data_9VZW # _entry.id 9VZW # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.404 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 9VZW pdb_00009vzw 10.2210/pdb9vzw/pdb WWPDB D_1300061867 ? ? BMRB 36774 ? 10.13018/BMR36774 # _pdbx_audit_revision_history.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_history.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_history.major_revision 1 _pdbx_audit_revision_history.minor_revision 0 _pdbx_audit_revision_history.revision_date 2025-08-06 _pdbx_audit_revision_history.part_number ? # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr . _pdbx_database_status.entry_id 9VZW _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2025-07-23 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_cs . _pdbx_database_status.status_code_nmr_data REL _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # _pdbx_database_related.db_name BMRB _pdbx_database_related.details 'A solution NMR model of Z-form DNA binding with ligand CBL0137' _pdbx_database_related.db_id 36774 _pdbx_database_related.content_type unspecified # _pdbx_contact_author.id 3 _pdbx_contact_author.email xuyan@med.miyazaki-u.ac.jp _pdbx_contact_author.name_first Yan _pdbx_contact_author.name_last Xu _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0003-0379-8866 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Wang, S.Y.' 1 0009-0005-9551-4817 'Liu, F.F.' 2 ? 'Xu, Y.' 3 0000-0003-0379-8866 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'To Be Published' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD 0353 _citation.journal_id_ISSN ? _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Uncovering the structure of Z-form DNA-CBL0137 complex in vitro and in cells' _citation.year ? _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI ? _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Liu, F.F.' 1 ? primary 'Wang, S.Y.' 2 ? primary 'Xu, Y.' 3 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer syn ;DNA (5'-D(*CP*GP*CP*(FG)P*CP*G)-3') ; 1896.194 2 ? ? ? ? 2 non-polymer syn CBL0137 336.427 2 ? ? ? ? # _entity_poly.entity_id 1 _entity_poly.type polydeoxyribonucleotide _entity_poly.nstd_linkage no _entity_poly.nstd_monomer yes _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code '(DC)(DG)(DC)(A1MA9)(DC)(DG)' _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can CGCGCG _entity_poly.pdbx_strand_id A,B _entity_poly.pdbx_target_identifier ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 2 _pdbx_entity_nonpoly.name CBL0137 _pdbx_entity_nonpoly.comp_id A1MA8 # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DC n 1 2 DG n 1 3 DC n 1 4 A1MA9 n 1 5 DC n 1 6 DG n # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num 6 _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific 'Homo sapiens' _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id 9606 _pdbx_entity_src_syn.details ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A1MA8 non-polymer . CBL0137 '1-[6-ethanoyl-9-[2-(propan-2-ylamino)ethyl]carbazol-3-yl]ethanone' 'C21 H24 N2 O2' 336.427 A1MA9 'DNA linking' n ;8-CF3-2'F-riboguanosine monophosphate ; ;[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-[2-azanyl-6-oxidanylidene-8-(trifluoromethyl)-1~{H}-purin-9-yl]-4-fluoranyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate ; 'C11 H12 F4 N5 O7 P' 433.210 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 DC 1 1 1 DC DC A . n A 1 2 DG 2 2 2 DG DG A . n A 1 3 DC 3 3 3 DC DC A . n A 1 4 A1MA9 4 4 4 A1MA9 FG A . n A 1 5 DC 5 5 5 DC DC A . n A 1 6 DG 6 6 6 DG DG A . n B 1 1 DC 1 1 1 DC DC B . n B 1 2 DG 2 2 2 DG DG B . n B 1 3 DC 3 3 3 DC DC B . n B 1 4 A1MA9 4 4 4 A1MA9 FG B . n B 1 5 DC 5 5 5 DC DC B . n B 1 6 DG 6 6 6 DG DG B . n # _pdbx_entity_instance_feature.ordinal 1 _pdbx_entity_instance_feature.comp_id A1MA8 _pdbx_entity_instance_feature.asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id A1MA8 _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.feature_type 'SUBJECT OF INVESTIGATION' _pdbx_entity_instance_feature.details ? # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 A1MA8 1 101 2 A1MA8 CBL A . D 2 A1MA8 1 101 1 A1MA8 CBL B . # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9VZW _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 9VZW _struct.title 'A solution NMR model of Z-form DNA binding with ligand CBL0137' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9VZW _struct_keywords.text 'Z-form DNA, Ligand CBL0137, DNA-ligand complex, Solution NMR model, DNA' _struct_keywords.pdbx_keywords DNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 2 ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name PDB _struct_ref.db_code 9VZW _struct_ref.pdbx_db_accession 9VZW _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ? _struct_ref.pdbx_align_begin 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9VZW A 1 ? 6 ? 9VZW 1 ? 6 ? 1 6 2 1 9VZW B 1 ? 6 ? 9VZW 1 ? 6 ? 1 6 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'NMR Distance Restraints' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale both ? A DC 3 "O3'" ? ? ? 1_555 A A1MA9 4 P ? ? A DC 3 A A1MA9 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.552 ? ? covale2 covale one ? A A1MA9 4 "O3'" ? ? ? 1_555 A DC 5 P ? ? A A1MA9 4 A DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? ? covale3 covale both ? B DC 3 "O3'" ? ? ? 1_555 B A1MA9 4 P ? ? B DC 3 B A1MA9 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.552 ? ? covale4 covale one ? B A1MA9 4 "O3'" ? ? ? 1_555 B DC 5 P ? ? B A1MA9 4 B DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.538 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A DC 1 N3 ? ? ? 1_555 B DG 6 N1 ? ? A DC 1 B DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DC 1 N4 ? ? ? 1_555 B DG 6 O6 ? ? A DC 1 B DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DC 1 O2 ? ? ? 1_555 B DG 6 N2 ? ? A DC 1 B DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DG 2 N1 ? ? ? 1_555 B DC 5 N3 ? ? A DG 2 B DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DG 2 N2 ? ? ? 1_555 B DC 5 O2 ? ? A DG 2 B DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DG 2 O6 ? ? ? 1_555 B DC 5 N4 ? ? A DG 2 B DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DC 3 N3 ? ? ? 1_555 B A1MA9 4 N1 ? ? A DC 3 B A1MA9 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DC 3 N4 ? ? ? 1_555 B A1MA9 4 O6 ? ? A DC 3 B A1MA9 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DC 3 O2 ? ? ? 1_555 B A1MA9 4 N2 ? ? A DC 3 B A1MA9 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A A1MA9 4 N1 ? ? ? 1_555 B DC 3 N3 ? ? A A1MA9 4 B DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A A1MA9 4 N2 ? ? ? 1_555 B DC 3 O2 ? ? A A1MA9 4 B DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A A1MA9 4 O6 ? ? ? 1_555 B DC 3 N4 ? ? A A1MA9 4 B DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DC 5 N3 ? ? ? 1_555 B DG 2 N1 ? ? A DC 5 B DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DC 5 N4 ? ? ? 1_555 B DG 2 O6 ? ? A DC 5 B DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DC 5 O2 ? ? ? 1_555 B DG 2 N2 ? ? A DC 5 B DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DG 6 N1 ? ? ? 1_555 B DC 1 N3 ? ? A DG 6 B DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DG 6 N2 ? ? ? 1_555 B DC 1 O2 ? ? A DG 6 B DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DG 6 O6 ? ? ? 1_555 B DC 1 N4 ? ? A DG 6 B DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? hydrog ? ? # _pdbx_entry_details.entry_id 9VZW _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y _pdbx_entry_details.has_protein_modification N # loop_ _pdbx_validate_rmsd_bond.id _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_target_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.linker_flag 1 1 C4 A DC 1 ? ? C5 A DC 1 ? ? 1.375 1.425 -0.050 0.008 N 2 1 N1 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? 1.324 1.373 -0.049 0.008 N 3 1 N7 A DG 2 ? ? C8 A DG 2 ? ? 1.352 1.305 0.047 0.006 N 4 1 C4 A DC 3 ? ? C5 A DC 3 ? ? 1.375 1.425 -0.050 0.008 N 5 1 "O3'" A A1MA9 4 ? ? P A DC 5 ? ? 