data_9RKU # _entry.id 9RKU # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.409 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 9RKU pdb_00009rku 10.2210/pdb9rku/pdb WWPDB D_1292148573 ? ? EMDB EMD-54021 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2025-12-10 ? 2 'EM metadata' 1 0 2025-12-10 ? 3 FSC 1 0 2025-12-10 ? 4 'Half map' 1 0 2025-12-10 1 5 'Half map' 1 0 2025-12-10 2 6 Image 1 0 2025-12-10 ? 7 'Primary map' 1 0 2025-12-10 ? 8 'Structure model' 1 1 2025-12-17 ? 9 'EM metadata' 1 1 2025-12-17 ? 10 'Structure model' 1 2 2026-01-21 ? 11 'EM metadata' 1 2 2026-01-21 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'EM metadata' 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'_citation.journal_id_ISSN' 14 9 'EM metadata' '_citation.pdbx_database_id_DOI' 15 9 'EM metadata' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 16 9 'EM metadata' '_citation.title' 17 9 'EM metadata' '_citation.year' 18 9 'EM metadata' '_em_admin.last_update' 19 10 'Structure model' '_citation.journal_volume' 20 10 'Structure model' '_citation.page_first' 21 10 'Structure model' '_citation.page_last' 22 10 'Structure model' '_em_admin.last_update' 23 11 'EM metadata' '_citation.journal_volume' 24 11 'EM metadata' '_citation.page_first' 25 11 'EM metadata' '_citation.page_last' 26 11 'EM metadata' '_em_admin.last_update' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9RKU _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2025-06-14 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Agrobacterium phage 7-7-1 baseplate' _pdbx_database_related.db_id EMD-54021 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email ariane.briegel@pasteur.fr _pdbx_contact_author.name_first Ariane _pdbx_contact_author.name_last Briegel _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0003-3733-3725 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Noteborn, W.E.M.' 1 0000-0003-1211-6222 'Hoeksma, T.' 2 0009-0004-2953-5516 'Briegel, A.' 3 0000-0003-3733-3725 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? 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0009-0004-2953-5516 primary 'Sidi Mabrouk, A.' 4 0000-0002-7000-0386 primary 'Esteves, N.C.' 5 ? primary 'Pelt, D.M.' 6 0000-0002-8253-0851 primary 'Scharf, B.E.' 7 0000-0001-6271-8972 primary 'Briegel, A.' 8 0000-0003-3733-3725 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Baseplate protein' 20893.727 3 ? ? ? ? 2 polymer nat 'Putative tail biosynthetic protein' 49304.430 3 ? ? ? ? 3 polymer nat 'Structural protein' 31473.984 6 ? ? ? ? 4 polymer nat 'Baseplate protein' 43428.816 12 ? ? ? ? 5 polymer nat 'Putative tail biosynthetic protein' 43729.598 6 ? ? ? ? 6 polymer nat 'Putative structural protein' 19321.740 6 ? ? ? ? 7 polymer nat 'Tail sheath protein' 54120.355 12 ? ? ? ? 