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'StrepII tagged' 6 polymer syn Polyubiquitin-C 8547.770 2 ? ? ? ? 7 polymer syn Polyubiquitin-C 8636.948 2 ? ? ? ? 8 polymer man Ubiquitin 8576.831 4 ? ? ? ? 9 non-polymer syn 'ZINC ION' 65.409 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'Coiled-coil domain-containing protein 98,Protein FAM175A' 2 ;BRCA1-A complex subunit BRCC36,BRCA1/BRCA2-containing complex subunit 3,BRCA1/BRCA2-containing complex subunit 36,BRISC complex subunit BRCC36 ; 3 'BRCA1-A complex subunit BRE,BRCA1/BRCA2-containing complex subunit 45,Brain and reproductive organ-expressed protein' 4 'Mediator of RAP80 interactions and targeting subunit of 40 kDa,New component of the BRCA1-A complex' 5 'Receptor-associated protein 80,Retinoid X receptor-interacting protein 110,Ubiquitin interaction motif-containing protein 1' 8 Polyubiquitin-C # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MEGESTSAVLSGFVLGALAFQHLNTDSDTEGFLLGEVKGEAKNSITDSQMDDVEVVYTIDIQKYIPCYQLFSFYNSSGEV NEQALKKILSNVKKNVVGWYKFRRHSDQIMTFRERLLHKNLQEHFSNQDLVFLLLTPSIITESCSTHRLEHSLYKPQKGL FHRVPLVVANLGMSEQLGYKTVSGSCMSTGFSRAVQTHSSKFFEEDGSLKEVHKINEMYASLQEELKSICKKVEDSEQAV DKLVKDVNRLKREIEKRRGAQIQAAREKNIQKDPQENIFLCQALRTFFPNSEFLHSCVMSLKNRHVSKSSCNYNHHLDVV DNLTLMVEHTDIPEASPASTPQIIKHKALDLDDRWQFKRSRLLDTQDKRSKADTGSSNQDKASKMSSPETDEEIEKMKGF GEYSRSPTF ; ;MEGESTSAVLSGFVLGALAFQHLNTDSDTEGFLLGEVKGEAKNSITDSQMDDVEVVYTIDIQKYIPCYQLFSFYNSSGEV NEQALKKILSNVKKNVVGWYKFRRHSDQIMTFRERLLHKNLQEHFSNQDLVFLLLTPSIITESCSTHRLEHSLYKPQKGL FHRVPLVVANLGMSEQLGYKTVSGSCMSTGFSRAVQTHSSKFFEEDGSLKEVHKINEMYASLQEELKSICKKVEDSEQAV DKLVKDVNRLKREIEKRRGAQIQAAREKNIQKDPQENIFLCQALRTFFPNSEFLHSCVMSLKNRHVSKSSCNYNHHLDVV DNLTLMVEHTDIPEASPASTPQIIKHKALDLDDRWQFKRSRLLDTQDKRSKADTGSSNQDKASKMSSPETDEEIEKMKGF GEYSRSPTF ; A,F ? 2 'polypeptide(L)' no no 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;MAHHHHHHSAALEVLFQGPGMEVAEPSSPTEEEEEEEEHSAEPRPRTRSNPEGAEDRAVGAQASVGSRSEGEGEAASADD GSLNTSGAGPKSWQVPPPAPEVQIRTPRVNCPEKVIICLDLSEEMSLPKLESFNGSKTNALNVSQKMIEMFVRTKHKIDK SHEFALVVVNDDTAWLSGLTSDPRELCSCLYDLETASCSTFNLEGLFSLIQQKTELPVTENVQTIPPPYVVRTILVYSRP PCQPQFSLTEPMKKMFQCPYFFFDVVYIHNGTEEKEEEMSWKDMFAFMGSLDTKGTSYKYEVALAGPALELHNCMAKLLA HPLQRPCQSHASYSLLEEEDEAIEVEATV ; D,I ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MASWSHPQFEKGALEVLFQGPGKGLQDTGGTVNYFWGIPFCPDGVDPNQYTKVILCQLEVYQKSLKMAQRQLLNKKGFGE PVLPRPPSLIQNECGQGEQASEKNECISEDMGDEDKEERQESRASDWHSKTKDFQESSIKSLKEKLLLEEEPTTSHGQSS QGIVEETSEEG ; ;MASWSHPQFEKGALEVLFQGPGKGLQDTGGTVNYFWGIPFCPDGVDPNQYTKVILCQLEVYQKSLKMAQRQLLNKKGFGE PVLPRPPSLIQNECGQGEQASEKNECISEDMGDEDKEERQESRASDWHSKTKDFQESSIKSLKEKLLLEEEPTTSHGQSS QGIVEETSEEG ; E,J ? 