data_6GH # _chem_comp.id 6GH _chem_comp.name "N~4~,N~4~-bis[(pyridin-2-yl)methyl]-6-(thiophen-3-yl)pyrimidine-2,4-diamine" _chem_comp.type NON-POLYMER _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C20 H18 N6 S" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2016-04-06 _chem_comp.pdbx_modified_date 2017-03-03 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 374.462 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code 6GH _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 5J5F _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal 6GH C10 C1 C 0 1 Y N N 44.075 -22.515 136.274 -1.905 -3.633 -0.002 C10 6GH 1 6GH C13 C2 C 0 1 Y N N 39.841 -18.478 132.868 -4.330 0.488 -1.153 C13 6GH 2 6GH C15 C3 C 0 1 Y N N 41.351 -18.328 131.004 -4.752 2.787 -1.613 C15 6GH 3 6GH C17 C4 C 0 1 Y N N 40.580 -25.991 135.104 3.309 0.903 -0.227 C17 6GH 4 6GH C20 C5 C 0 1 Y N N 39.689 -26.954 135.398 3.582 0.060 -1.238 C20 6GH 5 6GH N01 N1 N 0 1 Y N N 39.145 -24.635 133.835 1.748 1.863 1.392 N01 6GH 6 6GH C01 C6 C 0 1 Y N N 40.191 -24.772 134.677 1.965 1.014 0.386 C01 6GH 7 6GH C02 C7 C 0 1 Y N N 40.824 -23.620 135.122 0.909 0.233 -0.080 C02 6GH 8 6GH C03 C8 C 0 1 Y N N 40.381 -22.380 134.669 -0.336 0.373 0.528 C03 6GH 9 6GH N02 N2 N 0 1 Y N N 39.341 -22.313 133.827 -0.476 1.241 1.527 N02 6GH 10 6GH C04 C9 C 0 1 Y N N 38.725 -23.428 133.407 0.550 1.968 1.944 C04 6GH 11 6GH N03 N3 N 0 1 N N N 37.692 -23.323 132.551 0.364 2.860 2.986 N03 6GH 12 6GH N04 N4 N 0 1 N N N 40.939 -21.239 135.057 -1.416 -0.383 0.099 N04 6GH 13 6GH C05 C10 C 0 1 N N N 42.078 -21.183 136.009 -1.229 -1.413 -0.926 C05 6GH 14 6GH C06 C11 C 0 1 Y N N 43.291 -21.676 135.484 -0.896 -2.725 -0.263 C06 6GH 15 6GH N05 N5 N 0 1 Y N N 43.702 -21.331 134.255 0.353 -2.994 0.060 N05 6GH 16 6GH C07 C12 C 0 1 Y N N 44.913 -21.823 133.737 0.691 -4.129 0.641 C07 6GH 17 6GH C08 C13 C 0 1 Y N N 45.702 -22.664 134.522 -0.264 -5.085 0.933 C08 6GH 18 6GH C09 C14 C 0 1 Y N N 45.285 -23.018 135.797 -1.590 -4.835 0.612 C09 6GH 19 6GH C11 C15 C 0 1 N N N 40.305 -19.936 134.729 -2.746 -0.151 0.670 C11 6GH 20 6GH C12 C16 C 0 1 Y N N 40.670 -19.417 133.481 -3.469 0.888 -0.148 C12 6GH 21 6GH C14 C17 C 0 1 Y N N 40.172 -17.934 131.632 -4.987 1.452 -1.903 C14 6GH 22 6GH C16 C18 C 0 1 Y N N 42.178 -19.262 131.623 -3.885 3.111 -0.587 C16 6GH 23 6GH N06 N6 N 0 1 Y N N 41.810 -19.785 132.876 -3.273 2.167 0.103 N06 6GH 24 6GH C18 C19 C 0 1 Y N N 41.871 -26.345 135.296 4.401 1.661 0.200 C18 6GH 25 6GH C19 C20 C 0 1 Y N N 42.061 -27.602 135.730 5.522 1.412 -0.474 C19 6GH 26 6GH S01 S1 S 0 1 Y N N 40.541 -28.345 135.917 5.222 0.184 -1.695 S01 6GH 27 6GH H1 H1 H 0 1 N N N 43.742 -22.779 137.267 -2.927 -3.407 -0.269 H1 6GH 28 6GH H2 H2 H 0 1 N N N 38.930 -18.169 133.360 -4.486 -0.562 -1.354 H2 6GH 29 6GH H3 H3 H 0 1 N N N 41.622 -17.913 130.045 -5.249 3.564 -2.174 H3 6GH 30 6GH H4 H4 H 0 1 N N N 38.616 -26.865 135.320 2.864 -0.604 -1.697 H4 6GH 31 6GH H5 H5 H 0 1 N N N 41.652 -23.685 135.813 1.052 -0.464 -0.892 H5 6GH 32 6GH H6 H6 H 0 1 N N N 37.528 -22.359 132.342 -0.509 2.946 3.400 H6 6GH 33 6GH H7 H7 H 0 1 N N N 37.907 -23.815 131.707 1.106 3.398 3.302 H7 6GH 34 6GH H8 H8 H 0 1 N N N 42.230 -20.134 136.305 -2.145 -1.520 -1.505 H8 6GH 35 6GH