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L . n J 3 171 VAL 171 171 171 VAL VAL L . n J 3 172 GLU 172 172 172 GLU GLU L . n J 3 173 VAL 173 173 173 VAL VAL L . n # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 9TII _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 9TII _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9TII _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 9TII _struct.title 'Phage 812 baseplate in the pre-contraction state - lower arm (segment C)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9TII _struct_keywords.text 'phage, baseplate, VIRUS' _struct_keywords.pdbx_keywords VIRUS # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 3 ? H N N 3 ? I N N 3 ? J N N 3 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP Q6Y7Q4_BPPGK Q6Y7Q4 ? 1 ;MANFLKNLHPLLRRDRNKKDNQDPNFALIDALNEEMNQVEKDAIESKLQSSLKTSTSEYLDKFGDWFGVYRKTDEKDDVY RARIIKYLLLKRGTNNAIIDAIKDYLGRDDIDVSVYEPFTNIFYTNKSHLNGEDHLMGYYYRFAVINVSIGDYFPVEIID VINEFKPAGVTLYVTYDGASTIRGGAIIKWLDGLPKIETYQEFDRFTGYDDTFYGHINMNQSKDTDNSSSDIFKTNHSLI NSLDVLTGSSSVGRQYINYGYVTSYVYNPGMTSSVNQISASTEGRGQEVPTDYYMYTSTKNNNTVELSMQTTSGVSYLYN NFNFRDYMSKYRPQVDLQSDEARRIVSDYIKELSIDYYLSAVIPPDESIEIKLQVYDFSINRWLTVSINNLSFYEKNIGS NIGYIKDYLNSELNMFTRLEINAGKRDSVDIKVNYLDLMFYYYERGIYTIKPYKALIENYLDISRETYVEAFKIASLSNG DIITKTGFQPIGYLKLVGNYENTIPSTINIVAKDTDNNPIESNELDVYNTVENRNLLQSYKGVNTIAREITSTKEFTVSG WAKEIYSTNYLSKVLKPGKVYTLSFDMEITGNDPTLKSYSDNHGIYLYSNTKGIVVNGVKSMERTIGNKVSVTQTFTAPT ITDHRLLIYTGRYTSDGKASTPPVFFNTVKITELKLTEGSSKLEYSPAPEDKPNVIEKGIKFNNILTNIQTLSINSDTIL KNVTLYYSYYGDSWVELKTLGNISTGETTETNNLIDLYGLQTVDYSNINPMSKVSLRSIWNVKLGELNNQEGSLSNMPND YFNAVWQDIDKLSDIELGSMRMVKDTEGGVFDGATGEIIKATLFNVGAYTDLDMLAYTLTNYTEPLTLGSSRLISELKEE LLTSESFNVDNRIKVIDSIYEELPNTSIIKNGFVEREVTGSKYLDYGLYEPIEDGTRYKLIVEGEFKDNIEFISLYNSNP NFNETFIYPSEIINGVAEKEFIAKPSTEDKPRLNTDVRIYIRPYDSTISKVRRVELRKV ; 1 2 UNP Q6Y7P9_BPPGK Q6Y7P9 ? 2 ;MALNFTTITENNVIRDLTTQVNNIGEELTKERNIFDITDDLVYNFNKSQKIKLTDDKGLTKSYGNITALRDIKEPGYYYI GARTLATLLDRPDMESLDVVLHVVPLDTSSKVVQHLYTLSTNNNQIKMLYRFVSGNSSSEWQFIQGLPSNKNAVISGTNI LDIASPGVYFVMGMTGGMPSGVSSGFLDLSVDANDNRLARLTDAETGKEYTSIKKPTGTYTAWKKEFEPKDMEKYLLSSI RDDGSASFPLLVYTSDSKTFQQAIIDHIDRTGQTTFTFYVQGGVSGSPMSNSCRGLFMSDTPNTSSLHGVYNAIGTDGRN VTGSVVGSNWTSPKTSPSHKELWTGAQSFLSTGTTKNLSDDISNYSYVEVYTTHKTTEKTKGNDNTGTICHKFYLDGSGT YVCSGTFVSGDRTDTKPPITEFYRVGVSFKGSTWTLVDSAVQNSKTQYVTRIIGINMP ; 1 3 UNP Q6Y7Q3_BPPGK Q6Y7Q3 ? 3 ;MAIATYNSHVELAKYLVSKADSVYLTIGKSTPWSNETNPPQPDENATVLQEVIGYKKATKVTLVRPSKSPEDDNKNLISY GNKSWVEVTPENAKAEGAKWVYLESSIVGDELPLGTYRQVGFVMDLVAKSGISKFNLVPSEVESTGTLLFFDNKQFQNRS EQTTAKERFIVEV ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9TII A 1 ? 1019 ? Q6Y7Q4 1 ? 1019 ? 1 1019 2 2 9TII B 1 ? 458 ? Q6Y7P9 1 ? 458 ? 1 458 3 2 9TII C 1 ? 458 ? Q6Y7P9 1 ? 458 ? 1 458 4 2 9TII D 1 ? 458 ? Q6Y7P9 1 ? 458 ? 1 458 5 3 9TII E 1 ? 173 ? Q6Y7Q3 1 ? 173 ? 1 173 6 3 9TII H 1 ? 173 ? Q6Y7Q3 1 ? 173 ? 1 173 7 3 9TII I 1 ? 173 ? Q6Y7Q3 1 ? 173 ? 1 173 8 3 9TII J 1 ? 173 ? Q6Y7Q3 1 ? 173 ? 1 173 9 3 9TII K 1 ? 173 ? Q6Y7Q3 1 ? 173 ? 1 173 10 3 9TII L 1 ? 173 ? Q6Y7Q3 1 ? 173 ? 1 173 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details decameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 10 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 567 ? LEU A 575 ? SER A 567 LEU A 575 1 ? 