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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.580 ? 16888 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.842 ? 1684 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.042 ? 1943 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 2122 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 9VY0 _struct.title 'Cryo-EM Structure of Peste Des Petits Ruminants Virus Polymerase in complex with ERDRP-0519' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9VY0 _struct_keywords.text 'Polymerase, inhibitor, complex, RNA, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP Q5ZER1_PPRV Q5ZER1 ? 1 ;MDSLSVNQVLYPEVHLDSPIVTNKLVAILEYSGIDHNYVLEDQTLVKNIRYRLGCGFSNQMIINNRGVGETVNSKLKSYP HNRHIIYPDCNKELFCIKDSCISKKLSELFKKGNSLYSKISHQVLDCLKRVNGKLGLGTDLTYGLKEGILDLGLHMHSSQ WFETFLFWFTIKTEMRSMIKEQSHICHKRRYNPIFVSGDAFEVLVSRDLVVIIDKNTQYVFYLTFELVLMYCDVIEGRLM TETAMAIDQRYSELLSRVRYLWDLIDGFFPTLGNTTYQVVALLEPLSLAYLQLQDVTLELRGAFLDHCFKELYEILEHCG IDTEGTYNSITEGLDYVFITHDIHLTGEIFSFFRSFGHPRLEAVTAAENVRKHMNQPKVISYETMMKGHAVFCGIIINGF RDRHGGSWPPVALPEHASAAIRNAQASGEGLTHDLCIDNWKSFVGFKFGCFMPLSLDSDLTMYLKDKALAALKNEWDSVY PKEYLRYNPPRGTESRRLVEVFLNDSSFDPYNMIMYVVNGSYLKDPEFNLSYSLKEKEIKETGRLFAKMTYKMRACQVIA ENLISNGVGKYFRDNGMAKDEHDLTKALHTLAVSGVPKNNKDNHRGGPPRRTTNREVRSSQDTKTQNRDKVQGGPVYNYL RCQPISPDQGESYETVSAFITADLKKYCLNWRYETISIFAQRLNEIYGLPSFFQWLHRILEKSVLYVSDPHCPPDLDNHI PLDSVPNAQIFIKYPMGGIEGYCQKLWTISTIPYLYLAAYESGVRIASLVQGDNQTIAVTKRVPSSWPYSLKKREASKAA QNYFVVLRQRLHDVGHHLKANETIVSSHFFVYSKGIYYDGLLVSQSLKSIARCVFWSETIVDETRAACSNIATTVAKSIE RGYDRYLAYSLNILKIFQQILISLNFTINTTMTQDVVAPIIENGDLLIRMALLPAPIGGLNYLNMSRLFVRNIGDPVTSS IADLKRMIDAGLMPEETLHQVMTQTPGESSYLDWASDPYSANLPCVQSITRLLKNITARYILISSPNPMLKGLFHEGSRD EDEELASFLMDRHIIVPRAAHEILDHSITGAREAIAGMLDTTKGLIRTSMKRGGLTPRVLARLSNYDYEQFRSGITLLTK KGQCYLIDKDSCSVQLAIALRSHMWARLARGRPIYGLEVPDILESMNGYLIKRHESCAICETGSSHYGWFFVPAGCQLDD VSRETSALRVPYVGSTTEERTDMKLAFVRSPSRSLKSAVRIATVYSWAYGDDEKSWGEAWMLARQRANITLDELRMITPV STSTNLAHRLRDRSTQVKYSGTSLVRVARYTTISNDNLSFVISEKKVDTNFIYQQGMLLGLGILENLFRLEATTGVSNTV LHLHVETECCVVPMVDHPRIPSLRNIKVTDELCTNPLIYDRSPIIEHDATRLYSQSHRRHLVEFVTWSTSQLYHILAKST AMSMIELITRFEKDHMNEIAALIGDDDINSFITEFLLVEPRLFIVYLGQCAAINWAFDIHYHRPSGKHQMGELLYSLLSR MSKGVYKIFTNALSHPKVYKKFWRSGVIEPIHGPSLDTQNLHVTVCDMIYGSYVTYLDLLLNDELDDYPYLLCESDEDVV TDRFDNIQAKHLCVLADVYCSSKRCPSIIGMSPIEKCTILTHYIKGESVQSPSGTSWNTDPLVVDHYSCSLTYLRCGSIK QIRLRVDPGFVFEALTDVDFKQPRKAKLDISVVGLTDFSPPCDNVGDFLGTINTLRHNLPVTGTGVSNYEVHAYRRIGLN SSACYKAVEISTLIRPSLEVGEHGLFLGEGSGSMLAAYKEVLKLANCYYNSGVTAEGRAGQREISPYPSEMSLVENQMGI ERSVKVLFNGKPEVTWVGTTDCYKYIISNIQTSSLGFIHSDIETLPTKDAVEKLEEFASILSLSLILGKIGSITVVKVMP ISGDFTQGFIAYAIQYFRESLLAYPRYSNFISTECYLIMIGLKANRLINPEAIKQSIIRAGVRTAPGLVSHILSGKQKGC IQSFLGDPYIQGDFNKHLKSLTPIEKILVNCGLSINGTKICRDLIHHDIASGPDGLMSSTIILYRELAHFKDNIRSQHGM FHPYPVLANSRQRELILRIAKKFWGYVLLYSDDPALIRQTIKNLKRNHLTFDLHSNPFIKGLSKAEKLLVRTSSLRREWL FTLDTKEVKEWFKLVGYSALIRG ; 1 2 UNP Q5ZER7_PPRV Q5ZER7 ? 