data_6GY # _chem_comp.id 6GY _chem_comp.name "5-chloro-N~4~-[2-(dimethylphosphoryl)phenyl]-N~2~-{2-methoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]phenyl}pyrimidine-2,4-diamine" _chem_comp.type NON-POLYMER _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C29 H39 Cl N7 O2 P" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms Brigatinib _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2016-04-07 _chem_comp.pdbx_modified_date 2021-03-01 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 584.092 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code 6GY _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 5J7H _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB # # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal 6GY C1 C1 C 0 1 Y N N 4.228 15.579 9.907 3.634 2.050 0.859 C1 6GY 1 6GY C2 C2 C 0 1 Y N N 4.698 16.487 8.924 4.148 0.811 0.467 C2 6GY 2 6GY C3 C3 C 0 1 N N N 10.703 16.756 9.130 9.567 0.244 -2.203 C3 6GY 3 6GY C4 C4 C 0 1 Y N N 2.671 17.645 9.053 2.013 -0.059 0.504 C4 6GY 4 6GY C6 C5 C 0 1 Y N N 2.934 15.794 10.415 2.272 2.164 1.061 C6 6GY 5 6GY C9 C6 C 0 1 Y N N 3.543 20.308 7.824 -0.774 0.285 0.143 C9 6GY 6 6GY C10 C7 C 0 1 Y N N 3.827 21.462 7.057 -2.144 0.457 0.195 C10 6GY 7 6GY C11 C8 C 0 1 Y N N 2.775 22.132 6.375 -2.970 -0.622 0.481 C11 6GY 8 6GY C12 C9 C 0 1 Y N N 1.444 21.640 6.470 -2.421 -1.875 0.715 C12 6GY 9 6GY C13 C10 C 0 1 Y N N 1.148 20.471 7.245 -1.048 -2.049 0.663 C13 6GY 10 6GY O14 O1 O 0 1 N N N -0.132 19.906 7.400 -0.509 -3.276 0.891 O14 6GY 11 6GY C15 C11 C 0 1 N N N -1.267 20.775 7.429 -1.417 -4.341 1.179 C15 6GY 12 6GY C18 C12 C 0 1 N N N 2.656 25.735 5.351 -6.225 1.139 0.467 C18 6GY 13 6GY C26 C13 C 0 1 N N N 4.636 28.275 1.438 -10.353 1.839 -0.065 C26 6GY 14 6GY N3 N1 N 0 1 Y N N 3.895 17.506 8.518 3.313 -0.210 0.301 N3 6GY 15 6GY N5 N2 N 0 1 Y N N 2.152 16.830 9.989 1.497 1.105 0.871 N5 6GY 16 6GY N7 N3 N 0 1 N N N 1.856 18.673 8.662 1.170 -1.141 0.317 N7 6GY 17 6GY C8 C14 C 0 1 Y N N 2.209 19.802 7.927 -0.221 -0.966 0.376 C8 6GY 18 6GY N16 N4 N 0 1 N N N 3.034 23.263 5.631 -4.357 -0.445 0.534 N16 6GY 19 6GY C17 C15 C 0 1 N N N 2.978 24.585 6.328 -4.721 0.951 0.258 C17 6GY 20 6GY C19 C16 C 0 1 N N N 3.572 25.652 4.110 -6.987 0.198 -0.471 C19 6GY 21 6GY C20 C17 C 0 1 N N N 3.356 24.303 3.374 -6.555 -1.245 -0.196 C20 6GY 22 6GY C21 C18 C 0 1 N N N 3.737 23.127 4.316 -5.041 -1.363 -0.385 C21 6GY 23 6GY N22 N5 N 0 1 N N N 3.580 26.896 3.273 -8.431 0.333 -0.235 N22 6GY 24 6GY C23 C19 C 0 1 N N N 2.275 27.603 3.038 -9.194 -0.558 -1.120 C23 6GY 25 6GY C24 C20 