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N 4 IHP 1 901 400 IHP IHP E . # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 9R4I _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 9R4I _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? 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_refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'REAL-SPACE (WEIGHTED MAP SUM AT ATOM CENTERS)' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.475 ? 14506 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.558 ? 1499 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.037 ? 1532 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 1865 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 9R4I _struct.title 'An auto inhibitory loop in the MiDAC histone deacetylase complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9R4I _struct_keywords.text 'HDAC1 DNTTIP1 MIDEAS histone deacetylase complex, GENE REGULATION' _struct_keywords.pdbx_keywords 'GENE REGULATION' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 5 ? I N N 6 ? J N N 6 ? K N N 5 ? L N N 6 ? M N N 6 ? N N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP HDAC1_HUMAN Q13547 ? 1 ;MAQTQGTRRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIR PDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAI LELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAI FKPVMSKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVKSFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVAL DTEIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEDD PDKRISICSSDKRIACEEEFSDSEEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPEAKGVKEEVK LA ; 1 2 UNP MDEAS_HUMAN Q6PJG2 ? 2 ;TPYQSHLRSPVRLADHPSERSFELPPYTPPPILSPVREGSGLYFNAIISTSTIPAPPPITPKSAHRTLLRTNSAEVTPPV LSVMGEATPVSIEPRINVGSRFQAEIPLMRDRALAAADPHKADLVWQPWEDLESSREKQRQVEDLLTAACSSIFPGAGTN QELALHCLHESRGDILETLNKLLLKKPLRPHNHPLATYHYTGSDQWKMAERKLFNKGIAIYKKDFFLVQKLIQTKTVAQC VEFYYTYKKQVKIGRNGTLT ; 628 3 UNP TDIF1_HUMAN Q9H147 ? 3 ;MGATGDAEQPRGPSGAERGGLELGDAGAAGQLVLTNPWNIMIKHRQVQRRGRRSQMTTSFTDPAISMDLLRAVLQPSINE EIQTVFNKYMKFFQKAALNVRDNVGEEVDAEQLIQEACRSCLEQAKLLFSDGEKVIPRLTHELPGIKRGRQAEEECAHRG SPLPKKRKGRPPGHILSSDRAAAGMVWKPKSCEPIRREGPKWDPARLNESTTFVLGSRANKALGMGGTRGRIYIKHPHLF KYAADPQDKHWLAEQHHMRATGGKMAYLLIEEDIRDLAASDDYRGCLDLKLEELKSFVLPSWMVEKMRKYMETLRTENEH RAVEAPPQT ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9R4I A 1 ? 482 ? 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SER D 69 ILE D 79 1 ? 11 HELX_P HELX_P30 AD3 ARG D 80 ? MET D 84 ? ARG D 80 MET D 84 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 AD4 TYR D 87 ? ASN D 95 ? TYR D 87 ASN D 95 1 ? 9 HELX_P HELX_P32 AD5 GLY D 105 ? LYS D 126 ? GLY D 105 LYS D 126 1 ? 22 HELX_P HELX_P33 AD6 ASN D 154 ? LYS D 165 ? ASN D 154 LYS D 165 1 ? 12 HELX_P HELX_P34 AD7 GLY D 180 ? PHE D 187 ? GLY D 180 PHE D 187 1 ? 8 HELX_P HELX_P35 AD8 ASP D 233 ? PHE D 252 ? ASP D 233 PHE D 252 1 ? 20 HELX_P HELX_P36 AD9 GLY D 262 ? LEU D 266 ? GLY D 262 LEU D 266 5 ? 5 HELX_P HELX_P37 AE1 THR D 277 ? SER D 290 ? THR D 277 SER D 290 1 ? 14 HELX_P HELX_P38 AE2 THR D 304 ? ASP D 321 ? THR D 304 ASP D 321 1 ? 18 HELX_P HELX_P39 AE3 TYR D 333 ? PHE D 337 ? TYR D 333 PHE D 337 5 ? 5 HELX_P HELX_P40 AE4 THR D 355 ? MET D 372 ? THR D 355 MET D 372 1 ? 18 HELX_P HELX_P41 AE5 ASP E 111 ? ALA E 117 ? ASP E 738 ALA E 744 5 ? 7 HELX_P HELX_P42 AE6 SER E 135 ? ALA E 149 ? SER E 762 ALA E 776 1 ? 15 HELX_P HELX_P43 AE7 PHE E 154 ? GLY E 158 ? 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ASP F 109 ASP F 131 1 ? 23 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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