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_refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_Zscore _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0030 ? 29323 ? f_bond_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.4915 ? 40058 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0397 ? 4581 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0031 ? 4889 ? f_plane_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 19.2714 ? 4759 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? # _struct.entry_id 9WSM _struct.title 'Cryo-EM structure of Sigma28-RNAP open promoter complex from Pseudomonas aeruginosa' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9WSM _struct_keywords.text 'P. aeruginosa, Sigma 28, RNAP, Flagella, fliC, TRANSCRIPTION' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 5 ? G N N 6 ? H N N 7 ? I N N 8 ? J N N 9 ? K N N 9 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 9WSM 9WSM ? 1 ? 1 2 PDB 9WSM 9WSM ? 2 ? 1 3 UNP RPOZ_PSEAE Q9HTM1 ? 3 ;MARVTVEDCLDNVDNRFELVMLATKRARQLATGGKEPKVAWENDKPTVVALREIASGLVDENVVQQEDIVEDEPLFAAFD DEANTEAL ; 1 4 UNP FLIA_PSEAE P29248 ? 4 ;MTAASGVRMYSKAQAQNSQEQLIQRYAPLVKRIAYHLLGRLPASVQVEDLMQAGMIGLLEAAKKYDAGKGASFETYAGIR IRGAMLDEVRKGDWAPRSVHRNTRMVTDAIRAIEARTGRDAKDHEVAAELQLSLEDYYGILSDTQGSRLYSFDDLLQDGE HGLPEDTSLSHNEPIHGLLDERFQAALADAIAKLPERERLVLALYYDEELNLKEIGEVLGVSESRVSQLHSQCAARLRAR LADWRSA ; 1 5 UNP RPOA_PSEAE O52760 ? 5 ;MQSSVNEFLTPRHIDVQVVSQTRAKITLEPLERGFGHTLGNALRRILLSSMPGCAVVEAEIDGVLHEYSAIEGVQEDVIE ILLNLKGLAIKLHGRDEVTLTLAKKGSGVVTAADIQLDHDVEIINGDHVIANLADNGALNMKLKVARGRGYEPADARQSD EDESRSIGRLQLDASFSPVRRVSYVVENARVEQRTNLDKLVLDLETNGTLDPEEAIRRAATILQQQLAAFVDLKGDSEPV VEEQEDEIDPILLRPVDDLELTVRSANCLKAENIYYIGDLIQRTEVELLKTPNLGKKSLTEIKDVLASRGLSLGMRLDNW PPASLKKDDKATA ; 1 6 UNP RPOB_PSEAE Q51561 ? 6 ;MAYSYTEKKRIRKDFSKLPDVMDVPYLLAIQLDSYREFLQAGATKEQFRDVGLHAAFKSVFPIISYSGNAALEYVGYRLG EPAFDVKECVLRGVTFAVPLRVKVRLIIFDRESSNKAIKDIKEQEVYMGEIPLMTENGTFIINGTERVIVSQLHRSPGVF FDHDRGKTHSSGKLLYSARIIPYRGSWLDFEFDPKDCVFVRIDRRRKLPASVLLRALGYSTEEILNAFYATNVFHIKGET LNLELVPQRLRGEVASIDIKDGSGKVIVEQGRRITARHINQLEKAGVSQLEVPFDYLIGRTIAKAIVHPATGEIIAECNT ELTLDLLAKVAKAQVVRIETLYTNDIDCGPFISDTLKIDNTSNQLEALVEIYRMMRPGEPPTKEAAETLFGNLFFSAERY