data_6GF # _chem_comp.id 6GF _chem_comp.name "6-(4-methoxyphenyl)-N~4~,N~4~-bis[(pyridin-2-yl)methyl]pyrimidine-2,4-diamine" _chem_comp.type NON-POLYMER _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C23 H22 N6 O" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2016-04-06 _chem_comp.pdbx_modified_date 2017-03-03 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 398.460 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code 6GF _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 5J5G _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal 6GF C10 C1 C 0 1 Y N N 172.877 2.493 106.688 -0.850 -0.347 -0.571 C10 6GF 1 6GF C13 C2 C 0 1 Y N N 172.660 3.385 109.670 -3.880 -1.125 0.292 C13 6GF 2 6GF C15 C3 C 0 1 Y N N 172.902 5.463 110.910 -5.236 -1.832 2.125 C15 6GF 3 6GF C17 C4 C 0 1 Y N N 170.747 4.760 110.100 -4.077 -3.379 0.725 C17 6GF 4 6GF C20 C5 C 0 1 Y N N 168.373 1.931 107.965 -0.201 4.225 -0.671 C20 6GF 5 6GF C21 C6 C 0 1 Y N N 167.636 0.886 107.418 -1.247 5.100 -0.892 C21 6GF 6 6GF C22 C7 C 0 1 Y N N 168.303 -0.261 107.013 -2.526 4.738 -0.494 C22 6GF 7 6GF C01 C8 C 0 1 N N N 177.675 9.048 103.612 7.734 -0.734 0.814 C01 6GF 8 6GF O01 O1 O 0 1 N N N 177.385 8.621 104.956 6.678 0.012 1.422 O01 6GF 9 6GF C02 C9 C 0 1 Y N N 176.567 7.516 105.058 5.425 -0.184 0.937 C02 6GF 10 6GF C07 C10 C 0 1 Y N N 175.773 7.337 106.194 4.354 0.511 1.483 C07 6GF 11 6GF C06 C11 C 0 1 Y N N 174.937 6.226 106.313 3.080 0.314 0.993 C06 6GF 12 6GF C03 C12 C 0 1 Y N N 176.513 6.558 104.045 5.219 -1.073 -0.109 C03 6GF 13 6GF C04 C13 C 0 1 Y N N 175.668 5.454 104.158 3.948 -1.275 -0.604 C04 6GF 14 6GF C05 C14 C 0 1 Y N N 174.885 5.274 105.299 2.869 -0.584 -0.053 C05 6GF 15 6GF C08 C15 C 0 1 Y N N 174.030 4.173 105.414 1.501 -0.798 -0.583 C08 6GF 16 6GF C11 C16 C 0 1 Y N N 173.768 3.572 106.644 0.418 -0.112 -0.039 C11 6GF 17 6GF N01 N1 N 0 1 Y N N 173.418 3.697 104.313 1.291 -1.650 -1.587 N01 6GF 18 6GF C09 C17 C 0 1 Y N N 172.577 2.651 104.374 0.072 -1.850 -2.061 C09 6GF 19 6GF N02 N2 N 0 1 N N N 171.987 2.192 103.263 -0.107 -2.743 -3.104 N02 6GF 20 6GF N03 N3 N 0 1 Y N N 172.309 2.061 105.548 -0.982 -1.215 -1.569 N03 6GF 21 6GF N04 N4 N 0 1 N N N 172.601 1.852 107.833 -1.957 0.312 -0.062 N04 6GF 22 6GF C18 C18 C 0 1 N N N 171.812 0.594 107.842 -1.789 1.342 0.966 C18 6GF 23 6GF C19 C19 C 0 1 Y N N 170.420 0.721 107.706 -1.607 2.685 0.307 C19 6GF 24 6GF N06 N5 N 0 1 Y N N 169.768 1.821 108.105 -0.407 3.059 -0.090 N06 6GF 25 6GF C23 C20 C 0 1 Y N N 169.689 -0.337 107.159 -2.703 3.505 0.114 C23 6GF 26 6GF C12 C21 C 0 1 N N N 173.238 2.228 109.120 -3.297 -0.021 -0.552 C12 6GF 27 6GF N05 N6 N 0 1 Y N N 171.337 3.601 109.544 -3.594 -2.381 0.011 N05 6GF 28 6GF C16 C22 C 0 1 Y N N 171.534 5.685 110.777 -4.917 -3.141 1.796 C16 6GF 29 6GF C14 C23 C 0 1 Y N N 173.456 4.310 110.352 -4.705 -0.809 1.355 C14 6GF 30 6GF H1 H1 H 0 1 N N N 173.524 6.172 111.436 -5.884 -1.616 2.962 H1 6GF 31 6GF H2 H2 H 0 1 N N N 169.685 4.927 109.999 -3.823 -4.396 0.461 H2 6GF 32 6GF H3 H3 H 0 1 N N N 167.871 2.832 108.284 0.797 4.497 -0.983 H3 6GF 33 6GF H4 H4 H 0 1 N N N 166.564 0.966 107.311 -1.072 6.053 -1.369 H4 6GF 34 6GF H5 H5 H 0 1 N N N 167.754 -1.088 106.588 -3.363 5.402 -0.653 H5 6GF 35 6GF H6 H6 H 0 1 N N N 178.331 9.931 103.641 8.680 -0.484 1.295 H6 6GF 36 6GF H7 H7 H 0 1 N N N 178.179 8.234 103.070 7.538 -1.801 0.930 H7 6GF 37 6GF H8 H8 H 0 1 N N N 176.737 9.305 103.098 7.789 -0.488 -0.246 H8 6GF 38 6GF H9 H9 H 0 1 N N N 175.807 8.067 106.989 4.518 1.206 2.294 H9 6GF 39 6GF H10 H10 H 0 1 N N N 174.327 6.104 107.196 2.248 0.854 1.419 H10 6GF 40 6GF H11 H11 H 0 1 N N N 177.130 6.672 