data_9Q7U # _entry.id 9Q7U # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.410 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 9Q7U pdb_00009q7u 10.2210/pdb9q7u/pdb WWPDB D_1000297136 ? ? EMDB EMD-72318 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2026-02-18 ? 2 'EM metadata' 1 0 2026-02-18 ? 3 Image 1 0 2026-02-18 ? 4 'Primary map' 1 0 2026-02-18 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'EM metadata' repository 'Initial release' ? ? 3 3 Image repository 'Initial release' ? ? 4 4 'Primary map' repository 'Initial release' ? ? # _database_PDB_caveat.id 1 _database_PDB_caveat.text 'Residues DG J 162 and DC J 163 that are next to each other in the sample sequence are not properly linked.' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9Q7U _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2025-08-25 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type EMDB 'Consensus map for Cryo-EM structure of DNMT3A2/3B3 in complex with 167H3K36me2-nucleosome' EMD-71301 'consensus EM volume' EMDB 'Focus map of DNMT3A2/3B3 tetramer for Cryo-EM structure of DNMT3A2/3B3 in complex with 167H3K36me2-nucleosome' EMD-71302 'focused EM volume' EMDB 'Focus map of PWWP_1 domain for Cryo-EM structure of DNMT3A2/3B3 in complex with 167H3K36me2-nucleosome' EMD-71304 'focused EM volume' EMDB 'Focus map of PWWP_2 domain for Cryo-EM structure of DNMT3A2/3B3 in complex with 167H3K36me2-nucleosome' EMD-71305 'focused EM volume' EMDB 'Focus map of nucleosome for Cryo-EM structure of DNMT3A2/3B3 in complex with 167H3K36me2-nucleosome' EMD-71306 'focused EM volume' EMDB 'Composite map for Cryo-EM structure of DNMT3A2-DNMT3B3 tetramer bound to 167H3K36me2-nucleosome' EMD-72318 'associated EM volume' # loop_ _pdbx_contact_author.id _pdbx_contact_author.email _pdbx_contact_author.name_first _pdbx_contact_author.name_last _pdbx_contact_author.name_mi _pdbx_contact_author.role _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 3 peter.jones@vai.org Peter Jones A. 'principal investigator/group leader' 0000-0001-8309-4767 4 evan.worden@vai.org Evan Worden ? 'principal investigator/group leader' 0000-0003-0644-166X # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Xie, X.' 1 ? 'Zhou, X.E.' 2 ? 'Worden, E.J.' 3 ? 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'Lys36 di-methylation' 2 polymer man 'Histone H4' 11394.426 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'Histone H2A type 1' 13978.241 2 ? ? ? 'Histone H2A' 4 polymer man 'Histone H2B 1.1' 13655.948 2 ? ? ? 'Histone H2B' 5 polymer syn 'DNA (162-MER)' 51785.953 1 ? ? ? '167bp DNA' 6 polymer syn 'DNA (162-MER)' 51327.652 1 ? ? ? '167bp DNA' 7 polymer man 'Isoform 7 of DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B' 65568.391 2 2.1.1.37 ? ? ? 8 polymer man 'DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A' 77914.711 2 2.1.1.37 ? ? ? 9 non-polymer syn 'ZINC ION' 65.409 9 ? ? ? ? 10 non-polymer syn "5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine" 385.419 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 4 H2B1.1 7 'Dnmt3b,DNA methyltransferase HsaIIIB,DNA MTase HsaIIIB,M.HsaIIIB' 8 'Dnmt3a,DNA methyltransferase HsaIIIA,M.HsaIIIA' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no yes ;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGV(MLY)KPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQ DFKTDLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; ;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKT DLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; A,E ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; B,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;SGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; ;SGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; C,G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MAKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAH YNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; ;MAKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAH YNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; D,H ? 