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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.573 ? 37914 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 7.230 ? 4583 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.046 ? 4438 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 4840 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 9YOK _struct.title 'Fab-14/SARS-CoV-2 D614G spike complex, Mode I conformation' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9YOK _struct_keywords.text 'SARS-CoV-2, neutralizing anbitody, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 4 ? G N N 4 ? H N N 5 ? I N N 4 ? J N N 4 ? K N N 4 ? L N N 4 ? M N N 4 ? N N N 4 ? O N N 6 ? P N N 6 ? Q N N 6 ? R N N 6 ? S N N 6 ? T N N 6 ? U N N 6 ? 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CYS E 90 ? CYS E 22 ? 1_555 CYS E 90 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 69 CYS E 135 ? CYS E 194 ? CYS E 135 ? 1_555 CYS E 194 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 7 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 5 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 5 ? AC3 ? 5 ? AC4 ? 5 ? AC5 ? 7 ? AC6 ? 5 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 3 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 4 ? AD4 ? 2 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 3 ? AD7 ? 5 ? AD8 ? 5 ? AD9 ? 5 ? AE1 ? 2 ? AE2 ? 2 ? AE3 ? 3 ? AE4 ? 2 ? AE5 ? 2 ? AE6 ? 4 ? AE7 ? 4 ? AE8 ? 3 ? AE9 ? 2 ? AF1 ? 4 ? AF2 ? 4 ? AF3 ? 5 ? AF4 ? 5 ? AF5 ? 4 ? AF6 ? 4 ? AF7 ? 3 ? AF8 ? 2 ? AF9 ? 3 ? AG1 ? 4 ? AG2 ? 4 ? AG3 ? 4 ? AG4 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? anti-parallel AA7 6 7 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC5 1 2 ? parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC5 5 6 ? anti-parallel AC5 6 7 ? parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 4 5 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD7 4 5 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD8 4 5 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AD9 4 5 ? anti-parallel AE1 1 2 ? parallel AE2 1 2 ? parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE6 1 2 ? parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE6 3 4 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE7 3 4 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF2 3 4 ? anti-parallel AF3 1 2 ? parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF3 3 4 ? anti-parallel AF3 4 5 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF4 3 4 ? anti-parallel AF4 4 5 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF5 3 4 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF6 3 4 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF7 2 3 ? anti-parallel AF8 1 2 ? parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG1 2 3 ? anti-parallel AG1 3 4 ? anti-parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG2 2 3 ? anti-parallel AG2 3 4 ? anti-parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG3 2 3 ? anti-parallel AG3 3 4 ? anti-parallel AG4 1 2 ? anti-parallel AG4 2 3 ? anti-parallel AG4 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 TYR A 28 ? ASN A 30 ? TYR A 28 ASN A 30 AA1 2 ASN A 61 ? HIS A 66 ? ASN A 61 HIS A 66 AA1 3 ALA A 264 ? TYR A 269 ? ALA A 264 TYR A 269 AA1 4 GLY A 89 ? ALA A 93 ? GLY A 89 ALA A 93 AA1 5 GLU A 191 ? LYS A 195 ? GLU A 191 LYS A 195 AA1 6 ILE A 203 ? LYS A 206 ? ILE A 203 LYS A 206 AA2 1 VAL A 42 ? PHE A 43 ? VAL A 42 PHE A 43 AA2 2 PHE C 565 ? GLY C 566 ? PHE C 565 GLY C 566 AA3 1 VAL A 47 ? PHE A 55 ? VAL A 47 PHE A 55 AA3 2 GLN A 271 ? TYR A 279 ? GLN A 271 TYR A 279 AA3 3 ILE A 285 ? ASP A 290 ? ILE A 285 ASP A 290 AA4 1 LEU A 84 ? PRO A 85 ? LEU A 84 PRO A 85 AA4 2 ARG A 237 ? PHE A 238 ? ARG A 237 PHE A 238 AA5 1 ILE A 128 ? VAL A 130 ? ILE A 128 VAL A 130 AA5 2 PHE A 168 ? TYR A 170 ? PHE A 168 TYR A 170 AA6 1 GLY A 311 ? SER A 316 ? GLY A 311 SER A 316 AA6 2 GLY A 594 ? THR A 599 ? GLY A 594 THR A 599 AA6 3 ALA A 609 ? GLN A 613 ? ALA A 609 GLN A 613 AA6 4 GLY A 648 ? ILE A 651 ? GLY A 648 ILE A 651 AA6 5 VAL A 642 ? THR A 645 ? VAL A 642 THR A 645 AA7 1 GLU A 324 ? ARG A 328 ? GLU A 324 ARG A 328 AA7 2 CYS A 538 ? PHE A 543 ? CYS A 538 PHE A 543 AA7 3 LEU A 546 ? GLU A 554 ? LEU A 546 GLU A 554 AA7 4 ILE A 584 ? THR A 588 ? ILE A 584 THR A 588 AA7 5 THR A 573 ? ARG A 577 ? THR A 573 ARG A 577 AA7 6 PHE A 565 ? ARG A 567 ? PHE A 565 ARG A 567 AA7 7 VAL B 42 ? PHE B 43 ? VAL B 42 PHE B 43 AA8 1 ASN A 354 ? ILE A 358 ? ASN A 354 ILE A 358 AA8 2 PHE A 392 ? ARG A 403 ? PHE A 392 ARG A 403 AA8 3 PRO A 507 ? LEU A 517 ? PRO A 507 LEU A 517 AA8 4 GLY A 431 ? ASN A 437 ? GLY A 431 ASN A 437 AA8 5 THR A 376 ? TYR A 380 ? THR A 376 TYR A 380 AA9 1 LEU A 452 ? ARG A 454 ? LEU A 452 ARG A 454 AA9 2 LEU A 492 ? SER A 494 ? LEU A 492 SER A 494 AB1 1 TYR A 473 ? GLN A 474 ? TYR A 473 GLN A 474 AB1 2 CYS A 488 ? TYR A 489 ? CYS A 488 TYR A 489 AB2 1 GLU A 654 ? HIS A 655 ? GLU A 654 HIS A 655 AB2 2 ILE A 693 ? THR A 696 ? ILE A 693 THR A 696 AB2 3 ILE A 670 ? SER A 673 ? ILE A 670 SER A 673 AB2 4 ILE A 664 ? GLY A 667 ? ILE A 664 GLY A 667 AB3 1 SER A 711 ? ILE A 712 ? SER A 711 ILE A 712 AB3 2 PHE A 1075 ? THR A 1077 ? PHE A 1075 THR A 1077 AB3 3 VAL A 1094 ? SER A 1097 ? VAL A 1094 SER A 1097 AB3 4 PHE A 1103 ? THR A 1105 ? PHE A 1103 THR A 1105 AB3 5 GLN A 1113 ? ILE A 1114 ? GLN A 1113 ILE A 1114 AB4 1 PHE A 718 ? PRO A 728 ? PHE A 718 PRO A 728 AB4 2 GLY A 1059 ? PRO A 1069 ? GLY A 1059 PRO A 1069 AB4 3 TYR A 1047 ? ALA A 1056 ? TYR A 1047 ALA A 1056 AB5 1 LYS A 733 ? VAL A 736 ? LYS A 733 VAL A 736 AB5 2 LEU A 858 ? LEU A 861 ? LEU A 858 LEU A 861 AB6 1 GLN A 787 ? ILE A 788 ? GLN A 787 ILE A 788 AB6 2 ALA C 701 ? GLU C 702 ? ALA C 701 GLU C 702 AB7 1 THR A 1120 ? ASN A 1125 ? THR A 1120 ASN A 1125 AB7 2 LYS A 1086 ? PRO A 1090 ? LYS A 1086 PRO A 1090 AB7 3 ILE A 1081 ? CYS A 1082 ? ILE A 1081 CYS A 1082 AB7 4 VAL A 1133 ? ASN A 1134 ? VAL A 1133 ASN A 1134 AB8 1 TYR B 28 ? ASN B 30 ? TYR B 28 ASN B 30 AB8 2 ASN B 61 ? THR B 63 ? ASN B 61 THR B 63 AB9 1 VAL B 47 ? PHE B 55 ? VAL B 47 PHE B 55 AB9 2 GLN B 271 ? TYR B 279 ? 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