8 polymer nat 'Structural protein' 14503.347 12 ? ? ? ? # _entity_name_com.entity_id 8 _entity_name_com.name 'Tail tube protein' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MTTTKTFDERNRDTQDGFERHVFRKLDHTDTGAIVTVEGSGTMDEDVPVINSGYGFNPEDDEELEVFLLSDGSDASGKFG VMTIPRNKQRKWPKKTGGIQHPFNADKFVQLDDDSIWLKDGKFTLGDNRSLSITVEGNNVVIDTGGGELDIRSSKLMHNG VNIGDSHVHPQQADSDGDTEADTDPPKRD ; ;MTTTKTFDERNRDTQDGFERHVFRKLDHTDTGAIVTVEGSGTMDEDVPVINSGYGFNPEDDEELEVFLLSDGSDASGKFG VMTIPRNKQRKWPKKTGGIQHPFNADKFVQLDDDSIWLKDGKFTLGDNRSLSITVEGNNVVIDTGGGELDIRSSKLMHNG VNIGDSHVHPQQADSDGDTEADTDPPKRD ; Ac,Ad,Ae ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MIKPMRIFIGGEELETYTSARLQRTKKQLTGSLTVEIFLNYVPSKPVIVNAVRGKEILVYVMGELAFTGIIDKRKGKTVA GSQPRDASGRFAYSGGPGSMSDEGGSDVTVNFAKGQGYSVTLTARGRTKYLVDSSHSHPTGSFKDTSDRKVIEALVKEHK VVLDWQGTEVKEPKITLRDGNRIFNEIFERCNQNCHFAYETRDGKLLVTDGTTGVVGEDIVLGQNILDFSAEQSEDRANS 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KFTILRNIINWSSSHSELDGESADAQNAIFSAVRVLATAYLSKAYMETVASTVNEGLAQYDQIAAILEQEAQIAQEDCHD NEFFLSIREFSVSVARVMVNRAYNSPALIVYSFPGTMHSLVVAWEIFGDAKRSRELEGRNTGAPWAIGPKVIAERVRA ; A1,A2,A3,A4,A5,A6 ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MTCNFETADRRKRFWTTQVAACGQSSDDCGDCARPGLQLLCNGEGRITIATDNYVAGLALNILLTDASKADTGCGWTPGN RGGFWGDSFRSDNMRSGSKIRQVTARGSMRETVALIRAYAIDDLKKLVAYGVAKSVDVDLTYQGSNKIDMTIMIQGVDGN ESRVGLTGERIANAWVWS ; ;MTCNFETADRRKRFWTTQVAACGQSSDDCGDCARPGLQLLCNGEGRITIATDNYVAGLALNILLTDASKADTGCGWTPGN RGGFWGDSFRSDNMRSGSKIRQVTARGSMRETVALIRAYAIDDLKKLVAYGVAKSVDVDLTYQGSNKIDMTIMIQGVDGN ESRVGLTGERIANAWVWS ; A7,A8,A9,A0,BA,BB ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MAQDALSDGFVRLCIDPSLNFFGEGCKILVEGQITDDATAAENVVTCVNSELDLVERFGQGSVLTESLRKVFCMCKSGVS VYALPRADAAAAVSAVYTLTVTGTALTDGRVQLYMGEAEYSLDIGVDEGDTPTQIAAKIVAAISPDFPYEATAAAGVITL TARNGGTIGNHLSVIYTNLGSCTSVTPEGVTVAFAQTTPGSVNPEPNDYASVVNECCFAVYVLSSDDTDWQENLRDWIRS AWDCSKPQCFGHGYVFNKGTLGQVLADGDNSAELSRLALPTTYPVLPYLTNAAYGALSACSTCENPELNVQGQTYGLLSC 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GCAQIDAQVEKFDGTVMTLTEGAVTEPEESDGRAVTMTIIAAEIDELLPPGSLAAA ; BO,BP,BQ,BR,BS,BT,BU,BV,BW,BX,BY,BZ ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 THR n 1 3 THR n 1 4 THR n 1 5 LYS n 1 6 THR n 1 7 PHE n 1 8 ASP n 1 9 GLU n 1 10 ARG n 1 11 ASN n 1 12 ARG n 1 13 ASP n 1 14 THR n 1 15 GLN n 1 16 ASP n 1 17 GLY n 1 18 PHE n 1 19 GLU n 1 20 ARG n 1 21 HIS n 1 22 VAL n 1 23 PHE n 1 24 ARG n 1 25 LYS n 1 26 LEU n 1 27 ASP n 1 28 HIS n 1 29 THR n 1 30 ASP n 1 31 THR n 1 32 GLY n 1 33 ALA n 1 34 ILE n 1 35 VAL n 1 36 THR n 1 37 VAL n 1 38 GLU n 1 39 GLY n 1 40 SER n 1 41 GLY n 1 42 THR n 1 43 MET n 1 44 ASP n 1 45 GLU n 1 46 ASP n 1 47 VAL n 1 48 PRO n 1 49 VAL n 1 50 ILE n 1 51 ASN n 1 52 SER n 1 53 GLY n 1 54 TYR n 1 55 GLY n 1 56 PHE n 1 57 ASN n 1 58 PRO n 1 59 GLU n 1 60 ASP n 1 61 ASP n 1 62 GLU n 1 63 GLU n 1 64 LEU n 1 65 GLU n 1 66 VAL n 1 67 PHE n 1 68 LEU n 1 69 LEU n 1 70 SER n 1 71 ASP n 1 72 GLY n 1 73 SER n 1 74 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.4225 ? 200811 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0414 ? 22878 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0027 ? 26571 ? f_plane_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.1664 ? 