6 'polypeptide(L)' no yes 'MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQ(DAB)ESTLHLVLRLRGG' MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQAESTLHLVLRLRGG K,M ? 7 'polypeptide(L)' no yes ;MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRG (A1JPL) ; MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGX L,N ? 8 'polypeptide(L)' no no MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGG MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGG S,T,U,V ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 9 _pdbx_entity_nonpoly.name 'ZINC ION' _pdbx_entity_nonpoly.comp_id ZN # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 GLU n 1 3 GLY n 1 4 GLU n 1 5 SER n 1 6 THR n 1 7 SER n 1 8 ALA n 1 9 VAL n 1 10 LEU n 1 11 SER n 1 12 GLY n 1 13 PHE n 1 14 VAL n 1 15 LEU n 1 16 GLY n 1 17 ALA n 1 18 LEU n 1 19 ALA n 1 20 PHE n 1 21 GLN n 1 22 HIS n 1 23 LEU n 1 24 ASN n 1 25 THR n 1 26 ASP n 1 27 SER n 1 28 ASP n 1 29 THR n 1 30 GLU n 1 31 GLY n 1 32 PHE n 1 33 LEU n 1 34 LEU n 1 35 GLY n 1 36 GLU n 1 37 VAL n 1 38 LYS n 1 39 GLY n 1 40 GLU n 1 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ASP n 1 130 LEU n 1 131 VAL n 1 132 PHE n 1 133 LEU n 1 134 LEU n 1 135 LEU n 1 136 THR n 1 137 PRO n 1 138 SER n 1 139 ILE n 1 140 ILE n 1 141 THR n 1 142 GLU n 1 143 SER n 1 144 CYS n 1 145 SER n 1 146 THR n 1 147 HIS n 1 148 ARG n 1 149 LEU n 1 150 GLU n 1 151 HIS n 1 152 SER n 1 153 LEU n 1 154 TYR n 1 155 LYS n 1 156 PRO n 1 157 GLN n 1 158 LYS n 1 159 GLY n 1 160 LEU n 1 161 PHE n 1 162 HIS n 1 163 ARG n 1 164 VAL n 1 165 PRO n 1 166 LEU n 1 167 VAL n 1 168 VAL n 1 169 ALA n 1 170 ASN n 1 171 LEU n 1 172 GLY n 1 173 MET n 1 174 SER n 1 175 GLU n 1 176 GLN n 1 177 LEU n 1 178 GLY n 1 179 TYR n 1 180 LYS n 1 181 THR n 1 182 VAL n 1 183 SER n 1 184 GLY n 1 185 SER n 1 186 CYS n 1 187 MET n 1 188 SER n 1 189 THR n 1 190 GLY n 1 191 PHE n 1 192 SER n 1 193 ARG n 1 194 ALA n 1 195 VAL n 1 196 GLN n 1 197 THR n 1 198 HIS n 1 199 SER n 1 200 SER n 1 201 LYS n 1 202 PHE n 1 203 PHE n 1 204 GLU n 1 205 GLU n 1 206 ASP n 1 207 GLY n 1 208 SER n 1 209 LEU n 1 210 LYS n 1 211 GLU n 1 212 VAL 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SER G 98 GLY G 112 1 ? 15 HELX_P HELX_P44 AE8 SER G 132 ? ASP G 146 ? SER G 132 ASP G 146 1 ? 15 HELX_P HELX_P45 AE9 GLY G 225 ? SER G 252 ? GLY G 225 SER G 252 1 ? 28 HELX_P HELX_P46 AF1 ASP G 257 ? SER G 277 ? ASP G 257 SER G 277 1 ? 21 HELX_P HELX_P47 AF2 VAL G 279 ? GLU G 316 ? VAL G 279 GLU G 316 1 ? 