data_6GX
#
_chem_comp.id 6GX
_chem_comp.name "N-{2-[({2-methoxy-6-[(2-methyl[1,1'-biphenyl]-3-yl)methoxy]pyridin-3-yl}methyl)amino]ethyl}acetamide"
_chem_comp.type NON-POLYMER
_chem_comp.pdbx_type HETAIN
_chem_comp.formula "C25 H29 N3 O3"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ?
_chem_comp.pdbx_synonyms ?
_chem_comp.pdbx_formal_charge 0
_chem_comp.pdbx_initial_date 2016-04-07
_chem_comp.pdbx_modified_date 2016-04-22
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N
_chem_comp.pdbx_release_status REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by ?
_chem_comp.pdbx_replaces ?
_chem_comp.formula_weight 419.516
_chem_comp.one_letter_code ?
_chem_comp.three_letter_code 6GX
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 5J89
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list ?
_chem_comp.pdbx_processing_site EBI
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
6GX O1 O1 O 0 1 N N N 8.749 -16.894 179.513 2.374 -0.780 1.630 O1 6GX 1
6GX O2 O2 O 0 1 N N N 2.587 -22.310 181.088 8.857 -1.932 -2.105 O2 6GX 2
6GX C11 C1 C 0 1 N N N 3.636 -21.792 180.911 9.308 -1.471 -1.078 C11 6GX 3
6GX C12 C2 C 0 1 N N N 4.551 -22.372 179.828 10.761 -1.677 -0.735 C12 6GX 4
6GX N2 N1 N 0 1 N N N 3.961 -20.632 181.739 8.511 -0.776 -0.243 N2 6GX 5
6GX C10 C3 C 0 1 N N N 5.189 -19.848 181.719 7.098 -0.576 -0.577 C10 6GX 6
6GX C9 C4 C 0 1 N N N 5.501 -19.202 180.379 6.424 0.240 0.528 C9 6GX 7
6GX N1 N2 N 0 1 N N N 6.697 -19.869 179.907 5.007 0.440 0.193 N1 6GX 8
6GX C8 C5 C 0 1 N N N 7.177 -19.135 178.759 4.326 1.221 1.235 C8 6GX 9
6GX C7 C6 C 0 1 Y N N 8.705 -19.155 178.691 2.879 1.405 0.858 C7 6GX 10
6GX C5 C7 C 0 1 Y N N 9.433 -18.031 179.063 1.962 0.387 1.075 C5 6GX 11
6GX C6 C8 C 0 1 N N N 9.588 -15.874 179.972 1.382 -1.790 1.828 C6 6GX 12
6GX N N3 N 0 1 Y N N 10.787 -18.031 178.991 0.689 0.542 0.746 N 6GX 13
6GX C13 C9 C 0 1 Y N N 9.360 -20.252 178.241 2.447 2.596 0.295 C13 6GX 14
6GX C14 C10 C 0 1 Y N N 10.715 -20.251 178.167 1.108 2.725 -0.036 C14 6GX 15
6GX C4 C11 C 0 1 Y N N 11.439 -19.132 178.555 0.246 1.664 0.203 C4 6GX 16
6GX O O3 O 0 1 N N N 12.840 -19.161 178.473 -1.067 1.781 -0.119 O 6GX 17
6GX C3 C12 C 0 1 N N N 13.557 -18.371 179.385 -1.904 0.655 0.152 C3 6GX 18
6GX C2 C13 C 0 1 Y N N 15.027 -18.812 179.437 -3.318 0.967 -0.268 C2 6GX 19
6GX C15 C14 C 0 1 Y N N 15.600 -19.449 178.345 -3.616 2.198 -0.825 C15 6GX 20
6GX C16 C15 C 0 1 Y N N 16.929 -19.839 178.393 -4.911 2.491 -1.213 C16 6GX 21
6GX C17 C16 C 0 1 Y N N 17.679 -19.598 179.536 -5.913 1.556 -1.047 C17 6GX 22
6GX C18 C17 C 0 1 Y N N 17.121 -18.967 180.643 -5.617 0.315 -0.487 C18 6GX 23
6GX C1 C18 C 0 1 Y N N 15.787 -18.576 180.581 -4.310 0.023 -0.102 C1 6GX 24
6GX C C19 C 0 1 N N N 15.122 -17.871 181.747 -3.982 -1.319 0.500 C 6GX 25