DLSAVGRMKFNRRIGRTEIEGPGVLSKEDIIDVLKTLVDIRNGKGIVDDIDHLGNRRVRCVGEMAENQFRVGLVRVERAV KERLSMAESEGLMPQDLINAKPVAAAIKEFFGSSQLSQFMDQNNPLSEITHKRRVSALGPGGLTRERAGFEVRDVHPTHY GRVCPIETPEGPNIGLINSLATYARTNKYGFLESPYRVVKDSLVTDEIVFLSAIEEADHVIAQASATLNEKGQLVDELVA VRHLNEFTVKAPEDVTLMDVSPKQVVSVAASLIPFLEHDDANRALMGSNMQRQAVPTLRADKPLVGTGMERNVARDSGVC VVARRGGVIDSVDASRVVVRVADDEVETGEAGVDIYNLTKYTRSNQNTCINQRPLVSKGDVVARGDILADGPSTDMGELA LGQNMRVAFMPWNGFNFEDSICLSERVVQEDRFTTIHIQELTCVARDTKLGPEEITADIPNVGEAALNKLDEAGIVYVGA EVQAGDILVGKVTPKGETQLTPEEKLLRAIFGEKASDVKDTSLRVPTGTKGTVIDVQVFTRDGVERDSRALSIEKMQLDQ IRKDLNEEFRIVEGATFERLRAALVGAKAEGGPALKKGTEITDDYLDGLERGQWFKLRMADDALNEQLEKAQAYISDRRQ LLDDKFEDKKRKLQQGDDLAPGVLKIVKVYLAIKRRIQPGDKMAGRHGNKGVVSVIMPVEDMPHDANGTPVDIVLNPLGV PSRMNVGQILETHLGLAAKGLGEKINRMLEEQRKVAELRKFLHEIYNEIGGREENLDELGDNEILALAKNLRGGVPMATP VFDGAKEREIKAMLKLADLPESGQMRLFDGRTGNQFERPTTVGYMYMLKLNHLVDDKMHARSTGSYSLVTQQPLGGKAQF GGQRFGEMEVWALEAYGAAYTLQEMLTVKSDDVNGRTKMYKNIVDGDHRMEAGMPESFNVLIKEIRSLGIDIELETE ; 1 7 UNP RPOC_PSEAE Q9HWC9 ? 7 ;MKDLLNLLKNQGQIEEFDAIRIGLASPEMIRSWSFGEVKKPETINYRTFKPERDGLFCAKIFGPVKDYECLCGKYKRLKH RGVICEKCGVEVALAKVRRERMGHIELASPVAHIWFLKSLPSRIGLLLDMTLRDIERVLYFESYVVIDPGMTTLEKGQLL NDEQYFEALEEFGDDFDARMGAEAVHELLNAIDLEHEIGRLREEIPQTNSETKIKKLSKRLKLMEAFQGSGNKPEWMVLT VLPVLPPDLRPLVPLDGGRFATSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLAAPDIIVRNEKRMLQEAVDALLDNGRRGRAITGSN KRPLKSLADMIKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVITVGPTLRLHQCGLPKKMALELFKPFIFGKLEGRGMATTIKAAKKM VERELPEVWDVLAEVIREHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPVLIEGKAIQLHPLVCAAYNADFDGDQMAVHVPLTLEAQLEA RALMMSTNNILSPANGEPIIVPSQDVVMGLYYMTREAINAKGEGMAFADLQEVDRAYRSGQASLHARVKVRINEKIKGED GQLTANTRIVDTTVGRALLFQVVPAGLPFDVVNQSMKKKAISKLINHCYRVVGLKDTVIFADQLMYTGFAYSTISGVSIG VNDFVIPDEKARIINAATDEVKEIESQYASGLVTQGEKYNKVIDLWSKANDEVSKAMMANLSKEKVVDREGKEVDQESFN SMYMMADSGARGSAAQIRQLAGMRGLMAKPDGSIIETPITANFREGLNVLQYFISTHGARKGLADTALKTANSGYLTRRL VDVAQDLVVTEIDCGTEHGLLMSPHIEGGDVVEPLGERVLGRVIARDVFKPGSDEVIVPAGTLIDEKWVDFLEVMSVDEV VVRSPITCETRHGICAMCYGRDLARGHRVNIGEAVGVIAAQSIGEPGTQLTMRTFHIGGAASRTSAADNVQVKNGGTIRL HNLKHVVRADGALVAVSRSGELAVADDFGRERERYKLPYGAVISVKEGDKVDPGAIVAKWDPHTHPIVTEVDGTVAFVGM EEGITVKRQTDELTGLTNIEVMDPKDRPAAGKDIRPAVKLIDAAGKDLLLPGTDVPAQYFLPANALVNLTDGAKVSIGDV VARIPQETSKTRDITGGLPRVADLFEARRPKEPSILAEISGTISFGKETKGKRRLVITPNDGSDPYEELIPKWRHLNVFE GEQVNRGEVISDGPSNPHDILRLLGVSSLAKYIVNEIQDVYRLQGVKINDKHIETILRQMLRKVEVSESGDSSFIKGDQV ELTQVLEENEQLGTEDKFPAKYERVLLGITKASLSTESFISAASFQETTRVLTEAAVTGKRDFLRGLKENVVVGRLIPAG TGLAYHSERKRQRDLGKPQRVSASEAEAALTEALNSSGN ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9WSM 1 1 ? 