data_6GK # _chem_comp.id 6GK _chem_comp.name "6-(2-methoxyphenyl)-N~4~,N~4~-bis[(pyridin-2-yl)methyl]pyrimidine-2,4-diamine" _chem_comp.type NON-POLYMER _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C23 H22 N6 O" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2016-04-06 _chem_comp.pdbx_modified_date 2017-03-03 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 398.460 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code 6GK _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 5J5H _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal 6GK C10 C1 C 0 1 Y N N -12.660 -1.623 -58.404 0.546 0.291 -0.416 C10 6GK 1 6GK C13 C2 C 0 1 Y N N -12.663 1.542 -58.045 3.537 1.454 0.072 C13 6GK 2 6GK C15 C3 C 0 1 Y N N -11.591 3.669 -58.448 5.028 2.262 1.752 C15 6GK 3 6GK C17 C4 C 0 1 Y N N -10.811 2.259 -56.705 3.496 3.693 0.610 C17 6GK 4 6GK C20 C5 C 0 1 Y N N -11.742 -0.828 -53.939 0.511 -4.318 -0.721 C20 6GK 5 6GK C21 C6 C 0 1 Y N N -12.069 -1.926 -53.148 1.623 -5.026 -1.134 C21 6GK 6 6GK C22 C7 C 0 1 Y N N -13.136 -2.731 -53.528 2.885 -4.510 -0.881 C22 6GK 7 6GK C01 C8 C 0 1 N N N -12.118 -7.144 -61.180 -5.659 1.979 -1.025 C01 6GK 8 6GK O01 O1 O 0 1 N N N -11.626 -6.007 -60.484 -4.363 1.462 -0.715 O01 6GK 9 6GK C02 C9 C 0 1 Y N N -11.622 -6.246 -59.142 -4.291 0.527 0.266 C02 6GK 10 6GK C07 C10 C 0 1 Y N N -11.534 -7.540 -58.638 -5.442 0.113 0.919 C07 6GK 11 6GK C06 C11 C 0 1 Y N N -11.536 -7.732 -57.262 -5.367 -0.839 1.918 C06 6GK 12 6GK C05 C12 C 0 1 Y N N -11.626 -6.651 -56.388 -4.146 -1.385 2.273 C05 6GK 13 6GK C04 C13 C 0 1 Y N N -11.726 -5.368 -56.895 -2.992 -0.983 1.631 C04 6GK 14 6GK C03 C14 C 0 1 Y N N -11.729 -5.155 -58.269 -3.056 -0.028 0.618 C03 6GK 15 6GK C08 C15 C 0 1 Y N N -11.812 -3.834 -58.688 -1.821 0.402 -0.078 C08 6GK 16 6GK C11 C16 C 0 1 Y N N -12.626 -2.950 -57.996 -0.588 -0.146 0.268 C11 6GK 17 6GK N01 N1 N 0 1 Y N N -11.077 -3.383 -59.712 -1.874 1.320 -1.045 N01 6GK 18 6GK C09 C17 C 0 1 Y N N -11.135 -2.107 -60.099 -0.774 1.716 -1.664 C09 6GK 19 6GK N02 N2 N 0 1 N N N -10.403 -1.692 -61.127 -0.870 2.670 -2.662 N02 6GK 20 6GK N03 N3 N 0 1 Y N N -11.919 -1.247 -59.456 0.415 1.213 -1.365 N03 6GK 21 6GK N04 N4 N 0 1 N N N -13.441 -0.721 -57.791 1.794 -0.226 -0.107 N04 6GK 22 6GK C18 C18 C 0 1 N N N -14.249 -1.044 -56.602 1.917 -1.314 0.866 C18 6GK 23 6GK C19 C19 C 0 1 Y N N -13.499 -1.323 -55.462 1.824 -2.638 0.153 C19 6GK 24 6GK N06 N5 N 0 1 Y N N -12.479 -0.538 -55.098 0.640 -3.162 -0.099 N06 6GK 25 6GK C23 C20 C 0 1 Y N N -13.849 -2.425 -54.682 2.982 -3.296 -0.220 C23 6GK 26 6GK C12 C21 C 0 1 N N N -13.666 0.623 -58.373 2.992 0.317 -0.753 C12 6GK 27 6GK N05 N6 N 0 1 Y N N -11.801 1.321 -57.039 3.050 2.668 -0.090 N05 6GK 28 6GK C16 C22 C 0 1 Y N N -10.694 3.446 -57.414 4.491 3.525 1.554 C16 6GK 29 6GK C14 C23 C 0 1 Y N N -12.570 2.725 -58.764 4.538 1.210 0.994 C14 6GK 30 6GK H1 H1 H 0 1 N N N -11.531 4.585 -59.017 5.807 2.101 2.483 H1 6GK 31 6GK H2 H2 H 0 1 N N N -10.134 2.055 -55.889 3.072 4.674 0.449 H2 6GK 32 6GK H3 H3 H 0 1 N N N -10.914 -0.194 -53.658 -0.475 -4.713 -0.913 H3 6GK 33 6GK H4 H4 H 0 1 N N N -11.504 -2.148 -52.255 1.511 -5.970 -1.646 H4 6GK 34 6GK H5 H5 H 0 1 N N N -13.410 -3.588 -52.931 3.773 -5.042 -1.192 H5 6GK 35 6GK H6 H6 H 0 1 N N N -12.117 -6.941 -62.261 -5.575 2.716 -1.824 H6 6GK 36 6GK H7 H7 H 0 1 N N N -11.474 -8.010 -60.969 -6.307 1.165 -1.349 H7 6GK 37 6GK H8 H8 H 0 1 N N N -13.144 -7.361 -60.848 -6.083 2.451 -0.139 H8 6GK 38 6GK H9 H9 H 0 1 N N N -11.465 -8.384 -59.308 -6.398 0.536 0.647 H9 6GK 39 6GK H10 H10 H 0 1 N N N -11.467 -8.734 -56.864 -6.266 -1.158 2.424 H10 6GK 40 6GK H11 H11 H 0 1 N N