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H LYS 74 NZ # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 9RNH _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 9RNH _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9RNH _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 9RNH _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_Zscore _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 10353 ? f_bond_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.512 ? 13999 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 6.419 ? 1483 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.038 ? 1589 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.010 ? 1685 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 9RNH _struct.title 'GluA4 in complex with TARP-2, Resting II state, structure of TMD domain' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9RNH _struct_keywords.text 'Gria4, Voltage-dependent calcium channel gamma-2, AMPA Receptor, GluA4-TARP2, Membrane protein, Resting state II, TMD' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 4 ? K N N 4 ? L N N 4 ? M N N 3 ? N N N 4 ? O N N 5 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A0G2JU28_RAT A0A0G2JU28 ? 1 ;MRIICRQIVLLFSGFWGLAMGAFPSSVQIGGLFIRNTDQEYTAFRLAIFLHNTSPNASEAPFNLVPHVDNIETANSFAVT NAFCSQYSRGVFAIFGLYDKRSVHTLTSFCSALHISLITPSFPTEGESQFVLQLRPSLRGALLSLLDHYEWNCFVFLYDT DRGYSILQAIMEKAGQNGWHVSAICVENFNDVSYRQLLEELDRRQEKKFVIDCEIERLQNILEQIVSVGKHVKGYHYIIA NLGFKDISLERFIHGGANVTGFQLVDFNTPMVTKLMDRWKKLDQREYPGSETPPKYTSALTYDGVLVMAETFRSLRRQKI DISRRGNAGDCLANPAAPWGQGIDMERTLKQVRIQGLTGNVQFDHYGRRVNYTMDVFELKSTGPRKVGYWNDMDKLVLIQ DMPTLGNDTAAIENRTVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGARDADTK IWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSV VLFLVSRFSPYEWHTEEPEDGKEGPSDQPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTA NLAAFLTVERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVARVRKSKG KFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEAGVLDKLKNKWWYDKGECGPKDS GSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKLTFSEAIRNKARLSITGSVGENGRVLTPDCPK AVHTGTAIRQSSGLAVIASDLP ; 1 2 UNP CCG2_RAT Q71RJ2 ? 2 ;MGLFDRGVQMLLTTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRGVCKTKSVSENETSKKNEEVMTHSGLWRTCCLEGNFKGLCKQI DHFPEDADYEADTAEYFLRAVRASSIFPILSVILLFMGGLCIAASEFYKTRHNIILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISAN AGDPSKSDSKKNSYSYGWSFYFGALSFIIAEMVGVLAVHMFIDRHKQLRATARATDYLQASAITRIPSYRYRYQRRSRSS SRSTEPSHSRDASPVGVKGFNTLPSTEISMYTLSRDPLKAATTPTATYNSDRDNSFLQVHNCIQKDSKDSLHANTANRRT TPV ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9RNH A 1 ? 902 ? A0A0G2JU28 1 ? 902 ? 1 967 2 1 9RNH B 1 ? 902 ? A0A0G2JU28 1 ? 902 ? 1 902 3 1 9RNH C 1 ? 902 ? A0A0G2JU28 1 ? 902 ? 1 902 4 1 9RNH D 1 ? 902 ? A0A0G2JU28 1 ? 902 ? 1 967 5 2 9RNH E 1 ? 323 ? Q71RJ2 1 ? 323 ? 1 323 6 2 9RNH F 1 ? 323 ? Q71RJ2 1 ? 323 ? 1 323 7 2 9RNH G 1 ? 323 ? Q71RJ2 1 ? 323 ? 1 323 8 2 9RNH H 1 ? 323 ? Q71RJ2 1 ? 323 ? 