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EMDB EMD-53265 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2026-01-28 ? 2 'EM metadata' 1 0 2026-01-28 ? 3 Image 1 0 2026-01-28 ? 4 'Primary map' 1 0 2026-01-28 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'EM metadata' repository 'Initial release' ? ? 3 3 Image repository 'Initial release' ? ? 4 4 'Primary map' repository 'Initial release' ? ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9QOO _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2025-03-26 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type EMDB 'Consensus refinement used for subsequent local refinements. 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; 2 polymer man Akirin-2 22525.582 4 ? ? ? ? 3 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-3' 28469.252 1 ? ? ? ? 4 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-6' 27432.459 1 ? ? ? ? 5 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-2' 25927.535 1 ? ? ? ? 6 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-4' 29525.842 1 ? ? ? ? 7 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-7' 27929.891 1 ? ? ? ? 8 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-5' 26435.977 1 ? ? ? ? 9 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-1' 29595.627 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'Imp9,Ran-binding protein 9,RanBP9' 3 'Macropain subunit C8,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C8,Proteasome component C8' 4 '27 kDa prosomal protein,p27K,Macropain iota chain,Multicatalytic endopeptidase complex iota chain,Proteasome iota chain' 5 'Macropain subunit C3,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C3,Proteasome component C3' 6 'Macropain subunit C9,Multicatalytic endopeptidase complex 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;MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVM TGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYY CGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRILTEAEIDAHLV ALAERD ; ;MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVM TGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYY CGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRILTEAEIDAHLV ALAERD ; G ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MAERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMG PDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKA TAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA ; ;MAERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMG PDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKA TAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA ; O ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGIT SDANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWK ATCIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKVEIATLTRENGKTVIRVLKQKEVEQLIKKH EEEEAKAEREKKEKEQKEKDK ; ;MSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGIT SDANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWK ATCIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKVEIATLTRENGKTVIRVLKQKEVEQLIKKH EEEEAKAEREKKEKEQKEKDK ; P ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADA RIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANA IGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLTIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQSLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENE KKKQKKAS ; ;MSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADA RIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANA IGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLTIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQSLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENE KKKQKKAS ; Q ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MFLTRSEYDRGVNTFSPEGRLFQVEYAIEAIKLGSTAIGIQTSEGVCLAVEKRITSPLMEPSSIEKIVEIDAHIGCAMSG LIADAKTLIDKARVETQNHWFTYNETMTVESVTQAVSNLALQFGEEDADPGAMSRPFGVALLFGGVDEKGPQLFHMDPSG TFVQCDARAIGSASEGAQSSLQEVYHKSMTLKEAIKSSLIILKQVMEEKLNATNIELATVQPGQNFHMFTKEELEEVIKD I ; ;MFLTRSEYDRGVNTFSPEGRLFQVEYAIEAIKLGSTAIGIQTSEGVCLAVEKRITSPLMEPSSIEKIVEIDAHIGCAMSG LIADAKTLIDKARVETQNHWFTYNETMTVESVTQAVSNLALQFGEEDADPGAMSRPFGVALLFGGVDEKGPQLFHMDPSG TFVQCDARAIGSASEGAQSSLQEVYHKSMTLKEAIKSSLIILKQVMEEKLNATNIELATVQPGQNFHMFTKEELEEVIKD I ; R ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MFRNQYDNDVTVWSPQGRIHQIEYAMEAVKQGSATVGLKSKTHAVLVALKRAQSELAAHQKKILHVDNHIGISIAGLTAD ARLLCNFMRQECLDSRFVFDRPLPVSRLVSLIGSKTQIPTQRYGRRPYGVGLLIAGYDDMGPHIFQTCPSANYFDCRAMS 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ALA O 159 MET O 162 AA6 2 SER H 35 ? LYS H 39 ? SER O 34 LYS O 38 AA6 3 VAL H 44 ? THR H 48 ? VAL O 43 THR O 47 AA6 4 GLY H 211 ? ASN H 214 ? GLY O 210 ASN O 213 AA6 5 GLY H 217 ? ARG H 220 ? GLY O 216 ARG O 219 AA7 1 GLU H 66 ? PRO H 67 ? GLU O 65 PRO O 66 AA7 2 ILE H 72 ? GLY H 78 ? ILE O 71 GLY O 77 AA7 3 VAL H 132 ? TRP H 139 ? VAL O 131 TRP O 138 AA7 4 PRO H 144 ? SER H 149 ? PRO O 143 SER O 148 AA7 5 TYR H 155 ? ALA H 157 ? TYR O 154 ALA O 156 AA8 1 ALA I 161 ? ILE I 164 ? ALA P 161 ILE P 164 AA8 2 CYS I 34 ? ALA I 39 ? CYS P 34 ALA P 39 AA8 3 GLY I 42 ? GLU I 48 ? GLY P 42 GLU P 48 AA8 4 VAL I 211 ? GLU I 219 ? VAL P 211 GLU P 219 AA8 5 LYS I 222 ? VAL I 227 ? LYS P 222 VAL P 227 AA9 1 ILE I 65 ? LYS I 67 ? ILE P 65 LYS P 67 AA9 2 MET I 72 ? GLY I 78 ? MET P 72 GLY P 78 AA9 3 VAL I 132 ? ASP I 140 ? VAL P 132 ASP P 140 AA9 4 GLY I 144 ? SER I 150 ? GLY P 144 SER P 150 AA9 5 TYR I 156 ? GLY I 158 ? TYR P 156 GLY P 158 AB1 1 PHE J 10 ? SER J 11 ? 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