C 0 1 N N N 2.496 29.014 2.445 -10.684 -0.447 -0.789 C24 6GY 26 6GY N25 N6 N 0 1 N N N 3.329 28.948 1.205 -11.117 0.949 -0.950 N25 6GY 27 6GY C27 C21 C 0 1 N N N 4.463 26.866 2.058 -8.863 1.728 -0.397 C27 6GY 28 6GY C28 C22 C 0 1 N N N 3.461 30.255 0.530 -12.560 1.083 -0.714 C28 6GY 29 6GY N29 N7 N 0 1 N N N 5.968 16.349 8.371 5.509 0.649 0.252 N29 6GY 30 6GY C30 C23 C 0 1 Y N N 6.649 17.287 7.625 6.030 -0.623 -0.000 C30 6GY 31 6GY C31 C24 C 0 1 Y N N 8.003 17.582 7.984 7.275 -0.758 -0.602 C31 6GY 32 6GY C32 C25 C 0 1 Y N N 8.727 18.544 7.230 7.787 -2.016 -0.850 C32 6GY 33 6GY C33 C26 C 0 1 Y N N 8.124 19.212 6.132 7.062 -3.141 -0.501 C33 6GY 34 6GY C34 C27 C 0 1 Y N N 6.791 18.927 5.768 5.823 -3.010 0.098 C34 6GY 35 6GY C35 C28 C 0 1 Y N N 6.055 17.974 6.507 5.307 -1.755 0.354 C35 6GY 36 6GY P1 P1 P 0 1 N N N 8.855 16.740 9.389 8.226 0.717 -1.061 P1 6GY 37 6GY C37 C29 C 0 1 N N N 8.694 17.710 10.964 8.942 1.469 0.437 C37 6GY 38 6GY O41 O2 O 0 1 N N N 8.392 15.340 9.536 7.334 1.693 -1.725 O41 6GY 39 6GY CL CL1 CL 0 0 N N N 5.176 14.244 10.492 4.684 3.412 1.096 CL 6GY 40 6GY H1 H1 H 0 1 N N N 11.196 16.252 9.974 9.139 -0.206 -3.099 H1 6GY 41 6GY H2 H2 H 0 1 N N N 10.947 16.230 8.195 10.139 1.130 -2.479 H2 6GY 42 6GY H3 H3 H 0 1 N N N 11.055 17.796 9.068 10.224 -0.475 -1.713 H3 6GY 43 6GY H4 H4 H 0 1 N N N 2.547 15.120 11.165 1.843 3.106 1.369 H4 6GY 44 6GY H5 H5 H 0 1 N N N 4.345 19.801 8.340 -0.132 1.124 -0.084 H5 6GY 45 6GY H6 H6 H 0 1 N N N 4.839 21.833 6.990 -2.572 1.432 0.014 H6 6GY 46 6GY H7 H7 H 0 1 N N N 0.647 22.153 5.952 -3.064 -2.714 0.938 H7 6GY 47 6GY H8 H8 H 0 1 N N N -2.183 20.179 7.555 -2.100 -4.473 0.340 H8 6GY 48 6GY H9 H9 H 0 1 N N N -1.169 21.478 8.269 -0.857 -5.263 1.340 H9 6GY 49 6GY H10 H10 H 0 1 N N N -1.323 21.337 6.485 -1.987 -4.100 2.077 H10 6GY 50 6GY H11 H11 H 0 1 N N N 2.817 26.698 5.858 -6.481 0.907 1.501 H11 6GY 51 6GY H12 H12 H 0 1 N N N 1.606 25.659 5.033 -6.497 2.171 0.247 H12 6GY 52 6GY H13 H13 H 0 1 N N N 5.161 28.177 0.476 -10.682 2.868 -0.213 H13 6GY 53 6GY H14 H14 H 0 1 N N N 5.236 28.893 2.123 -10.517 1.550 0.972 H14 6GY 54 6GY H15 H15 H 0 1 N N N 0.897 18.606 8.936 1.541 -2.021 0.144 H15 6GY 55 6GY H16 H16 H 0 1 N N N 3.953 24.781 6.799 -4.464 1.196 -0.773 H16 6GY 56 6GY H17 H17 H 0 1 N N N 2.197 24.547 7.102 -4.175 1.609 0.934 H17 6GY 57 6GY H18 H18 H 0 1 N N N 4.589 25.580 4.522 -6.762 0.454 -1.506 H18 6GY 58 6GY H19 H19 H 0 1 N N N 2.299 24.210 3.082 -6.815 -1.514 0.828 H19 6GY 59 6GY H20 H20 H 0 1 N N N 3.989 24.271 2.475 -7.062 -1.916 -0.889 H20 6GY 60 6GY H21 H21 H 0 1 N N N 