAAALEQPAELPASVRASIERKRQRALMLRQARLAARPYSATAAAATGGMANVKAAPKIIDTGGGFILEEE EEEEQKIGKVVHQPGPVMEFDYVICEECGKEFMDSYLMNHFDLPTCDNCRDADDKHKLITKTEAKQEYLLKDCDLEKREP PLKFIVKKNPHHSQWGDMKLYLKLQIVKRSLEVWGSQEALEEAKEVRQENREKMKQKKFDKKVKELRRAVRSSVWKRETI VHQHEYGPEENLEDDMYRKTCTMCGHELTYEKM ; 1 9 PDB 9PD5 9PD5 ? 9 ? 1 10 PDB 9PD5 9PD5 ? 10 ? 1 11 UNP ERCC5_HUMAN P28715 ? 11 ;MGVQGLWKLLECSGRQVSPEALEGKILAVDISIWLNQALKGVRDRHGNSIENPHLLTLFHRLCKLLFFRIRPIFVFDGDA PLLKKQTLVKRRQRKDLASSDSRKTTEKLLKTFLKRQAIKTAFRSKRDEALPSLTQVRRENDLYVLPPLQEEEKHSSEEE DEKEWQERMNQKQALQEEFFHNPQAIDIESEDFSSLPPEVKHEILTDMKEFTKRRRTLFEAMPEESDDFSQYQLKGLLKK NYLNQHIEHVQKEMNQQHSGHIRRQYEDEGGFLKEVESRRVVSEDTSHYILIKGIQAKTVAEVDSESLPSSSKMHGMSFD VKSSPCEKLKTEKEPDATPPSPRTLLAMQAALLGSSSEEELESENRRQARGRNAPAAVDEGSISPRTLSAIKRALDDDED VKVCAGDDVQTGGPGAEEMRINSSTENSDEGLKVRDGKGIPFTATLASSSVNSAEEHVASTNEGREPTDSVPKEQMSLVH VGTEAFPISDESMIKDRKDRLPLESAVVRHSDAPGLPNGRELTPASPTCTNSVSKNETHAEVLEQQNELCPYESKFDSSL LSSDDETKCKPNSASEVIGPVSLQETSSIVSVPSEAVDNVENVVSFNAKEHENFLETIQEQQTTESAGQDLISIPKAVEP MEIDSEESESDGSFIEVQSVISDEELQAEFPETSKPPSEQGEEELVGTREGEAPAESESLLRDNSERDDVDGEPQEAEKD AEDSLHEWQDINLEELETLESNLLAQQNSLKAQKQQQERIAATVTGQMFLESQELLRLFGIPYIQAPMEAEAQCAILDLT DQTSGTITDDSDIWLFGARHVYRNFFNKNKFVEYYQYVDFHNQLGLDRNKLINLAYLLGSDYTEGIPTVGCVTAMEILNE FPGHGLEPLLKFSEWWHEAQKNPKIRPNPHDTKVKKKLRTLQLTPGFPNPAVAEAYLKPVVDDSKGSFLWGKPDLDKIRE FCQRYFGWNRTKTDESLFPVLKQLDAQQTQLRIDSFFRLAQQEKEDAKRIKSQRLNRAVTCMLRKEKEAAASEIEAVSVA MEKEFELLDKAKGKTQKRGITNTLEESSSLKRKRLSDSKGKNTCGGFLGETCLSESSDGSSSEDAESSSLMNVQRRTAAK EPKTSASDSQNSVKEAPVKNGGATTSSSSDSDDDGGKEKMVLVTARSVFGKKRRKLRRARGRKRKT ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9PD5 A 1 ? 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F HIS 258 ? 1_555 158.5 ? 45 SG ? F CYS 257 ? F CYS 257 ? 1_555 ZN ? Q ZN . ? F ZN 402 ? 1_555 NE2 ? F HIS 258 ? F HIS 258 ? 1_555 88.5 ? 46 SG ? F CYS 255 ? F CYS 255 ? 1_555 ZN ? Q ZN . ? F ZN 402 ? 1_555 SG ? F CYS 276 ? F CYS 276 ? 1_555 113.0 ? 47 SG ? F CYS 257 ? F CYS 257 ? 1_555 ZN ? Q ZN . ? F ZN 402 ? 1_555 SG ? F CYS 276 ? F CYS 276 ? 1_555 113.7 ? 48 NE2 ? F HIS 258 ? F HIS 258 ? 1_555 ZN ? Q ZN . ? F ZN 402 ? 