6GX C19 C20 C 0 1 Y N N 18.045 -18.744 181.852 -6.690 -0.695 -0.305 C19 6GX 26
6GX C24 C21 C 0 1 Y N N 17.786 -19.289 183.107 -6.937 -1.232 0.956 C24 6GX 27
6GX C23 C22 C 0 1 Y N N 18.676 -19.073 184.149 -7.936 -2.171 1.120 C23 6GX 28
6GX C22 C23 C 0 1 Y N N 19.826 -18.330 183.942 -8.691 -2.578 0.034 C22 6GX 29
6GX C21 C24 C 0 1 Y N N 20.090 -17.797 182.692 -8.449 -2.047 -1.220 C21 6GX 30
6GX C20 C25 C 0 1 Y N N 19.205 -18.006 181.652 -7.457 -1.104 -1.394 C20 6GX 31
6GX H1 H1 H 0 1 N N N 4.059 -23.234 179.354 11.351 -0.858 -1.147 H1 6GX 32
6GX H2 H2 H 0 1 N N N 4.753 -21.602 179.069 10.879 -1.700 0.348 H2 6GX 33
6GX H3 H3 H 0 1 N N N 5.498 -22.696 180.283 11.105 -2.621 -1.158 H3 6GX 34
6GX H4 H4 H 0 1 N N N 3.262 -20.344 182.393 8.872 -0.407 0.578 H4 6GX 35
6GX H5 H5 H 0 1 N N N 6.025 -20.512 181.984 7.021 -0.040 -1.523 H5 6GX 36
6GX H6 H6 H 0 1 N N N 5.101 -19.051 182.472 6.606 -1.544 -0.666 H6 6GX 37
6GX H7 H7 H 0 1 N N N 5.683 -18.124 180.503 6.502 -0.296 1.474 H7 6GX 38
6GX H8 H8 H 0 1 N N N 4.670 -19.354 179.674 6.916 1.208 0.617 H8 6GX 39
6GX H9 H9 H 0 1 N N N 6.483 -20.810 179.646 4.543 -0.443 0.042 H9 6GX 40
6GX H11 H11 H 0 1 N N N 6.834 -18.092 178.831 4.389 0.692 2.185 H11 6GX 41
6GX H12 H12 H 0 1 N N N 6.771 -19.592 177.845 4.804 2.196 1.329 H12 6GX 42
6GX H13 H13 H 0 1 N N N 8.980 -15.021 180.306 1.844 -2.669 2.277 H13 6GX 43
6GX H14 H14 H 0 1 N N N 10.191 -16.246 180.813 0.604 -1.410 2.490 H14 6GX 44
6GX H15 H15 H 0 1 N N N 10.254 -15.553 179.158 0.943 -2.061 0.868 H15 6GX 45
6GX H16 H16 H 0 1 N N N 8.804 -21.128 177.941 3.140 3.406 0.119 H16 6GX 46
6GX H17 H17 H 0 1 N N N 11.233 -21.126 177.804 0.740 3.640 -0.476 H17 6GX 47
6GX H18 H18 H 0 1 N N N 13.506 -17.318 179.071 -1.542 -0.209 -0.405 H18 6GX 48
6GX H19 H19 H 0 1 N N N 13.111 -18.477 180.385 -1.883 0.435 1.219 H19 6GX 49
6GX H20 H20 H 0 1 N N N 15.011 -19.640 177.460 -2.836 2.932 -0.957 H20 6GX 50
6GX H21 H21 H 0 1 N N N 17.380 -20.329 177.543 -5.139 3.453 -1.647 H21 6GX 51
6GX H22 H22 H 0 1 N N N 18.714 -19.906 179.566 -6.924 1.785 -1.350 H22 6GX 52
6GX H23 H23 H 0 1 N N N 14.669 -18.617 182.417 -4.149 -1.286 1.576 H23 6GX 53
6GX H24 H24 H 0 1 N N N 15.874 -17.289 182.300 -4.621 -2.082 0.056 H24 6GX 54
6GX H25 H25 H 0 1 N N N 14.340 -17.195 181.369 -2.937 -1.561 0.302 H25 6GX 55
6GX H26 H26 H 0 1 N N N 16.895 -19.878 183.269 -6.349 -0.916 1.805 H26 6GX 56
6GX H27 H27 H 0 1 N N N 18.471 -19.486 185.126 -8.129 -2.589 2.097 H27 6GX 57
6GX H28 H28 H 0 1 N N N 20.517 -18.166 184.756 -9.471 -3.313 0.167 H28 6GX 58
6GX H29 H29 H 0 1 N N N 20.987 -17.218 182.530 -9.041 -2.369 -2.064 H29 6GX 59
6GX H30 H30 H 0 1 N N N 19.416 -17.593 180.677 -7.272 -0.687 -2.373 H30 6GX 60
