data_6GN # _chem_comp.id 6GN _chem_comp.name "1-(17-amino-5,8-dioxo-12,15-dioxa-4,9-diazaheptadecan-1-yl)-4-{[3-(3-sulfopropyl)-1,3-benzothiazol-3-ium-2-yl]methyl}quinolin-1-ium" _chem_comp.type NON-POLYMER _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C33 H45 N5 O7 S2" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 2 _chem_comp.pdbx_initial_date 2016-04-06 _chem_comp.pdbx_modified_date 2016-05-20 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 687.870 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code 6GN _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 5J74 _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal 6GN C C1 C 0 1 N N N 17.190 -27.321 -35.369 13.804 3.427 -0.711 C 6GN 1 6GN N N1 N 0 1 N N N 17.532 -26.385 -36.441 15.044 3.155 0.029 N 6GN 2 6GN O O1 O 0 1 N N N 15.906 -29.421 -35.206 13.261 1.081 -0.925 O 6GN 3 6GN C2 C2 C 0 1 N N N 16.354 -29.766 -33.891 12.982 -0.064 -1.733 C2 6GN 4 6GN N2 N2 N 0 1 N N N 16.389 -34.943 -25.519 2.747 -0.562 0.357 N2 6GN 5 6GN O2 O2 O 0 1 N N N 17.028 -34.605 -30.343 7.379 -1.205 2.266 O2 6GN 6 6GN C3 C3 C 0 1 N N N 17.584 -30.642 -33.988 12.722 -1.273 -0.832 C3 6GN 7 6GN N3 N3 N 1 1 Y N N 13.352 -35.644 -22.780 -2.047 0.303 -0.074 N3 6GN 8 6GN O3 O3 O 0 1 N N N 16.560 -37.002 -26.420 4.169 -1.046 -1.275 O3 6GN 9 6GN C4 C4 C 0 1 N N N 18.314 -31.763 -31.974 11.201 -2.127 0.812 C4 6GN 10 6GN N4 N4 N 1 1 Y N N 8.574 -38.215 -18.879 -7.616 0.703 0.643 N4 6GN 11 6GN O4 O4 O 0 1 N N N 7.872 -43.002 -22.741 -6.057 -5.461 0.056 O4 6GN 12 6GN C5 C5 C 0 1 N N N 16.986 -31.852 -31.275 9.920 -1.782 1.574 C5 6GN 13 6GN C6 C6 C 0 1 N N N 16.837 -33.650 -29.586 7.565 -1.393 1.082 C6 6GN 14 6GN C7 C7 C 0 1 N N N 16.320 -33.834 -28.165 6.415 -1.298 0.114 C7 6GN 15 6GN C8 C8 C 0 1 N N N 15.794 -35.244 -27.868 5.134 -0.953 0.877 C8 6GN 16 6GN C9 C9 C 0 1 N N N 16.293 -35.803 -26.541 3.983 -0.857 -0.092 C9 6GN 17 6GN C10 C10 C 0 1 N N N 16.883 -35.313 -24.197 1.628 -0.468 -0.584 C10 6GN 18 6GN C11 C11 C 0 1 N N N 15.765 -35.751 -23.261 0.347 -0.124 0.179 C11 6GN 19 6GN C12 C12 C 0 1 N N N 14.504 -34.907 -23.344 -0.821 -0.026 -0.804 C12 6GN 20 6GN O6 O5 O 0 1 N N N 9.766 -41.500 -22.957 -4.624 -3.749 -0.590 O6 6GN 21 6GN S S1 S 0 1 N N N 8.419 -41.688 -22.437 -6.008 -4.071 -0.562 S 6GN 22 6GN O5 O6 O 0 1 N N N 