1.527 1.607 -0.080 0.012 Y 6 1 C4 A DC 5 ? ? C5 A DC 5 ? ? 1.375 1.425 -0.050 0.008 N 7 1 C5 A DC 5 ? ? C6 A DC 5 ? ? 1.389 1.339 0.050 0.008 N 8 1 N1 A DG 6 ? ? C2 A DG 6 ? ? 1.322 1.373 -0.051 0.008 N 9 1 N7 A DG 6 ? ? C8 A DG 6 ? ? 1.347 1.305 0.042 0.006 N 10 1 C4 B DC 1 ? ? C5 B DC 1 ? ? 1.376 1.425 -0.049 0.008 N 11 1 C5 B DC 1 ? ? C6 B DC 1 ? ? 1.387 1.339 0.048 0.008 N 12 1 N1 B DG 2 ? ? C2 B DG 2 ? ? 1.324 1.373 -0.049 0.008 N 13 1 N7 B DG 2 ? ? C8 B DG 2 ? ? 1.348 1.305 0.043 0.006 N 14 1 C4 B DC 3 ? ? C5 B DC 3 ? ? 1.376 1.425 -0.049 0.008 N 15 1 C5 B DC 3 ? ? C6 B DC 3 ? ? 1.389 1.339 0.050 0.008 N 16 1 C4 B DC 5 ? ? C5 B DC 5 ? ? 1.373 1.425 -0.052 0.008 N 17 1 N1 B DG 6 ? ? C2 B DG 6 ? ? 1.322 1.373 -0.051 0.008 N 18 1 N7 B DG 6 ? ? C8 B DG 6 ? ? 1.349 1.305 0.044 0.006 N 19 2 C4 A DC 1 ? ? C5 A DC 1 ? ? 1.374 1.425 -0.051 0.008 N 20 2 C5 A DC 1 ? ? C6 A DC 1 ? ? 1.389 1.339 0.050 0.008 N 21 2 N1 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? 1.322 1.373 -0.051 0.008 N 22 2 N7 A DG 2 ? ? C8 A DG 2 ? ? 1.348 1.305 0.043 0.006 N 23 2 C4 A DC 3 ? ? C5 A DC 3 ? ? 1.376 1.425 -0.049 0.008 N 24 2 C5 A DC 3 ? ? C6 A DC 3 ? ? 1.388 1.339 0.049 0.008 N 25 2 "O3'" A A1MA9 4 ? ? P A DC 5 ? ? 1.522 1.607 -0.085 0.012 Y 26 2 C4 A DC 5 ? ? C5 A DC 5 ? ? 1.376 1.425 -0.049 0.008 N 27 2 C5 A DC 5 ? ? C6 A DC 5 ? ? 1.389 1.339 0.050 0.008 N 28 2 N1 A DG 6 ? ? C2 A DG 6 ? ? 1.322 1.373 -0.051 0.008 N 29 2 N7 A DG 6 ? ? C8 A DG 6 ? ? 1.347 1.305 0.042 0.006 N 30 2 C4 B DC 1 ? ? C5 B DC 1 ? ? 1.373 1.425 -0.052 0.008 N 31 2 N7 B DG 2 ? ? C8 B DG 2 ? ? 1.353 1.305 0.048 0.006 N 32 2 C4 B DC 3 ? ? C5 B DC 3 ? ? 1.374 1.425 -0.051 0.008 N 33 2 C5 B DC 3 ? ? C6 B DC 3 ? ? 1.389 1.339 0.050 0.008 N 34 2 C4 B DC 5 ? ? C5 B DC 5 ? ? 1.371 1.425 -0.054 0.008 N 35 2 N1 B DG 6 ? ? C2 B DG 6 ? ? 1.322 1.373 -0.051 0.008 N 36 2 N7 B DG 6 ? ? C8 B DG 6 ? ? 1.351 1.305 0.046 0.006 N 37 3 C4 A DC 1 ? ? C5 A DC 1 ? ? 1.374 1.425 -0.051 0.008 N 38 3 C5 A DC 1 ? ? C6 A DC 1 ? ? 1.388 1.339 0.049 0.008 N 39 3 N1 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? 1.323 1.373 -0.050 0.008 N 40 3 N7 A DG 2 ? ? C8 A DG 2 ? ? 1.351 1.305 0.046 0.006 N 41 3 C5 A DC 3 ? ? C6 A DC 3 ? ? 1.388 1.339 0.049 0.008 N 42 3 C4 A DC 5 ? ? C5 A DC 5 ? ? 1.375 1.425 -0.050 0.008 N 43 3 C5 A DC 5 ? ? C6 A DC 5 ? ? 1.388 1.339 0.049 0.008 N 44 3 N7 A DG 6 ? ? C8 A DG 6 ? ? 1.347 1.305 0.042 0.006 N 45 3 C4 B DC 1 ? ? C5 B DC 1 ? ? 1.375 1.425 -0.050 0.008 N 46 3 N1 B DG 2 ? ? C2 B DG 2 ? ? 1.325 1.373 -0.048 0.008 N 47 3 N7 B DG 2 ? ? C8 B DG 2 ? ? 1.351 1.305 0.046 0.006 N 48 3 C4 B DC 3 ? ? C5 B DC 3 ? ? 1.377 1.425 -0.048 0.008 N 49 3 C5 B DC 3 ? ? C6 B DC 3 ? ? 1.391 1.339 0.052 0.008 N 50 3 C4 B DC 5 ? ? C5 B DC 5 ? ? 1.375 1.425 -0.050 0.008 N 51 3 N1 B DG 6 ? ? C2 B DG 6 ? ? 1.324 1.373 -0.049 0.008 N 52 3 N7 B DG 6 ? ? C8 B DG 6 ? ? 1.349 1.305 0.044 0.006 N 53 4 C4 A DC 1 ? ? C5 A DC 1 ? ? 1.374 1.425 -0.051 0.008 N 54 4 N1 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? 1.322 1.373 -0.051 0.008 N 55 4 N7 A DG 2 ? ? C8 A DG 2 ? ? 1.353 1.305 0.048 0.006 N 56 4 C4 A DC 3 ? ? C5 A DC 3 ? ? 1.375 1.425 -0.050 0.008 N 57 4 C5 A DC 3 ? ? C6 A DC 3 ? ? 1.390 1.339 0.051 0.008 N 58 4 "O3'" A A1MA9 4 ? ? P A DC 5 ? ? 1.532 1.607 -0.075 0.012 Y 59 4 C4 A DC 5 ? ? C5 A DC 5 ? ? 1.376 1.425 -0.049 0.008 N 60 4 C5 A DC 5 ? ? C6 A DC 5 ? ? 1.389 1.339 0.050 0.008 N 61 4 N1 A DG 6 ? ? C2 A DG 6 ? ? 1.321 1.373 -0.052 0.008 N 62 4 N7 A DG 6 ? ? C8 A DG 6 ? ? 1.347 1.305 0.042 0.006 N 63 4 C4 B DC 1 ? ? C5 B DC 1 ? ? 1.375 1.425 -0.050 0.008 N 64 4 N1 B DG 2 ? ? C2 B DG 2 ? ? 1.323 1.373 -0.050 0.008 N 65 4 N7 B DG 2 ? ? C8 B DG 2 ? ? 1.351 1.305 0.046 0.006 N 66 4 C4 B DC 3 ? ? C5 B DC 3 ? ? 1.374 1.425 -0.051 0.008 N 67 4 C5 B DC 3 ? ? C6 B DC 3 ? ? 1.390 1.339 0.051 0.008 N 68 4 "O3'" B A1MA9 4 ? ? P B DC 5 ? ? 1.533 1.607 -0.074 0.012 Y 69 4 C4 B DC 5 ? ? C5 B DC 5 ? ? 1.372 1.425 -0.053 0.008 N 70 4 N7 B DG 6 ? ? C8 B DG 6 ? ? 1.350 1.305 0.045 0.006 N 71 5 C5 A DC 1 ? ? C6 A DC 1 ? ? 1.390 1.339 0.051 0.008 N 72 5 N1 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? 1.320 1.373 -0.053 0.008 N 73 5 N7 A DG 2 ? ? C8 A DG 2 ? ? 1.346 1.305 0.041 0.006 N 74 5 C5 A DC 3 ? ? C6 A DC 3 ? ? 1.392 1.339 0.053 0.008 N 75 5 "O3'" A A1MA9 4 ? ? P A DC 5 ? ? 1.531 1.607 -0.076 0.012 Y 76 5 C4 A DC 5 ? ? C5 A DC 5 ? ? 1.376 1.425 -0.049 0.008 N 77 5 C5 A DC 5 ? ? C6 A DC 5 ? ? 1.389 1.339 0.050 0.008 N 78 5 N1 A DG 6 ? ? C2 A DG 6 ? ? 1.324 1.373 -0.049 0.008 N 79 5 N7 A DG 6 ? ? C8 A DG 6 ? ? 1.349 1.305 0.044 0.006 N 80 5 C4 B DC 1 ? ? C5 B DC 1 ? ? 1.373 1.425 -0.052 0.008 N 81 5 N1 B DG 2 ? ? C2 B DG 2 ? ? 1.324 1.373 -0.049 0.008 N 82 5 N7 B DG 2 ? ? C8 B DG 2 ? ? 1.349 1.305 0.044 0.006 N 83 5 C4 B DC 3 ? ? C5 B DC 3 ? ? 1.376 1.425 -0.049 0.008 N 84 5 C5 B DC 3 ? ? C6 B DC 3 ? ? 1.390 1.339 0.051 0.008 N 85 5 C4 B DC 5 ? ? C5 B DC 5 ? ? 1.372 1.425 -0.053 0.008 N 86 5 N1 B DG 6 ? ? C2 B DG 6 ? ? 1.322 1.373 -0.051 0.008 N 87 5 N7 B DG 6 ? ? C8 B DG 6 ? ? 1.348 1.305 0.043 0.006 N 88 6 C4 A DC 1 ? ? C5 A DC 1 ? ? 1.374 1.425 -0.051 0.008 N 89 6 C5 A DC 1 ? ? C6 A DC 1 ? ? 1.387 1.339 0.048 0.008 N 90 6 N1 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? 1.324 1.373 -0.049 0.008 N 91 6 N7 A DG 2 ? ? C8 A DG 2 ? ? 1.349 1.305 0.044 0.006 N 92 6 C4 A DC 3 ? ? C5 A DC 3 ? ? 1.373 1.425 -0.052 0.008 N 93 6 "O3'" A A1MA9 4 ? ? P A DC 5 ? ? 1.526 1.607 -0.081 0.012 Y 94 6 C4 A DC 5 ? ? C5 A DC 5 ? ? 1.374 1.425 -0.051 0.008 N 95 6 C5 A DC 5 ? ? C6 A DC 5 ? ? 1.389 1.339 0.050 0.008 N 96 6 N1 A DG 6 ? ? C2 A DG 6 ? ? 1.322 1.373 -0.051 0.008 N 97 6 N7 A DG 6 ? ? C8 A DG 6 ? ? 1.347 1.305 0.042 0.006 N 98 6 C4 B DC 1 ? ? C5 B DC 1 ? ? 1.375 1.425 -0.050 0.008 N 99 6 C5 B DC 1 ? ? C6 B DC 1 ? ? 1.387 1.339 0.048 0.008 N 100 6 N7 B DG 2 ? ? C8 B DG 2 ? ? 1.347 1.305 0.042 0.006 N 101 6 C4 B DC 3 ? ? C5 B DC 3 ? ? 1.374 1.425 -0.051 0.008 N 102 6 C5 B DC 3 ? ? C6 B DC 3 ? ? 1.388 1.339 0.049 0.008 N 103 6 C4 B DC 5 ? ? C5 B DC 5 ? ? 1.373 1.425 -0.052 0.008 N 104 6 N7 B DG 6 ? ? C8 B DG 6 ? ? 1.352 1.305 0.047 0.006 N 105 7 C4 A DC 1 ? ? C5 A DC 1 ? ? 1.375 1.425 -0.050 0.008 N 106 7 N1 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? 1.322 1.373 -0.051 0.008 N 107 7 N7 A DG 2 ? ? C8 A DG 2 ? ? 1.350 1.305 0.045 0.006 N 108 7 C4 A DC 3 ? ? C5 A DC 3 ? ? 1.375 1.425 -0.050 0.008 N 109 7 C5 A DC 3 ? ? C6 A DC 3 ? ? 1.390 1.339 0.051 0.008 N 110 7 "O3'" A A1MA9 4 ? ? P A DC 5 ? ? 1.533 1.607 -0.074 0.012 Y 111 7 C4 A DC 5 ? ? C5 A DC 5 ? ? 1.374 1.425 -0.051 0.008 N 112 7 N1 A DG 6 ? ? C2 A DG 6 ? ? 1.322 1.373 -0.051 0.008 N 113 7 N7 A DG 6 ? ? C8 A DG 6 ? ? 1.348 1.305 0.043 0.006 N 114 7 C4 B DC 1 ? ? C5 B DC 1 ? ? 1.370 1.425 -0.055 0.008 N 115 7 N1 B DG 2 ? ? C2 B DG 2 ? ? 1.324 1.373 -0.049 0.008 N 116 7 N7 B DG 2 ? ? C8 B DG 2 ? ? 1.350 1.305 0.045 0.006 N 117 7 C4 B DC 3 ? ? C5 B DC 3 ? ? 1.373 1.425 -0.052 0.008 N 118 7 C5 B DC 3 ? ? C6 B DC 3 ? ? 1.388 1.339 0.049 0.008 N 119 7 "O3'" B A1MA9 4 ? ? P B DC 5 ? ? 1.529 1.607 -0.078 0.012 Y 120 7 C4 B DC 5 ? ? C5 B DC 5 ? ? 1.374 1.425 -0.051 0.008 N 121 7 N7 B DG 6 ? ? C8 B DG 6 ? ? 1.352 1.305 0.047 0.006 N 122 8 C4 A DC 1 ? ? C5 A DC 1 ? ? 1.370 1.425 -0.055 0.008 N 123 8 N1 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? 1.322 1.373 -0.051 0.008 N 124 8 N7 A DG 2 ? ? C8 A DG 2 ? ? 1.352 1.305 0.047 0.006 N 125 8 C4 A DC 3 ? ? C5 A DC 3 ? ? 1.374 1.425 -0.051 0.008 N 126 8 C5 A DC 3 ? ? C6 A DC 3 ? ? 1.390 1.339 0.051 0.008 N 127 8 C4 A DC 5 ? ? C5 A DC 5 ? ? 1.373 1.425 -0.052 0.008 N 128 8 N1 A DG 6 ? ? C2 A DG 6 ? ? 1.324 1.373 -0.049 0.008 N 129 8 N7 A DG 6 ? ? C8 A DG 6 ? ? 1.349 1.305 0.044 0.006 N 130 8 C4 B DC 1 ? ? C5 B DC 1 ? ? 1.374 1.425 -0.051 0.008 N 131 8 N7 B DG 2 ? ? C8 B DG 2 ? ? 1.349 1.305 0.044 0.006 N 132 8 C4 B DC 3 ? ? C5 B DC 3 ? ? 1.374 1.425 -0.051 0.008 N 133 8 C5 B DC 3 ? ? C6 B DC 3 ? ? 1.388 1.339 0.049 0.008 N 134 8 "O3'" B A1MA9 4 ? ? P B DC 5 ? ? 