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_refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs 158057 _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs 100.00 _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs 0.34113 _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.34113 _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details 'PARAMETERS FOR MASK CACLULATION' _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.correlation_coeff_I_to_Fcsqd_work ? _refine.correlation_coeff_I_to_Fcsqd_free ? _refine.pdbx_R_complete ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'MAXIMUM LIKELIHOOD WITH PHASES' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R 0.485 _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B 28.109 _refine.overall_SU_ML 0.426 _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine_hist.cycle_id 1 _refine_hist.details ? _refine_hist.d_res_high . _refine_hist.d_res_low . _refine_hist.number_atoms_solvent ? _refine_hist.number_atoms_total 15563 _refine_hist.number_reflns_all ? _refine_hist.number_reflns_obs ? _refine_hist.number_reflns_R_free ? _refine_hist.number_reflns_R_work ? _refine_hist.R_factor_all ? _refine_hist.R_factor_obs ? _refine_hist.R_factor_R_free ? _refine_hist.R_factor_R_work ? _refine_hist.pdbx_number_residues_total ? _refine_hist.pdbx_B_iso_mean_ligand ? _refine_hist.pdbx_B_iso_mean_solvent ? _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein ? _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid ? _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand ? _refine_hist.pdbx_number_atoms_lipid ? _refine_hist.pdbx_number_atoms_carb ? _refine_hist.pdbx_pseudo_atom_details ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_Zscore _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.000 0.017 12630 ? r_bond_other_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.538 1.846 23503 ? r_angle_refined_deg ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.660 1.739 29243 ? r_angle_other_deg ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 8.711 7.648 2577 ? r_dihedral_angle_1_deg ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.690 5.000 126 ? r_dihedral_angle_2_deg ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 11.377 10.000 1766 ? r_dihedral_angle_3_deg ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_dihedral_angle_4_deg ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.124 0.208 2939 ? r_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.008 0.020 15288 ? r_gen_planes_refined ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 0.020 3550 ? r_gen_planes_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbd_refined ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbd_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbtor_refined ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbtor_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_xyhbond_nbd_refined ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_xyhbond_nbd_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_metal_ion_refined ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_metal_ion_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_vdw_refined ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_vdw_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_hbond_refined ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_hbond_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_metal_ion_refined ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_metal_ion_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 14.920 21.136 4978 ? r_mcbond_it ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 14.919 21.136 4978 ? r_mcbond_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 23.628 38.061 6205 ? r_mcangle_it ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 23.626 38.061 6206 ? r_mcangle_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 14.206 28.982 11584 ? r_scbond_it ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 14.187 28.986 11575 ? r_scbond_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_scangle_it ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 22.762 52.811 17299 ? r_scangle_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 40.185 393.26 85961 ? r_long_range_B_refined ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 40.184 393.25 85962 ? r_long_range_B_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_rigid_bond_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_sphericity_free ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_sphericity_bonded ? ? ? # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine_ls_shell.d_res_high 3.530 _refine_ls_shell.d_res_low 3.622 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 0 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 11736 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 100.00 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.R_factor_obs ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.561 _refine_ls_shell.redundancy_reflns_all ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_all ? _refine_ls_shell.wR_factor_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_free ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_work ? _refine_ls_shell.pdbx_R_complete ? _refine_ls_shell.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine_ls_shell.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine_ls_shell.correlation_coeff_I_to_Fcsqd_work ? _refine_ls_shell.correlation_coeff_I_to_Fcsqd_free ? _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.pdbx_phase_error ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_work ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_free ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.000 # _struct.entry_id 9SHY _struct.title 'Cryo-EM structure of the catalytic core of human telomerase at the initiation state of the repeat addition cycle' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9SHY _struct_keywords.text 'telomerase, H/ACA, RNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'RNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP TERT_HUMAN O14746 ? 1 ;MPRAPRCRAVRSLLRSHYREVLPLATFVRRLGPQGWRLVQRGDPAAFRALVAQCLVCVPWDARPPPAAPSFRQVSCLKEL VARVLQRLCERGAKNVLAFGFALLDGARGGPPEAFTTSVRSYLPNTVTDALRGSGAWGLLLRRVGDDVLVHLLARCALFV LVAPSCAYQVCGPPLYQLGAATQARPPPHASGPRRRLGCERAWNHSVREAGVPLGLPAPGARRRGGSASRSLPLPKRPRR GAAPEPERTPVGQGSWAHPGRTRGPSDRGFCVVSPARPAEEATSLEGALSGTRHSHPSVGRQHHAGPPSTSRPPRPWDTP CPPVYAETKHFLYSSGDKEQLRPSFLLSSLRPSLTGARRLVETIFLGSRPWMPGTPRRLPRLPQRYWQMRPLFLELLGNH AQCPYGVLLKTHCPLRAAVTPAAGVCAREKPQGSVAAPEEEDTDPRRLVQLLRQHSSPWQVYGFVRACLRRLVPPGLWGS RHNERRFLRNTKKFISLGKHAKLSLQELTWKMSVRDCAWLRRSPGVGCVPAAEHRLREEILAKFLHWLMSVYVVELLRSF FYVTETTFQKNRLFFYRKSVWSKLQSIGIRQHLKRVQLRELSEAEVRQHREARPALLTSRLRFIPKPDGLRPIVNMDYVV GARTFRREKRAERLTSRVKALFSVLNYERARRPGLLGASVLGLDDIHRAWRTFVLRVRAQDPPPELYFVKVDVTGAYDTI PQDRLTEVIASIIKPQNTYCVRRYAVVQKAAHGHVRKAFKSHVSTLTDLQPYMRQFVAHLQETSPLRDAVVIEQSSSLNE ASSGLFDVFLRFMCHHAVRIRGKSYVQCQGIPQGSILSTLLCSLCYGDMENKLFAGIRRDGLLLRLVDDFLLVTPHLTHA KTFLRTLVRGVPEYGCVVNLRKTVVNFPVEDEALGGTAFVQMPAHGLFPWCGLLLDTRTLEVQSDYSSYARTSIRASLTF NRGFKAGRNMRRKLFGVLRLKCHSLFLDLQVNSLQTVCTNIYKILLLQAYRFHACVLQLPFHQQVWKNPTFFLRVISDTA SLCYSILKAKNAGMSLGAKGAAGPLPSEAVQWLCHQAFLLKLTRHRVTYVPLLGSLRTAQTQLSRKLPGTTLTALEAAAN PALPSDFKTILD ; 1 2 UNP B2R5B3_HUMAN B2R5B3 ? 2 ;MSGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVRRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; 1 3 UNP B4DR52_HUMAN B4DR52 ? 3 ;MPDPAKSAPAPKKGSKKAVTKVQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSNPRNLSPTKPGGSEDRQPPPSQLSAIPPFCLVLRA GIAGQV ; 1 4 PDB 9SHY 9SHY ? 4 ? 1 5 UNP ACD_HUMAN Q96AP0 ? 5 ;MAGSGRLVLRPWIRELILGSETPSSPRAGQLLEVLQDAEAAVAGPSHAPDTSDVGATLLVSDGTHSVRCLVTREALDTSD WEEKEFGFRGTEGRLLLLQDCGVHVQVAEGGAPAEFYLQVDRFSLLPTEQPRLRVPGCNQDLDVQKKLYDCLEEHLSEST SSNAGLSLSQLLDEMREDQEHQGALVCLAESCLTLEGPCTAPPVTHWAASRCKATGEAVYTVPSSMLCISENDQLILSSL GPCQRTQGPELPPPDPALQDLSLTLIASPPSSPSSSGTPALPGHMSSEESGTSISLLPALSLAAPDPGQRSSSQPSPAIC SAPATLTPRSPHASRTPSSPLQSCTPSLSPRSHVPSPHQALVTRPQKPSLEFKEFVGLPCKNRPPFPRTGATRGAQEPCS VWEPPKRHRDGSAFQYEYEPPCTSLCARVQAVRLPPQLMAWALHFLMDAQPGSEPTPM ; 1 6 GB U85256.1 1932797 ? 6 ;GGGUUGCGGAGGGUGGGCCUGGGAGGGGUGGUGGCCAUUUUUUGUCUAACCCUAACUGAGAAGGGCGUAGGCGCCGUGCU UUUGCUCCCCGCGCGCUGUUUUUCUCGCUGACUUUCAGCGGGCGGAAAAGCCUCGGCCUGCCGCCUUCCACCGUUCAUUC UAGAGCAAACAAAAAAUGUCAGCUGCUGGCCCGUUCGCCCCUCCCGGGGACCUGCGGCGGGUCGCCUGCCCAGCCCCCGA ACCCCGCCUGGAGGCCGCGGUCGGCCCGGGGCUUCUCCGGAGGCACCCACUGCCACCGCGAAGAGUUGGGCUCUGUCAGC CGCGGGUCUCUCGGGGGCGAGGGCGAGGUUCAGGCCUUUCAGGCCGCAGGAAGAGGAACGGAGCGAGUCCCCGCGCGCGG CGCGAUUCCCUGAGCUGUGGGACGUGCACCCAGGACUCGGCUCACACAUGC ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9SHY A 1 ? 1132 ? O14746 1 ? 1132 ? 1 1132 2 2 9SHY L 1 ? 130 ? B2R5B3 1 ? 130 ? 1 130 3 3 9SHY M 1 ? 166 ? B4DR52 1 ? 166 ? 1 166 4 4 9SHY N 1 ? 34 ? 9SHY 25 ? 58 ? 25 58 5 5 9SHY O 1 ? 458 ? 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