20370 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? # _struct.entry_id 9RKU _struct.title 'Agrobacterium phage 7-7-1 baseplate' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9RKU _struct_keywords.text 'Flagella phage, Agrobacterium sp. H13-3, Baseplate, VIRUS' _struct_keywords.pdbx_keywords VIRUS # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 3 ? I N N 3 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 3 ? M N N 4 ? N N N 4 ? O N N 4 ? P N N 4 ? Q N N 4 ? R N N 4 ? S N N 4 ? T N N 4 ? U N N 4 ? V N N 4 ? W N N 4 ? 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J7F8X4 1 ? 396 ? 1 396 23 4 9RKU Ay 1 ? 396 ? J7F8X4 1 ? 396 ? 1 396 24 4 9RKU Az 1 ? 396 ? J7F8X4 1 ? 396 ? 1 396 25 5 9RKU A1 1 ? 398 ? J7FAD8 1 ? 398 ? 1 398 26 5 9RKU A2 1 ? 398 ? J7FAD8 1 ? 398 ? 1 398 27 5 9RKU A3 1 ? 398 ? J7FAD8 1 ? 398 ? 1 398 28 5 9RKU A4 1 ? 398 ? J7FAD8 1 ? 398 ? 1 398 29 5 9RKU A5 1 ? 398 ? J7FAD8 1 ? 398 ? 1 398 30 5 9RKU A6 1 ? 398 ? J7FAD8 1 ? 398 ? 1 398 31 6 9RKU A7 1 ? 178 ? J7FA56 1 ? 178 ? 1 178 32 6 9RKU A8 1 ? 178 ? J7FA56 1 ? 178 ? 1 178 33 6 9RKU A9 1 ? 178 ? J7FA56 1 ? 178 ? 1 178 34 6 9RKU A0 1 ? 178 ? J7FA56 1 ? 178 ? 1 178 35 6 9RKU BA 1 ? 178 ? J7FA56 1 ? 178 ? 1 178 36 6 9RKU BB 1 ? 178 ? J7FA56 1 ? 178 ? 1 178 37 7 9RKU BN 1 ? 503 ? J7FA80 1 ? 503 ? 1 503 38 8 9RKU BO 1 ? 136 ? J7F8Z8 1 ? 136 ? 1 136 39 7 9RKU BC 1 ? 503 ? J7FA80 1 ? 503 ? 1 503 40 8 9RKU BP 1 ? 136 ? J7F8Z8 1 ? 136 ? 1 136 41 7 9RKU BD 1 ? 503 ? J7FA80 1 ? 503 ? 1 503 42 8 9RKU BQ 1 ? 136 ? J7F8Z8 1 ? 136 ? 1 136 43 7 9RKU BE 1 ? 503 ? 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Ak CYS 206 At CYS 282 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf10 disulf ? ? J CYS 75 SG ? ? ? 1_555 JA CYS 22 SG ? ? Al CYS 75 BB CYS 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf11 disulf ? ? J CYS 130 SG ? ? ? 1_555 R CYS 302 SG ? ? Al CYS 130 At CYS 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf12 disulf ? ? J CYS 206 SG ? ? ? 1_555 M CYS 282 SG ? ? Al CYS 206 Ao CYS 282 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf13 disulf ? ? K CYS 75 SG ? ? ? 1_555 EA CYS 22 SG ? ? Am CYS 75 A7 CYS 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf14 disulf ? ? K CYS 130 SG ? ? ? 1_555 M CYS 302 SG ? ? Am CYS 130 Ao CYS 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf15 disulf ? ? K CYS 206 SG ? ? ? 1_555 N CYS 282 SG ? ? Am CYS 206 Ap CYS 282 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf16 disulf ? ? L CYS 75 SG ? ? ? 1_555 FA CYS 22 SG ? ? An CYS 75 A8 CYS 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf17 disulf ? ? L CYS 130 SG ? ? ? 1_555 N CYS 302 SG ? ? An CYS 130 Ap CYS 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf18 disulf ? ? L CYS 206 SG ? ? ? 1_555 O CYS 282 SG ? ? An CYS 206 Aq CYS 282 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf19 disulf ? ? M CYS 234 SG ? ? ? 1_555 T CYS 282 SG ? ? Ao CYS 234 Av CYS 282 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf20 disulf ? ? N CYS 234 SG ? ? ? 1_555 S CYS 282 SG ? ? Ap CYS 234 Au CYS 282 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf21 disulf ? ? O CYS 234 SG ? ? ? 