1.535 1.607 -0.072 0.012 Y 135 8 C4 B DC 5 ? ? C5 B DC 5 ? ? 1.373 1.425 -0.052 0.008 N 136 8 N1 B DG 6 ? ? C2 B DG 6 ? ? 1.324 1.373 -0.049 0.008 N 137 8 N7 B DG 6 ? ? C8 B DG 6 ? ? 1.353 1.305 0.048 0.006 N 138 9 C4 A DC 1 ? ? C5 A DC 1 ? ? 1.372 1.425 -0.053 0.008 N 139 9 N1 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? 1.323 1.373 -0.050 0.008 N 140 9 N7 A DG 2 ? ? C8 A DG 2 ? ? 1.348 1.305 0.043 0.006 N 141 9 C4 A DC 3 ? ? C5 A DC 3 ? ? 1.375 1.425 -0.050 0.008 N 142 9 C5 A DC 3 ? ? C6 A DC 3 ? ? 1.389 1.339 0.050 0.008 N 143 9 "O3'" A A1MA9 4 ? ? P A DC 5 ? ? 1.531 1.607 -0.076 0.012 Y 144 9 C4 A DC 5 ? ? C5 A DC 5 ? ? 1.375 1.425 -0.050 0.008 N 145 9 C5 A DC 5 ? ? C6 A DC 5 ? ? 1.388 1.339 0.049 0.008 N 146 9 N1 A DG 6 ? ? C2 A DG 6 ? ? 1.325 1.373 -0.048 0.008 N 147 9 N7 A DG 6 ? ? C8 A DG 6 ? ? 1.347 1.305 0.042 0.006 N 148 9 C4 B DC 1 ? ? C5 B DC 1 ? ? 1.373 1.425 -0.052 0.008 N 149 9 N7 B DG 2 ? ? C8 B DG 2 ? ? 1.349 1.305 0.044 0.006 N 150 9 C4 B DC 3 ? ? C5 B DC 3 ? ? 1.373 1.425 -0.052 0.008 N 151 9 C4 B DC 5 ? ? C5 B DC 5 ? ? 1.373 1.425 -0.052 0.008 N 152 9 C5 B DC 5 ? ? C6 B DC 5 ? ? 1.387 1.339 0.048 0.008 N 153 9 N1 B DG 6 ? ? C2 B DG 6 ? ? 1.322 1.373 -0.051 0.008 N 154 9 N7 B DG 6 ? ? C8 B DG 6 ? ? 1.351 1.305 0.046 0.006 N 155 10 C4 A DC 1 ? ? C5 A DC 1 ? ? 1.374 1.425 -0.051 0.008 N 156 10 C5 A DC 1 ? ? C6 A DC 1 ? ? 1.388 1.339 0.049 0.008 N 157 10 N1 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? 1.323 1.373 -0.050 0.008 N 158 10 N7 A DG 2 ? ? C8 A DG 2 ? ? 1.348 1.305 0.043 0.006 N 159 10 C4 A DC 3 ? ? C5 A DC 3 ? ? 1.374 1.425 -0.051 0.008 N 160 10 C5 A DC 3 ? ? C6 A DC 3 ? ? 1.390 1.339 0.051 0.008 N 161 10 "O3'" A A1MA9 4 ? ? P A DC 5 ? ? 1.527 1.607 -0.080 0.012 Y 162 10 C4 A DC 5 ? ? C5 A DC 5 ? ? 1.376 1.425 -0.049 0.008 N 163 10 N7 A DG 6 ? ? C8 A DG 6 ? ? 1.345 1.305 0.040 0.006 N 164 10 C4 B DC 1 ? ? C5 B DC 1 ? ? 1.375 1.425 -0.050 0.008 N 165 10 C5 B DC 1 ? ? C6 B DC 1 ? ? 1.389 1.339 0.050 0.008 N 166 10 N7 B DG 2 ? ? C8 B DG 2 ? ? 1.351 1.305 0.046 0.006 N 167 10 C4 B DC 3 ? ? C5 B DC 3 ? ? 1.377 1.425 -0.048 0.008 N 168 10 C5 B DC 3 ? ? C6 B DC 3 ? ? 1.390 1.339 0.051 0.008 N 169 10 C4 B DC 5 ? ? C5 B DC 5 ? ? 1.374 1.425 -0.051 0.008 N 170 10 N1 B DG 6 ? ? C2 B DG 6 ? ? 1.323 1.373 -0.050 0.008 N 171 10 N7 B DG 6 ? ? C8 B DG 6 ? ? 1.353 1.305 0.048 0.006 N # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 113.30 108.30 5.00 0.30 N 2 1 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 123.73 118.90 4.83 0.60 N 3 1 "O3'" A DC 1 ? ? P A DG 2 ? ? "O5'" A DG 2 ? ? 115.87 104.00 11.87 1.90 Y 4 1 OP1 A DG 2 ? ? P A DG 2 ? ? OP2 A DG 2 ? ? 108.56 119.60 -11.04 1.50 N 5 1 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 111.28 108.30 2.98 0.30 N 6 1 C2 A DG 2 ? ? N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? 116.36 111.90 4.46 0.50 N 7 1 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? C5 A DG 2 ? ? 123.33 128.60 -5.27 0.50 N 8 1 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 129.63 126.00 3.63 0.60 N 9 1 "O3'" A DG 2 ? ? P A DC 3 ? ? "O5'" A DC 3 ? ? 117.39 104.00 13.39 1.90 Y 10 1 OP1 A DC 3 ? ? P A DC 3 ? ? OP2 A DC 3 ? ? 108.99 119.60 -10.61 1.50 N 11 1 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 110.44 108.30 2.14 0.30 N 12 1 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 111.16 108.30 2.86 0.30 N 13 1 C2 A DC 5 ? ? N3 A DC 5 ? ? C4 A DC 5 ? ? 123.11 119.90 3.21 0.50 N 14 1 N1 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 123.86 118.90 4.96 0.60 N 15 1 "O3'" A DC 5 ? ? P A DG 6 ? ? "O5'" A DG 6 ? ? 115.50 104.00 11.50 1.90 Y 16 1 OP1 A DG 6 ? ? P A DG 6 ? ? OP2 A DG 6 ? ? 109.64 119.60 -9.96 1.50 N 17 1 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 110.31 108.30 2.01 0.30 N 18 1 C2 A DG 6 ? ? N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? 115.93 111.90 4.03 0.50 N 19 1 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? C5 A DG 6 ? ? 123.07 128.60 -5.53 0.50 N 20 1 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 130.14 126.00 4.14 0.60 N 21 1 "O4'" B DC 1 ? ? "C1'" B DC 1 ? ? N1 B DC 1 ? ? 112.30 108.30 4.00 0.30 N 22 1 N1 B DC 1 ? ? C2 B DC 1 ? ? O2 B DC 1 ? ? 123.21 118.90 4.31 0.60 N 23 1 OP1 B DG 2 ? ? P B DG 2 ? ? OP2 B DG 2 ? ? 108.55 119.60 -11.05 1.50 N 24 1 "O4'" B DG 2 ? ? "C1'" B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 110.58 108.30 2.28 0.30 N 25 1 C2 B DG 2 ? ? N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? 116.35 111.90 4.45 0.50 N 26 1 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? C5 B DG 2 ? ? 123.07 128.60 -5.53 0.50 N 27 1 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 129.96 126.00 3.96 0.60 N 28 1 OP1 B DC 3 ? ? P B DC 3 ? ? OP2 B DC 3 ? ? 108.78 119.60 -10.82 1.50 N 29 1 "O4'" B DC 3 ? ? "C1'" B DC 3 ? ? N1 B DC 3 ? ? 112.50 108.30 4.20 0.30 N 30 1 C2 B DC 3 ? ? N3 B DC 3 ? ? C4 B DC 3 ? ? 123.40 119.90 3.50 0.50 N 31 1 N1 B DC 3 ? ? C2 B DC 3 ? ? O2 B DC 3 ? ? 124.02 118.90 5.12 0.60 N 32 1 "O3'" B A1MA9 4 ? ? P B DC 5 ? ? "O5'" B DC 5 ? ? 115.54 104.00 11.54 1.90 Y 33 1 OP1 B DC 5 ? ? P B DC 5 ? ? OP2 B DC 5 ? ? 109.91 119.60 -9.69 1.50 N 34 1 N1 B DC 5 ? ? C2 B DC 5 ? ? O2 B DC 5 ? ? 123.62 118.90 4.72 0.60 N 35 1 OP1 B DG 6 ? ? P B DG 6 ? ? OP2 B DG 6 ? ? 108.79 119.60 -10.81 1.50 N 36 1 C2 B DG 6 ? ? N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? 116.28 111.90 4.38 0.50 N 37 1 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? C5 B DG 6 ? ? 123.20 128.60 -5.40 0.50 N 38 2 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.71 108.30 2.41 0.30 N 39 2 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 123.72 118.90 4.82 0.60 N 40 2 OP1 A DG 2 ? ? P A DG 2 ? ? OP2 A DG 2 ? ? 109.40 119.60 -10.20 1.50 N 41 2 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.14 108.30 1.84 0.30 N 42 2 C2 A DG 2 ? ? N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? 116.37 111.90 4.47 0.50 N 43 2 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? C5 A DG 2 ? ? 123.16 128.60 -5.44 0.50 N 44 2 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 130.15 126.00 4.15 0.60 N 45 2 OP1 A DC 3 ? ? P A DC 3 ? ? OP2 A DC 3 ? ? 110.46 119.60 -9.14 1.50 N 46 2 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 113.55 108.30 5.25 0.30 N 47 2 C2 A DC 3 ? ? N3 A DC 3 ? ? C4 A DC 3 ? ? 123.30 119.90 3.40 0.50 N 48 2 N1 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 123.85 118.90 4.95 0.60 N 49 2 OP1 A DC 5 ? ? P A DC 5 ? ? OP2 A DC 5 ? ? 109.80 119.60 -9.80 1.50 N 50 2 N1 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 124.13 118.90 5.23 0.60 N 51 2 OP1 A DG 6 ? ? P A DG 6 ? ? OP2 A DG 6 ? ? 108.73 119.60 -10.87 1.50 N 52 2 C2 A DG 6 ? ? N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? 116.17 111.90 4.27 0.50 N 53 2 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? C5 A DG 6 ? ? 123.10 128.60 -5.50 0.50 N 54 2 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 130.11 126.00 4.11 0.60 N 55 2 N1 B DC 1 ? ? C2 B DC 1 ? ? O2 B DC 1 ? ? 123.89 118.90 4.99 0.60 N 56 2 "O3'" B DC 1 ? ? P B DG 2 ? ? "O5'" B DG 2 ? ? 117.41 104.00 13.41 1.90 Y 57 2 OP1 B DG 2 ? ? P B DG 2 ? ? OP2 B DG 2 ? ? 108.18 119.60 -11.42 1.50 N 58 2 "O4'" B DG 2 ? ? "C1'" B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 110.55 108.30 2.25 0.30 N 59 2 C2 B DG 2 ? ? N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? 116.59 111.90 4.69 0.50 N 60 2 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? C5 B DG 2 ? ? 122.91 128.60 -5.69 0.50 N 61 2 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 130.17 126.00 4.17 0.60 N 62 2 "O3'" B DG 2 ? ? P B DC 3 ? ? "O5'" B DC 3 ? ? 116.70 104.00 12.70 1.90 Y 63 2 OP1 B DC 3 ? ? P B DC 3 ? ? OP2 B DC 3 ? ? 109.21 119.60 -10.39 1.50 N 64 2 C2 B DC 3 ? ? N3 B DC 3 ? ? C4 B DC 3 ? ? 122.99 119.90 3.09 0.50 N 65 2 N1 B DC 3 ? ? C2 B DC 3 ? ? O2 B DC 3 ? ? 123.88 118.90 4.98 0.60 N 66 2 "O3'" B A1MA9 4 ? ? P B DC 5 ? ? "O5'" B DC 5 ? ? 117.89 104.00 13.89 1.90 Y 67 2 OP1 B DC 5 ? ? P B DC 5 ? ? OP2 B DC 5 ? ? 109.16 119.60 -10.44 1.50 N 68 2 N1 B DC 5 ? ? C2 B DC 5 ? ? O2 B DC 5 ? ? 