7.519 -40.608 -22.816 -6.756 -4.195 -1.763 O5 6GN 23 6GN C20 C13 C 0 1 N N N 8.562 -41.604 -20.669 -6.882 -3.015 0.626 C20 6GN 24 6GN C19 C14 C 0 1 N N N 8.961 -40.294 -20.234 -6.900 -1.575 0.112 C19 6GN 25 6GN C18 C15 C 0 1 N N N 8.029 -39.507 -19.351 -7.637 -0.684 1.114 C18 6GN 26 6GN C21 C16 C 0 1 Y N N 8.164 -37.704 -17.638 -8.528 1.151 -0.241 C21 6GN 27 6GN C26 C17 C 0 1 Y N N 8.784 -36.488 -17.345 -8.328 2.499 -0.556 C26 6GN 28 6GN C25 C18 C 0 1 Y N N 8.511 -35.830 -16.152 -9.175 3.143 -1.456 C25 6GN 29 6GN C24 C19 C 0 1 Y N N 7.615 -36.395 -15.260 -10.213 2.452 -2.039 C24 6GN 30 6GN C23 C20 C 0 1 Y N N 7.000 -37.602 -15.548 -10.417 1.114 -1.730 C23 6GN 31 6GN C22 C21 C 0 1 Y N N 7.257 -38.256 -16.741 -9.599 0.468 -0.853 C22 6GN 32 6GN S1 S2 S 0 1 Y N N 9.847 -35.991 -18.637 -6.933 3.069 0.354 S1 6GN 33 6GN C17 C22 C 0 1 Y N N 9.469 -37.419 -19.539 -6.734 1.529 1.062 C17 6GN 34 6GN C16 C23 C 0 1 N N N 10.085 -37.658 -20.878 -5.649 1.183 2.049 C16 6GN 35 6GN C15 C24 C 0 1 Y N N 11.228 -36.936 -21.554 -4.373 0.880 1.307 C15 6GN 36 6GN C14 C25 C 0 1 Y N N 12.045 -36.077 -20.864 -4.028 -0.406 1.001 C14 6GN 37 6GN C13 C26 C 0 1 Y N N 13.086 -35.444 -21.488 -2.849 -0.662 0.304 C13 6GN 38 6GN C27 C27 C 0 1 Y N N 11.503 -37.191 -22.925 -3.504 1.913 0.909 C27 6GN 39 6GN C32 C28 C 0 1 Y N N 12.591 -36.522 -23.540 -2.324 1.583 0.198 C32 6GN 40 6GN C31 C29 C 0 1 Y N N 12.859 -36.756 -24.900 -1.460 2.614 -0.209 C31 6GN 41 6GN C30 C30 C 0 1 Y N N 12.076 -37.620 -25.618 -1.768 3.907 0.083 C30 6GN 42 6GN C29 C31 C 0 1 Y N N 11.014 -38.274 -25.024 -2.928 4.230 0.783 C29 6GN 43 6GN C28 C32 C 0 1 Y N N 10.723 -38.070 -23.718 -3.789 3.258 1.194 C28 6GN 44 6GN N1 N5 N 0 1 N N N 17.136 -32.392 -29.932 8.801 -1.689 0.633 N1 6GN 45 6GN O1 O7 O 0 1 N N N 18.353 -30.591 -32.783 11.535 -1.051 -0.068 O1 6GN 46 6GN C1 C33 C 0 1 N N N 15.801 -28.028 -35.526 13.519 2.271 -1.673 C1 6GN 47 6GN H1 H1 H 0 1 N N N 17.967 -28.099 -35.334 12.976 3.526 -0.008 H1 6GN 48 6GN H2 H2 H 0 1 N N N 17.185 -26.765 -34.420 13.913 4.352 -1.276 H2 6GN 49 6GN H3 H3 H 0 1 N N N 18.430 -25.983 -36.260 15.814 2.995 -0.604 H3 6GN 50 6GN H4 H4 H 0 1 N N N 17.555 -26.872 -37.314 15.253 3.904 0.671 H4 6GN 51 6GN H6 H6 H 0 1 N N N 16.600 -28.849 -33.336 12.101 0.129 -2.345 H6 6GN 52 6GN H7 H7 H 0 1 N N N 15.557 -30.311 -33.364 