1_555 X CYS 282 SG ? ? Aq CYS 234 Az CYS 282 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf22 disulf ? ? P CYS 234 SG ? ? ? 1_555 W CYS 282 SG ? ? Ar CYS 234 Ay CYS 282 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf23 disulf ? ? Q CYS 234 SG ? ? ? 1_555 V CYS 282 SG ? ? As CYS 234 Ax CYS 282 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf24 disulf ? ? R CYS 234 SG ? ? ? 1_555 U CYS 282 SG ? ? At CYS 234 Aw CYS 282 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf25 disulf ? ? LA CYS 3 SG ? ? ? 1_555 HB CYS 19 SG ? ? BO CYS 3 BZ CYS 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf26 disulf ? ? LA CYS 43 SG ? ? ? 1_555 FB CYS 82 SG ? ? BO CYS 43 BY CYS 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf27 disulf ? ? LA CYS 82 SG ? ? ? 1_555 PA CYS 43 SG ? ? BO CYS 82 BQ CYS 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf28 disulf ? ? NA CYS 43 SG ? ? ? 1_555 HB CYS 82 SG ? ? BP CYS 43 BZ CYS 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf29 disulf ? ? PA CYS 82 SG ? ? ? 1_555 TA CYS 43 SG ? ? BQ CYS 82 BS CYS 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf30 disulf ? ? RA CYS 19 SG ? ? ? 1_555 TA CYS 3 SG ? ? BR CYS 19 BS CYS 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf31 disulf ? ? RA CYS 82 SG ? ? ? 1_555 VA CYS 43 SG ? ? BR CYS 82 BT CYS 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf32 disulf ? ? TA CYS 82 SG ? ? ? 1_555 XA CYS 43 SG ? ? BS CYS 82 BU CYS 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf33 disulf ? ? VA CYS 19 SG ? ? ? 1_555 XA CYS 3 SG ? ? BT CYS 19 BU CYS 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf34 disulf ? ? VA CYS 82 SG ? ? ? 1_555 ZA CYS 43 SG ? ? BT CYS 82 BV CYS 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf35 disulf ? ? XA CYS 82 SG ? ? ? 1_555 BB CYS 43 SG ? ? BU CYS 82 BW CYS 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf36 disulf ? ? ZA CYS 19 SG ? ? ? 1_555 BB CYS 3 SG ? ? BV CYS 19 BW CYS 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf37 disulf ? ? ZA CYS 82 SG ? ? ? 1_555 DB CYS 43 SG ? ? BV CYS 82 BX CYS 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf38 disulf ? ? BB CYS 82 SG ? ? ? 1_555 FB CYS 43 SG ? ? BW CYS 82 BY CYS 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf39 disulf ? ? DB CYS 19 SG ? ? ? 1_555 FB CYS 3 SG ? ? BX CYS 19 BY CYS 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf40 disulf ? ? DB CYS 82 SG ? ? ? 1_555 HB CYS 43 SG ? ? BX CYS 82 BZ CYS 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 CYS BB 82 ? CYS FB 43 ? CYS BW 82 ? 1_555 CYS BY 43 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 2 CYS DB 19 ? CYS FB 3 ? CYS BX 19 ? 1_555 CYS BY 3 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 3 CYS DB 82 ? CYS HB 43 ? CYS BX 82 ? 1_555 CYS BZ 43 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 4 CYS G 75 ? CYS GA 22 ? CYS Ai 75 ? 1_555 CYS A9 22 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 5 CYS G 130 ? CYS O 302 ? CYS Ai 130 ? 1_555 CYS Aq 302 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 6 CYS G 206 ? CYS P 282 ? CYS Ai 206 ? 