5 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA) (DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DA)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG) (DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT) (DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG) (DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA) (DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DA) (DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DG) (DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DG)(DC) (DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DT) ; ;ATCGGCCGCCACAGGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGG ACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGGC GGCCGAT ; I ? 6 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC) (DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA) (DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG) (DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC) (DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA) (DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA)(DA)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC) (DC)(DT)(DA)(DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC) (DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DG)(DC) (DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DT) ; ;ATCGGCCGCCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTAC GCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCAGATATATACATCCTGTGGC GGCCGAT ; J ? 7 'polypeptide(L)' no no ;DSQQGGMESPQVEADSGDGDSSEYQDGKEFGIGDLVWGKIKGFSWWPAMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFSEVS ADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRKAMYHALEKARVRAGKTFPSSPGDSLEDQLKPMLEWAHGGFKPTGIEGLKPNNT 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WSVPVIRHLFAPLKDYFACE ; V,Z ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MNAVEENQGPGESQKVEEASPPAVQQPTDPASPTVATTPEPVGSDAGDKNATKAGDDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGF SWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSVVCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKL FPVCHDSDESDTAKAVEVQNKPMIEWALGGFQPSGPKGLEPPEEEKNPYKEVYTDMWVEPEAAAYAPPPPAKKPRKSTAE KPKVKEIIDERTRERLVYEVRQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFVGGMCQNCKNCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGG REVLMCGNNNCCRCFCVECVDLLVGPGAAQAAIKEDPWNCYMCGHKGTYGLLRRREDWPSRLQMFFANNHDQEFDPPKVY PPVPAEKRKPIRVLSLFDGIATGLLVLKDLGIQVDRYIASEVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQEWGPFDL VIGGSPCNDLSIVNPARKGLYEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFENVVAMGVSDKRDISRFLESNPVMIDAK EVSAAHRARYFWGNLPGMNRPLASTVNDKLELQECLEHGRIAKFSKVRTITTRSNSIKQGKDQHFPVFMNEKEDILWCTE MERVFGFPVHYTDVSNMSRLARQRLLGRSWSVPVIRHLFAPLKEYFACV ; ;MNAVEENQGPGESQKVEEASPPAVQQPTDPASPTVATTPEPVGSDAGDKNATKAGDDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGF SWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSVVCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKL FPVCHDSDESDTAKAVEVQNKPMIEWALGGFQPSGPKGLEPPEEEKNPYKEVYTDMWVEPEAAAYAPPPPAKKPRKSTAE KPKVKEIIDERTRERLVYEVRQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFVGGMCQNCKNCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGG REVLMCGNNNCCRCFCVECVDLLVGPGAAQAAIKEDPWNCYMCGHKGTYGLLRRREDWPSRLQMFFANNHDQEFDPPKVY PPVPAEKRKPIRVLSLFDGIATGLLVLKDLGIQVDRYIASEVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQEWGPFDL VIGGSPCNDLSIVNPARKGLYEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFENVVAMGVSDKRDISRFLESNPVMIDAK