123.87 118.90 4.97 0.60 N 69 2 OP1 B DG 6 ? ? P B DG 6 ? ? OP2 B DG 6 ? ? 109.45 119.60 -10.15 1.50 N 70 2 C2 B DG 6 ? ? N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? 116.40 111.90 4.50 0.50 N 71 2 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? C5 B DG 6 ? ? 123.06 128.60 -5.54 0.50 N 72 2 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 129.60 126.00 3.60 0.60 N 73 3 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 124.92 118.90 6.02 0.60 N 74 3 "O3'" A DC 1 ? ? P A DG 2 ? ? "O5'" A DG 2 ? ? 115.78 104.00 11.78 1.90 Y 75 3 OP1 A DG 2 ? ? P A DG 2 ? ? OP2 A DG 2 ? ? 109.39 119.60 -10.21 1.50 N 76 3 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 111.58 108.30 3.28 0.30 N 77 3 C2 A DG 2 ? ? N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? 116.41 111.90 4.51 0.50 N 78 3 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? C5 A DG 2 ? ? 123.04 128.60 -5.56 0.50 N 79 3 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 129.96 126.00 3.96 0.60 N 80 3 "O3'" A DG 2 ? ? P A DC 3 ? ? "O5'" A DC 3 ? ? 117.10 104.00 13.10 1.90 Y 81 3 OP1 A DC 3 ? ? P A DC 3 ? ? OP2 A DC 3 ? ? 108.39 119.60 -11.21 1.50 N 82 3 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 112.06 108.30 3.76 0.30 N 83 3 OP1 A DC 5 ? ? P A DC 5 ? ? OP2 A DC 5 ? ? 109.64 119.60 -9.96 1.50 N 84 3 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? "C2'" A DC 5 ? ? 101.00 105.90 -4.90 0.80 N 85 3 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 111.89 108.30 3.59 0.30 N 86 3 C2 A DC 5 ? ? N3 A DC 5 ? ? C4 A DC 5 ? ? 123.04 119.90 3.14 0.50 N 87 3 N1 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 123.80 118.90 4.90 0.60 N 88 3 OP1 A DG 6 ? ? P A DG 6 ? ? OP2 A DG 6 ? ? 109.04 119.60 -10.56 1.50 N 89 3 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.36 108.30 3.06 0.30 N 90 3 C2 A DG 6 ? ? N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? 116.22 111.90 4.32 0.50 N 91 3 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? C5 A DG 6 ? ? 122.88 128.60 -5.72 0.50 N 92 3 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 130.64 126.00 4.64 0.60 N 93 3 "O4'" B DC 1 ? ? "C1'" B DC 1 ? ? N1 B DC 1 ? ? 110.97 108.30 2.67 0.30 N 94 3 N1 B DC 1 ? ? C2 B DC 1 ? ? O2 B DC 1 ? ? 124.25 118.90 5.35 0.60 N 95 3 "O3'" B DC 1 ? ? P B DG 2 ? ? "O5'" B DG 2 ? ? 115.87 104.00 11.87 1.90 Y 96 3 OP1 B DG 2 ? ? P B DG 2 ? ? OP2 B DG 2 ? ? 109.79 119.60 -9.81 1.50 N 97 3 "O4'" B DG 2 ? ? "C1'" B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 110.52 108.30 2.22 0.30 N 98 3 C2 B DG 2 ? ? N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? 116.42 111.90 4.52 0.50 N 99 3 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? C5 B DG 2 ? ? 123.06 128.60 -5.54 0.50 N 100 3 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 129.94 126.00 3.94 0.60 N 101 3 "O3'" B DG 2 ? ? P B DC 3 ? ? "O5'" B DC 3 ? ? 115.72 104.00 11.72 1.90 Y 102 3 OP1 B DC 3 ? ? P B DC 3 ? ? OP2 B DC 3 ? ? 109.43 119.60 -10.17 1.50 N 103 3 "O4'" B DC 3 ? ? "C1'" B DC 3 ? ? N1 B DC 3 ? ? 111.76 108.30 3.46 0.30 N 104 3 C2 B DC 3 ? ? N3 B DC 3 ? ? C4 B DC 3 ? ? 123.31 119.90 3.41 0.50 N 105 3 N1 B DC 3 ? ? C2 B DC 3 ? ? O2 B DC 3 ? ? 123.72 118.90 4.82 0.60 N 106 3 "O3'" B A1MA9 4 ? ? P B DC 5 ? ? "O5'" B DC 5 ? ? 116.18 104.00 12.18 1.90 Y 107 3 OP1 B DC 5 ? ? P B DC 5 ? ? OP2 B DC 5 ? ? 108.93 119.60 -10.67 1.50 N 108 3 "O4'" B DC 5 ? ? "C1'" B DC 5 ? ? N1 B DC 5 ? ? 111.48 108.30 3.18 0.30 N 109 3 N1 B DC 5 ? ? C2 B DC 5 ? ? O2 B DC 5 ? ? 123.40 118.90 4.50 0.60 N 110 3 OP1 B DG 6 ? ? P B DG 6 ? ? OP2 B DG 6 ? ? 110.16 119.60 -9.44 1.50 N 111 3 C2 B DG 6 ? ? N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? 116.37 111.90 4.47 0.50 N 112 3 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? C5 B DG 6 ? ? 123.09 128.60 -5.51 0.50 N 113 3 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 130.00 126.00 4.00 0.60 N 114 4 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 111.24 108.30 2.94 0.30 N 115 4 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 123.99 118.90 5.09 0.60 N 116 4 OP1 A DG 2 ? ? P A DG 2 ? ? OP2 A DG 2 ? ? 109.99 119.60 -9.61 1.50 N 117 4 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 111.88 108.30 3.58 0.30 N 118 4 C2 A DG 2 ? ? N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? 116.41 111.90 4.51 0.50 N 119 4 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? C5 A DG 2 ? ? 122.98 128.60 -5.62 0.50 N 120 4 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 129.96 126.00 3.96 0.60 N 121 4 OP1 A DC 3 ? ? P A DC 3 ? ? OP2 A DC 3 ? ? 109.29 119.60 -10.31 1.50 N 122 4 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 114.86 108.30 6.56 0.30 N 123 4 N1 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 124.13 118.90 5.23 0.60 N 124 4 OP1 A DC 5 ? ? P A DC 5 ? ? OP2 A DC 5 ? ? 109.08 119.60 -10.52 1.50 N 125 4 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 112.99 108.30 4.69 0.30 N 126 4 C2 A DC 5 ? ? N3 A DC 5 ? ? C4 A DC 5 ? ? 123.12 119.90 3.22 0.50 N 127 4 N1 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 123.71 118.90 4.81 0.60 N 128 4 OP1 A DG 6 ? ? P A DG 6 ? ? OP2 A DG 6 ? ? 109.27 119.60 -10.33 1.50 N 129 4 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.70 108.30 3.40 0.30 N 130 4 C2 A DG 6 ? ? N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? 115.93 111.90 4.03 0.50 N 131 4 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? C5 A DG 6 ? ? 123.04 128.60 -5.56 0.50 N 132 4 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 130.18 126.00 4.18 0.60 N 133 4 "O4'" B DC 1 ? ? "C1'" B DC 1 ? ? N1 B DC 1 ? ? 111.08 108.30 2.78 0.30 N 134 4 N1 B DC 1 ? ? C2 B DC 1 ? ? O2 B DC 1 ? ? 124.01 118.90 5.11 0.60 N 135 4 OP1 B DG 2 ? ? P B DG 2 ? ? OP2 B DG 2 ? ? 109.80 119.60 -9.80 1.50 N 136 4 C2 B DG 2 ? ? N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? 116.42 111.90 4.52 0.50 N 137 4 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? C5 B DG 2 ? ? 122.92 128.60 -5.68 0.50 N 138 4 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 130.33 126.00 4.33 0.60 N 139 4 "O3'" B DG 2 ? ? P B DC 3 ? ? "O5'" B DC 3 ? ? 115.41 104.00 11.41 1.90 Y 140 4 OP1 B DC 3 ? ? P B DC 3 ? ? OP2 B DC 3 ? ? 108.95 119.60 -10.65 1.50 N 141 4 "O4'" B DC 3 ? ? "C1'" B DC 3 ? ? N1 B DC 3 ? ? 111.68 108.30 3.38 0.30 N 142 4 C2 B DC 3 ? ? N3 B DC 3 ? ? C4 B DC 3 ? ? 123.12 119.90 3.22 0.50 N 143 4 N1 B DC 3 ? ? C2 B DC 3 ? ? O2 B DC 3 ? ? 123.90 118.90 5.00 0.60 N 144 4 OP1 B DC 5 ? ? P B DC 5 ? ? OP2 B DC 5 ? ? 110.14 119.60 -9.46 1.50 N 145 4 "O4'" B DC 5 ? ? "C1'" B DC 5 ? ? N1 B DC 5 ? ? 110.29 108.30 1.99 0.30 N 146 4 N1 B DC 5 ? ? C2 B DC 5 ? ? O2 B DC 5 ? ? 123.34 118.90 4.44 0.60 N 147 4 "O3'" B DC 5 ? ? P B DG 6 ? ? "O5'" B DG 6 ? ? 116.17 104.00 12.17 1.90 Y 148 4 OP1 B DG 6 ? ? P B DG 6 ? ? OP2 B DG 6 ? ? 106.52 119.60 -13.08 1.50 N 149 4 C2 B DG 6 ? ? N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? 116.37 111.90 4.47 0.50 N 150 4 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? C5 B DG 6 ? ? 123.28 128.60 -5.32 0.50 N 151 4 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 129.68 126.00 3.68 0.60 N 152 5 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 113.01 108.30 4.71 0.30 N 153 5 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 123.58 118.90 4.68 0.60 N 154 5 OP1 A DG 2 ? ? P A DG 2 ? ? OP2 A DG 2 ? ? 109.29 119.60 -10.31 1.50 N 155 5 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.32 108.30 4.02 0.30 N 156 5 C2 A DG 2 ? ? N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? 116.38 111.90 4.48 0.50 N 157 5 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? C5 A DG 2 ? ? 122.81 128.60 -5.79 0.50 N 158 5 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 130.83 126.00 4.83 0.60 N 159 5 "O3'" A DG 2 ? ? P A DC 3 ? ? "O5'" A DC 3 ? ? 116.77 104.00 12.77 1.90 Y 160 5 OP1 A DC 3 ? ? P A DC 3 ? ? OP2 A DC 3 ? ? 109.63 119.60 -9.97 1.50 N 161 5 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 114.29 108.30 5.99 0.30 N 162 5 C2 A DC 3 ? ? N3 A DC 3 ? ? C4 A DC 3 ? ? 