1_555 CYS Ar 282 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 7 CYS H 75 ? CYS HA 22 ? CYS Aj 75 ? 1_555 CYS A0 22 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 8 CYS H 130 ? CYS P 302 ? CYS Aj 130 ? 1_555 CYS Ar 302 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 9 CYS H 206 ? CYS Q 282 ? CYS Aj 206 ? 1_555 CYS As 282 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 10 CYS I 75 ? CYS IA 22 ? CYS Ak 75 ? 1_555 CYS BA 22 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 11 CYS I 130 ? CYS Q 302 ? CYS Ak 130 ? 1_555 CYS As 302 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 12 CYS I 206 ? CYS R 282 ? CYS Ak 206 ? 1_555 CYS At 282 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 13 CYS J 75 ? CYS JA 22 ? CYS Al 75 ? 1_555 CYS BB 22 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 14 CYS J 130 ? CYS R 302 ? CYS Al 130 ? 1_555 CYS At 302 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 15 CYS J 206 ? CYS M 282 ? CYS Al 206 ? 1_555 CYS Ao 282 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 16 CYS K 75 ? CYS EA 22 ? CYS Am 75 ? 1_555 CYS A7 22 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 17 CYS K 130 ? CYS M 302 ? CYS Am 130 ? 1_555 CYS Ao 302 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 18 CYS K 206 ? CYS N 282 ? CYS Am 206 ? 1_555 CYS Ap 282 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 19 CYS L 75 ? CYS FA 22 ? CYS An 75 ? 1_555 CYS A8 22 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 20 CYS L 130 ? CYS N 302 ? CYS An 130 ? 1_555 CYS Ap 302 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 21 CYS L 206 ? CYS O 282 ? CYS An 206 ? 1_555 CYS Aq 282 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 22 CYS LA 3 ? CYS HB 19 ? CYS BO 3 ? 1_555 CYS BZ 19 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 23 CYS LA 43 ? CYS FB 82 ? CYS BO 43 ? 1_555 CYS BY 82 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 24 CYS LA 82 ? CYS PA 43 ? CYS BO 82 ? 1_555 CYS BQ 43 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 25 CYS M 234 ? CYS T 282 ? CYS Ao 234 ? 1_555 CYS Av 282 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 26 CYS N 234 ? CYS S 282 ? CYS Ap 234 ? 1_555 CYS Au 282 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 27 CYS NA 43 ? CYS HB 82 ? CYS BP 43 ? 1_555 CYS BZ 82 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 28 CYS O 234 ? CYS X 282 ? CYS Aq 234 ? 1_555 CYS Az 282 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 29 CYS P 234 ? CYS W 282 ? CYS Ar 234 ? 1_555 CYS Ay 282 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 30 CYS PA 82 ? CYS TA 43 ? CYS BQ 82 ? 1_555 CYS BS 43 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 31 CYS Q 234 ? CYS V 282 ? CYS As 234 ? 1_555 CYS Ax 282 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 32 CYS R 234 ? CYS U 282 ? CYS At 234 ? 1_555 CYS Aw 282 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 33 CYS RA 19 ? CYS TA 3 ? CYS BR 19 ? 1_555 CYS BS 3 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 34 CYS RA 82 ? CYS VA 43 ? CYS BR 82 ? 