13.836 -0.269 -2.379 H7 6GN 53 6GN H8 H8 H 0 1 N N N 16.107 -33.996 -25.670 2.598 -0.411 1.304 H8 6GN 54 6GN H9 H9 H 0 1 N N N 17.271 -31.681 -34.170 12.598 -2.164 -1.447 H9 6GN 55 6GN H10 H10 H 0 1 N N N 18.207 -30.295 -34.826 13.568 -1.412 -0.158 H10 6GN 56 6GN H11 H11 H 0 1 N N N 18.453 -32.650 -32.609 12.014 -2.283 1.520 H11 6GN 57 6GN H12 H12 H 0 1 N N N 19.119 -31.718 -31.226 11.044 -3.036 0.231 H12 6GN 58 6GN H13 H13 H 0 1 N N N 16.546 -30.846 -31.211 9.713 -2.561 2.308 H13 6GN 59 6GN H14 H14 H 0 1 N N N 16.319 -32.508 -31.853 10.046 -0.827 2.084 H14 6GN 60 6GN H15 H15 H 0 1 N N N 17.143 -33.618 -27.467 6.621 -0.518 -0.620 H15 6GN 61 6GN H16 H16 H 0 1 N N N 15.501 -33.118 -28.000 6.288 -2.253 -0.396 H16 6GN 62 6GN H17 H17 H 0 1 N N N 14.695 -35.209 -27.842 4.927 -1.732 1.610 H17 6GN 63 6GN H18 H18 H 0 1 N N N 16.120 -35.916 -28.675 5.260 0.002 1.386 H18 6GN 64 6GN H19 H19 H 0 1 N N N 17.597 -36.142 -24.306 1.835 0.311 -1.318 H19 6GN 65 6GN H20 H20 H 0 1 N N N 17.394 -34.445 -23.755 1.502 -1.423 -1.094 H20 6GN 66 6GN H21 H21 H 0 1 N N N 15.499 -36.790 -23.506 0.141 -0.903 0.913 H21 6GN 67 6GN H22 H22 H 0 1 N N N 16.143 -35.703 -22.229 0.474 0.831 0.689 H22 6GN 68 6GN H23 H23 H 0 1 N N N 14.652 -33.977 -22.776 -0.947 -0.982 -1.314 H23 6GN 69 6GN H24 H24 H 0 1 N N N 14.299 -34.665 -24.397 -0.614 0.753 -1.538 H24 6GN 70 6GN H25 H25 H 0 1 N N N 7.588 -41.848 -20.220 -7.905 -3.372 0.745 H25 6GN 71 6GN H26 H26 H 0 1 N N N 9.313 -42.335 -20.336 -6.371 -3.051 1.589 H26 6GN 72 6GN H27 H27 H 0 1 N N N 9.906 -40.410 -19.684 -5.877 -1.218 -0.007 H27 6GN 73 6GN H28 H28 H 0 1 N N N 9.135 -39.692 -21.138 -7.411 -1.539 -0.850 H28 6GN 74 6GN H29 H29 H 0 1 N N N 7.108 -39.305 -19.918 -7.146 -0.746 2.085 H29 6GN 75 6GN H30 H30 H 0 1 N N N 7.790 -40.121 -18.470 -8.670 -1.021 1.207 H30 6GN 76 6GN H31 H31 H 0 1 N N N 8.991 -34.890 -15.923 -9.017 4.184 -1.696 H31 6GN 77 6GN H32 H32 H 0 1 N N N 7.394 -35.890 -14.331 -10.869 2.951 -2.737 H32 6GN 78 6GN H33 H33 H 0 1 N N N 6.314 -38.037 -14.836 -11.234 0.579 -2.191 H33 6GN 79 6GN H34 H34 H 0 1 N N N 6.758 -39.185 -16.972 -9.773 -0.573 -0.626 H34 6GN 80 6GN H35 H35 H 0 1 N N N 9.247 -37.558 -21.583 -5.487 2.026 2.721 H35 6GN 81 6GN H36 H36 H 0 1 N N N 10.411 -38.708 -20.842 -5.950 0.310 2.628 H36 6GN 82 6GN H37 H37 H 0 1 N N N 11.865 -35.898 -19.814 -4.673 -1.222 1.292 H37 6GN 83 6GN H38 H38 H 0 1 N N N 13.707 -34.766 -20.921 -2.589 -1.684 0.069 H38 6GN 84 6GN H39 H39 H 0 1 N N N 13.685 -36.253 -25.380 -0.555 2.381 -0.751 H39 6GN 85 6GN H40 H40 H 0 1 N N N 12.291 -37.792 -26.662 -1.100 4.696 -0.232 H40 6GN 86 6GN H41 H41 H 0 1 N N N 10.411 -38.954 -25.607 -3.148 5.264 1.002 H41 6GN 87 6GN H42 H42 H 0 1 N N N 9.884 -38.585 -23.273 -4.686 3.521 1.735 H42 6GN 88 6GN H43 H43 H 0 1 N N N 17.486 -31.783 -29.220 8.950 -1.840 -0.314 H43 6GN 89 6GN H44 H44 H 0 1 N N N 15.076 -27.555 -34.848 12.650 2.513 -2.283 H44 6GN 90 6GN H45 H45 H 0 1 N N N 15.456 -27.921 -36.565 14.384 2.115 -2.317 H45 6GN 91 6GN H5 H5 H 0 1 N N N 7.014 -42.904 -23.137 -5.623 -6.143 -0.474 H5 6GN 92 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal 6GN N C SING N N 1 6GN C1 C SING N N 2 6GN C1 O SING N N 3 6GN O C2 SING N N 4 6GN C3 C2 SING N N 5 6GN C3 O1 SING N N 6 6GN O1 C4 SING N N 7 6GN C4 C5 SING N N 8 6GN C5 N1 SING N N 9 6GN O2 C6 DOUB N N 10 6GN N1 C6 SING N N 11 6GN C6 C7 SING N N 12 6GN C7 C8 SING N N 13 6GN C8 C9 SING N N 14 6GN C9 O3 DOUB N N 15 6GN C9 N2 SING N N 16 6GN C30 C29 DOUB Y N 17 6GN C30 C31 SING Y N 18 6GN N2 C10 SING N N 19 6GN C29 C28 SING Y N 20 6GN C31 C32 DOUB Y N 21 6GN C10 C11 SING N N 22 6GN C28 C27 DOUB Y N 23 6GN C32 C27 SING Y N 24 6GN C32 N3 SING Y N 25 6GN C12 C11 SING N N 26 6GN C12 N3 SING N N 27 6GN O6 S DOUB N N 28 6GN C27 C15 SING Y N 29 6GN O5 S DOUB N N 30 6GN N3 C13 DOUB Y N 31 6GN O4 S SING N N 32 6GN S C20 SING N N 33 6GN C15 C16 SING N N 34 6GN C15 C14 DOUB Y N 35 6GN C13 C14 SING Y N 36 6GN C16 C17 SING N N 37 6GN C20 C19 SING N N 38 6GN C19 C18 SING N N 39 6GN C17 N4 DOUB Y N 40 6GN C17 S1 SING Y N 41 6GN C18 N4 SING N N 42 6GN N4 C21 SING Y N 43 6GN S1 C26 SING Y N 44 6GN C21 C26 DOUB Y N 45 6GN C21 C22 SING Y N 46 6GN C26 C25 SING Y N 47 6GN C22 C23 DOUB Y N 48 6GN C25 C24 DOUB Y N 49 6GN C23 C24 SING Y N 50 6GN C H1 SING N N 51 6GN C H2 SING N N 52 6GN N H3 SING N N 53 6GN N H4 SING N N 54 6GN C2 H6 SING N N 55 6GN C2 H7 SING N N 56 6GN N2 H8 SING N N 57 6GN C3 H9 SING N N 58 6GN C3 H10 SING N N 59 6GN C4 H11 SING N N 60 6GN C4 H12 SING N N 61 6GN C5 H13 SING N N 62 6GN C5 H14 SING N N 63 6GN C7 H15 SING N N 64 6GN C7 H16 SING N N 65 6GN C8 H17 SING N N 66 6GN C8 H18 SING N N 67 6GN