1_555 SG ? F CYS 276 ? F CYS 276 ? 1_555 67.8 ? 49 SG ? F CYS 268 ? F CYS 268 ? 1_555 ZN ? P ZN . ? F ZN 401 ? 1_555 SG ? F CYS 271 ? F CYS 271 ? 1_555 109.4 ? 50 SG ? F CYS 268 ? F CYS 268 ? 1_555 ZN ? P ZN . ? F ZN 401 ? 1_555 SG ? F CYS 282 ? F CYS 282 ? 1_555 109.7 ? 51 SG ? F CYS 271 ? F CYS 271 ? 1_555 ZN ? P ZN . ? F ZN 401 ? 1_555 SG ? F CYS 282 ? F CYS 282 ? 1_555 111.3 ? 52 SG ? F CYS 268 ? F CYS 268 ? 1_555 ZN ? P ZN . ? F ZN 401 ? 1_555 SG ? F CYS 285 ? F CYS 285 ? 1_555 110.4 ? 53 SG ? F CYS 271 ? F CYS 271 ? 1_555 ZN ? P ZN . ? F ZN 401 ? 1_555 SG ? 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CYS A 512 ? VAL A 505 CYS A 512 AA5 3 ALA A 657 ? SER A 664 ? ALA A 657 SER A 664 AA5 4 VAL A 622 ? ILE A 626 ? VAL A 622 ILE A 626 AA5 5 ILE A 558 ? PHE A 561 ? ILE A 558 PHE A 561 AA5 6 THR A 604 ? ILE A 607 ? THR A 604 ILE A 607 AA6 1 LYS B 2 ? VAL B 5 ? LYS B 2 VAL B 5 AA6 2 LEU B 8 ? TYR B 11 ? LEU B 8 TYR B 11 AA7 1 ALA B 479 ? PHE B 481 ? ALA B 479 PHE B 481 AA7 2 GLY B 36 ? GLU B 41 ? GLY B 36 GLU B 41 AA7 3 SER B 453 ? SER B 458 ? SER B 453 SER B 458 AA7 4 ALA B 229 ? ASP B 234 ? ALA B 229 ASP B 234 AA7 5 LYS B 69 ? CYS B 73 ? LYS B 69 CYS B 73 AA7 6 VAL B 204 ? TYR B 207 ? VAL B 204 TYR B 207 AA7 7 GLY B 106 ? ALA B 108 ? GLY B 106 ALA B 108 AA8 1 VAL B 249 ? THR B 252 ? VAL B 249 THR B 252 AA8 2 PRO B 431 ? CYS B 437 ? PRO B 431 CYS B 437 AA8 3 PHE B 414 ? GLU B 419 ? PHE B 414 GLU B 419 AA8 4 GLN B 351 ? SER B 353 ? GLN B 351 SER B 353 AA9 1 LEU B 490 ? ILE B 495 ? LEU B 490 ILE B 495 AA9 2 GLY B 675 ? ALA B 680 ? GLY B 675 ALA B 680 AA9 3 ALA B 617 ? PHE B 621 ? ALA B 617 PHE B 621 AA9 4 ILE B 535 ? PHE B 539 ? ILE B 535 PHE B 539 AA9 5 ALA B 594 ? VAL B 599 ? ALA B 594 VAL B 599 AA9 6 LEU B 566 ? ILE B 569 ? LEU B 566 ILE B 569 AB1 1 TRP D 96 ? LEU D 100 ? TRP D 96 LEU D 100 AB1 2 GLN D 106 ? LEU D 110 ? GLN D 106 LEU D 110 AB2 1 ASP D 248 ? VAL D 251 ? ASP D 248 VAL D 251 AB2 2 ARG D 279 ? THR D 284 ? ARG D 279 THR D 284 AB2 3 LEU D 270 ? PHE D 272 ? LEU D 270 PHE D 272 AB3 1 ARG D 402 ? TYR D 409 ? ARG D 402 TYR D 409 AB3 2 LEU D 440 ? VAL D 443 ? LEU D 440 VAL