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_refine.pdbx_ls_cross_valid_method NONE _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.5830 ? 59676 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0446 ? 6828 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0052 ? 7842 ? f_plane_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.7570 ? 6000 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? # _struct.entry_id 9RKS _struct.title 'Agrobacterium phage 7-7-1 neck 2 + tail terminator + tail sheath + tail tube' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9RKS _struct_keywords.text 'Flagella phage, Agrobacterium sp. H13-3, neck 2 + tail terminator + sheath + tail, VIRUS' _struct_keywords.pdbx_keywords VIRUS # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 2 ? J N N 2 ? K N N 2 ? L N N 2 ? M N N 3 ? N N N 4 ? O N N 3 ? P N N 4 ? 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J7FA80 1 ? 503 ? 1 503 24 4 9RKS X 1 ? 136 ? J7F8Z8 1 ? 136 ? 1 136 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 24-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 24 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 14 ? 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ASN A 178 GLY A 180 5 ? 3 HELX_P HELX_P31 AD4 ASP M 208 ? VAL M 213 ? ASP A 208 VAL A 213 1 ? 6 HELX_P HELX_P32 AD5 ASP M 227 ? ASP M 243 ? ASP A 227 ASP A 243 1 ? 17 HELX_P HELX_P33 AD6 THR M 260 ? ALA M 266 ? THR A 260 ALA A 266 1 ? 7 HELX_P HELX_P34 AD7 LEU M 286 ? CYS M 300 ? LEU A 286 CYS A 300 1 ? 15 HELX_P HELX_P35 AD8 GLU M 332 ? ASN M 341 ? GLU A 332 ASN A 341 1 ? 10 HELX_P HELX_P36 AD9 ALA M 385 ? GLN M 403 ? ALA A 385 GLN A 403 1 ? 19 HELX_P HELX_P37 AE1 GLN M 404 ? ASN M 406 ? GLN A 404 ASN A 406 5 ? 3 HELX_P HELX_P38 AE2 ASN M 425 ? VAL M 441 ? ASN A 425 VAL A 441 1 ? 17 HELX_P HELX_P39 AE3 ASN M 450 ? ASP M 454 ? ASN A 450 ASP A 454 1 ? 5 HELX_P HELX_P40 AE4 PHE M 461 ? VAL M 463 ? PHE A 461 VAL A 463 5 ? 3 HELX_P HELX_P41 AE5 PRO N 75 ? GLN N 80 ? PRO N 75 GLN N 80 5 ? 6 HELX_P HELX_P42 AE6 GLN O 3 ? SER O 7 ? GLN C 3 SER C 7 5 ? 5 HELX_P HELX_P43 AE7 SER O 62 ? CYS O 75 ? SER C 62 CYS C 75 1 ? 14 HELX_P HELX_P44 AE8 LYS O 138 ? ALA O 142 ? 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ASN E 425 ASN E 440 1 ? 16 HELX_P HELX_P73 AI1 ASN Q 450 ? ASP Q 454 ? ASN E 450 ASP E 454 1 ? 5 HELX_P HELX_P74 AI2 PHE Q 461 ? VAL Q 463 ? PHE E 461 VAL E 463 5 ? 3 HELX_P HELX_P75 AI3 PRO R 75 ? GLN R 80 ? PRO h 75 GLN h 80 1 ? 6 HELX_P HELX_P76 AI4 GLN S 3 ? SER S 7 ? GLN Z 3 SER Z 7 5 ? 5 HELX_P HELX_P77 AI5 SER S 62 ? CYS S 75 ? SER Z 62 CYS Z 75 1 ? 14 HELX_P HELX_P78 AI6 LYS S 138 ? ALA S 142 ? LYS Z 138 ALA Z 142 5 ? 5 HELX_P HELX_P79 AI7 THR S 167 ? LEU S 172 ? THR Z 167 LEU Z 172 5 ? 6 HELX_P HELX_P80 AI8 ASP S 208 ? VAL S 213 ? ASP Z 208 VAL Z 213 1 ? 6 HELX_P HELX_P81 AI9 ASP S 227 ? ASP S 243 ? ASP Z 227 ASP Z 243 1 ? 17 HELX_P HELX_P82 AJ1 THR S 260 ? ALA S 266 ? THR Z 260 ALA Z 266 1 ? 7 HELX_P HELX_P83 AJ2 LEU S 286 ? ALA S 299 ? LEU Z 286 ALA Z 299 1 ? 14 HELX_P HELX_P84 AJ3 GLU S 332 ? ASN S 341 ? GLU Z 332 ASN Z 341 1 ? 10 HELX_P HELX_P85 AJ4 ASP S 384 ? GLN S 403 ? ASP Z 384 GLN Z 403 1 ? 20 HELX_P HELX_P86 AJ5 GLN S 404 ? ASN S 406 ? 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ALA d 299 GLU d 304 1 ? 6 HELX_P HELX_P115 AM7 GLN W 311 ? GLY W 316 ? GLN d 311 GLY d 316 1 ? 6 HELX_P HELX_P116 AM8 GLU W 332 ? ASN W 341 ? GLU d 332 ASN d 341 1 ? 10 HELX_P HELX_P117 AM9 ALA W 385 ? GLN W 403 ? ALA d 385 GLN d 403 1 ? 19 HELX_P HELX_P118 AN1 GLN W 404 ? ASN W 406 ? GLN d 404 ASN d 406 5 ? 3 HELX_P HELX_P119 AN2 ASN W 425 ? ASN W 440 ? ASN d 425 ASN d 440 1 ? 16 HELX_P HELX_P120 AN3 ASN W 450 ? ASP W 454 ? ASN d 450 ASP d 454 1 ? 5 HELX_P HELX_P121 AN4 THR X 51 ? GLY X 53 ? THR X 51 GLY X 53 5 ? 3 HELX_P HELX_P122 AN5 PRO X 75 ? GLN X 80 ? 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V CYS 82 X CYS 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 CYS N 43 ? 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None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 LYS 52 A . ? LYS 52 F PRO 53 A ? PRO 53 F 1 -7.91 2 LYS 52 B . ? LYS 52 G PRO 53 B ? PRO 53 G 1 -5.49 3 LYS 52 C . ? LYS 52 H PRO 53 C ? PRO 53 H 1 -7.57 4 LYS 52 D . ? LYS 52 I PRO 53 D ? PRO 53 I 1 -7.78 5 LYS 52 E . ? LYS 52 J PRO 53 E ? PRO 53 J 1 -6.74 6 LYS 52 F . ? LYS 52 K PRO 53 F ? 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