#
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
6GX C14 C13 DOUB Y N 1
6GX C14 C4 SING Y N 2
6GX C13 C7 SING Y N 3
6GX C15 C16 DOUB Y N 4
6GX C15 C2 SING Y N 5
6GX C16 C17 SING Y N 6
6GX O C4 SING N N 7
6GX O C3 SING N N 8
6GX C4 N DOUB Y N 9
6GX C7 C8 SING N N 10
6GX C7 C5 DOUB Y N 11
6GX C8 N1 SING N N 12
6GX N C5 SING Y N 13
6GX C5 O1 SING N N 14
6GX C3 C2 SING N N 15
6GX C2 C1 DOUB Y N 16
6GX O1 C6 SING N N 17
6GX C17 C18 DOUB Y N 18
6GX C12 C11 SING N N 19
6GX N1 C9 SING N N 20
6GX C9 C10 SING N N 21
6GX C1 C18 SING Y N 22
6GX C1 C SING N N 23
6GX C18 C19 SING N N 24
6GX C11 O2 DOUB N N 25
6GX C11 N2 SING N N 26
6GX C20 C19 DOUB Y N 27
6GX C20 C21 SING Y N 28
6GX C10 N2 SING N N 29
6GX C19 C24 SING Y N 30
6GX C21 C22 DOUB Y N 31
6GX C24 C23 DOUB Y N 32
6GX C22 C23 SING Y N 33
6GX C12 H1 SING N N 34
6GX C12 H2 SING N N 35
6GX C12 H3 SING N N 36
6GX N2 H4 SING N N 37
6GX C10 H5 SING N N 38
6GX C10 H6 SING N N 39
6GX C9 H7 SING N N 40
6GX C9 H8 SING N N 41
6GX N1 H9 SING N N 42
6GX C8 H11 SING N N 43
6GX C8 H12 SING N N 44
6GX C6 H13 SING N N 45
6GX C6 H14 SING N N 46
6GX C6 H15 SING N N 47
6GX C13 H16 SING N N 48
6GX C14 H17 SING N N 49
6GX C3 H18 SING N N 50
6GX C3 H19 SING N N 51
6GX C15 H20 SING N N 52
6GX C16 H21 SING N N 53
6GX C17 H22 SING N N 54
6GX C H23 SING N N 55
6GX C H24 SING N N 56
6GX C H25 SING N N 57
6GX C24 H26 SING N N 58
6GX C23 H27 SING N N 59
6GX C22 H28 SING N N 60
6GX C21 H29 SING N N 61
6GX C20 H30 SING N N 62
#
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
6GX SMILES ACDLabs 12.01 "O(C)c1c(CNCCNC(=O)C)ccc(n1)OCc2c(c(ccc2)c3ccccc3)C"
6GX InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C25H29N3O3/c1-18-22(10-7-11-23(18)20-8-5-4-6-9-20)17-31-24-13-12-21(25(28-24)30-3)16-26-14-15-27-19(2)29/h4-13,26H,14-17H2,1-3H3,(H,27,29)"
6GX InChIKey InChI 1.03 JEDPSOYOYVELLZ-UHFFFAOYSA-N
6GX SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "COc1nc(OCc2cccc(c2C)c3ccccc3)ccc1CNCCNC(C)=O"
6GX SMILES CACTVS 3.385 "COc1nc(OCc2cccc(c2C)c3ccccc3)ccc1CNCCNC(C)=O"
6GX SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "Cc1c(cccc1c2ccccc2)COc3ccc(c(n3)OC)CNCCNC(=O)C"
6GX SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "Cc1c(cccc1c2ccccc2)COc3ccc(c(n3)OC)CNCCNC(=O)C"
#
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
6GX "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "N-{2-[({2-methoxy-6-[(2-methyl[1,1'-biphenyl]-3-yl)methoxy]pyridin-3-yl}methyl)amino]ethyl}acetamide"
6GX "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "~{N}-[2-[[2-methoxy-6-[(2-methyl-3-phenyl-phenyl)methoxy]pyridin-3-yl]methylamino]ethyl]ethanamide"
#
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
6GX "Create component" 2016-04-07 EBI
6GX "Initial release" 2016-04-27 RCSB
#