1_555 CYS BT 43 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 35 CYS TA 82 ? CYS XA 43 ? CYS BS 82 ? 1_555 CYS BU 43 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 36 CYS VA 19 ? CYS XA 3 ? CYS BT 19 ? 1_555 CYS BU 3 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 37 CYS VA 82 ? CYS ZA 43 ? CYS BT 82 ? 1_555 CYS BV 43 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 38 CYS XA 82 ? CYS BB 43 ? CYS BU 82 ? 1_555 CYS BW 43 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 39 CYS ZA 19 ? CYS BB 3 ? CYS BV 19 ? 1_555 CYS BW 3 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 40 CYS ZA 82 ? CYS DB 43 ? CYS BV 82 ? 1_555 CYS BX 43 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 268 M . ? SER 268 Ao PRO 269 M ? PRO 269 Ao 1 4.37 2 SER 268 N . ? SER 268 Ap PRO 269 N ? PRO 269 Ap 1 3.79 3 SER 268 O . ? SER 268 Aq PRO 269 O ? PRO 269 Aq 1 3.82 4 SER 268 P . ? SER 268 Ar PRO 269 P ? PRO 269 Ar 1 4.18 5 SER 268 Q . ? SER 268 As PRO 269 Q ? PRO 269 As 1 3.66 6 SER 268 R . ? SER 268 At PRO 269 R ? PRO 269 At 1 3.79 7 SER 268 S . ? SER 268 Au PRO 269 S ? PRO 269 Au 1 0.46 8 SER 268 T . ? SER 268 Av PRO 269 T ? PRO 269 Av 1 0.56 9 SER 268 U . ? SER 268 Aw PRO 269 U ? PRO 269 Aw 1 1.50 10 SER 268 V . ? SER 268 Ax PRO 269 V ? PRO 269 Ax 1 0.51 11 SER 268 W . ? SER 268 Ay PRO 269 W ? PRO 269 Ay 1 0.52 12 SER 268 X . ? SER 268 Az PRO 269 X ? PRO 269 Az 1 1.70 13 GLY 388 Y . ? GLY 388 A1 PRO 389 Y ? PRO 389 A1 1 -0.42 14 GLY 388 Z . ? GLY 388 A2 PRO 389 Z ? PRO 389 A2 1 -0.26 15 GLY 388 AA . ? GLY 388 A3 PRO 389 AA ? PRO 389 A3 1 0.03 16 GLY 388 BA . ? GLY 388 A4 PRO 389 BA ? PRO 389 A4 1 -0.27 17 GLY 388 CA . ? GLY 388 A5 PRO 389 CA ? PRO 389 A5 1 -0.55 18 GLY 388 DA . ? GLY 388 A6 PRO 389 DA ? PRO 389 A6 1 -0.61 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 8 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 8 ? AA6 ? 10 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 9 ? 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? -69.56 -177.63 52 1 THR Ak 63 ? ? -103.24 70.66 53 1 VAL Ak 110 ? ? -123.33 -61.35 54 1 CYS Ak 147 ? ? -94.99 55.94 55 1 ALA Ak 205 ? ? 61.13 -161.14 56 1 CYS Ak 206 ? ? 77.96 -2.42 57 1 GLN Ak 246 ? ? 60.50 60.83 58 1 VAL Al 110 ? ? -123.25 -61.34 59 1 SER Al 112 ? ? -98.95 34.91 60 1 CYS Al 147 ? ? -94.97 55.82 61 1 ALA Al 205 ? ? 61.25 -158.84 62 1 CYS Al 206 ? ? 76.39 -3.12 63 1 GLN Al 246 ? ? 60.42 61.11 64 1 ASP Am 29 ? ? 77.42 -3.56 65 1 PRO Am 44 ? ? -69.76 -177.67 66 1 VAL Am 110 ? ? -122.76 -63.01 67 1 SER Am 112 ? ? -98.81 34.34 68 1 CYS Am 130 ? ? -93.85 58.08 69 1 CYS Am 147 ? ? -92.80 52.38 70 1 ALA Am 205 ? ? 61.32 -160.49 71 1 CYS Am 206 ? ? 78.33 -2.13 72 1 GLN Am 246 ? ? 60.49 60.48 73 1 PRO An 44 ? ? -69.56 -177.83 74 1 THR An 63 ? ? -102.25 68.70 75 1 VAL An 110 ? ? -123.36 -60.67 76 1 CYS An 147 ? ? -95.05 56.22 77 1 ALA An 205 ? ? 61.26 -160.96 78 1 CYS An 206 ? ? 77.83 -2.54 79 1 GLN An 246 ? ? 60.22 60.87 80 1 MET Ao 75 ? ? 49.37 19.56 81 1 ASN Ao 113 ? ? 58.43 10.93 82 1 ARG Ao 187 ? ? 75.79 -8.24 83 1 MET Ap 75 ? ? 