38 HELX_P HELX_P48 AF3 SER H 2 ? ARG H 9 ? SER H 2 ARG H 9 1 ? 8 HELX_P HELX_P49 AF4 SER H 11 ? MET H 13 ? SER H 11 MET H 13 5 ? 3 HELX_P HELX_P50 AF5 LEU H 14 ? GLY H 25 ? LEU H 14 GLY H 25 1 ? 12 HELX_P HELX_P51 AF6 PHE H 86 ? ALA H 90 ? PHE H 86 ALA H 90 5 ? 5 HELX_P HELX_P52 AF7 LEU H 99 ? SER H 104 ? LEU H 99 SER H 104 1 ? 6 HELX_P HELX_P53 AF8 GLU H 111 ? SER H 135 ? GLU H 111 SER H 135 1 ? 25 HELX_P HELX_P54 AF9 SER H 135 ? GLU H 148 ? SER H 135 GLU H 148 1 ? 14 HELX_P HELX_P55 AG1 GLU H 148 ? ASN H 154 ? GLU H 148 ASN H 154 1 ? 7 HELX_P HELX_P56 AG2 SER H 222 ? LEU H 229 ? SER H 222 LEU H 229 1 ? 8 HELX_P HELX_P57 AG3 CYS H 245 ? GLY H 283 ? 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L A1JPL 76 ? 1_555 90.3 ? 10 OD2 ? B ASP 135 ? B ASP 135 ? 1_555 ZN ? S ZN . ? B ZN 401 ? 1_555 S1 ? L A1JPL 76 ? L A1JPL 76 ? 1_555 117.9 ? 11 NE2 ? G HIS 122 ? G HIS 122 ? 1_555 ZN ? T ZN . ? G ZN 401 ? 1_555 NE2 ? G HIS 124 ? G HIS 124 ? 1_555 102.4 ? 12 NE2 ? G HIS 122 ? G HIS 122 ? 1_555 ZN ? T ZN . ? G ZN 401 ? 1_555 OD2 ? G ASP 135 ? G ASP 135 ? 1_555 119.9 ? 13 NE2 ? G HIS 124 ? G HIS 124 ? 1_555 ZN ? T ZN . ? G ZN 401 ? 1_555 OD2 ? G ASP 135 ? G ASP 135 ? 1_555 89.1 ? 14 NE2 ? G HIS 122 ? G HIS 122 ? 1_555 ZN ? T ZN . ? G ZN 401 ? 1_555 S1 ? N A1JPL 76 ? N A1JPL 76 ? 1_555 133.0 ? 15 NE2 ? G HIS 124 ? G HIS 124 ? 1_555 ZN ? T ZN . ? G ZN 401 ? 1_555 S1 ? N A1JPL 76 ? N A1JPL 76 ? 1_555 75.0 ? 16 OD2 ? G ASP 135 ? G ASP 135 ? 1_555 ZN ? T ZN . ? G ZN 401 ? 1_555 S1 ? N A1JPL 76 ? N A1JPL 76 ? 1_555 107.0 ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 DAB K 63 ? . . . . 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None 'Non-standard linkage' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 318 C . ? PHE 318 C PRO 319 C ? PRO 319 C 1 21.99 2 PHE 318 H . ? PHE 318 H PRO 319 H ? PRO 319 H 1 23.47 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 17 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 6 ? AA9 ? 15 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 5 ? AB6 ? 6 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 5 ? AC1 ? 5 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 5 ? AC4 ? 5 ? AC5 ? 5 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 3 ? parallel AA1 1 8 ? parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 2 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA1 6 15 ? anti-parallel AA1 9 11 ? parallel AA1 9 17 ? parallel AA1 10 11 ? anti-parallel AA1 10 12 ? anti-parallel AA1 12 13 ? parallel AA1 13 15 ? anti-parallel AA1 14 15 ? anti-parallel AA1 