EVSAAHRARYFWGNLPGMNRPLASTVNDKLELQECLEHGRIAKFSKVRTITTRSNSIKQGKDQHFPVFMNEKEDILWCTE MERVFGFPVHYTDVSNMSRLARQRLLGRSWSVPVIRHLFAPLKEYFACV ; K,L ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 9 'ZINC ION' ZN 10 "5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine" SAO # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 ALA n 1 2 ARG n 1 3 THR n 1 4 LYS n 1 5 GLN n 1 6 THR n 1 7 ALA n 1 8 ARG n 1 9 LYS n 1 10 SER n 1 11 THR n 1 12 GLY n 1 13 GLY n 1 14 LYS n 1 15 ALA n 1 16 PRO n 1 17 ARG n 1 18 LYS n 1 19 GLN n 1 20 LEU n 1 21 ALA n 1 22 THR n 1 23 LYS n 1 24 ALA n 1 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n 1 115 LYS n 1 116 ARG n 1 117 VAL n 1 118 THR n 1 119 ILE n 1 120 MET n 1 121 PRO n 1 122 LYS n 1 123 ASP n 1 124 ILE n 1 125 GLN n 1 126 LEU n 1 127 ALA n 1 128 ARG n 1 129 ARG n 1 130 ILE n 1 131 ARG n 1 132 GLY n 1 133 GLU n 1 134 ARG n 1 135 ALA n 2 1 MET n 2 2 SER n 2 3 GLY n 2 4 ARG n 2 5 GLY n 2 6 LYS n 2 7 GLY n 2 8 GLY n 2 9 LYS n 2 10 GLY n 2 11 LEU n 2 12 GLY n 2 13 LYS n 2 14 GLY n 2 15 GLY n 2 16 ALA n 2 17 LYS n 2 18 ARG n 2 19 HIS n 2 20 ARG n 2 21 LYS n 2 22 VAL n 2 23 LEU n 2 24 ARG n 2 25 ASP n 2 26 ASN n 2 27 ILE n 2 28 GLN n 2 29 GLY n 2 30 ILE n 2 31 THR n 2 32 LYS n 2 33 PRO n 2 34 ALA n 2 35 ILE n 2 36 ARG n 2 37 ARG n 2 38 LEU n 2 39 ALA n 2 40 ARG n 2 41 ARG n 2 42 GLY n 2 43 GLY n 2 44 VAL n 2 45 LYS n 2 46 ARG n 2 47 ILE n 2 48 SER n 2 49 GLY n 2 50 LEU n 2 51 ILE n 2 52 TYR n 2 53 GLU n 2 54 GLU n 2 55 THR n 2 56 ARG n 2 57 GLY n 2 58 VAL n 2 59 LEU n 2 60 LYS n 2 61 VAL n 2 62 PHE n 2 63 LEU n 2 64 GLU n 2 65 ASN n 2 66 VAL n 2 67 ILE n 2 68 ARG n 2 69 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UNP Q9UBC3 ? ? insertion 393 14 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 14-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 14 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 44 ? 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K CYS 514 ? 1_555 123.4 ? 10 SG ? M CYS 271 ? K CYS 494 ? 1_555 ZN ? R ZN . ? K ZN 1001 ? 1_555 SG ? M CYS 294 ? K CYS 517 ? 1_555 144.7 ? 11 SG ? M CYS 291 ? K CYS 514 ? 1_555 ZN ? R ZN . ? K ZN 1001 ? 1_555 SG ? M CYS 294 ? K CYS 517 ? 1_555 86.1 ? 12 SG ? M CYS 326 ? K CYS 549 ? 1_555 ZN ? T ZN . ? K ZN 1003 ? 1_555 SG ? M CYS 360 ? K CYS 583 ? 1_555 129.6 ? 13 SG ? M CYS 326 ? K CYS 549 ? 1_555 ZN ? T ZN . ? K ZN 1003 ? 1_555 SG ? M CYS 363 ? K CYS 586 ? 1_555 166.2 ? 14 SG ? M CYS 360 ? K CYS 583 ? 1_555 ZN ? T ZN . ? K ZN 1003 ? 1_555 SG ? M CYS 363 ? K CYS 586 ? 1_555 37.8 ? 15 SG ? N CYS 271 ? L CYS 494 ? 1_555 ZN ? V ZN . ? L ZN 1001 ? 1_555 SG ? N CYS 274 ? L CYS 497 ? 1_555 94.2 ? 16 SG ? N CYS 271 ? L CYS 494 ? 1_555 ZN ? V ZN . ? L ZN 1001 ? 1_555 SG ? N CYS 291 ? L CYS 514 ? 1_555 123.3 ? 17 SG ? N CYS 274 ? L CYS 497 ? 1_555 ZN ? V ZN . ? L ZN 1001 ? 1_555 SG ? N CYS 291 ? L CYS 514 ? 1_555 112.1 ? 18 SG ? N CYS 271 ? L CYS 494 ? 1_555 ZN ? V ZN . ? L ZN 1001 ? 1_555 SG ? N CYS 294 ? L CYS 517 ? 1_555 96.8 ? 19 SG ? N CYS 274 ? L CYS 497 ? 1_555 ZN ? V ZN . ? L ZN 1001 ? 1_555 SG ? N CYS 294 ? L CYS 517 ? 1_555 92.4 ? 20 SG ? N CYS 291 ? L CYS 514 ? 1_555 ZN ? V ZN . ? L ZN 1001 ? 1_555 SG ? N CYS 294 ? L CYS 517 ? 1_555 36.4 ? 21 SG ? N CYS 314 ? L CYS 537 ? 1_555 ZN ? W ZN . ? L ZN 1002 ? 1_555 N ? N CYS 317 ? L CYS 540 ? 1_555 109.4 ? 22 SG ? N CYS 314 ? L CYS 537 ? 1_555 ZN ? W ZN . ? L ZN 1002 ? 1_555 SG ? N CYS 336 ? L CYS 559 ? 1_555 81.1 ? 23 N ? N CYS 317 ? L CYS 540 ? 1_555 ZN ? W ZN . ? L ZN 1002 ? 1_555 SG ? N CYS 336 ? L CYS 559 ? 1_555 161.6 ? 24 SG ? N CYS 314 ? L CYS 537 ? 1_555 ZN ? W ZN . ? L ZN 1002 ? 1_555 SG ? N CYS 339 ? L CYS 562 ? 1_555 114.7 ? 25 N ? N CYS 317 ? L CYS 540 ? 1_555 ZN ? W ZN . ? L ZN 1002 ? 1_555 SG ? N CYS 339 ? L CYS 562 ? 1_555 133.9 ? 26 SG ? N CYS 336 ? L CYS 559 ? 