C10 H19 SING N N 68 6GN C10 H20 SING N N 69 6GN C11 H21 SING N N 70 6GN C11 H22 SING N N 71 6GN C12 H23 SING N N 72 6GN C12 H24 SING N N 73 6GN C20 H25 SING N N 74 6GN C20 H26 SING N N 75 6GN C19 H27 SING N N 76 6GN C19 H28 SING N N 77 6GN C18 H29 SING N N 78 6GN C18 H30 SING N N 79 6GN C25 H31 SING N N 80 6GN C24 H32 SING N N 81 6GN C23 H33 SING N N 82 6GN C22 H34 SING N N 83 6GN C16 H35 SING N N 84 6GN C16 H36 SING N N 85 6GN C14 H37 SING N N 86 6GN C13 H38 SING N N 87 6GN C31 H39 SING N N 88 6GN C30 H40 SING N N 89 6GN C29 H41 SING N N 90 6GN C28 H42 SING N N 91 6GN N1 H43 SING N N 92 6GN C1 H44 SING N N 93 6GN C1 H45 SING N N 94 6GN O4 H5 SING N N 95 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 6GN SMILES ACDLabs 12.01 "C(N)COCCOCCNC(=O)CCC(NCCC[n+]3ccc(Cc2[n+](c1c(cccc1)s2)CCCS(O)(=O)=O)c4c3cccc4)=O" 6GN InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C33H43N5O7S2/c34-14-20-44-22-23-45-21-16-36-32(40)12-11-31(39)35-15-5-17-37-19-13-26(27-7-1-2-8-28(27)37)25-33-38(18-6-24-47(41,42)43)29-9-3-4-10-30(29)46-33/h1-4,7-10,13,19H,5-6,11-12,14-18,20-25,34H2,(H-2,35,36,39,40,41,42,43)/p+2" 6GN InChIKey InChI 1.03 WTDQEZATLRLHFH-UHFFFAOYSA-P 6GN SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "NCCOCCOCCNC(=O)CCC(=O)NCCC[n+]1ccc(Cc2sc3ccccc3[n+]2CCC[S](O)(=O)=O)c4ccccc14" 6GN SMILES CACTVS 3.385 "NCCOCCOCCNC(=O)CCC(=O)NCCC[n+]1ccc(Cc2sc3ccccc3[n+]2CCC[S](O)(=O)=O)c4ccccc14" 6GN SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "c1ccc2c(c1)c(cc[n+]2CCCNC(=O)CCC(=O)NCCOCCOCCN)Cc3[n+](c4ccccc4s3)CCCS(=O)(=O)O" 6GN SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "c1ccc2c(c1)c(cc[n+]2CCCNC(=O)CCC(=O)NCCOCCOCCN)Cc3[n+](c4ccccc4s3)CCCS(=O)(=O)O" # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier 6GN "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "1-(17-amino-5,8-dioxo-12,15-dioxa-4,9-diazaheptadecan-1-yl)-4-{[3-(3-sulfopropyl)-1,3-benzothiazol-3-ium-2-yl]methyl}quinolin-1-ium" 6GN "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "3-[2-[[1-[3-[[4-[2-[2-(2-azanylethoxy)ethoxy]ethylamino]-4-oxidanylidene-butanoyl]amino]propyl]quinolin-1-ium-4-yl]methyl]-1,3-benzothiazol-3-ium-3-yl]propane-1-sulfonic acid" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site 6GN "Create component" 2016-04-06 RCSB 6GN "Initial release" 2016-05-25 RCSB #