15 16 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 1 4 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 4 5 ? parallel AA8 4 6 ? parallel AA9 1 3 ? parallel AA9 1 7 ? parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 2 4 ? anti-parallel AA9 4 5 ? parallel AA9 5 6 ? anti-parallel AA9 6 13 ? anti-parallel AA9 8 10 ? parallel AA9 8 15 ? parallel AA9 9 10 ? anti-parallel AA9 9 11 ? anti-parallel AA9 11 12 ? parallel AA9 12 13 ? anti-parallel AA9 13 14 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? parallel AB6 3 4 ? parallel AB6 4 5 ? parallel AB6 5 6 ? parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC1 4 5 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 SER A 7 ? SER A 11 ? SER A 7 SER A 11 AA1 2 GLU A 30 ? THR A 46 ? GLU A 30 THR A 46 AA1 3 MET A 50 ? CYS A 67 ? MET A 50 CYS A 67 AA1 4 ASN A 95 ? PHE A 102 ? ASN A 95 PHE A 102 AA1 5 VAL A 131 ? ILE A 139 ? VAL A 131 ILE A 139 AA1 6 THR A 146 ? TYR A 154 ? THR A 146 TYR A 154 AA1 7 ARG A 163 ? VAL A 164 ? ARG A 163 VAL A 164 AA1 8 LEU A 166 ? ALA A 169 ? LEU A 166 ALA A 169 AA1 9 ALA B 11 ? GLU B 15 ? ALA B 11 GLU B 15 AA1 10 MET B 35 ? ASN B 43 ? MET B 35 ASN B 43 AA1 11 ILE B 71 ? ILE B 79 ? ILE B 71 ILE B 79 AA1 12 ARG B 116 ? HIS B 122 ? ARG B 116 HIS B 122 AA1 13 VAL B 150 ? SER B 155 ? VAL B 150 SER B 155 AA1 14 GLU B 159 ? ASP B 160 ? GLU B 159 ASP B 160 AA1 15 THR B 165 ? GLN B 177 ? THR B 165 GLN B 177 AA1 16 TYR B 209 ? GLU B 213 ? TYR B 209 GLU B 213 AA1 17 ILE B 216 ? VAL B 219 ? ILE B 216 VAL B 219 AA2 1 VAL A 298 ? SER A 300 ? VAL A 298 SER A 300 AA2 2 THR E 31 ? TYR E 34 ? THR E 273 TYR E 276 AA2 3 VAL D 102 ? ILE D 104 ? VAL D 82 ILE D 84 AA3 1 ASP B 84 ? LYS B 85 ? ASP B 84 LYS B 85 AA3 2 VAL B 90 ? GLU B 91 ? VAL B 90 GLU B 91 AA4 1 ILE C 37 ? LYS C 41 ? ILE C 37 LYS C 41 AA4 2 ARG C 55 ? TYR C 62 ? ARG C 55 TYR C 62 AA4 3 GLU C 65 ? ILE C 72 ? GLU C 65 ILE C 72 AA4 4 ASP C 83 ? ILE C 85 ? ASP C 83 ILE C 85 AA5 1 MET C 155 ? ALA C 159 ? MET C 155 ALA C 159 AA5 2 ALA C 171 ? LYS C 176 ? ALA C 171 LYS C 176 AA5 3 ALA C 201 ? PHE C 207 ? ALA C 201 PHE C 207 AA5 4 VAL C 215 ? LEU C 221 ? VAL C 215 LEU C 221 AA6 1 GLU C 194 ? ASP C 195 ? GLU C 194 ASP C 195 AA6 2 ASN E 74 ? LYS E 75 ? ASN E 316 LYS E 317 AA7 1 VAL C 286 ? TYR C 289 ? VAL C 286 TYR C 289 AA7 2 LYS C 296 ? TRP C 303 ? LYS C 296 TRP C 303 AA7 3 PHE C 306 ? ASP C 313 ? PHE C 306 ASP C 313 AA7 4 THR C 324 ? PHE C 333 ? THR C 324 PHE C 333 AA7 5 LEU C 339 ? ALA C 343 ? LEU C 339 ALA C 343 AA8 1 GLU D 113 ? LEU D 119 ? GLU D 93 LEU D 99 AA8 2 GLU D 163 ? VAL D 169 ? GLU D 143 VAL D 149 AA8 3 THR D 173 ? THR D 180 ? THR D 153 THR D 160 AA8 4 VAL D 230 ? VAL D 236 ? VAL D 210 VAL D 216 AA8 5 PHE D 261 ? PHE D 262 ? PHE D 241 PHE D 242 AA8 6 VAL D 265 ? VAL D 266 ? VAL D 245 VAL D 246 AA9 1 SER F 5 ? SER F 11 ? SER F 5 SER F 11 AA9 2 THR F 29 ? ALA F 41 ? THR F 29 ALA F 41 AA9 3 VAL F 55 ? CYS F 67 ? VAL F 55 CYS F 67 AA9 4 ASN F 95 ? PHE F 102 ? ASN F 95 PHE F 102 AA9 5 VAL F 131 ? ILE F 139 ? VAL F 131 ILE F 139 AA9 6 THR F 146 ? TYR F 154 ? THR F 146 TYR F 154 AA9 7 LEU F 166 ? ALA F 169 ? LEU F 166 ALA F 169 AA9 8 ALA G 11 ? GLU G 15 ? ALA G 11 GLU G 15 AA9 9 GLY G 36 ? LEU G 42 ? GLY G 36 LEU G 42 AA9 10 ILE G 71 ? ILE G 79 ? ILE G 71 ILE G 79 AA9 11 ARG G 116 ? SER G 123 ? ARG G 116 SER G 123 AA9 12 VAL G 150 ? ASP G 160 ? VAL G 150 ASP G 160 AA9 13 THR G 165 ? GLN G 177 ? THR G 165 GLN G 177 AA9 14 TYR G 209 ? GLU G 213 ? TYR G 209 GLU G 213 AA9 15 ILE G 216 ? VAL G 219 ? ILE G 216 VAL G 219 AB1 1 VAL F 298 ? SER F 300 ? VAL F 298 SER F 300 AB1 2 THR J 31 ? TYR J 34 ? THR J 273 TYR J 276 AB1 3 GLU I 101 ? ILE I 104 ? GLU I 81 ILE I 84 AB2 1 ASP G 84 ? LYS G 85 ? ASP G 84 LYS G 85 AB2 2 VAL G 90 ? GLU G 91 ? VAL G 90 GLU G 91 AB2 3 ARG N 74 ? GLY N 75 ? ARG N 74 GLY N 75 AB3 1 ILE H 37 ? SER H 42 ? ILE H 37 SER H 42 AB3 2 CYS H 53 ? TYR H 62 ? CYS H 53 TYR H 62 AB3 3 GLU H 65 ? ILE H 72 ? GLU H 65 ILE H 72 AB3 4 ASP H 83 ? ILE H 85 ? ASP H 83 ILE H 85 AB4 1 MET H 155 ? TYR H 158 ? MET H 155 TYR H 158 AB4 2 ALA H 171 ? LYS H 176 ? ALA H 171 LYS H 176 AB4 3 ALA H 201 ? PHE H 207 ? ALA H 201 PHE H 207 AB4 4 TYR H 216 ? LEU H 221 ? TYR H 216 LEU H 221 AB5 1 VAL H 286 ? TYR H 289 ? VAL H 286 TYR H 289 AB5 2 LYS H 296 ? MET H 302 ? LYS H 296 MET H 302 AB5 3 CYS H 307 ? ASP H 313 ? CYS H 307 ASP H 313 AB5 4 THR H 324 ? PHE H 333 ? THR H 324 PHE H 333 AB5 5 LEU H 339 ? GLN H 344 ? LEU H 339 GLN H 344 AB6 1 THR I 173 ? THR I 180 ? THR I 153 THR I 160 AB6 2 GLU I 163 ? VAL I 169 ? GLU I 143 VAL I 149 AB6 3 LYS I 114 ? ASP I 120 ? LYS I 94 ASP I 100 AB6 4 VAL I 231 ? TYR I 237 ? 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THR N 66 VAL N 70 AC2 4 ARG N 42 ? ILE N 44 ? ARG N 42 ILE N 44 AC3 1 ILE O 13 ? GLU O 16 ? ILE S 13 GLU S 16 AC3 2 GLN O 2 ? LYS O 6 ? GLN S 2 LYS S 6 AC3 3 THR O 66 ? LEU O 71 ? THR S 66 LEU S 71 AC3 4 GLN O 41 ? PHE O 45 ? GLN S 41 PHE S 45 AC3 5 LYS O 48 ? GLN O 49 ? LYS S 48 GLN S 49 AC4 1 ILE P 13 ? GLU P 16 ? ILE T 13 GLU T 16 AC4 2 GLN P 2 ? THR P 7 ? GLN T 2 THR T 7 AC4 3 THR P 66 ? LEU P 71 ? THR T 66 LEU T 71 AC4 4 GLN P 41 ? PHE P 45 ? GLN T 41 PHE T 45 AC4 5 LYS P 48 ? GLN P 49 ? LYS T 48 GLN T 49 AC5 1 THR Q 12 ? GLU Q 16 ? THR U 12 GLU U 16 AC5 2 GLN Q 2 ? THR Q 7 ? GLN U 2 THR U 7 AC5 3 GLU Q 64 ? LEU Q 71 ? GLU U 64 LEU U 71 AC5 4 GLN Q 41 ? PHE Q 45 ? GLN U 41 PHE U 45 AC5 5 LYS Q 48 ? GLN Q 49 ? LYS U 48 GLN U 49 AC6 1 VAL R 5 ? LYS R 6 ? VAL V 5 LYS V 6 AC6 2 THR R 12 ? ILE R 13 ? THR V 12 ILE V 13 AC7 1 GLN R 41 ? LEU R 43 ? GLN V 41 LEU V 43 AC7 2 LEU R 69 ? LEU R 71 ? LEU V 69 LEU V 71 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 3 N VAL A 9 ? 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PDB 'experimental model' 1ubq 2 # _em_3d_reconstruction.entry_id 9SMN _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 3.2 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 113100 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ;0.5% octyl-glucoside, 150 mM NaCl, 20 mM HEPES, pH 8.0 buffer was added as 10x to protein in 150 mM NaCl, 20 mM HEPES pH 8.0 prior to grid freezing. ; _em_buffer.pH 8.0 # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details _em_entity_assembly.entity_id_list 1 0 RECOMBINANT COMPLEX 'BRCA1-A complex bound to Lys-63 linked polyubiquitin chains' ? ? ? 1,2,3,4,5,6,8 2 1 RECOMBINANT COMPLEX 'BRCA1-A complex' ? ? ? 1,2,3,4,5 3 1 RECOMBINANT COMPLEX 'Lys-63 Polyubiquitin chain analog' 'Visible ubiquitin moieties deriving from two copies of an uncleavable synthetic analog of Lys-63 polyubiquitin chains;' ? ? 6,8 # _em_imaging.entry_id 9SMN _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'TFS KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_min 1250 _em_imaging.nominal_defocus_max 2000 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification 105000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter 50.0 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.objective_aperture ? _em_imaging.microscope_serial_number ? _em_imaging.microscope_version ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.method ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R2/2' _em_sample_support.details 'Current: 30 mA' _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.entry_id 9SMN _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature 277 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ;Blot time: 5 s Blot Force: 0 ; # _em_experiment.entry_id 9SMN _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 9SMN _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? A MET 1 2 1 Y 1 A ASN 314 ? A ASN 314 3 1 Y 1 A HIS 315 ? A HIS 315 4 1 Y 1 A HIS 316 ? A HIS 316 5 1 Y 1 A LEU 