51.42 13.58 84 1 ALA Ap 76 ? ? -131.74 -33.56 85 1 ARG Ap 187 ? ? 75.68 -8.92 86 1 SER Ap 382 ? ? -170.41 142.68 87 1 MET Aq 75 ? ? 57.05 13.16 88 1 PHE Aq 111 ? ? -92.97 -63.92 89 1 ASN Aq 113 ? ? 57.94 11.72 90 1 ARG Aq 187 ? ? 76.03 -8.84 91 1 GLU Ar 34 ? ? 77.85 -0.83 92 1 MET Ar 75 ? ? 49.24 18.49 93 1 ALA Ar 76 ? ? -130.42 -36.82 94 1 PHE Ar 111 ? ? -90.22 -64.43 95 1 ASN Ar 113 ? ? 58.30 11.43 96 1 ARG Ar 187 ? ? 75.82 -8.16 97 1 MET As 75 ? ? 54.67 9.99 98 1 ARG As 187 ? ? 75.61 -8.82 99 1 SER As 382 ? ? -170.90 142.66 100 1 VAL At 25 ? ? -124.56 -53.08 101 1 GLU At 34 ? ? 78.82 -0.99 102 1 MET At 75 ? ? 57.03 13.15 103 1 ALA At 76 ? ? -130.34 -36.52 104 1 PHE At 111 ? ? -92.95 -64.06 105 1 ASN At 113 ? ? 57.99 11.75 106 1 ARG At 187 ? ? 76.92 -6.67 107 1 PRO Au 8 ? ? -58.33 170.18 108 1 SER Au 35 ? ? -171.84 -179.61 109 1 ASN Au 113 ? ? 69.93 -0.94 110 1 CYS Au 212 ? ? 77.13 -4.12 111 1 THR Au 391 ? ? 77.01 -8.04 112 1 GLU Av 180 ? ? -78.54 -169.90 113 1 CYS Av 212 ? ? 78.49 -2.41 114 1 THR Av 391 ? ? 77.02 -5.49 115 1 ASN Aw 113 ? ? 70.46 -2.07 116 1 CYS Aw 212 ? ? 78.96 -2.90 117 1 THR Aw 391 ? ? 76.93 -4.52 118 1 PRO Ax 8 ? ? -58.38 170.24 119 1 ASN Ax 113 ? ? 70.44 -1.55 120 1 CYS Ax 212 ? ? 77.01 -4.10 121 1 THR Ax 391 ? ? 76.38 -4.23 122 1 ASN Ay 113 ? ? 71.72 -1.48 123 1 CYS Ay 212 ? ? 78.61 -2.54 124 1 CYS Ay 250 ? ? 72.08 -0.03 125 1 THR Ay 391 ? ? 76.93 -5.61 126 1 ASN Az 113 ? ? 70.63 -2.42 127 1 SER Az 153 ? ? -171.18 148.27 128 1 CYS Az 212 ? ? 77.42 -5.29 129 1 THR Az 391 ? ? 76.94 -4.43 130 1 CYS A1 5 ? ? -97.48 36.22 131 1 PHE A1 132 ? ? 37.34 57.22 132 1 LEU A1 258 ? ? -79.50 -169.95 133 1 PHE A2 17 ? ? -160.01 117.97 134 1 LEU A2 134 ? ? -141.34 30.86 135 1 SER A2 159 ? ? -152.32 82.99 136 1 LEU A2 258 ? ? -79.83 -169.34 137 1 PHE A3 132 ? ? 39.93 39.88 138 1 SER A3 159 ? ? -155.73 85.18 139 1 SER A3 190 ? ? -99.63 36.47 140 1 LEU A3 258 ? ? -79.98 -169.79 141 1 ASN A4 67 ? ? -48.17 150.15 142 1 PHE A4 132 ? ? 39.46 54.84 143 1 LEU A4 258 ? ? -79.67 -169.94 144 1 CYS A5 5 ? ? -99.14 36.02 145 1 PHE A5 17 ? ? -160.02 117.96 146 1 PHE A5 42 ? ? 69.29 -3.38 147 1 PHE A5 132 ? ? 38.28 56.01 148 1 LEU A5 134 ? ? -140.58 43.73 149 1 SER A5 159 ? ? -152.35 82.99 150 1 LEU A5 258 ? ? -79.87 -169.38 151 1 LEU A6 134 ? ? -140.74 29.28 152 1 SER A6 159 ? ? -155.60 85.23 153 1 SER A6 190 ? ? -99.97 36.76 154 1 LEU A6 258 ? ? -79.84 -169.23 155 1 GLN A7 102 ? ? -98.45 32.74 156 1 SER A7 135 ? ? -170.11 146.20 157 1 TRP A8 177 ? ? 39.81 62.06 158 1 SER A9 135 ? ? -172.26 148.08 159 1 THR A0 65 ? ? -161.69 116.47 160 1 SER A0 135 ? ? -171.14 147.53 161 1 SER BB 135 ? ? -172.31 148.30 162 1 VAL BN 11 ? ? -109.26 -65.44 163 1 VAL BN 55 ? ? 73.90 -63.71 164 1 LYS BN 76 ? ? -39.78 -39.30 165 1 ALA BN 136 ? ? -68.13 -175.78 166 1 ALA BN 153 ? ? 61.64 62.40 167 1 ASN BN 207 ? ? -140.26 27.80 168 1 PHE BN 250 ? ? 60.06 172.31 169 1 CYS BN 303 ? ? -96.07 55.35 170 1 LYS BN 413 ? ? 59.92 -94.87 171 1 ASN BO 52 ? ? 71.12 36.72 172 1 SER BO 60 ? ? 55.47 -172.70 173 1 ALA BO 83 ? ? -172.86 148.87 174 1 ALA BC 2 ? ? 