123.19 119.90 3.29 0.50 N 163 5 N1 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 123.41 118.90 4.51 0.60 N 164 5 OP1 A DC 5 ? ? P A DC 5 ? ? OP2 A DC 5 ? ? 108.71 119.60 -10.89 1.50 N 165 5 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 112.38 108.30 4.08 0.30 N 166 5 C2 A DC 5 ? ? N3 A DC 5 ? ? C4 A DC 5 ? ? 122.91 119.90 3.01 0.50 N 167 5 N1 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 123.49 118.90 4.59 0.60 N 168 5 "O3'" A DC 5 ? ? P A DG 6 ? ? "O5'" A DG 6 ? ? 115.73 104.00 11.73 1.90 Y 169 5 OP1 A DG 6 ? ? P A DG 6 ? ? OP2 A DG 6 ? ? 108.41 119.60 -11.19 1.50 N 170 5 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 112.05 108.30 3.75 0.30 N 171 5 C2 A DG 6 ? ? N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? 116.18 111.90 4.28 0.50 N 172 5 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? C5 A DG 6 ? ? 122.88 128.60 -5.72 0.50 N 173 5 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 130.41 126.00 4.41 0.60 N 174 5 "O4'" B DC 1 ? ? "C1'" B DC 1 ? ? N1 B DC 1 ? ? 112.04 108.30 3.74 0.30 N 175 5 N1 B DC 1 ? ? C2 B DC 1 ? ? O2 B DC 1 ? ? 123.75 118.90 4.85 0.60 N 176 5 OP1 B DG 2 ? ? P B DG 2 ? ? OP2 B DG 2 ? ? 108.76 119.60 -10.84 1.50 N 177 5 "O4'" B DG 2 ? ? "C1'" B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 110.46 108.30 2.16 0.30 N 178 5 C2 B DG 2 ? ? N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? 116.40 111.90 4.50 0.50 N 179 5 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? C5 B DG 2 ? ? 122.89 128.60 -5.71 0.50 N 180 5 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 130.28 126.00 4.28 0.60 N 181 5 OP1 B DC 3 ? ? P B DC 3 ? ? OP2 B DC 3 ? ? 109.52 119.60 -10.08 1.50 N 182 5 "O4'" B DC 3 ? ? "C1'" B DC 3 ? ? N1 B DC 3 ? ? 113.34 108.30 5.04 0.30 N 183 5 C2 B DC 3 ? ? N3 B DC 3 ? ? C4 B DC 3 ? ? 123.19 119.90 3.29 0.50 N 184 5 N1 B DC 3 ? ? C2 B DC 3 ? ? O2 B DC 3 ? ? 123.56 118.90 4.66 0.60 N 185 5 OP1 B DC 5 ? ? P B DC 5 ? ? OP2 B DC 5 ? ? 109.77 119.60 -9.83 1.50 N 186 5 "O4'" B DC 5 ? ? "C1'" B DC 5 ? ? N1 B DC 5 ? ? 110.61 108.30 2.31 0.30 N 187 5 N1 B DC 5 ? ? C2 B DC 5 ? ? O2 B DC 5 ? ? 123.99 118.90 5.09 0.60 N 188 5 OP1 B DG 6 ? ? P B DG 6 ? ? OP2 B DG 6 ? ? 106.03 119.60 -13.57 1.50 N 189 5 C2 B DG 6 ? ? N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? 116.01 111.90 4.11 0.50 N 190 5 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? C5 B DG 6 ? ? 123.02 128.60 -5.58 0.50 N 191 5 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 130.21 126.00 4.21 0.60 N 192 6 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 112.16 108.30 3.86 0.30 N 193 6 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 123.96 118.90 5.06 0.60 N 194 6 OP1 A DG 2 ? ? P A DG 2 ? ? OP2 A DG 2 ? ? 109.60 119.60 -10.00 1.50 N 195 6 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.73 108.30 2.43 0.30 N 196 6 C2 A DG 2 ? ? N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? 116.43 111.90 4.53 0.50 N 197 6 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? C5 A DG 2 ? ? 122.78 128.60 -5.82 0.50 N 198 6 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 130.52 126.00 4.52 0.60 N 199 6 "O3'" A DG 2 ? ? P A DC 3 ? ? "O5'" A DC 3 ? ? 116.23 104.00 12.23 1.90 Y 200 6 OP1 A DC 3 ? ? P A DC 3 ? ? OP2 A DC 3 ? ? 108.73 119.60 -10.87 1.50 N 201 6 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 111.71 108.30 3.41 0.30 N 202 6 C2 A DC 3 ? ? N3 A DC 3 ? ? C4 A DC 3 ? ? 123.15 119.90 3.25 0.50 N 203 6 N1 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 123.96 118.90 5.06 0.60 N 204 6 OP1 A DC 5 ? ? P A DC 5 ? ? OP2 A DC 5 ? ? 108.54 119.60 -11.06 1.50 N 205 6 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 112.71 108.30 4.41 0.30 N 206 6 C2 A DC 5 ? ? N3 A DC 5 ? ? C4 A DC 5 ? ? 123.11 119.90 3.21 0.50 N 207 6 N1 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 124.04 118.90 5.14 0.60 N 208 6 OP1 A DG 6 ? ? P A DG 6 ? ? OP2 A DG 6 ? ? 109.24 119.60 -10.36 1.50 N 209 6 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 113.13 108.30 4.83 0.30 N 210 6 C2 A DG 6 ? ? N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? 116.02 111.90 4.12 0.50 N 211 6 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? C5 A DG 6 ? ? 123.25 128.60 -5.35 0.50 N 212 6 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 129.62 126.00 3.62 0.60 N 213 6 "O4'" B DC 1 ? ? "C1'" B DC 1 ? ? N1 B DC 1 ? ? 110.19 108.30 1.89 0.30 N 214 6 N1 B DC 1 ? ? C2 B DC 1 ? ? O2 B DC 1 ? ? 124.25 118.90 5.35 0.60 N 215 6 "O3'" B DC 1 ? ? P B DG 2 ? ? "O5'" B DG 2 ? ? 116.18 104.00 12.18 1.90 Y 216 6 OP1 B DG 2 ? ? P B DG 2 ? ? OP2 B DG 2 ? ? 109.61 119.60 -9.99 1.50 N 217 6 "O4'" B DG 2 ? ? "C1'" B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 111.08 108.30 2.78 0.30 N 218 6 C2 B DG 2 ? ? N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? 116.36 111.90 4.46 0.50 N 219 6 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? C5 B DG 2 ? ? 123.10 128.60 -5.50 0.50 N 220 6 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 130.28 126.00 4.28 0.60 N 221 6 OP1 B DC 3 ? ? P B DC 3 ? ? OP2 B DC 3 ? ? 109.83 119.60 -9.77 1.50 N 222 6 "O4'" B DC 3 ? ? "C1'" B DC 3 ? ? N1 B DC 3 ? ? 111.49 108.30 3.19 0.30 N 223 6 C2 B DC 3 ? ? N3 B DC 3 ? ? C4 B DC 3 ? ? 123.01 119.90 3.11 0.50 N 224 6 N1 B DC 3 ? ? C2 B DC 3 ? ? O2 B DC 3 ? ? 124.49 118.90 5.59 0.60 N 225 6 OP1 B DC 5 ? ? P B DC 5 ? ? OP2 B DC 5 ? ? 109.21 119.60 -10.39 1.50 N 226 6 "O4'" B DC 5 ? ? "C1'" B DC 5 ? ? N1 B DC 5 ? ? 110.21 108.30 1.91 0.30 N 227 6 N1 B DC 5 ? ? C2 B DC 5 ? ? O2 B DC 5 ? ? 124.05 118.90 5.15 0.60 N 228 6 OP1 B DG 6 ? ? P B DG 6 ? ? OP2 B DG 6 ? ? 108.90 119.60 -10.70 1.50 N 229 6 C2 B DG 6 ? ? N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? 116.50 111.90 4.60 0.50 N 230 6 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? C5 B DG 6 ? ? 123.06 128.60 -5.54 0.50 N 231 6 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 129.93 126.00 3.93 0.60 N 232 7 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 111.86 108.30 3.56 0.30 N 233 7 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 123.89 118.90 4.99 0.60 N 234 7 "O3'" A DC 1 ? ? P A DG 2 ? ? "O5'" A DG 2 ? ? 115.61 104.00 11.61 1.90 Y 235 7 OP1 A DG 2 ? ? P A DG 2 ? ? OP2 A DG 2 ? ? 108.91 119.60 -10.69 1.50 N 236 7 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.53 108.30 4.23 0.30 N 237 7 C2 A DG 2 ? ? N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? 116.03 111.90 4.13 0.50 N 238 7 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? C5 A DG 2 ? ? 123.08 128.60 -5.52 0.50 N 239 7 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 130.14 126.00 4.14 0.60 N 240 7 "O3'" A DG 2 ? ? P A DC 3 ? ? "O5'" A DC 3 ? ? 116.44 104.00 12.44 1.90 Y 241 7 OP1 A DC 3 ? ? P A DC 3 ? ? OP2 A DC 3 ? ? 109.25 119.60 -10.35 1.50 N 242 7 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 111.80 108.30 3.50 0.30 N 243 7 C2 A DC 3 ? ? N3 A DC 3 ? ? C4 A DC 3 ? ? 123.28 119.90 3.38 0.50 N 244 7 N1 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 123.67 118.90 4.77 0.60 N 245 7 OP1 A DC 5 ? ? P A DC 5 ? ? OP2 A DC 5 ? ? 109.37 119.60 -10.23 1.50 N 246 7 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 110.99 108.30 2.69 0.30 N 247 7 C2 A DC 5 ? ? N3 A DC 5 ? ? C4 A DC 5 ? ? 122.91 119.90 3.01 0.50 N 248 7 N1 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 123.88 118.90 4.98 0.60 N 249 7 OP1 A DG 6 ? ? P A DG 6 ? ? OP2 A DG 6 ? ? 108.82 119.60 -10.78 1.50 N 250 7 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.08 108.30 2.78 0.30 N 251 7 C2 A DG 6 ? ? N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? 115.86 111.90 3.96 0.50 N 252 7 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? C5 A DG 6 ? ? 123.17 128.60 -5.43 0.50 N 253 7 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 130.06 126.00 4.06 0.60 N 254 7 N1 B DC 1 ? ? C2 B DC 1 ? ? O2 B DC 1 ? ? 124.30 118.90 5.40 0.60 N 255 7 "O3'" B DC 1 ? ? P B DG 2 ? ? "O5'" B DG 2 ? ? 116.14 104.00 12.14 1.90 Y 256 7 OP1 B DG 2 ? ? P B DG 2 ? ? OP2 B DG 2 ? ? 