54 ? 9WSM 55 ? 108 ? 55 108 2 2 9WSM 2 1 ? 54 ? 9WSM 1 ? 54 ? 1 54 3 3 9WSM E 1 ? 88 ? Q9HTM1 1 ? 88 ? 1 88 4 4 9WSM F 6 ? 252 ? P29248 1 ? 247 ? 1 247 5 5 9WSM A 1 ? 333 ? O52760 1 ? 333 ? 1 333 6 5 9WSM B 1 ? 333 ? O52760 1 ? 333 ? 1 333 7 6 9WSM C 1 ? 1357 ? Q51561 1 ? 1357 ? 1 1357 8 7 9WSM D 1 ? 1399 ? Q9HWC9 1 ? 1399 ? 1 1399 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 4 9WSM GLY F 1 ? UNP P29248 ? ? 'expression tag' -4 1 4 9WSM PRO F 2 ? UNP P29248 ? ? 'expression tag' -3 2 4 9WSM LEU F 3 ? UNP P29248 ? ? 'expression tag' -2 3 4 9WSM HIS F 4 ? UNP P29248 ? ? 'expression tag' -1 4 4 9WSM MET F 5 ? UNP P29248 ? ? 'expression tag' 0 5 4 9WSM GLY F 253 ? UNP P29248 ? ? 'expression tag' 248 6 4 9WSM SER F 254 ? UNP P29248 ? ? 'expression tag' 249 7 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ARG C 16 ? THR C 32 ? ARG E 16 THR E 32 1 ? 17 HELX_P HELX_P2 AA2 LYS C 45 ? SER C 56 ? LYS E 45 SER E 56 1 ? 12 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP C 60 ? GLU C 67 ? ASP E 60 GLU E 67 1 ? 8 HELX_P HELX_P4 AA4 ASN D 22 ? GLY D 44 ? ASN F 17 GLY F 39 1 ? 23 HELX_P HELX_P5 AA5 GLN D 51 ? LYS D 69 ? GLN F 46 LYS F 64 1 ? 19 HELX_P HELX_P6 AA6 SER D 77 ? GLY D 97 ? SER F 72 GLY F 92 1 ? 21 HELX_P HELX_P7 AA7 PRO D 101 ? GLY D 123 ? PRO F 96 GLY F 118 1 ? 23 HELX_P HELX_P8 AA8 LYS D 127 ? LEU D 135 ? LYS F 122 LEU F 130 1 ? 9 HELX_P HELX_P9 AA9 SER D 138 ? GLN D 150 ? SER F 133 GLN F 145 1 ? 13 HELX_P HELX_P10 AB1 PHE D 157 ? GLN D 162 ? PHE F 152 GLN F 157 1 ? 6 HELX_P HELX_P11 AB2 ASP D 163 ? GLY D 167 ? ASP F 158 GLY F 162 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 AB3 ASP D 171 ? HIS D 176 ? ASP F 166 HIS F 171 1 ? 6 HELX_P HELX_P13 AB4 GLU D 178 ? LYS D 198 ? GLU F 173 LYS F 193 1 ? 21 HELX_P HELX_P14 AB5 PRO D 200 ? TYR D 211 ? PRO F 195 TYR F 206 1 ? 12 HELX_P HELX_P15 AB6 LEU D 217 ? GLY D 225 ? 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