1 323 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 5 9RNH ILE E 14 ? UNP Q71RJ2 THR 14 'engineered mutation' 14 1 6 9RNH ILE F 14 ? UNP Q71RJ2 THR 14 'engineered mutation' 14 2 7 9RNH ILE G 14 ? UNP Q71RJ2 THR 14 'engineered mutation' 14 3 8 9RNH ILE H 14 ? UNP Q71RJ2 THR 14 'engineered mutation' 14 4 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ALA A 544 ? PHE A 568 ? ALA A 544 PHE A 568 1 ? 25 HELX_P HELX_P2 AA2 PHE A 596 ? MET A 607 ? PHE A 596 MET A 607 1 ? 12 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 617 ? VAL A 652 ? SER A 617 VAL A 652 1 ? 36 HELX_P HELX_P4 AA4 ALA A 815 ? ALA A 842 ? ALA A 815 ALA A 907 1 ? 28 HELX_P HELX_P5 AA5 ALA B 544 ? SER B 569 ? ALA B 544 SER B 569 1 ? 26 HELX_P HELX_P6 AA6 GLY B 594 ? MET B 607 ? GLY B 594 MET B 607 1 ? 14 HELX_P HELX_P7 AA7 SER B 617 ? MET B 651 ? SER B 617 MET B 651 1 ? 35 HELX_P HELX_P8 AA8 ALA B 815 ? GLU B 843 ? ALA B 815 GLU B 843 1 ? 29 HELX_P HELX_P9 AA9 ALA C 544 ? PHE C 568 ? ALA C 544 PHE C 568 1 ? 25 HELX_P HELX_P10 AB1 GLY C 594 ? GLN C 608 ? GLY C 594 GLN C 608 1 ? 15 HELX_P HELX_P11 AB2 SER C 617 ? VAL C 648 ? SER C 617 VAL C 648 1 ? 32 HELX_P HELX_P12 AB3 ALA C 815 ? ARG C 841 ? ALA C 815 ARG C 841 1 ? 27 HELX_P HELX_P13 AB4 ALA D 544 ? SER D 569 ? ALA D 544 SER D 569 1 ? 26 HELX_P HELX_P14 AB5 GLY D 594 ? MET D 607 ? GLY D 594 MET D 607 1 ? 14 HELX_P HELX_P15 AB6 SER D 617 ? LEU D 646 ? SER D 617 LEU D 646 1 ? 30 HELX_P HELX_P16 AB7 VAL D 814 ? GLU D 843 ? VAL D 814 GLU D 908 1 ? 30 HELX_P HELX_P17 AB8 VAL E 8 ? THR E 30 ? VAL E 8 THR E 30 1 ? 23 HELX_P HELX_P18 AB9 ALA E 94 ? SER E 105 ? ALA E 94 SER E 105 1 ? 12 HELX_P HELX_P19 AC1 SER E 105 ? SER E 125 ? SER E 105 SER E 125 1 ? 21 HELX_P HELX_P20 AC2 HIS E 132 ? GLY E 162 ? HIS E 132 GLY E 162 1 ? 31 HELX_P HELX_P21 AC3 GLY E 177 ? THR E 211 ? GLY E 177 THR E 211 1 ? 35 HELX_P HELX_P22 AC4 VAL F 8 ? THR F 30 ? VAL F 8 THR F 30 1 ? 23 HELX_P HELX_P23 AC5 GLU F 95 ? SER F 105 ? GLU F 95 SER F 105 1 ? 11 HELX_P HELX_P24 AC6 SER F 105 ? TYR F 128 ? SER F 105 TYR F 128 1 ? 24 HELX_P HELX_P25 AC7 HIS F 132 ? ALA F 161 ? HIS F 132 ALA F 161 1 ? 30 HELX_P HELX_P26 AC8 GLY F 177 ? ALA F 212 ? GLY F 177 ALA F 212 1 ? 36 HELX_P HELX_P27 AC9 VAL G 8 ? THR G 30 ? VAL G 8 THR G 30 1 ? 23 HELX_P HELX_P28 AD1 ALA G 94 ? SER G 105 ? ALA G 94 SER G 105 1 ? 12 HELX_P HELX_P29 AD2 SER G 105 ? TYR G 128 ? SER G 105 TYR G 128 1 ? 24 HELX_P HELX_P30 AD3 HIS G 132 ? ASN G 160 ? HIS G 132 ASN G 160 1 ? 29 HELX_P HELX_P31 AD4 GLY G 177 ? ALA G 212 ? GLY G 177 ALA G 212 1 ? 36 HELX_P HELX_P32 AD5 VAL H 8 ? THR H 30 ? VAL H 8 THR H 30 1 ? 23 HELX_P HELX_P33 AD6 ALA H 94 ? SER H 105 ? ALA H 94 SER H 105 1 ? 12 HELX_P HELX_P34 AD7 SER H 105 ? ALA H 123 ? SER H 105 ALA H 123 1 ? 19 HELX_P HELX_P35 AD8 HIS H 132 ? ASN H 160 ? HIS H 132 ASN H 160 1 ? 29 HELX_P HELX_P36 AD9 GLY H 177 ? ALA H 212 ? GLY H 177 ALA H 212 1 ? 36 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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H CYS 67 SG ? ? ? 1_555 H CYS 77 SG ? ? H CYS 67 H CYS 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? covale1 covale one ? A CYS 837 SG ? ? ? 1_555 I PLM . C1 ? ? A CYS 837 A PLM 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.762 ? ? covale2 covale one ? D CYS 837 SG ? ? ? 1_555 M PLM . C1 ? ? 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