2 ;MAEEQAYHVNKGLECIKSLKASPPDLSTIRDTIESWREGLSPSGRATPNPDTSEGDHQSINQSCSPAIGPNKVYLSPGDN LGFREITGNDCEAGLGGVQGKRSNSQVQRYYVYSHGGEEIEGLEDADSLVVQADPPVANVFNGGEDGSDDSDVDSGPDDP SRDTLYDRGSVAGNDVARSTDVEKLEGADIQEVLNSQKGKGGRFQGGKTLRVPEIPDVKHSRPSAQSIKKGTDGNSVSSG TVTECLSISGATQAVPESRWESSEQNASVGSVLKSARSAETIQGLTQESGTIASLTQPKENDSEYEYEDDLFKEIQDIRA SIAKIHDDNKTILSKLDSILLLKGEVDTIKKQISKQNISISTIEGHLSSIMIAIPGFGKDIKDPTSEVELNPDLRPIISR DSGRALAEVLKKPAVDRSQKIGTKANSSSKGQLLKDLQLKPVDKQASSAIGFVPSDHESSRNVIRSIIKSSKLNTDHKDY LLDLLNDVKGSKDLKEFHKMLTAILAKHP ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9VY0 A 1 ? 2183 ? 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Q5ZER7 1 ? 509 ? 1 509 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 VAL A 21 ? 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TYR A 667 TRP A 671 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 AD3 ARG A 672 ? GLY A 688 ? ARG A 672 GLY A 688 1 ? 17 HELX_P HELX_P31 AD4 TRP A 695 ? LEU A 700 ? TRP A 695 LEU A 700 1 ? 6 HELX_P HELX_P32 AD5 PRO A 721 ? VAL A 725 ? PRO A 721 VAL A 725 5 ? 5 HELX_P HELX_P33 AD6 CYS A 743 ? GLY A 763 ? CYS A 743 GLY A 763 1 ? 21 HELX_P HELX_P34 AD7 PRO A 788 ? ASP A 813 ? PRO A 788 ASP A 813 1 ? 26 HELX_P HELX_P35 AD8 SER A 846 ? ALA A 851 ? SER A 846 ALA A 851 1 ? 6 HELX_P HELX_P36 AD9 GLU A 863 ? ARG A 881 ? GLU A 863 ARG A 881 1 ? 19 HELX_P HELX_P37 AE1 ASP A 884 ? PHE A 906 ? ASP A 884 PHE A 906 1 ? 23 HELX_P HELX_P38 AE2 THR A 913 ? GLU A 922 ? THR A 913 GLU A 922 1 ? 10 HELX_P HELX_P39 AE3 GLY A 924 ? LEU A 933 ? GLY A 924 LEU A 933 1 ? 10 HELX_P HELX_P40 AE4 PRO A 934 ? GLY A 938 ? PRO A 934 GLY A 938 5 ? 5 HELX_P HELX_P41 AE5 ASP A 955 ? ALA A 970 ? ASP A 955 ALA A 970 1 ? 16 HELX_P HELX_P42 AE6 PRO A 974 ? GLN A 980 ? PRO A 974 GLN A 980 5 ? 7 HELX_P HELX_P43 AE7 SER A 990 ? ASP A 997 ? SER A 990 ASP A 997 1 ? 8 HELX_P HELX_P44 AE8 SER A 1008 ? LEU A 1022 ? SER A 1008 LEU A 1022 1 ? 15 HELX_P HELX_P45 AE9 SER A 1038 ? ASP A 1051 ? SER A 1038 ASP A 1051 1 ? 14 HELX_P HELX_P46 AF1 VAL A 1056 ? HIS A 1066 ? VAL A 1056 HIS A 1066 1 ? 11 HELX_P HELX_P47 AF2 SER A 1067 ? LEU A 1079 ? SER A 1067 LEU A 1079 1 ? 13 HELX_P HELX_P48 AF3 THR A 1082 ? ARG A 1092 ? THR A 1082 ARG A 1092 1 ? 11 HELX_P HELX_P49 AF4 THR A 1096 ? ASN A 1105 ? THR A 1096 ASN A 1105 1 ? 10 HELX_P HELX_P50 AF5 TYR A 1106 ? THR A 1119 ? TYR A 1106 THR A 1119 1 ? 14 HELX_P HELX_P51 AF6 CYS A 1132 ? TRP A 1145 ? CYS A 1132 TRP A 1145 1 ? 14 HELX_P HELX_P52 AF7 ALA A 1178 ? GLY A 1183 ? ALA A 1178 GLY A 1183 5 ? 6 HELX_P HELX_P53 AF8 VAL A 1307 ? THR A 1311 ? VAL A 1307 THR A 1311 5 ? 5 HELX_P HELX_P54 AF9 TYR A 1333 ? PHE A 1348 ? TYR A 1333 PHE A 1348 1 ? 16 HELX_P HELX_P55 AG1 ILE B 318 ? SER B 369 ? ILE B 318 SER B 369 1 ? 52 HELX_P HELX_P56 AG2 GLU B 458 ? SER B 471 ? GLU B 458 SER B 471 1 ? 14 HELX_P HELX_P57 AG3 HIS B 477 ? ASN B 486 ? HIS B 477 ASN B 486 1 ? 10 HELX_P HELX_P58 AG4 GLY B 490 ? MET B 500 ? GLY B 490 MET B 500 1 ? 11 HELX_P HELX_P59 AG5 THR B 502 ? HIS B 508 ? THR B 502 HIS B 508 1 ? 7 HELX_P HELX_P60 AG6 ILE C 318 ? ILE C 374 ? ILE C 318 ILE C 374 1 ? 57 HELX_P HELX_P61 AG7 ILE D 318 ? MET D 371 ? ILE D 318 MET D 371 1 ? 54 HELX_P HELX_P62 AG8 ILE E 318 ? SER E 369 ? ILE E 318 SER E 369 1 ? 52 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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