3.445 22.177 3.846 -4.782 -1.108 -1.413 H21 6GY 61 6GY H22 H22 H 0 1 N N N 4.824 23.134 4.484 -4.727 -2.386 -0.176 H22 6GY 62 6GY H24 H24 H 0 1 N N N 1.741 27.697 3.995 -9.030 -0.268 -2.158 H24 6GY 63 6GY H25 H25 H 0 1 N N N 1.669 27.011 2.337 -8.865 -1.587 -0.973 H25 6GY 64 6GY H26 H26 H 0 1 N N N 3.008 29.641 3.190 -11.255 -1.085 -1.463 H26 6GY 65 6GY H27 H27 H 0 1 N N N 1.520 29.458 2.200 -10.853 -0.763 0.241 H27 6GY 66 6GY H29 H29 H 0 1 N N N 4.013 26.199 1.307 -8.694 2.044 -1.426 H29 6GY 67 6GY H30 H30 H 0 1 N N N 5.452 26.480 2.346 -8.292 2.366 0.278 H30 6GY 68 6GY H31 H31 H 0 1 N N N 2.464 30.697 0.388 -12.865 2.112 -0.906 H31 6GY 69 6GY H32 H32 H 0 1 N N N 4.075 30.926 1.148 -13.102 0.413 -1.382 H32 6GY 70 6GY H33 H33 H 0 1 N N N 3.942 30.115 -0.449 -12.785 0.825 0.320 H33 6GY 71 6GY H34 H34 H 0 1 N N N 6.435 15.479 8.532 6.098 1.419 0.278 H34 6GY 72 6GY H35 H35 H 0 1 N N N 9.749 18.770 7.495 8.755 -2.122 -1.318 H35 6GY 73 6GY H36 H36 H 0 1 N N N 8.689 19.943 5.572 7.465 -4.124 -0.697 H36 6GY 74 6GY H37 H37 H 0 1 N N N 6.336 19.434 4.930 5.259 -3.890 0.369 H37 6GY 75 6GY H38 H38 H 0 1 N N N 5.034 17.758 6.230 4.339 -1.653 0.822 H38 6GY 76 6GY H39 H39 H 0 1 N N N 9.212 17.180 11.777 9.513 2.356 0.162 H39 6GY 77 6GY H40 H40 H 0 1 N N N 9.145 18.704 10.830 8.140 1.752 1.120 H40 6GY 78 6GY H41 H41 H 0 1 N N N 7.630 17.821 11.219 9.599 0.751 0.927 H41 6GY 79 # # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal 6GY C28 N25 SING N N 1 6GY N25 C26 SING N N 2 6GY N25 C24 SING N N 3 6GY C26 C27 SING N N 4 6GY C27 N22 SING N N 5 6GY C24 C23 SING N N 6 6GY C23 N22 SING N N 7 6GY N22 C19 SING N N 8 6GY C20 C19 SING N N 9 6GY C20 C21 SING N N 10 6GY C19 C18 SING N N 11 6GY C21 N16 SING N N 12 6GY C18 C17 SING N N 13 6GY N16 C17 SING N N 14 6GY N16 C11 SING N N 15 6GY C34 C33 DOUB Y N 16 6GY C34 C35 SING Y N 17 6GY C33 C32 SING Y N 18 6GY C11 C12 DOUB Y N 19 6GY C11 C10 SING Y N 20 6GY C12 C13 SING Y N 21 6GY C35 C30 DOUB Y N 22 6GY C10 C9 DOUB Y N 23 6GY C32 C31 DOUB Y N 24 6GY C13 O14 SING N N 25 6GY C13 C8 DOUB Y N 26 6GY O14 C15 SING N N 27 6GY C30 C31 SING Y N 28 6GY C30 N29 SING N N 29 6GY C9 C8 SING Y N 30 6GY C8 N7 SING N N 31 6GY C31 P1 SING N N 32 6GY N29 C2 SING N N 33 6GY N3 C2 DOUB Y N 34 6GY N3 C4 SING Y N 35 6GY N7 C4 SING N N 36 6GY C2 C1 SING Y N 37 6GY C4 N5 DOUB Y N 38 6GY C3 P1 SING N N 39 6GY P1 O41 DOUB N N 40 6GY P1 C37 SING N N 41 6GY C1 C6 DOUB Y N 42 6GY C1 CL SING N N 43 6GY N5 C6 SING Y N 44 6GY C3 H1 SING N N 45 6GY C3 H2 SING N N 46 6GY C3 H3 SING N N 47 6GY C6 H4 SING N N 48 6GY C9 H5 SING N N 49 