9 HELX_P HELX_P2 AA2 ALA A 688 ? LYS A 692 ? ALA A 688 LYS A 692 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 VAL B 13 ? LEU B 28 ? VAL B 13 LEU B 28 1 ? 16 HELX_P HELX_P4 AA4 ASN B 33 ? LYS B 47 ? ASN B 33 LYS B 47 1 ? 15 HELX_P HELX_P5 AA5 VAL C 13 ? LEU C 28 ? VAL C 13 LEU C 28 1 ? 16 HELX_P HELX_P6 AA6 ASN C 33 ? SER C 48 ? ASN C 33 SER C 48 1 ? 16 HELX_P HELX_P7 AA7 VAL D 13 ? LEU D 28 ? VAL D 13 LEU D 28 1 ? 16 HELX_P HELX_P8 AA8 ASN D 33 ? ASN D 46 ? ASN D 33 ASN D 46 1 ? 14 HELX_P HELX_P9 AA9 THR E 5 ? SER E 18 ? THR E 5 SER E 18 1 ? 14 HELX_P HELX_P10 AB1 LYS E 19 ? SER E 22 ? LYS E 19 SER E 22 5 ? 4 HELX_P HELX_P11 AB2 LYS E 68 ? ASP E 73 ? LYS E 68 ASP E 73 1 ? 6 HELX_P HELX_P12 AB3 ASN E 92 ? GLY E 97 ? ASN E 92 GLY E 97 5 ? 6 HELX_P HELX_P13 AB4 VAL E 138 ? VAL E 142 ? VAL E 138 VAL E 142 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 AB5 THR F 5 ? LYS F 19 ? THR H 5 LYS H 19 1 ? 15 HELX_P HELX_P15 AB6 ALA F 20 ? SER F 22 ? ALA H 20 SER H 22 5 ? 3 HELX_P HELX_P16 AB7 ASN F 92 ? GLY F 97 ? ASN H 92 GLY H 97 5 ? 6 HELX_P HELX_P17 AB8 VAL F 138 ? VAL F 142 ? VAL H 138 VAL H 142 5 ? 5 HELX_P HELX_P18 AB9 THR G 5 ? LYS G 19 ? THR I 5 LYS I 19 1 ? 15 HELX_P HELX_P19 AC1 ALA G 20 ? SER G 22 ? ALA I 20 SER I 22 5 ? 3 HELX_P HELX_P20 AC2 ASN G 92 ? GLY G 97 ? ASN I 92 GLY I 97 5 ? 6 HELX_P HELX_P21 AC3 VAL G 138 ? VAL G 142 ? VAL I 138 VAL I 142 5 ? 5 HELX_P HELX_P22 AC4 THR H 5 ? LYS H 19 ? THR J 5 LYS J 19 1 ? 15 HELX_P HELX_P23 AC5 ALA H 20 ? SER H 22 ? ALA J 20 SER J 22 5 ? 3 HELX_P HELX_P24 AC6 ASN H 92 ? GLY H 97 ? ASN J 92 GLY J 97 5 ? 6 HELX_P HELX_P25 AC7 VAL H 138 ? VAL H 142 ? VAL J 138 VAL J 142 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 AC8 THR I 5 ? LYS I 19 ? THR K 5 LYS K 19 1 ? 15 HELX_P HELX_P27 AC9 ASN I 92 ? GLY I 97 ? ASN K 92 GLY K 97 5 ? 6 HELX_P HELX_P28 AD1 VAL I 138 ? VAL I 142 ? VAL K 138 VAL K 142 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 AD2 THR J 5 ? LYS J 19 ? THR L 5 LYS L 19 1 ? 15 HELX_P HELX_P30 AD3 ALA J 20 ? SER J 22 ? ALA L 20 SER L 22 5 ? 3 HELX_P HELX_P31 AD4 ASN J 92 ? GLY J 97 ? ASN L 92 GLY L 97 5 ? 6 HELX_P HELX_P32 AD5 VAL J 138 ? VAL J 142 ? VAL L 138 VAL L 142 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id PRO _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 662 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id A _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id PRO _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 662 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id A _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 663 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 A _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 663 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 A _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle -13.83 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 8 ? AA3 ? 5 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 6 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 6 ? AB2 ? 6 ? AB3 ? 5 ? AB4 ? 5 ? AB5 ? 5 ? AB6 ? 5 ? 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