317 ? A LEU 317 6 1 Y 1 A ASP 318 ? A ASP 318 7 1 Y 1 A VAL 319 ? A VAL 319 8 1 Y 1 A VAL 327 ? A VAL 327 9 1 Y 1 A GLU 328 ? A GLU 328 10 1 Y 1 A HIS 329 ? A HIS 329 11 1 Y 1 A THR 330 ? A THR 330 12 1 Y 1 A ASP 331 ? A ASP 331 13 1 Y 1 A ILE 332 ? A ILE 332 14 1 Y 1 A PRO 333 ? A PRO 333 15 1 Y 1 A GLU 334 ? A GLU 334 16 1 Y 1 A ALA 335 ? A ALA 335 17 1 Y 1 A SER 336 ? A SER 336 18 1 Y 1 A PRO 337 ? A PRO 337 19 1 Y 1 A ALA 338 ? A ALA 338 20 1 Y 1 A SER 339 ? A SER 339 21 1 Y 1 A THR 340 ? A THR 340 22 1 Y 1 A PRO 341 ? A PRO 341 23 1 Y 1 A GLN 342 ? A GLN 342 24 1 Y 1 A ILE 343 ? A ILE 343 25 1 Y 1 A ILE 344 ? A ILE 344 26 1 Y 1 A LYS 345 ? A LYS 345 27 1 Y 1 A HIS 346 ? A HIS 346 28 1 Y 1 A LYS 347 ? A LYS 347 29 1 Y 1 A ALA 348 ? A ALA 348 30 1 Y 1 A LEU 349 ? A LEU 349 31 1 Y 1 A ASP 350 ? A ASP 350 32 1 Y 1 A LEU 351 ? A LEU 351 33 1 Y 1 A ASP 352 ? 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N N 105 DAB C OXT sing N N 106 DAB CB CG sing N N 107 DAB CB HB2 sing N N 108 DAB CB HB3 sing N N 109 DAB CG ND sing N N 110 DAB CG HG2 sing N N 111 DAB CG HG3 sing N N 112 DAB ND HD1 sing N N 113 DAB ND HD2 sing N N 114 DAB OXT HXT sing N N 115 GLN N CA sing N N 116 GLN N H sing N N 117 GLN N H2 sing N N 118 GLN CA C sing N N 119 GLN CA CB sing N N 120 GLN CA HA sing N N 121 GLN C O doub N N 122 GLN C OXT sing N N 123 GLN CB CG sing N N 124 GLN CB HB2 sing N N 125 GLN CB HB3 sing N N 126 GLN CG CD sing N N 127 GLN CG HG2 sing N N 128 GLN CG HG3 sing N N 129 GLN CD OE1 doub N N 130 GLN CD NE2 sing N N 131 GLN NE2 HE21 sing N N 132 GLN NE2 HE22 sing N N 133 GLN OXT HXT sing N N 134 GLU N CA sing N N 135 GLU N H sing N N 136 GLU N H2 sing N N 137 GLU CA C sing N N 138 GLU CA CB sing N N 139 GLU CA HA sing N N 140 GLU C O doub N N 141 GLU C OXT sing N N 142 GLU CB CG sing N N 143 GLU CB HB2 sing N N 144 GLU CB HB3 sing N N 145 GLU CG CD sing N N 146 GLU CG HG2 sing N N 147 GLU CG HG3 sing N N 148 GLU CD OE1 doub N N 149 GLU CD OE2 sing N N 150 GLU OE2 HE2 sing N N 151 GLU OXT HXT sing N N 152 GLY N CA sing N N 153 GLY N H sing N N 154 GLY N H2 sing N N 155 GLY CA C sing N N 156 GLY CA HA2 sing N N 157 GLY CA HA3 sing N N 158 GLY C O doub N N 159 GLY C OXT sing N N 160 GLY OXT HXT sing N N 161 HIS N CA sing N N 162 HIS N H sing N N 163 HIS N H2 sing N N 164 HIS CA C sing N N 165 HIS CA CB sing N N 166 HIS CA HA sing N N 167 HIS C O doub N N 168 HIS C OXT sing N N 169 HIS CB CG sing N N 170 HIS CB HB2 sing N N 171 HIS CB HB3 sing N N 172 HIS CG ND1 sing Y N 173 HIS CG CD2 doub Y N 174 HIS ND1 CE1 doub Y N 175 HIS