109.11 119.60 -10.49 1.50 N 257 7 "O4'" B DG 2 ? ? "C1'" B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 110.26 108.30 1.96 0.30 N 258 7 C2 B DG 2 ? ? N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? 116.51 111.90 4.61 0.50 N 259 7 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? C5 B DG 2 ? ? 123.02 128.60 -5.58 0.50 N 260 7 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 130.16 126.00 4.16 0.60 N 261 7 OP1 B DC 3 ? ? P B DC 3 ? ? OP2 B DC 3 ? ? 108.79 119.60 -10.81 1.50 N 262 7 "O4'" B DC 3 ? ? "C1'" B DC 3 ? ? N1 B DC 3 ? ? 110.97 108.30 2.67 0.30 N 263 7 C2 B DC 3 ? ? N3 B DC 3 ? ? C4 B DC 3 ? ? 123.07 119.90 3.17 0.50 N 264 7 N1 B DC 3 ? ? C2 B DC 3 ? ? O2 B DC 3 ? ? 124.30 118.90 5.40 0.60 N 265 7 "O3'" B A1MA9 4 ? ? P B DC 5 ? ? "O5'" B DC 5 ? ? 116.31 104.00 12.31 1.90 Y 266 7 OP1 B DC 5 ? ? P B DC 5 ? ? OP2 B DC 5 ? ? 109.09 119.60 -10.51 1.50 N 267 7 "O4'" B DC 5 ? ? "C1'" B DC 5 ? ? N1 B DC 5 ? ? 110.63 108.30 2.33 0.30 N 268 7 N1 B DC 5 ? ? C2 B DC 5 ? ? O2 B DC 5 ? ? 123.14 118.90 4.24 0.60 N 269 7 "O3'" B DC 5 ? ? P B DG 6 ? ? "O5'" B DG 6 ? ? 115.43 104.00 11.43 1.90 Y 270 7 OP1 B DG 6 ? ? P B DG 6 ? ? OP2 B DG 6 ? ? 106.53 119.60 -13.07 1.50 N 271 7 C2 B DG 6 ? ? N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? 116.38 111.90 4.48 0.50 N 272 7 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? C5 B DG 6 ? ? 122.96 128.60 -5.64 0.50 N 273 7 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 130.10 126.00 4.10 0.60 N 274 8 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 111.03 108.30 2.73 0.30 N 275 8 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 123.80 118.90 4.90 0.60 N 276 8 OP1 A DG 2 ? ? P A DG 2 ? ? OP2 A DG 2 ? ? 109.38 119.60 -10.22 1.50 N 277 8 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.90 108.30 4.60 0.30 N 278 8 C2 A DG 2 ? ? N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? 116.54 111.90 4.64 0.50 N 279 8 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? C5 A DG 2 ? ? 122.93 128.60 -5.67 0.50 N 280 8 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 130.22 126.00 4.22 0.60 N 281 8 "O3'" A DG 2 ? ? P A DC 3 ? ? "O5'" A DC 3 ? ? 116.13 104.00 12.13 1.90 Y 282 8 OP1 A DC 3 ? ? P A DC 3 ? ? OP2 A DC 3 ? ? 108.65 119.60 -10.95 1.50 N 283 8 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 112.22 108.30 3.92 0.30 N 284 8 C2 A DC 3 ? ? N3 A DC 3 ? ? C4 A DC 3 ? ? 123.27 119.90 3.37 0.50 N 285 8 N1 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 123.79 118.90 4.89 0.60 N 286 8 "O3'" A A1MA9 4 ? ? P A DC 5 ? ? "O5'" A DC 5 ? ? 115.49 104.00 11.49 1.90 Y 287 8 OP1 A DC 5 ? ? P A DC 5 ? ? OP2 A DC 5 ? ? 108.89 119.60 -10.71 1.50 N 288 8 C2 A DC 5 ? ? N3 A DC 5 ? ? C4 A DC 5 ? ? 123.06 119.90 3.16 0.50 N 289 8 N1 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 124.27 118.90 5.37 0.60 N 290 8 OP1 A DG 6 ? ? P A DG 6 ? ? OP2 A DG 6 ? ? 109.73 119.60 -9.87 1.50 N 291 8 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 110.23 108.30 1.93 0.30 N 292 8 C2 A DG 6 ? ? N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? 116.22 111.90 4.32 0.50 N 293 8 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? C5 A DG 6 ? ? 122.79 128.60 -5.81 0.50 N 294 8 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 130.53 126.00 4.53 0.60 N 295 8 "O4'" B DC 1 ? ? "C1'" B DC 1 ? ? "C2'" B DC 1 ? ? 101.02 105.90 -4.88 0.80 N 296 8 N1 B DC 1 ? ? C2 B DC 1 ? ? O2 B DC 1 ? ? 124.52 118.90 5.62 0.60 N 297 8 OP1 B DG 2 ? ? P B DG 2 ? ? OP2 B DG 2 ? ? 108.91 119.60 -10.69 1.50 N 298 8 "O4'" B DG 2 ? ? "C1'" B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 110.93 108.30 2.63 0.30 N 299 8 C2 B DG 2 ? ? N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? 116.42 111.90 4.52 0.50 N 300 8 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? C5 B DG 2 ? ? 123.08 128.60 -5.52 0.50 N 301 8 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 130.05 126.00 4.05 0.60 N 302 8 "O3'" B DG 2 ? ? P B DC 3 ? ? "O5'" B DC 3 ? ? 115.85 104.00 11.85 1.90 Y 303 8 OP1 B DC 3 ? ? P B DC 3 ? ? OP2 B DC 3 ? ? 109.02 119.60 -10.58 1.50 N 304 8 "O4'" B DC 3 ? ? "C1'" B DC 3 ? ? N1 B DC 3 ? ? 110.96 108.30 2.66 0.30 N 305 8 C2 B DC 3 ? ? N3 B DC 3 ? ? C4 B DC 3 ? ? 123.31 119.90 3.41 0.50 N 306 8 N1 B DC 3 ? ? C2 B DC 3 ? ? O2 B DC 3 ? ? 124.30 118.90 5.40 0.60 N 307 8 OP1 B DC 5 ? ? P B DC 5 ? ? OP2 B DC 5 ? ? 110.12 119.60 -9.48 1.50 N 308 8 "O4'" B DC 5 ? ? "C1'" B DC 5 ? ? N1 B DC 5 ? ? 110.41 108.30 2.11 0.30 N 309 8 N1 B DC 5 ? ? C2 B DC 5 ? ? O2 B DC 5 ? ? 123.53 118.90 4.63 0.60 N 310 8 "O3'" B DC 5 ? ? P B DG 6 ? ? "O5'" B DG 6 ? ? 115.52 104.00 11.52 1.90 Y 311 8 OP1 B DG 6 ? ? P B DG 6 ? ? OP2 B DG 6 ? ? 106.82 119.60 -12.78 1.50 N 312 8 C2 B DG 6 ? ? N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? 116.57 111.90 4.67 0.50 N 313 8 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? C5 B DG 6 ? ? 123.21 128.60 -5.39 0.50 N 314 8 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 129.65 126.00 3.65 0.60 N 315 9 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 113.46 108.30 5.16 0.30 N 316 9 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 123.80 118.90 4.90 0.60 N 317 9 OP1 A DG 2 ? ? P A DG 2 ? ? OP2 A DG 2 ? ? 109.00 119.60 -10.60 1.50 N 318 9 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 111.79 108.30 3.49 0.30 N 319 9 C2 A DG 2 ? ? N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? 116.56 111.90 4.66 0.50 N 320 9 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? C5 A DG 2 ? ? 122.88 128.60 -5.72 0.50 N 321 9 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 130.67 126.00 4.67 0.60 N 322 9 "O3'" A DG 2 ? ? P A DC 3 ? ? "O5'" A DC 3 ? ? 117.04 104.00 13.04 1.90 Y 323 9 OP1 A DC 3 ? ? P A DC 3 ? ? OP2 A DC 3 ? ? 108.34 119.60 -11.26 1.50 N 324 9 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 112.25 108.30 3.95 0.30 N 325 9 C2 A DC 3 ? ? N3 A DC 3 ? ? C4 A DC 3 ? ? 123.19 119.90 3.29 0.50 N 326 9 N1 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 123.83 118.90 4.93 0.60 N 327 9 OP1 A DC 5 ? ? P A DC 5 ? ? OP2 A DC 5 ? ? 109.22 119.60 -10.38 1.50 N 328 9 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 111.23 108.30 2.93 0.30 N 329 9 N1 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 123.45 118.90 4.55 0.60 N 330 9 OP1 A DG 6 ? ? P A DG 6 ? ? OP2 A DG 6 ? ? 110.23 119.60 -9.37 1.50 N 331 9 C2 A DG 6 ? ? N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? 116.40 111.90 4.50 0.50 N 332 9 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? C5 A DG 6 ? ? 123.00 128.60 -5.60 0.50 N 333 9 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 130.30 126.00 4.30 0.60 N 334 9 "O4'" B DC 1 ? ? "C1'" B DC 1 ? ? N1 B DC 1 ? ? 111.20 108.30 2.90 0.30 N 335 9 N1 B DC 1 ? ? C2 B DC 1 ? ? O2 B DC 1 ? ? 124.13 118.90 5.23 0.60 N 336 9 "O3'" B DC 1 ? ? P B DG 2 ? ? "O5'" B DG 2 ? ? 116.77 104.00 12.77 1.90 Y 337 9 OP1 B DG 2 ? ? P B DG 2 ? ? OP2 B DG 2 ? ? 108.30 119.60 -11.30 1.50 N 338 9 "O4'" B DG 2 ? ? "C1'" B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 111.97 108.30 3.67 0.30 N 339 9 C2 B DG 2 ? ? N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? 116.59 111.90 4.69 0.50 N 340 9 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? C5 B DG 2 ? ? 122.81 128.60 -5.79 0.50 N 341 9 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 130.14 126.00 4.14 0.60 N 342 9 OP1 B DC 3 ? ? P B DC 3 ? ? OP2 B DC 3 ? ? 110.01 119.60 -9.59 1.50 N 343 9 "O4'" B DC 3 ? ? "C1'" B DC 3 ? ? N1 B DC 3 ? ? 110.57 108.30 2.27 0.30 N 344 9 C2 B DC 3 ? ? N3 B DC 3 ? ? C4 B DC 3 ? ? 123.34 119.90 3.44 0.50 N 345 9 N1 B DC 3 ? ? C2 B DC 3 ? ? O2 B DC 3 ? ? 124.88 118.90 5.98 0.60 N 346 9 "O3'" B A1MA9 4 ? ? P B DC 5 ? ? "O5'" B DC 5 ? ? 116.13 104.00 12.13 1.90 Y 347 9 OP1 B DC 5 ? ? P B DC 5 ? ? OP2 B DC 5 ? ? 109.04 119.60 -10.56 1.50 N 348 9 "O4'" B DC 5 ? ? "C1'" B DC 5 ? ? N1 B DC 5 ? ? 110.73 108.30 2.43 0.30 N 349 9 N1 B DC 5 ? ? C2 B DC 5 ? ? O2 B DC 5 ? ? 124.05 118.90 5.15 0.60 N 350 9 OP1 B DG 6 ? ? P B DG 6 ? ? OP2 B DG 6 ? ? 