6GY C10 H6 SING N N 50 6GY C12 H7 SING N N 51 6GY C15 H8 SING N N 52 6GY C15 H9 SING N N 53 6GY C15 H10 SING N N 54 6GY C18 H11 SING N N 55 6GY C18 H12 SING N N 56 6GY C26 H13 SING N N 57 6GY C26 H14 SING N N 58 6GY N7 H15 SING N N 59 6GY C17 H16 SING N N 60 6GY C17 H17 SING N N 61 6GY C19 H18 SING N N 62 6GY C20 H19 SING N N 63 6GY C20 H20 SING N N 64 6GY C21 H21 SING N N 65 6GY C21 H22 SING N N 66 6GY C23 H24 SING N N 67 6GY C23 H25 SING N N 68 6GY C24 H26 SING N N 69 6GY C24 H27 SING N N 70 6GY C27 H29 SING N N 71 6GY C27 H30 SING N N 72 6GY C28 H31 SING N N 73 6GY C28 H32 SING N N 74 6GY C28 H33 SING N N 75 6GY N29 H34 SING N N 76 6GY C32 H35 SING N N 77 6GY C33 H36 SING N N 78 6GY C34 H37 SING N N 79 6GY C35 H38 SING N N 80 6GY C37 H39 SING N N 81 6GY C37 H40 SING N N 82 6GY C37 H41 SING N N 83 # # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 6GY SMILES ACDLabs 12.01 "c1(cnc(nc1Nc2c(P(C)(=O)C)cccc2)Nc3ccc(cc3OC)N4CCC(CC4)N5CCN(CC5)C)Cl" 6GY InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C29H39ClN7O2P/c1-35-15-17-37(18-16-35)21-11-13-36(14-12-21)22-9-10-24(26(19-22)39-2)33-29-31-20-23(30)28(34-29)32-25-7-5-6-8-27(25)40(3,4)38/h5-10,19-21H,11-18H2,1-4H3,(H2,31,32,33,34)" 6GY InChIKey InChI 1.03 AILRADAXUVEEIR-UHFFFAOYSA-N 6GY SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "COc1cc(ccc1Nc2ncc(Cl)c(Nc3ccccc3[P](C)(C)=O)n2)N4CCC(CC4)N5CCN(C)CC5" 6GY SMILES CACTVS 3.385 "COc1cc(ccc1Nc2ncc(Cl)c(Nc3ccccc3[P](C)(C)=O)n2)N4CCC(CC4)N5CCN(C)CC5" 6GY SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "CN1CCN(CC1)C2CCN(CC2)c3ccc(c(c3)OC)Nc4ncc(c(n4)Nc5ccccc5P(=O)(C)C)Cl" 6GY SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "CN1CCN(CC1)C2CCN(CC2)c3ccc(c(c3)OC)Nc4ncc(c(n4)Nc5ccccc5P(=O)(C)C)Cl" # # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier 6GY "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "5-chloro-N~4~-[2-(dimethylphosphoryl)phenyl]-N~2~-{2-methoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]phenyl}pyrimidine-2,4-diamine" 6GY "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "5-chloranyl-~{N}4-(2-dimethylphosphorylphenyl)-~{N}2-[2-methoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]phenyl]pyrimidine-2,4-diamine" # # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site 6GY "Create component" 2016-04-07 RCSB 6GY "Initial release" 2016-05-25 RCSB 6GY "Modify synonyms" 2021-03-01 PDBE # _pdbx_chem_comp_synonyms.ordinal 1 _pdbx_chem_comp_synonyms.comp_id 6GY _pdbx_chem_comp_synonyms.name Brigatinib _pdbx_chem_comp_synonyms.provenance ? _pdbx_chem_comp_synonyms.type ? ##