H9 H9 H 0 1 N N N 41.817 -21.780 136.895 -0.412 -1.123 -1.587 H9 6GH 36 6GH H10 H10 H 0 1 N N N 45.229 -21.552 132.741 1.725 -4.314 0.891 H10 6GH 37 6GH H11 H11 H 0 1 N N N 46.638 -23.040 134.137 0.018 -6.012 1.408 H11 6GH 38 6GH H12 H12 H 0 1 N N N 45.887 -23.672 136.410 -2.357 -5.564 0.829 H12 6GH 39 6GH H13 H13 H 0 1 N N N 40.592 -19.208 135.502 -3.313 -1.082 0.659 H13 6GH 40 6GH H14 H14 H 0 1 N N N 39.213 -20.071 134.740 -2.644 0.201 1.696 H14 6GH 41 6GH H15 H15 H 0 1 N N N 39.520 -17.212 131.163 -5.665 1.169 -2.694 H15 6GH 42 6GH H16 H16 H 0 1 N N N 43.093 -19.582 131.146 -3.696 4.148 -0.355 H16 6GH 43 6GH H17 H17 H 0 1 N N N 42.691 -25.666 135.113 4.342 2.383 1.001 H17 6GH 44 6GH H18 H18 H 0 1 N N N 43.017 -28.064 135.927 6.473 1.893 -0.297 H18 6GH 45 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal 6GH C15 C16 DOUB Y N 1 6GH C15 C14 SING Y N 2 6GH C16 N06 SING Y N 3 6GH C14 C13 DOUB Y N 4 6GH N03 C04 SING N N 5 6GH C13 C12 SING Y N 6 6GH N06 C12 DOUB Y N 7 6GH C04 N02 DOUB Y N 8 6GH C04 N01 SING Y N 9 6GH C12 C11 SING N N 10 6GH C07 N05 DOUB Y N 11 6GH C07 C08 SING Y N 12 6GH N02 C03 SING Y N 13 6GH N01 C01 DOUB Y N 14 6GH N05 C06 SING Y N 15 6GH C08 C09 DOUB Y N 16 6GH C03 N04 SING N N 17 6GH C03 C02 DOUB Y N 18 6GH C01 C17 SING N N 19 6GH C01 C02 SING Y N 20 6GH C11 N04 SING N N 21 6GH N04 C05 SING N N 22 6GH C17 C18 SING Y N 23 6GH C17 C20 DOUB Y N 24 6GH C18 C19 DOUB Y N 25 6GH C20 S01 SING Y N 26 6GH C06 C05 SING N N 27 6GH C06 C10 DOUB Y N 28 6GH C19 S01 SING Y N 29 6GH C09 C10 SING Y N 30 6GH C10 H1 SING N N 31 6GH C13 H2 SING N N 32 6GH C15 H3 SING N N 33 6GH C20 H4 SING N N 34 6GH C02 H5 SING N N 35 6GH N03 H6 SING N N 36 6GH N03 H7 SING N N 37 6GH C05 H8 SING N N 38 6GH C05 H9 SING N N 39 6GH C07 H10 SING N N 40 6GH C08 H11 SING N N 41 6GH C09 H12 SING N N 42 6GH C11 H13 SING N N 43 6GH C11 H14 SING N N 44 6GH C14 H15 SING N N 45 6GH C16 H16 SING N N 46 6GH C18 H17 SING N N 47 6GH C19 H18 SING N N 48 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 6GH SMILES ACDLabs 12.01 "c4c(CN(c2cc(c1ccsc1)nc(n2)N)Cc3ccccn3)nccc4" 6GH InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C20H18N6S/c21-20-24-18(15-7-10-27-14-15)11-19(25-20)26(12-16-5-1-3-8-22-16)13-17-6-2-4-9-23-17/h1-11,14H,12-13H2,(H2,21,24,25)" 6GH InChIKey InChI 1.03 GNKFSGIISAKKRV-UHFFFAOYSA-N 6GH SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "Nc1nc(cc(n1)c2cscc2)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4" 6GH SMILES CACTVS 3.385 "Nc1nc(cc(n1)c2cscc2)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4" 6GH SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "c1ccnc(c1)CN(Cc2ccccn2)c3cc(nc(n3)N)c4ccsc4" 6GH SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "c1ccnc(c1)CN(Cc2ccccn2)c3cc(nc(n3)N)c4ccsc4" # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier 6GH "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "N~4~,N~4~-bis[(pyridin-2-yl)methyl]-6-(thiophen-3-yl)pyrimidine-2,4-diamine" 6GH "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "~{N}4,~{N}4-bis(pyridin-2-ylmethyl)-6-thiophen-3-yl-pyrimidine-2,4-diamine" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site 6GH "Create component" 2016-04-06 RCSB 6GH "Initial release" 2017-03-08 RCSB #