57.72 -146.49 175 1 VAL BC 55 ? ? 68.37 -67.58 176 1 PRO BC 148 ? ? -66.69 1.18 177 1 ALA BC 153 ? ? 61.43 62.22 178 1 ASN BC 207 ? ? -140.45 31.55 179 1 ASN BC 369 ? ? -94.95 31.30 180 1 ARG BC 372 ? ? 47.39 -137.23 181 1 ALA BP 44 ? ? -93.05 52.31 182 1 LEU BP 50 ? ? 55.15 -152.85 183 1 SER BP 60 ? ? 58.87 -172.04 184 1 PRO BP 72 ? ? -66.25 0.54 185 1 GLN BP 80 ? ? -126.22 -167.04 186 1 ALA BP 83 ? ? -170.79 141.50 187 1 PHE BD 10 ? ? -171.43 -174.56 188 1 ARG BD 12 ? ? 64.35 68.74 189 1 SER BD 18 ? ? -38.20 -39.51 190 1 VAL BD 55 ? ? 69.89 -66.32 191 1 ALA BD 136 ? ? -66.92 -179.34 192 1 ALA BD 153 ? ? 62.18 61.90 193 1 LEU BD 179 ? ? 77.63 -7.81 194 1 ASN BD 207 ? ? -140.39 32.32 195 1 ASP BD 269 ? ? -91.25 43.20 196 1 CYS BD 300 ? ? 68.40 -2.87 197 1 CYS BD 303 ? ? -96.75 55.43 198 1 ARG BD 372 ? ? 54.07 -150.77 199 1 LYS BD 375 ? ? 67.43 -136.46 200 1 ASN BD 376 ? ? -141.70 17.08 201 1 ALA BQ 44 ? ? -91.28 50.93 202 1 ASN BQ 52 ? ? 70.00 42.65 203 1 SER BQ 60 ? ? 57.26 -177.02 204 1 PRO BQ 72 ? ? -69.93 3.27 205 1 ALA BE 2 ? ? 60.49 -138.46 206 1 VAL BE 55 ? ? 67.23 -65.60 207 1 ALA BE 91 ? ? -95.01 30.74 208 1 ALA BE 136 ? ? -67.77 -177.25 209 1 ALA BE 153 ? ? 61.91 61.04 210 1 PHE BE 250 ? ? 64.18 168.21 211 1 ASP BE 269 ? ? -86.91 45.96 212 1 CYS BE 300 ? ? 72.20 -5.22 213 1 ASN BE 369 ? ? -92.09 30.06 214 1 ARG BE 372 ? ? 53.23 -157.71 215 1 PRO BR 72 ? ? -66.34 1.34 216 1 ASP BF 16 ? ? 61.27 67.72 217 1 VAL BF 55 ? ? 70.12 -67.91 218 1 ALA BF 136 ? ? -66.67 -178.82 219 1 PRO BF 148 ? ? -65.87 3.04 220 1 GLU BF 215 ? ? -140.57 47.64 221 1 ASP BF 269 ? ? -87.32 45.00 222 1 ALA BF 299 ? ? -66.28 -177.05 223 1 ARG BF 372 ? ? 55.03 -161.63 224 1 ALA BF 487 ? ? -171.93 147.60 225 1 ASN BF 492 ? ? -39.60 121.70 226 1 SER BS 60 ? ? 55.38 -173.00 227 1 MET BS 64 ? ? -171.04 146.61 228 1 PRO BS 72 ? ? -65.21 1.07 229 1 ALA BG 2 ? ? 58.85 -142.79 230 1 LEU BG 54 ? ? -68.89 -177.59 231 1 VAL BG 55 ? ? 67.52 -64.54 232 1 ALA BG 136 ? ? -66.79 -179.02 233 1 PRO BG 148 ? ? -66.19 1.79 234 1 ALA BG 153 ? ? 61.86 61.32 235 1 ASN BG 207 ? ? -140.84 31.74 236 1 ALA BG 299 ? ? -69.22 -173.51 237 1 ASN BG 379 ? ? -170.10 -176.00 238 1 PRO BT 72 ? ? -65.04 0.86 239 1 ASP BH 16 ? ? -158.39 89.56 240 1 VAL BH 55 ? ? 71.09 -66.49 241 1 GLU BH 128 ? ? -171.26 -176.33 242 1 ALA BH 153 ? ? 61.71 62.56 243 1 VAL BH 185 ? ? 36.32 61.60 244 1 PHE BH 250 ? ? 60.02 173.01 245 1 CYS BH 300 ? ? 66.36 -1.32 246 1 CYS BH 303 ? ? -94.90 51.33 247 1 ARG BH 372 ? ? 54.93 -167.13 248 1 LYS BH 413 ? ? 75.81 -3.96 249 1 ASN BH 414 ? ? -162.18 97.24 250 1 ALA BU 44 ? ? -92.20 51.19 251 1 ASN BU 52 ? ? 71.51 37.06 252 1 SER BU 60 ? ? 57.47 -178.02 253 1 ALA BU 83 ? ? -172.66 149.35 254 1 ALA BI 2 ? ? -165.90 -167.19 255 1 VAL BI 55 ? ? 68.27 -68.11 256 1 ALA BI 136 ? ? -66.20 -178.89 257 1 PRO BI 148 ? ? -66.52 1.01 258 1 ALA BI 153 ? ? 61.81 61.55 259 1 ASN BI 207 ? ? -140.52 31.91 260 1 PHE BI 250 ? ? 65.12 169.35 261 1 ASP BI 269 ? ? -88.28 45.25 262 1 THR BI 282 ? 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