N -11.618 -6.814 -55.320 -4.096 -2.128 3.055 H11 6GK 41 6GK H12 H12 H 0 1 N N N -11.802 -4.528 -56.221 -2.041 -1.411 1.911 H12 6GK 42 6GK H13 H13 H 0 1 N N N -13.220 -3.286 -57.159 -0.512 -0.890 1.046 H13 6GK 43 6GK H14 H14 H 0 1 N N N -9.873 -2.458 -61.490 -1.735 3.038 -2.900 H14 6GK 44 6GK H15 H15 H 0 1 N N N -11.004 -1.335 -61.842 -0.071 2.970 -3.124 H15 6GK 45 6GK H16 H16 H 0 1 N N N -14.901 -0.186 -56.384 2.878 -1.241 1.374 H16 6GK 46 6GK H17 H17 H 0 1 N N N -14.866 -1.925 -56.833 1.112 -1.239 1.598 H17 6GK 47 6GK H18 H18 H 0 1 N N N -14.682 -3.046 -54.977 3.948 -2.862 -0.011 H18 6GK 48 6GK H19 H19 H 0 1 N N N -14.627 1.008 -58.002 2.735 0.680 -1.748 H19 6GK 49 6GK H20 H20 H 0 1 N N N -13.707 0.527 -59.468 3.746 -0.466 -0.836 H20 6GK 50 6GK H21 H21 H 0 1 N N N -9.931 4.171 -57.169 4.846 4.367 2.130 H21 6GK 51 6GK H22 H22 H 0 1 N N N -13.259 2.917 -59.573 4.932 0.213 1.122 H22 6GK 52 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal 6GK C01 O01 SING N N 1 6GK N02 C09 SING N N 2 6GK O01 C02 SING N N 3 6GK C09 N01 DOUB Y N 4 6GK C09 N03 SING Y N 5 6GK N01 C08 SING Y N 6 6GK N03 C10 DOUB Y N 7 6GK C02 C07 DOUB Y N 8 6GK C02 C03 SING Y N 9 6GK C14 C15 DOUB Y N 10 6GK C14 C13 SING Y N 11 6GK C08 C03 SING N N 12 6GK C08 C11 DOUB Y N 13 6GK C07 C06 SING Y N 14 6GK C15 C16 SING Y N 15 6GK C10 C11 SING Y N 16 6GK C10 N04 SING N N 17 6GK C12 C13 SING N N 18 6GK C12 N04 SING N N 19 6GK C03 C04 DOUB Y N 20 6GK C13 N05 DOUB Y N 21 6GK N04 C18 SING N N 22 6GK C16 C17 DOUB Y N 23 6GK C06 C05 DOUB Y N 24 6GK N05 C17 SING Y N 25 6GK C04 C05 SING Y N 26 6GK C18 C19 SING N N 27 6GK C19 N06 DOUB Y N 28 6GK C19 C23 SING Y N 29 6GK N06 C20 SING Y N 30 6GK C23 C22 DOUB Y N 31 6GK C20 C21 DOUB Y N 32 6GK C22 C21 SING Y N 33 6GK C15 H1 SING N N 34 6GK C17 H2 SING N N 35 6GK C20 H3 SING N N 36 6GK C21 H4 SING N N 37 6GK C22 H5 SING N N 38 6GK C01 H6 SING N N 39 6GK C01 H7 SING N N 40 6GK C01 H8 SING N N 41 6GK C07 H9 SING N N 42 6GK C06 H10 SING N N 43 6GK C05 H11 SING N N 44 6GK C04 H12 SING N N 45 6GK C11 H13 SING N N 46 6GK N02 H14 SING N N 47 6GK N02 H15 SING N N 48 6GK C18 H16 SING N N 49 6GK C18 H17 SING N N 50 6GK C23 H18 SING N N 51 6GK C12 H19 SING N N 52 6GK C12 H20 SING N N 53 6GK C16 H21 SING N N 54 6GK C14 H22 SING N N 55 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 6GK SMILES ACDLabs 12.01 "c2(cc(c1c(OC)cccc1)nc(n2)N)N(Cc3ncccc3)Cc4ncccc4" 6GK InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C23H22N6O/c1-30-21-11-3-2-10-19(21)20-14-22(28-23(24)27-20)29(15-17-8-4-6-12-25-17)16-18-9-5-7-13-26-18/h2-14H,15-16H2,1H3,(H2,24,27,28)" 6GK InChIKey InChI 1.03 BOPSVMQMLOGQBG-UHFFFAOYSA-N 6GK SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "COc1ccccc1c2cc(nc(N)n2)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4" 6GK SMILES CACTVS 3.385 "COc1ccccc1c2cc(nc(N)n2)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4" 6GK SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "COc1ccccc1c2cc(nc(n2)N)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4" 6GK SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "COc1ccccc1c2cc(nc(n2)N)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4" # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier 6GK "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "6-(2-methoxyphenyl)-N~4~,N~4~-bis[(pyridin-2-yl)methyl]pyrimidine-2,4-diamine" 6GK "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "6-(2-methoxyphenyl)-~{N}4,~{N}4-bis(pyridin-2-ylmethyl)pyrimidine-2,4-diamine" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site 6GK "Create component" 2016-04-06 RCSB 6GK "Initial release" 2017-03-08 RCSB #