109.98 119.60 -9.62 1.50 N 351 9 C2 B DG 6 ? ? N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? 116.34 111.90 4.44 0.50 N 352 9 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? C5 B DG 6 ? ? 123.11 128.60 -5.49 0.50 N 353 9 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 129.67 126.00 3.67 0.60 N 354 10 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 113.06 108.30 4.76 0.30 N 355 10 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 123.22 118.90 4.32 0.60 N 356 10 OP1 A DG 2 ? ? P A DG 2 ? ? OP2 A DG 2 ? ? 110.09 119.60 -9.51 1.50 N 357 10 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 111.25 108.30 2.95 0.30 N 358 10 C2 A DG 2 ? ? N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? 116.47 111.90 4.57 0.50 N 359 10 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? C5 A DG 2 ? ? 122.75 128.60 -5.85 0.50 N 360 10 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 130.53 126.00 4.53 0.60 N 361 10 "O3'" A DG 2 ? ? P A DC 3 ? ? "O5'" A DC 3 ? ? 117.03 104.00 13.03 1.90 Y 362 10 OP1 A DC 3 ? ? P A DC 3 ? ? OP2 A DC 3 ? ? 108.45 119.60 -11.15 1.50 N 363 10 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 113.53 108.30 5.23 0.30 N 364 10 C2 A DC 3 ? ? N3 A DC 3 ? ? C4 A DC 3 ? ? 123.15 119.90 3.25 0.50 N 365 10 N1 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 123.82 118.90 4.92 0.60 N 366 10 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 111.71 108.30 3.41 0.30 N 367 10 C2 A DC 5 ? ? N3 A DC 5 ? ? C4 A DC 5 ? ? 122.99 119.90 3.09 0.50 N 368 10 N1 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 123.22 118.90 4.32 0.60 N 369 10 OP1 A DG 6 ? ? P A DG 6 ? ? OP2 A DG 6 ? ? 108.29 119.60 -11.31 1.50 N 370 10 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 113.04 108.30 4.74 0.30 N 371 10 C2 A DG 6 ? ? N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? 115.75 111.90 3.85 0.50 N 372 10 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? C5 A DG 6 ? ? 123.21 128.60 -5.39 0.50 N 373 10 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 130.28 126.00 4.28 0.60 N 374 10 "O4'" B DC 1 ? ? "C1'" B DC 1 ? ? N1 B DC 1 ? ? 110.78 108.30 2.48 0.30 N 375 10 N1 B DC 1 ? ? C2 B DC 1 ? ? O2 B DC 1 ? ? 124.60 118.90 5.70 0.60 N 376 10 "O3'" B DC 1 ? ? P B DG 2 ? ? "O5'" B DG 2 ? ? 117.29 104.00 13.29 1.90 Y 377 10 OP1 B DG 2 ? ? P B DG 2 ? ? OP2 B DG 2 ? ? 107.62 119.60 -11.98 1.50 N 378 10 "O4'" B DG 2 ? ? "C1'" B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 110.67 108.30 2.37 0.30 N 379 10 C2 B DG 2 ? ? N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? 116.48 111.90 4.58 0.50 N 380 10 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? C5 B DG 2 ? ? 123.15 128.60 -5.45 0.50 N 381 10 N3 B DG 2 ? ? C4 B DG 2 ? ? N9 B DG 2 ? ? 129.77 126.00 3.77 0.60 N 382 10 N3 B DG 2 ? ? C2 B DG 2 ? ? N2 B DG 2 ? ? 115.39 119.90 -4.51 0.70 N 383 10 OP1 B DC 3 ? ? P B DC 3 ? ? OP2 B DC 3 ? ? 109.64 119.60 -9.96 1.50 N 384 10 "O4'" B DC 3 ? ? "C1'" B DC 3 ? ? N1 B DC 3 ? ? 110.93 108.30 2.63 0.30 N 385 10 C2 B DC 3 ? ? N3 B DC 3 ? ? C4 B DC 3 ? ? 123.49 119.90 3.59 0.50 N 386 10 N1 B DC 3 ? ? C2 B DC 3 ? ? O2 B DC 3 ? ? 124.25 118.90 5.35 0.60 N 387 10 OP1 B DC 5 ? ? P B DC 5 ? ? OP2 B DC 5 ? ? 109.12 119.60 -10.48 1.50 N 388 10 "O4'" B DC 5 ? ? "C1'" B DC 5 ? ? N1 B DC 5 ? ? 110.47 108.30 2.17 0.30 N 389 10 N1 B DC 5 ? ? C2 B DC 5 ? ? O2 B DC 5 ? ? 124.17 118.90 5.27 0.60 N 390 10 OP1 B DG 6 ? ? P B DG 6 ? ? OP2 B DG 6 ? ? 108.71 119.60 -10.89 1.50 N 391 10 C2 B DG 6 ? ? N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? 116.47 111.90 4.57 0.50 N 392 10 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? C5 B DG 6 ? ? 122.98 128.60 -5.62 0.50 N 393 10 N3 B DG 6 ? ? C4 B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 129.64 126.00 3.64 0.60 N # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 9VZW _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 20 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'structures with the lowest energy' _pdbx_nmr_ensemble.representative_conformer ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.entry_id 9VZW _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'lowest energy' # loop_ _pdbx_nmr_sample_details.solution_id _pdbx_nmr_sample_details.contents _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system _pdbx_nmr_sample_details.label _pdbx_nmr_sample_details.type _pdbx_nmr_sample_details.details 1 ;6.0 mM DNA (5'-D(*CP*GP*CP*(FG)P*CP*G)-3'), 90% H2O/10% D2O ; '90% H2O/10% D2O' 1H solution ? 2 ;6.0 mM DNA (5'-D(*CP*GP*CP*(FG)P*CP*G)-3'), 100% D2O ; '100% D2O' 1H solution ? 3 ;6.0 mM DNA (5'-D(*CP*GP*CP*(FG)P*CP*G)-3'), 90% H2O/10% D2O ; '90% H2O/10% D2O' 31P solution ? 4 ;6.0 mM DNA (5'-D(*CP*GP*CP*(FG)P*CP*G)-3'), 90% H2O/10% D2O ; '90% H2O/10% D2O' 19F solution ? # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample.solution_id _pdbx_nmr_exptl_sample.component _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_range _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_units _pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling 1 ;DNA (5'-D(*CP*GP*CP*(FG)P*CP*G)-3') ; 6.0 ? mM 'natural abundance' 2 ;DNA (5'-D(*CP*GP*CP*(FG)P*CP*G)-3') ; 6.0 ? mM 'natural abundance' 3 ;DNA (5'-D(*CP*GP*CP*(FG)P*CP*G)-3') ; 6.0 ? mM 'natural abundance' 4 ;DNA (5'-D(*CP*GP*CP*(FG)P*CP*G)-3') ; 6.0 ? mM 'natural abundance' # _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature 298 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units atm _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH 7.0 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength 2.0 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.details ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_units M _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.label conditions_1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_units pH _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units K # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.type _pdbx_nmr_exptl.spectrometer_id _pdbx_nmr_exptl.sample_state 1 1 1 '2D 1H-1H NOESY' 1 isotropic 2 1 3 1D 1 isotropic 3 1 4 1D 1 isotropic 4 1 2 1D 1 isotropic # _pdbx_nmr_refine.entry_id 9VZW _pdbx_nmr_refine.method 'molecular dynamics' _pdbx_nmr_refine.details ? _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 3 # loop_ _pdbx_nmr_software.ordinal _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.authors 1 'chemical shift assignment' 'MestreLab (Mnova / MestReNova / MestReC)' ? Carballas 2 'chemical shift calculation' 'MestreLab (Mnova / MestReNova / MestReC)' ? Carballas 5 collection TopSpin ? 'Bruker Biospin' 6 refinement 'Discovery Studio' ? Martinez 3 'structure calculation' 'Discovery Studio' ? Martinez # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_ordinal A1MA8 C1 C Y N 1 A1MA8 C2 C Y N 2 A1MA8 C3 C Y N 3 A1MA8 C4 C Y N 4 A1MA8 C5 C Y N 5 A1MA8 C6 C Y N 6 A1MA8 N7 N Y N 7 A1MA8 C8 C Y N 8 A1MA8 C9 C Y N 9 A1MA8 C10 C Y N 10 A1MA8 C11 C Y N 11 A1MA8 C12 C Y N 12 A1MA8 C13 C Y N 13 A1MA8 C14 C N N 14 A1MA8 C15 C N N 15 A1MA8 C16 C N N 16 A1MA8 O17 O N N 17 A1MA8 C18 C N N 18 A1MA8 O19 O N N 19 A1MA8 C20 C N N 20 A1MA8 C21 C N N 21 A1MA8 N22 N N N 22 A1MA8 C23 C N N 23 A1MA8 C24 C N N 24 A1MA8 C25 C N N 25 A1MA8 H26 H N N 26 A1MA8 H27 H N N 27 A1MA8 H28 H N N 28 A1MA8 H29 H N N 29 A1MA8 H30 H N N 30 A1MA8 H31 H N N 31 A1MA8 H34 H N N 32 A1MA8 H32 H N N 33 A1MA8 H33 H N N 34 A1MA8 H36 H N N 35 A1MA8 H37 H N N 36 A1MA8 H35 H N N 37 A1MA8 H38 H N N 38 A1MA8 H39 H N N 39 A1MA8 H40 H N N 40 A1MA8 H41 H N N 41 A1MA8 H50 H N N 42 A1MA8 H42 H N N 43 A1MA8 H44 H N N 44 A1MA8 H45 H N N 45 A1MA8 H43 H N N 46 A1MA8 H46 H N N 47 A1MA8 H48 H N N 48 A1MA8 H47 H N N 49 A1MA9 P P N N 50 A1MA9 OP2 O N N 51 A1MA9 "O5'" O N N 52 A1MA9 "C2'" C N R 53 A1MA9 "C5'" C N N 54 A1MA9 "C4'" C N R 55 A1MA9 "O4'" O N N 56 A1MA9 "C1'" C N R 57 A1MA9 "C3'" C N R 58 A1MA9 "O3'" O N N 59 A1MA9 OP1 O N N 60 A1MA9 N9 N Y N 61 A1MA9 C4 C Y N 62 A1MA9 N3 N N N 63 A1MA9 C2 C N N 64 A1MA9 N2 N N N 65 A1MA9 