ND1 HD1 sing N N 176 HIS CD2 NE2 sing Y N 177 HIS CD2 HD2 sing N N 178 HIS CE1 NE2 sing Y N 179 HIS CE1 HE1 sing N N 180 HIS NE2 HE2 sing N N 181 HIS OXT HXT sing N N 182 ILE N CA sing N N 183 ILE N H sing N N 184 ILE N H2 sing N N 185 ILE CA C sing N N 186 ILE CA CB sing N N 187 ILE CA HA sing N N 188 ILE C O doub N N 189 ILE C OXT sing N N 190 ILE CB CG1 sing N 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N N 403 VAL CG2 HG22 sing N N 404 VAL CG2 HG23 sing N N 405 VAL OXT HXT sing N N 406 # _em_admin.current_status REL _em_admin.deposition_date 2025-09-08 _em_admin.deposition_site PDBE _em_admin.entry_id 9SMN _em_admin.last_update 2026-06-17 _em_admin.map_release_date 2026-06-17 _em_admin.title 'BRCA1-A complex bound to K63-polyUbATA - open form StateC StateP' # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.id _em_buffer_component.name 1 150 mM NaCl 1 'Sodium Chloride' 1 20 mM C8H18N2O4S 2 '2-[4-(2-Hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethane-1-sulfonic acid (HEPES)' 1 0.05 '% (v/v)' C14H28O6 3 'Octyl beta-D-glucopyranoside (Octyl glucoside)' 1 2 mM C9H15O6P 4 'tris(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP)' # _em_ctf_correction.details ? _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' # loop_ _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag _em_entity_assembly_molwt.id _em_entity_assembly_molwt.units _em_entity_assembly_molwt.value 1 NO 1 MEGADALTONS 0.454 1 NO 2 MEGADALTONS 0.369 3 ? 3 ? ? # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.cell _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organ _em_entity_assembly_naturalsource.strain _em_entity_assembly_naturalsource.tissue _em_entity_assembly_naturalsource.details ? ? 1 2 9606 'Homo sapiens' ? ? ? ? ? ? ? 2 3 9606 'Homo sapiens' ? ? ? ? ? ? ? 3 4 9606 'Homo sapiens' ? ? ? ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain ? 1 2 7108 'Spodoptera frugiperda' ? ? ? 2 3 7108 'Spodoptera frugiperda' ? ? ? 3 4 7108 'Spodoptera frugiperda' ? ? # _em_image_processing.details ? _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 # _em_image_recording.average_exposure_time 2.28 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ? _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 50 _em_image_recording.details ;8017 images collected without tilt, 5 shots / hole at rim of hole (no particles at center due to lensing); 3768 images tilted 30 degrees, collected from same grid, different session, same imaging conditions, 4 shots / hole. 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