1_555 ZN ? W ZN . ? L ZN 1002 ? 1_555 SG ? N CYS 339 ? L CYS 562 ? 1_555 44.3 ? 27 SG ? N CYS 331 ? L CYS 554 ? 1_555 ZN ? X ZN . ? L ZN 1003 ? 1_555 SG ? N CYS 363 ? L CYS 586 ? 1_555 84.8 ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 MLY A 36 ? . . . . MLY A 36 ? 1_555 . . . . . . . LYS 1 MLY Methylation 'Named protein modification' 2 MLY E 36 ? . . . . MLY E 36 ? 1_555 . . . . . . . LYS 1 MLY Methylation 'Named protein modification' 3 CYS K 268 ? CYS K 271 ? CYS V 458 ? 1_555 CYS V 461 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 4 CYS K 268 ? CYS K 290 ? CYS V 458 ? 1_555 CYS V 480 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 5 CYS K 271 ? CYS K 290 ? CYS V 461 ? 1_555 CYS V 480 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 6 CYS K 271 ? CYS K 293 ? CYS V 461 ? 1_555 CYS V 483 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 7 CYS K 280 ? CYS K 314 ? CYS V 470 ? 1_555 CYS V 504 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 8 CYS K 285 ? CYS K 314 ? CYS V 475 ? 1_555 CYS V 504 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 9 CYS M 274 ? CYS M 294 ? CYS K 497 ? 1_555 CYS K 517 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 10 CYS M 314 ? CYS M 336 ? CYS K 537 ? 1_555 CYS K 559 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 11 CYS M 314 ? CYS M 339 ? CYS K 537 ? 1_555 CYS K 562 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 12 CYS M 317 ? CYS M 336 ? CYS K 540 ? 1_555 CYS K 559 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 13 CYS M 331 ? CYS M 360 ? CYS K 554 ? 1_555 CYS K 583 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 14 CYS M 336 ? CYS M 339 ? CYS K 559 ? 1_555 CYS K 562 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 15 CYS N 317 ? CYS N 336 ? CYS L 540 ? 1_555 CYS L 559 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 16 CYS N 326 ? CYS N 360 ? CYS L 549 ? 1_555 CYS L 583 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 17 CYS N 360 ? CYS N 363 ? CYS L 583 ? 1_555 CYS L 586 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLU 310 K . ? GLU 500 V PRO 311 K ? PRO 501 V 1 -0.82 2 GLN 192 M . ? GLN 141 K PRO 193 M ? PRO 142 K 1 -3.57 3 GLN 192 N . ? GLN 141 L PRO 193 N ? PRO 142 L 1 -2.80 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 3 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 3 ? AC4 ? 5 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 3 ? AC8 ? 3 ? AC9 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA2 1 2 ? parallel AA3 1 2 ? parallel AA4 1 2 ? parallel AA5 1 2 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB3 1 2 ? parallel AB3 2 3 ? parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ARG A 83 ? 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THR K 591 TYR K 592 AB9 2 LEU M 372 ? ARG M 373 ? LEU K 595 ARG K 596 AC1 1 ILE M 411 ? LEU M 414 ? ILE K 634 LEU K 637 AC1 2 VAL M 434 ? ILE M 438 ? VAL K 657 ILE K 661 AC1 3 ILE M 458 ? MET M 459 ? ILE K 681 MET K 682 AC2 1 LEU M 531 ? VAL M 535 ? LEU K 754 VAL K 758 AC2 2 ALA M 568 ? GLY M 573 ? ALA K 791 GLY K 796 AC2 3 MET M 556 ? ASP M 558 ? MET K 779 ASP K 781 AC3 1 ARG M 600 ? ALA M 602 ? ARG K 823 ALA K 825 AC3 2 VAL M 627 ? MET M 629 ? VAL K 850 MET K 852 AC3 3 LYS M 632 ? ASP M 634 ? LYS K 855 ASP K 857 AC4 1 PHE N 113 ? CYS N 117 ? PHE L 62 CYS L 66 AC4 2 THR N 102 ? TRP N 107 ? THR L 51 TRP L 56 AC4 3 TRP N 83 ? ILE N 87 ? TRP L 32 ILE L 36 AC4 4 VAL N 73 ? GLY N 75 ? VAL L 22 GLY L 24 AC4 5 MET N 122 ? PRO N 123 ? MET L 71 PRO L 72 AC5 1 VAL N 323 ? MET N 325 ? VAL L 546 MET L 548 AC5 2 CYS N 334 ? CYS N 336 ? CYS L 557 CYS L 559 AC6 1 THR N 368 ? TYR N 369 ? THR L 591 TYR L 592 AC6 2 LEU N 372 ? ARG N 373 ? LEU L 595 ARG L 596 AC7 1 VAL N 434 ? TYR N 437 ? 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