D 443 AB3 3 LEU D 431 ? ASN D 435 ? LEU D 431 ASN D 435 AB4 1 LEU D 184 ? LYS D 186 ? LEU D 184 LYS D 186 AB4 2 CYS D 195 ? THR D 197 ? CYS D 195 THR D 197 AB5 1 ARG E 113 ? THR E 118 ? ARG E 113 THR E 118 AB5 2 GLN E 103 ? LYS E 110 ? GLN E 103 LYS E 110 AB5 3 ARG E 59 ? ASP E 66 ? ARG E 59 ASP E 66 AB5 4 SER E 164 ? PHE E 171 ? SER E 164 PHE E 171 AB5 5 ARG E 195 ? GLY E 200 ? ARG E 195 GLY E 200 AB5 6 TYR E 219 ? VAL E 221 ? TYR E 219 VAL E 221 AB6 1 TYR E 289 ? CYS E 291 ? 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LEU G 5 GLU G 11 AC4 2 HIS G 42 ? VAL G 45 ? HIS G 42 VAL G 45 AC4 3 GLN G 36 ? ASP G 39 ? GLN G 36 ASP G 39 AC5 1 LEU H 138 ? THR H 140 ? LEU K 138 THR K 140 AC5 2 MET H 178 ? LEU H 182 ? MET K 178 LEU K 182 AC5 3 ILE H 165 ? LYS H 167 ? ILE K 165 LYS K 167 AC6 1 PRO H 248 ? LEU H 252 ? PRO K 248 LEU K 252 AC6 2 MET H 256 ? THR H 260 ? MET K 256 THR K 260 AC6 3 GLU H 267 ? GLU H 271 ? GLU K 267 GLU K 271 AC7 1 VAL H 103 ? CYS H 105 ? VAL K 103 CYS K 105 AC7 2 GLY H 109 ? PHE H 112 ? 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N ALA A 657 AA5 3 4 O PHE A 658 ? O PHE A 658 N LEU A 623 ? N LEU A 623 AA5 4 5 O VAL A 622 ? O VAL A 622 N ILE A 559 ? N ILE A 559 AA5 5 6 O ILE A 558 ? O ILE A 558 N ILE A 605 ? N ILE A 605 AA6 1 2 O LEU B 3 ? O LEU B 3 N VAL B 10 ? N VAL B 10 AA7 1 2 O VAL B 39 ? O VAL B 39 N ALA B 479 ? N ALA B 479 AA7 2 3 O GLY B 38 ? O GLY B 38 N ILE B 456 ? N ILE B 456 AA7 3 4 O SER B 453 ? O SER B 453 N VAL B 231 ? N VAL B 231 AA7 4 5 O VAL B 230 ? O VAL B 230 N LYS B 69 ? N LYS B 69 AA7 5 6 O LEU B 70 ? O LEU B 70 N VAL B 205 ? N VAL B 205 AA7 6 7 O VAL B 204 ? O VAL B 204 N LEU B 107 ? N LEU B 107 AA8 1 2 O VAL B 249 ? O VAL B 249 N LEU B 433 ? N LEU B 433 AA8 2 3 O SER B 436 ? O SER B 436 N THR B 415 ? N THR B 415 AA8 3 4 O ILE B 418 ? O ILE B 418 N GLU B 352 ? N GLU B 352 AA9 1 2 O CYS B 491 ? O CYS B 491 N GLY B 675 ? N GLY B 675 AA9 2 3 O LEU B 676 ? O LEU B 676 N VAL B 618 ? N VAL B 618 AA9 3 4 O ALA B 617 ? O ALA B 617 N VAL B 536 ? N VAL B 536 AA9 4 5 O ILE B 535 ? 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