103.166 6.054 -1.608 -0.535 H11 6GF 41 6GF H12 H12 H 0 1 N N N 175.619 4.733 103.356 3.788 -1.967 -1.418 H12 6GF 42 6GF H13 H13 H 0 1 N N N 174.243 3.931 107.545 0.556 0.585 0.775 H13 6GF 43 6GF H14 H14 H 0 1 N N N 172.281 2.739 102.479 0.655 -3.212 -3.477 H14 6GF 44 6GF H15 H15 H 0 1 N N N 172.246 1.237 103.119 -0.995 -2.899 -3.462 H15 6GF 45 6GF H16 H16 H 0 1 N N N 172.008 0.084 108.797 -2.673 1.367 1.604 H16 6GF 46 6GF H17 H17 H 0 1 N N N 172.172 -0.031 107.012 -0.911 1.112 1.571 H17 6GF 47 6GF H18 H18 H 0 1 N N N 170.207 -1.231 106.843 -3.685 3.191 0.438 H18 6GF 48 6GF H19 H19 H 0 1 N N N 173.119 1.398 109.832 -3.233 -0.352 -1.589 H19 6GF 49 6GF H20 H20 H 0 1 N N N 174.309 2.413 108.947 -3.936 0.859 -0.490 H20 6GF 50 6GF H21 H21 H 0 1 N N N 171.086 6.573 111.198 -5.319 -3.963 2.369 H21 6GF 51 6GF H22 H22 H 0 1 N N N 174.516 4.129 110.449 -4.932 0.221 1.584 H22 6GF 52 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal 6GF N02 C09 SING N N 1 6GF C01 O01 SING N N 2 6GF C03 C04 DOUB Y N 3 6GF C03 C02 SING Y N 4 6GF C04 C05 SING Y N 5 6GF N01 C09 DOUB Y N 6 6GF N01 C08 SING Y N 7 6GF C09 N03 SING Y N 8 6GF O01 C02 SING N N 9 6GF C02 C07 DOUB Y N 10 6GF C05 C08 SING N N 11 6GF C05 C06 DOUB Y N 12 6GF C08 C11 DOUB Y N 13 6GF N03 C10 DOUB Y N 14 6GF C07 C06 SING Y N 15 6GF C11 C10 SING Y N 16 6GF C10 N04 SING N N 17 6GF C22 C23 DOUB Y N 18 6GF C22 C21 SING Y N 19 6GF C23 C19 SING Y N 20 6GF C21 C20 DOUB Y N 21 6GF C19 C18 SING N N 22 6GF C19 N06 DOUB Y N 23 6GF N04 C18 SING N N 24 6GF N04 C12 SING N N 25 6GF C20 N06 SING Y N 26 6GF C12 C13 SING N N 27 6GF N05 C13 DOUB Y N 28 6GF N05 C17 SING Y N 29 6GF C13 C14 SING Y N 30 6GF C17 C16 DOUB Y N 31 6GF C14 C15 DOUB Y N 32 6GF C16 C15 SING Y N 33 6GF C15 H1 SING N N 34 6GF C17 H2 SING N N 35 6GF C20 H3 SING N N 36 6GF C21 H4 SING N N 37 6GF C22 H5 SING N N 38 6GF C01 H6 SING N N 39 6GF C01 H7 SING N N 40 6GF C01 H8 SING N N 41 6GF C07 H9 SING N N 42 6GF C06 H10 SING N N 43 6GF C03 H11 SING N N 44 6GF C04 H12 SING N N 45 6GF C11 H13 SING N N 46 6GF N02 H14 SING N N 47 6GF N02 H15 SING N N 48 6GF C18 H16 SING N N 49 6GF C18 H17 SING N N 50 6GF C23 H18 SING N N 51 6GF C12 H19 SING N N 52 6GF C12 H20 SING N N 53 6GF C16 H21 SING N N 54 6GF C14 H22 SING N N 55 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 6GF SMILES ACDLabs 12.01 "c4(N(Cc1ncccc1)Cc2ccccn2)cc(c3ccc(OC)cc3)nc(n4)N" 6GF InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C23H22N6O/c1-30-20-10-8-17(9-11-20)21-14-22(28-23(24)27-21)29(15-18-6-2-4-12-25-18)16-19-7-3-5-13-26-19/h2-14H,15-16H2,1H3,(H2,24,27,28)" 6GF InChIKey InChI 1.03 FIGQTBBMNODYCB-UHFFFAOYSA-N 6GF SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "COc1ccc(cc1)c2cc(nc(N)n2)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4" 6GF SMILES CACTVS 3.385 "COc1ccc(cc1)c2cc(nc(N)n2)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4" 6GF SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "COc1ccc(cc1)c2cc(nc(n2)N)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4" 6GF SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "COc1ccc(cc1)c2cc(nc(n2)N)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4" # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier 6GF "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "6-(4-methoxyphenyl)-N~4~,N~4~-bis[(pyridin-2-yl)methyl]pyrimidine-2,4-diamine" 6GF "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "6-(4-methoxyphenyl)-~{N}4,~{N}4-bis(pyridin-2-ylmethyl)pyrimidine-2,4-diamine" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site 6GF "Create component" 2016-04-06 RCSB 6GF "Initial release" 2017-03-08 RCSB #