N1 N N N 66 A1MA9 C6 C N N 67 A1MA9 O6 O N N 68 A1MA9 C5 C Y N 69 A1MA9 N7 N Y N 70 A1MA9 C8 C Y N 71 A1MA9 C C N N 72 A1MA9 "F2'" F N N 73 A1MA9 F11 F N N 74 A1MA9 F12 F N N 75 A1MA9 F13 F N N 76 A1MA9 HOP2 H N N 77 A1MA9 "H2'" H N N 78 A1MA9 "H5'" H N N 79 A1MA9 "H5''" H N N 80 A1MA9 "H4'" H N N 81 A1MA9 "H1'" H N N 82 A1MA9 "H3'" H N N 83 A1MA9 H3 H N N 84 A1MA9 H21 H N N 85 A1MA9 H22 H N N 86 A1MA9 H1 H N N 87 A1MA9 OP3 O N N 88 A1MA9 HOP3 H N N 89 DC OP3 O N N 90 DC P P N N 91 DC OP1 O N N 92 DC OP2 O N N 93 DC "O5'" O N N 94 DC "C5'" C N N 95 DC "C4'" C N R 96 DC "O4'" O N N 97 DC "C3'" C N S 98 DC "O3'" O N N 99 DC "C2'" C N N 100 DC "C1'" C N R 101 DC N1 N N N 102 DC C2 C N N 103 DC O2 O N N 104 DC N3 N N N 105 DC C4 C N N 106 DC N4 N N N 107 DC C5 C N N 108 DC C6 C N N 109 DC HOP3 H N N 110 DC HOP2 H N N 111 DC "H5'" H N N 112 DC "H5''" H N N 113 DC "H4'" H N N 114 DC "H3'" H N N 115 DC "HO3'" H N N 116 DC "H2'" H N N 117 DC "H2''" H N N 118 DC "H1'" H N N 119 DC H41 H N N 120 DC H42 H N N 121 DC H5 H N N 122 DC H6 H N N 123 DG OP3 O N N 124 DG P P N N 125 DG OP1 O N N 126 DG OP2 O N N 127 DG "O5'" O N N 128 DG "C5'" C N N 129 DG "C4'" C N R 130 DG "O4'" O N N 131 DG "C3'" C N S 132 DG "O3'" O N N 133 DG "C2'" C N N 134 DG "C1'" C N R 135 DG N9 N Y N 136 DG C8 C Y N 137 DG N7 N Y N 138 DG C5 C Y N 139 DG C6 C N N 140 DG O6 O N N 141 DG N1 N N N 142 DG C2 C N N 143 DG N2 N N N 144 DG N3 N N N 145 DG C4 C Y N 146 DG HOP3 H N N 147 DG HOP2 H N N 148 DG "H5'" H N N 149 DG "H5''" H N N 150 DG "H4'" H N N 151 DG "H3'" H N N 152 DG "HO3'" H N N 153 DG "H2'" H N N 154 DG "H2''" H N N 155 DG "H1'" H N N 156 DG H8 H N N 157 DG H1 H N N 158 DG H21 H N N 159 DG H22 H N N 160 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal A1MA8 O17 C14 doub N N 1 A1MA8 C24 C23 sing N N 2 A1MA8 C18 C15 sing N N 3 A1MA8 O19 C15 doub N N 4 A1MA8 C15 C12 sing N N 5 A1MA8 C14 C16 sing N N 6 A1MA8 C14 C1 sing N N 7 A1MA8 C13 C12 doub Y N 8 A1MA8 C13 C9 sing Y N 9 A1MA8 C12 C11 sing Y N 10 A1MA8 C6 C1 doub Y N 11 A1MA8 C6 C5 sing Y N 12 A1MA8 C1 C2 sing Y N 13 A1MA8 C9 C5 sing Y N 14 A1MA8 C9 C8 doub Y N 15 A1MA8 C11 C10 doub Y N 16 A1MA8 C5 C4 doub Y N 17 A1MA8 C2 C3 doub Y N 18 A1MA8 C10 C8 sing Y N 19 A1MA8 C8 N7 sing Y N 20 A1MA8 C21 N22 sing N N 21 A1MA8 C21 C20 sing N N 22 A1MA8 C4 C3 sing Y N 23 A1MA8 C4 N7 sing Y N 24 A1MA8 N7 C20 sing N N 25 A1MA8 C23 N22 sing N N 26 A1MA8 C23 C25 sing N N 27 A1MA8 C2 H26 sing N N 28 A1MA8 C3 H27 sing N N 29 A1MA8 C6 H28 sing N N 30 A1MA8 C10 H29 sing N N 31 A1MA8 C11 H30 sing N N 32 A1MA8 C13 H31 sing N N 33 A1MA8 C16 H34 sing N N 34 A1MA8 C16 H32 sing N N 35 A1MA8 C16 H33 sing N N 36 A1MA8 C18 H36 sing N N 37 A1MA8 C18 H37 sing N N 38 A1MA8 C18 H35 sing N N 39 A1MA8 C20 H38 sing N N 40 A1MA8 C20 H39 sing N N 41 A1MA8 C21 H40 sing N N 42 A1MA8 C21 H41 sing N N 43 A1MA8 N22 H50 sing N N 44 A1MA8 C23 H42 sing N N 45 A1MA8 C24 H44 sing N N 46 A1MA8 C24 H45 sing N N 47 A1MA8 C24 H43 sing N N 48 A1MA8 C25 H46 sing N N 49 A1MA8 C25 H48 sing N N 50 A1MA8 C25 H47 sing N N 51 A1MA9 OP2 P sing N N 52 A1MA9 OP1 P doub N N 53 A1MA9 P "O5'" sing N N 54 A1MA9 "O5'" "C5'" sing N N 55 A1MA9 "C5'" "C4'" sing N N 56 A1MA9 "C4'" "O4'" sing N N 57 A1MA9 "C4'" "C3'" sing N N 58 A1MA9 "O4'" "C1'" sing N N 59 A1MA9 "C3'" "O3'" sing N N 60 A1MA9 "C3'" "C2'" sing N N 61 A1MA9 F11 C sing N N 62 A1MA9 "C1'" N9 sing N N 63 A1MA9 "C1'" "C2'" sing N N 64 A1MA9 N2 C2 sing N N 65 A1MA9 N3 C2 doub N N 66 A1MA9 N3 C4 sing N N 67 A1MA9 C2 N1 sing N N 68 A1MA9 N9 C4 sing Y N 69 A1MA9 N9 C8 sing Y N 70 A1MA9 C4 C5 doub Y N 71 A1MA9 N1 C6 sing N N 72 A1MA9 "C2'" "F2'" sing N N 73 A1MA9 C5 C6 sing N N 74 A1MA9 C5 N7 sing Y N 75 A1MA9 C8 C sing N N 76 A1MA9 C8 N7 doub Y N 77 A1MA9 C6 O6 doub N N 78 A1MA9 C F12 sing N N 79 A1MA9 C F13 sing N N 80 A1MA9 OP2 HOP2 sing N N 81 A1MA9 "C2'" "H2'" sing N N 82 A1MA9 "C5'" "H5'" sing N N 83 A1MA9 "C5'" "H5''" sing N N 84 A1MA9 "C4'" "H4'" sing N N 85 A1MA9 "C1'" "H1'" sing N N 86 A1MA9 "C3'" "H3'" sing N N 87 A1MA9 "O3'" H3 sing N N 88 A1MA9 N2 H21 sing N N 89 A1MA9 N2 H22 sing N N 90 A1MA9 N1 H1 sing N N 91 A1MA9 P OP3 sing N N 92 A1MA9 OP3 HOP3 sing N N 93 DC OP3 P sing N N 94 DC OP3 HOP3 sing N N 95 DC P OP1 doub N N 96 DC P OP2 sing N N 97 DC P "O5'" sing N N 98 DC OP2 HOP2 sing N N 99 DC "O5'" "C5'" sing N N 100 DC "C5'" "C4'" sing N N 101 DC "C5'" "H5'" sing N N 102 DC "C5'" "H5''" sing N N 103 DC "C4'" "O4'" sing N N 104 DC "C4'" "C3'" sing N N 105 DC "C4'" "H4'" sing N N 106 DC "O4'" "C1'" sing N N 107 DC "C3'" "O3'" sing N N 108 DC "C3'" "C2'" sing N N 109 DC "C3'" "H3'" sing N N 110 DC "O3'" "HO3'" sing N N 111 DC "C2'" "C1'" sing N N 112 DC "C2'" "H2'" sing N N 113 DC "C2'" "H2''" sing N N 114 DC "C1'" N1 sing N N 115 DC "C1'" "H1'" sing N N 116 DC N1 C2 sing N N 117 DC N1 C6 sing N N 118 DC C2 O2 doub N N 119 DC C2 N3 sing N N 120 DC N3 C4 doub N N 121 DC C4 N4 sing N N 122 DC C4 C5 sing N N 123 DC N4 H41 sing N N 124 DC N4 H42 sing N N 125 DC C5 C6 doub N N 126 DC C5 H5 sing N N 127 DC C6 H6 sing N N 128 DG OP3 P sing N N 129 DG OP3 HOP3 sing N N 130 DG P OP1 doub N N 131 DG P OP2 sing N N 132 DG P "O5'" sing N N 133 DG OP2 HOP2 sing N N 134 DG "O5'" "C5'" sing N N 135 DG "C5'" "C4'" sing N N 136 DG "C5'" "H5'" sing N N 137 DG "C5'" "H5''" sing N N 138 DG "C4'" "O4'" sing N N 139 DG "C4'" "C3'" sing N N 140 DG "C4'" "H4'" sing N N 141 DG "O4'" "C1'" sing N N 142 DG "C3'" "O3'" sing N N 143 DG "C3'" "C2'" sing N N 144 DG "C3'" "H3'" sing N N 145 DG "O3'" "HO3'" sing N N 146 DG "C2'" "C1'" sing N N 147 DG "C2'" "H2'" sing N N 148 DG "C2'" "H2''" sing N N 149 DG "C1'" N9 sing N N 150 DG "C1'" "H1'" sing N N 151 DG N9 C8 sing Y N 152 DG N9 C4 sing Y N 153 DG C8 N7 doub Y N 154 DG C8 H8 sing N N 155 DG N7 C5 sing Y N 156 DG C5 C6 sing N N 157 DG C5 C4 doub Y N 158 DG C6 O6 doub N N 159 DG C6 N1 sing N N 160 DG N1 C2 sing N N 161 DG N1 H1 sing N N 162 DG C2 N2 sing N N 163 DG C2 N3 doub N N 164 DG N2 H21 sing N N 165 DG N2 H22 sing N N 166 DG N3 C4 sing N N 167 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 9VZW 'double helix' 9VZW 'z-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DC 1 1_555 B DG 6 1_555 -0.112 0.016 1.116 -23.102 8.810 3.782 1 A_DC1:DG6_B A 1 ? B 6 ? 19 1 1 A DG 2 1_555 B DC 5 1_555 -0.644 0.004 -0.176 -8.917 12.409 2.571 2 A_DG2:DC5_B A 2 ? B 5 ? 19 1 1 A DC 3 1_555 B A1MA9 4 1_555 -0.614 -0.099 0.088 -10.836 11.901 -1.390 3 A_DC3:A1MA94_B A 3 ? B 4 ? 19 1 1 A A1MA9 4 1_555 B DC 3 1_555 0.217 0.037 0.036 -1.615 17.133 -4.699 4 A_A1MA94:DC3_B A 4 ? B 3 ? 19 1 1 A DC 5 1_555 B DG 2 1_555 -0.322 -0.064 0.171 5.688 8.308 1.368 5 A_DC5:DG2_B A 5 ? B 2 ? 19 1 1 A DG 6 1_555 B DC 1 1_555 0.231 0.048 0.152 18.959 6.993 -2.894 6 A_DG6:DC1_B A 6 ? B 1 ? 19 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A DG 2 1_555 B DC 5 1_555 A DC 3 1_555 B A1MA9 4 1_555 0.390 -1.332 3.256 -0.568 -0.314 -46.146 1.726 0.450 3.251 0.400 -0.724 -46.150 1 AA_DG2DC3:A1MA94DC5_BB A 2 ? B 5 ? A 3 ? B 4 ? 1 A DC 3 1_555 B A1MA9 4 1_555 A A1MA9 4 1_555 B DC 3 1_555 0.273 4.497 3.075 -2.377 9.229 -24.101 -11.817 0.151 1.311 -21.078 -5.429 -25.891 2 AA_DC3A1MA94:DC3A1MA94_BB A 3 ? B 4 ? A 4 ? B 3 ? 1 A A1MA9 4 1_555 B DC 3 1_555 A DC 5 1_555 B DG 2 1_555 -0.534 -1.015 3.057 -0.557 -0.370 -48.723 1.256 -0.688 3.044 0.448 -0.675 -48.727 3 AA_A1MA94DC5:DG2DC3_BB A 4 ? B 3 ? A 5 ? B 2 ? # _pdbx_audit_support.funding_organization 'Japan Society for the Promotion of Science (JSPS)' _pdbx_audit_support.country Japan _pdbx_audit_support.grant_number ? _pdbx_audit_support.ordinal 1 # _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id 1 _pdbx_nmr_spectrometer.model 'AVANCE III' _pdbx_nmr_spectrometer.type ? _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer Bruker _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength 500 _pdbx_nmr_spectrometer.details ? # _atom_sites.entry_id 9VZW _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.Cartn_transform_axes ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C F H N O P # loop_ #